目的:通过网络药理学探讨麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘作用的靶点以及所通过的信号通路,以进一步分析麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Dat...目的:通过网络药理学探讨麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘作用的靶点以及所通过的信号通路,以进一步分析麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)采集出药物的有效成分、靶点,从GeneCards中采集并整理出小儿哮喘的靶点。将麻黄-杏仁的靶点与小儿哮喘的靶点取交集并绘制出韦恩图。使用Cytoscape构建出“药物-相关疾病-潜在活性成分-关键靶点”网络,通过网络图找出药物的主要活性成分。运用String数据库构建靶点蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,找出药物作用的关键靶点蛋白。运用Bioconductor分别进行基因本体论(The Gene Ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,探究麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘的作用机制。结果:筛选出麻黄-苦杏仁共44个活性成分,其中麻黄24个活性成分,苦杏仁20个活性成分,去除重复靶点后,共有药物靶点229个,整合后,疾病靶点共计1224个,药物与疾病交集靶点112个。主要活性成分排名居前五位的是山柰酚(Kaempferol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、左旋千金藤啶碱(l-SPD)、豆甾醇(Stigmasterol)、柚皮素(naringenin)。PPI网络中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等为其关键靶点。GO富集分析可得出127个分子功能条目;KEGG分析可得到155条通路,主要涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切力与动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)、人巨细胞病毒感染(Human cytomegalovirus infection)等通路。结论:本研究初步预测了麻黄-苦杏仁可能通过重要信号通路作用于相关受体从而达到治疗小儿哮喘的目的,为中药复方治疗小儿哮喘提供了新思路,也为后期基础实验提供相关的理论依据。展开更多
文摘目的:通过网络药理学探讨麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘作用的靶点以及所通过的信号通路,以进一步分析麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)采集出药物的有效成分、靶点,从GeneCards中采集并整理出小儿哮喘的靶点。将麻黄-杏仁的靶点与小儿哮喘的靶点取交集并绘制出韦恩图。使用Cytoscape构建出“药物-相关疾病-潜在活性成分-关键靶点”网络,通过网络图找出药物的主要活性成分。运用String数据库构建靶点蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,找出药物作用的关键靶点蛋白。运用Bioconductor分别进行基因本体论(The Gene Ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,探究麻黄-苦杏仁治疗小儿哮喘的作用机制。结果:筛选出麻黄-苦杏仁共44个活性成分,其中麻黄24个活性成分,苦杏仁20个活性成分,去除重复靶点后,共有药物靶点229个,整合后,疾病靶点共计1224个,药物与疾病交集靶点112个。主要活性成分排名居前五位的是山柰酚(Kaempferol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、左旋千金藤啶碱(l-SPD)、豆甾醇(Stigmasterol)、柚皮素(naringenin)。PPI网络中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等为其关键靶点。GO富集分析可得出127个分子功能条目;KEGG分析可得到155条通路,主要涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切力与动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)、人巨细胞病毒感染(Human cytomegalovirus infection)等通路。结论:本研究初步预测了麻黄-苦杏仁可能通过重要信号通路作用于相关受体从而达到治疗小儿哮喘的目的,为中药复方治疗小儿哮喘提供了新思路,也为后期基础实验提供相关的理论依据。