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结直肠癌组织中MAD2L1的表达及与预后的关系
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作者 章芳芳 李宁君 +1 位作者 陈福娟 朱伟君 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期649-651,655,共4页
目的探讨有丝分裂阻滞缺陷蛋白2(mitotic arrest deficient 2-like 1,MAD2L1)在结直肠癌组织中的表达及与预后的关系。方法收集259例结直肠癌患者的临床病理资料,采用免疫组化SP法检测结直肠癌组织中MAD2L1的表达,分析MAD2L1表达与结直... 目的探讨有丝分裂阻滞缺陷蛋白2(mitotic arrest deficient 2-like 1,MAD2L1)在结直肠癌组织中的表达及与预后的关系。方法收集259例结直肠癌患者的临床病理资料,采用免疫组化SP法检测结直肠癌组织中MAD2L1的表达,分析MAD2L1表达与结直肠癌临床病理特征的关系及其对患者5年生存期的影响。结果TCGA和GTEx数据库分析结果显示,结直肠癌组织中MAD2L1 mRNA表达量显著高于癌旁组织;免疫组化结果显示,结直肠癌组织中MAD2L1表达水平均高于癌旁正常组织。259例结直肠癌组织中148例呈MAD2L1高表达,111例呈低表达。生存分析结果显示,MAD2L1低表达组患者5年生存率高于高表达组(67.57%vs 49.32%);按病变部位分析,MAD2L1高表达的结肠癌和直肠癌患者5年生存率均低于低表达患者(47.25%vs 73.21%;52.53%vs 65.38%)。结论MAD2L1在结直肠癌组织中高表达,可能与患者预后不良有关,是预测结直肠癌的潜在标志物。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 mad2l1 预后 总生存率
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MAD2L1在结直肠癌中的表达及与免疫浸润关系的研究
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作者 刘萌萌 李付广 《临床研究》 2024年第5期5-9,共5页
目的 探讨干扰有丝分裂阻滞缺陷2样蛋白1(MAD2L1)在结直肠癌组织中的表达及与免疫浸润的关系。方法 基于TCGA数据库分析结直肠癌组织及正常结直肠组织中MAD2L1的表达差异,生存分析评价MAD2L1表达水平与患者预后的关系,采用临床相关性分... 目的 探讨干扰有丝分裂阻滞缺陷2样蛋白1(MAD2L1)在结直肠癌组织中的表达及与免疫浸润的关系。方法 基于TCGA数据库分析结直肠癌组织及正常结直肠组织中MAD2L1的表达差异,生存分析评价MAD2L1表达水平与患者预后的关系,采用临床相关性分析研究结直肠癌与临床资料的相关性。使用Timer数据库gene模块分析探究MAD2L1与免疫细胞群之间的关系。使用correlation模块评估与免疫检查点水平的相关性。使用correlation模块进行免疫细胞浸润的关联分析,分析结直肠癌组织中MAD2L1的表达与免疫细胞浸润的关系。结果 与正常组织相比,结直肠癌组织中MAD2L1表达上调;MAD2L1高表达组与低表达组结直肠癌患者相比,N分期患者比例不同,差异具有统计学意义(P<0.05)。预后分析显示,MAD2L1高表达组的患者生存期、无进展生存期均高于低表达组的患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。多因素COX回归分析显示,年龄和T分期可作为影响结直肠癌患者预后的独立预后因子(P<0.05)。MAD2L1与结直肠癌中CD8^(+)T细胞(结肠癌:r=0.315,P<0.001;直肠癌r=0.352,P<0.001)、嗜中性粒细胞(结肠癌:r=0.195,P<0.001;直肠癌:r=0.278,P<0.001)浸润水平均呈正相关,与CD4^(+)T细胞(结肠癌:r=-0.174,P<0.001;直肠癌:r=-0.381,P<0.001)浸润水平呈负相关。其中还与结肠癌中B细胞水平(r=0.125,P<0.05)呈正相关。在结肠癌中,MAD2L1与PD-L1(r=0.159,P<0.05)呈正相关。在直肠癌中,MAD2L1与PD-1(r=-0.241,P<0.05)呈负相关。结论 MAD2L1在结直肠癌中高表达,与结直肠癌良好的预后及肿瘤免疫浸润相关,可能是结直肠癌患者潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 mad2l1 结直肠癌 免疫浸润 预后
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MAD2L2 overexpression attenuates the effects of TNF-α-induced migration and invasion capabilities in colorectal cancer cells
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作者 HAOTONG SUN HEYING WANG +5 位作者 YANJIE HAO XIN LI JUN LING HUAN WANG FEIMIAO WANG FANG XU 《BIOCELL》 SCIE 2024年第9期1311-1322,共12页
Background:Colorectal cancer is a major global health concern,exacerbated by tumor necrosis factor-alpha(TNF-α)and its role in inflammation,with the effects of Mitotic Arrest Deficient 2 Like 2(MAD2L2)in this context... Background:Colorectal cancer is a major global health concern,exacerbated by tumor necrosis factor-alpha(TNF-α)and its role in inflammation,with the effects of Mitotic Arrest Deficient 2 Like 2(MAD2L2)in this context still unclear.Methods:The colorectal carcinoma cell lines HCT116 and SW620 were exposed to TNF-αfor a period of 24 h to instigate an inflammatory response.Subsequent assessments were conducted to measure the expression of inflammatory cytokines,the activity within the p38 mitogen-activated protein kinase(p38 MAPK)and Phosphoinositide 3-Kinase/AKT Serine/Threonine Kinase pathway(PI3K/AKT)signaling cascades.Transcriptome sequencing and subsequent integrative analysis with the Cancer Genome Atlas(TCGA)program database revealed a significant downregulation of the key factor MAD2L2.Enhancement of MAD2L2 expression was facilitated via lentiviral vector-mediated transfection.The influence of this overexpression on TNF-α-prompted inflammation,intracellular signaling pathways,and the migratory and invasive behaviors of the colorectal cancer cells was then scrutinized.Results:TNF-αtreatment significantly increased the expression of Interleukin-1 beta(IL-1β)and Interleukin-6(IL-6),activated the MAPK p38 and PI3K/AKT signaling pathways,and enhanced cell migration and invasion.A decrease in MAD2L2 expression was observed following TNF-αtreatment.However,overexpression of MAD2L2 reversed the effects of TNF-α,reducing IL-1βand IL-6 levels,attenuating PI3K/AKT pathway activation,and inhibiting cell migration and invasion.Conclusions:Overexpression of MAD2L2 attenuates the pro-inflammatory effects of TNF-α,suggesting that MAD2L2 plays a protective role against TNF-α-induced migration and invasion of colorectal carcinoma cells.Therefore,MAD2L2 holds potential as a therapeutic target in the treatment of colorectal cancer. 展开更多
关键词 Colorectal cancer TNF-Α mad2l2 MIGRATION INVASION
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Increased MAD2L2 expression predicts poor clinical outcome in Colon Adenocarcinoma 被引量:1
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作者 HAOTONG SUN HEYING WANG +5 位作者 XIN LI YANJIE HAO JUN LING HUAN WANG FEIMIAO WANG FANG XU 《BIOCELL》 SCIE 2023年第3期607-618,共12页
Background:Colon adenocarcinoma(COAD)is the second leading cause of cancer death worldwide thus,identification of COAD biomarkers is critical.Mitotic Arrest Deficient 2 Like 2(MAD2L2)is a key factor in mammalian DNA d... Background:Colon adenocarcinoma(COAD)is the second leading cause of cancer death worldwide thus,identification of COAD biomarkers is critical.Mitotic Arrest Deficient 2 Like 2(MAD2L2)is a key factor in mammalian DNA damage repair and is highly expressed in many malignant tumors.This is a comprehensive study of MAD2L2 expression,its diagnostic value,prognostic analysis,potential biological function,and impact on the immune system of patients with COAD.Methods:Gene expression,clinical relevance,prognostic analysis,diagnostic value,GO/KEGG cluster analysis,data obtained from TCGA,and bioinformatics statistical analysis were performed using the R package.Immune responses to MAD2L2 expression in COAD were analyzed using TIMER.The expression of MAD2L2 in HCT116 cells induced by the inflammatory factor TNF-αwas detected using Western blot.Results:Our results underscore the clinical diagnostic value and potential biological significance of MAD2L2 in patients with COAD.A high level of MAD2L2 expression has been found in COAD and correlated with tumor status and colon polyps.ROC curve analysis showed that MAD2L2 expression has high diagnostic value in COAD.Analysis of immune infiltration results showed that MAD2L2 expression was positively correlated with neutrophil levels.The western blot results demonstrated that MAD2L2 was dose-dependently present with TNF-α.GO/KEGG revealed that MAD2L2 overexpressed and coexpressed genes were mostly involved in biological functions,including hypoxia response,response to reduced oxygen levels,mitochondrial translation elongation,and other processes.Conclusion:MAD2L2 as a new COAD biomarker contributes to our understanding of how alterations in gene expression and the immunological environment contribute to the development of colon cancer.Following further investigation,MAD2L2 may prove to be a viable target factor for clinical diagnosis and therapy of COAD. 展开更多
关键词 mad2l2 COAD Poor prognosis Immune infiltration TCGA
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辣椒MIKC型MADS-box基因家族鉴定及胁迫响应 被引量:1
5
作者 罗希榕 祝晓云 +4 位作者 杨仕梅 李唐燕 李靖 陀海燕 覃成 《种子》 北大核心 2024年第1期59-67,113,共10页
MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定... MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定到25条MIKC_MADS基因,均具有MIKC_MADS的N端SRF-TF和C端K-box保守结构域,氨基酸数为122~278 aa,为两性亲水性蛋白。Motif分析发现,25条CaMADS-box基因均含有Motif1、Motif2、Motif4共3个保守基序。染色体定位发现,25条基因不均匀地分布在12条染色体上,其中染色体Chr02定位基因最多,共计5条基因。共线性分析发现MIKC_MADS在野生种Chiltepin中存在多个共线性区块。GO富集分析发现,MIKC_MADS主要参与植物生长初期发育过程,主要是花器官、胚乳发育过程,KEGG富集到甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(ko00260),乙醛酸盐和二羧酸盐代谢(ko00630),碳代谢(ko01200)。顺式作用元件发现,与光响应元件、水杨酸、胚乳等元件相关。在时空表达过程中,MIKC_MADS在茎、叶、芽和花过程表达呈现上调表达趋势。 展开更多
关键词 辣椒 madS-BOX基因 基因特征 时空表达特性
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Composition Analysis and Identification of Ancient Glass Products Based on L1 Regularization Logistic Regression
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作者 Yuqiao Zhou Xinyang Xu Wenjing Ma 《Applied Mathematics》 2024年第1期51-64,共14页
In view of the composition analysis and identification of ancient glass products, L1 regularization, K-Means cluster analysis, elbow rule and other methods were comprehensively used to build logical regression, cluste... In view of the composition analysis and identification of ancient glass products, L1 regularization, K-Means cluster analysis, elbow rule and other methods were comprehensively used to build logical regression, cluster analysis, hyper-parameter test and other models, and SPSS, Python and other tools were used to obtain the classification rules of glass products under different fluxes, sub classification under different chemical compositions, hyper-parameter K value test and rationality analysis. Research can provide theoretical support for the protection and restoration of ancient glass relics. 展开更多
关键词 Glass Composition l1 Regularization logistic Regression Model K-Means Clustering Analysis Elbow rule Parameter Verification
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基于CRISPR/Cas9系统定点编辑小鼠MAD2L1基因及其脱靶效应分析 被引量:4
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作者 陈丽香 彭秀华 +5 位作者 谭丹 韩铖潇 赵锐 王超 李顺 周晓辉 《中国实验动物学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期587-593,共7页
目的建立利用CRISPR/Cas9系统对小鼠MAD2L1基因第二外显子基因编辑的方法体系,并分析CRISPR/Cas9对MAD2L1基因编辑的脱靶效应。方法通过CHOPCHOP网站设计位于小鼠MAD2L1基因第二外显子的靶点序列,并构建Cas9-MAD2L1载体,将该载体转染到N... 目的建立利用CRISPR/Cas9系统对小鼠MAD2L1基因第二外显子基因编辑的方法体系,并分析CRISPR/Cas9对MAD2L1基因编辑的脱靶效应。方法通过CHOPCHOP网站设计位于小鼠MAD2L1基因第二外显子的靶点序列,并构建Cas9-MAD2L1载体,将该载体转染到NIH/3T3细胞中,通过嘌呤霉素筛选并结合荧光显微镜观察GFP后,提取细胞转染后的基因组DNA,利用PCR方法,结合T7E1分析和桑格尔测序,鉴定对小鼠MAD2L1基因编辑情况,并对转染后的NIH/3T3细胞进行CRISPR/Cas9脱靶效应分析。结果将Cas9-MAD2L1载体转染到NIH/3T3细胞并进行嘌呤霉素筛选后,荧光显微镜下观察到大量表达GFP的细胞,PCR结合T7E1结果显示,以转染后的细胞DNA为模板扩增出的228 bp MAD2L1 PCR产物,可被酶切成166 bp和62 bp片段,测序结果显示,成功对MAD2L1基因第二外显子靶点处进行基因编辑,脱靶效应分析未检测到CRISPR/Cas9有对脱靶位点进行基因编辑。结论成功建立对小鼠MAD2L1基因第二外显子进行基因编辑的方法体系,设计的对MAD2L1基因编辑靶点未检测到脱靶效应的发生。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 小鼠 mad2l1 脱靶效应
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苦瓜(Momordica CharantiaL.)MADS-box基因BAG启动子的克隆分析及表达载体的构建 被引量:3
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作者 杨满业 赵茂俊 +4 位作者 唐琳 徐莺 王胜华 邢杰 陈放 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期783-786,共4页
作者提取苦瓜基因组总DNA,构建了DNA步移文库,并根据已克隆并公布的苦瓜MADS box基因BAG的基因序列设计引物,通过染色体步移技术克隆出BAG基因起始密码子上游调控序列BAGP.对BAGP的鉴定和分析表明其具备大多数高等植物启动子的保守元件... 作者提取苦瓜基因组总DNA,构建了DNA步移文库,并根据已克隆并公布的苦瓜MADS box基因BAG的基因序列设计引物,通过染色体步移技术克隆出BAG基因起始密码子上游调控序列BAGP.对BAGP的鉴定和分析表明其具备大多数高等植物启动子的保守元件,预测它对BAG基因的表达具有一定的作用.为鉴定BAG基因的基本启动子元件,将基因5′侧翼序列做缺失片段分析,利用PCR方法从BAGP中得到3个大小不等两端带有HindⅢ,BamHⅠ酶切位点的片段BAGP1,BAGP2和BAGP3,定向插入载体pMGFP4(pBI221改建,报告基因为GFP)中,取代原有的CaMV35S启动子,构建了由驱动报告基因GFP的植物表达载体BAGPV1,BAGPV2和BAGPV3. 展开更多
关键词 苦瓜 启动子 madS-BOX基因 DNA步移技术 表达载体 PCR扩增
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MAD2L1在肺腺癌中的表达及对免疫微环境的影响 被引量:4
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作者 刘迎博 刘晓红 +1 位作者 茹美华 李建强 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2022年第6期586-592,共7页
目的探讨MAD2L1在肺腺癌组织中的表达对患者预后及免疫微环境的影响。方法通过TCGA和GEO数据库分析在肺腺癌组织及正常肺组织样本中MAD2L1的表达差异,生存分析评价其表达水平与患者预后的关系,StarBase数据库构建肺腺癌miRNA-MAD2L1调... 目的探讨MAD2L1在肺腺癌组织中的表达对患者预后及免疫微环境的影响。方法通过TCGA和GEO数据库分析在肺腺癌组织及正常肺组织样本中MAD2L1的表达差异,生存分析评价其表达水平与患者预后的关系,StarBase数据库构建肺腺癌miRNA-MAD2L1调控网络,分析肺腺癌组织中MAD2L1的表达与免疫细胞浸润的关系。结果肺腺癌组织中MAD2L1表达上调且MAD2L1高表达与肺腺癌的病理分期、淋巴结转移显著相关,MAD2L1表达水平高的肺腺癌患者预后较差,miR-101-3p/MAD2L1轴被确定为MAD2L1在肺腺癌中最有潜力的上游调控相关途径,MAD2L1表达水平与肿瘤免疫细胞浸润和免疫检查点表达呈显著相关。结论MAD2L1在肺腺癌组织中高表达,与肺腺癌不良预后及肿瘤免疫浸润相关,可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 mad2l1 肺腺癌 预后 免疫浸润 免疫微环境
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纺锤体检查点功能复合物基因MAD1L1遗传变异与潮汕地区女性乳腺癌易感性研究 被引量:2
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作者 杨少宜 张庆英 +4 位作者 吴俊东 林秋强 王锐锋 郑庆元 蔡奋 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2018年第3期209-213,共5页
目的:研究纺锤体检查点功能复合物基因MAD1L1基因变异与潮汕地区女性乳腺癌易感性的关系。方法:采用病例-对照研究,收集2015年12月—2017年12月在汕头大学医学院附属肿瘤医院住院的乳腺癌新发病例191例及同期社区健康对照225例,采用Taq... 目的:研究纺锤体检查点功能复合物基因MAD1L1基因变异与潮汕地区女性乳腺癌易感性的关系。方法:采用病例-对照研究,收集2015年12月—2017年12月在汕头大学医学院附属肿瘤医院住院的乳腺癌新发病例191例及同期社区健康对照225例,采用TaqMan荧光双标记探针法对MAD1L1基因位点rs1801368进行基因分型。同时收集其人口学特征、女性生理生育相关信息、生活方式、既往病史及乳腺癌患者临床病理指标。结果:MAD1L1 rs1801368位点基因型CC、CT、TT的频率分布在病例组中分别为20.63%、42.86%、36.51%,在对照组中分别为30.14%、41.15%、28.71%,两组中分布的差异无统计学意义(P>0.05)。多因素分析表明,调整了年龄、初潮年龄、绝经状态等混杂因素后,相较于野生型纯合子CC,突变型纯合子TT增加乳腺癌患病风险(OR=3.399,95%CI:1.288-8.973,P=0.013)。结论:MAD1L1基因位点rs1801368多态性与潮汕地区女性乳腺癌易感性可能相关,携带TT基因型的较携带CC或CT基因型的女性患乳腺癌的风险高。 展开更多
关键词 乳腺癌 纺锤体检查点 mad1l1 遗传易感性
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Madaline网络学习算法改进 被引量:1
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作者 盛新新 颜伟琼 王炳辉 《计算机技术与发展》 2006年第6期224-226,共3页
根据Madaline网络工作原理,针对其网络特点和现有算法中存在的缺点,提出将MRⅡ算法与感知机学习规则相结合的改进的学习算法,使每个样本学习后权值的改动尽量小,从而减少它对其它样本学习产生的影响,达到提高网络学习能力的目的。
关键词 madaline网络 MRⅡ学习算法 感知机学习规则 学习速率
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Expression pattern and function analyses of the MADS thranscription factor genes in wheat(Triticum aestivum L.) under phosphorusstarvation condition 被引量:1
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作者 SHI Shu-ya ZHANG Fei-fei +1 位作者 GAO Si XIAO Kai 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第8期1703-1715,共13页
supported by the National Natural Science Foundation of China (31201674 and 31371618);the National Transgenic Major Program, China (2011ZX08008)
关键词 wheat(Triticum aestivum l madS type transcription factor Pi deprivation expression gene function
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UPLC-Q-TOF-MS/MS法分析栾樨叶的化学成分 被引量:4
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作者 肖观林 江洁怡 +4 位作者 程青云 张靖年 汤瑞茵 李冬梅 李养学 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1424-1433,共10页
采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间高分辨质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)对栾樨叶的化学成分进行定性分析。栾樨叶提取液经Waters UPLC BEH C_(18)柱(2.1 mm×100 mm,1.7μm)分离,以乙腈-0.1%甲酸水溶液为流动相进行梯度洗脱,正、负离子... 采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间高分辨质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)对栾樨叶的化学成分进行定性分析。栾樨叶提取液经Waters UPLC BEH C_(18)柱(2.1 mm×100 mm,1.7μm)分离,以乙腈-0.1%甲酸水溶液为流动相进行梯度洗脱,正、负离子模式下采集得到基峰色谱图。通过质谱数据库、化合物质谱裂解规律,并结合相关文献及对照品的保留时间与质谱信息,从栾樨叶中共鉴别出52个化学成分,包括2个香豆素类,15个黄酮类,16个苯丙素类,5个生物碱类,5个脂肪酸类,3个有机酸类,3个氨基酸类,1个酚酸类和2个其他类化合物,其中23个成分为栾樨叶中首次报道,11个化合物经对照品验证。该方法准确、可靠、高效,适用于栾樨叶化学成分的快速鉴定,可为栾樨叶的药效机制研究及临床应用提供依据。 展开更多
关键词 阔苞菊 超高效液相色谱-四极杆-飞行时间高分辨质谱 化学成分 裂解规律
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The Influence of Photoperiod on the Regulation of Root and Callus Initiation of Perle Noir (<i>V. vinifera</i>L.): Expression of MADS-Box Gene
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作者 Henda Cheikhrouhou Manel Zrida Bechir Ezzili 《Agricultural Sciences》 2015年第9期908-915,共8页
To study the influence of photoperiod on roots differentiation in the Tunisian grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Perle noir, roots and callus initiation were analyzed under three different conditions of day lengt... To study the influence of photoperiod on roots differentiation in the Tunisian grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Perle noir, roots and callus initiation were analyzed under three different conditions of day length: long day (LD), short day (SD) and darkness (D). The photoperiod influenced the number of callus and roots per cuttings;it has a significant effect on the roots and callus initiation. Expression profile analysis of six MADS-box genes (VTM8, VSEP2, VAG12, VAG17-1, VAG17-2 and VSOC1.3) during root and callus development is in agreement with the above-mentioned observation. The expression of the MADS-box genes during root and callus development fluctuated in a tissue-dependent manner. These data suggest that all genes are expressed in roots under three photoperiods. Total darkness gives the number of the most important root per cutting compared to the other two conditions. This photoperiodic condition gave the most important expression of the studied genes VAG12, VAG17-2, VAG17-1, VTM8 and VSEP2 transcripts were not found in callus grown in the dark or in LD conditions, respectively. VSOC1.3 transcripts were not found in callus grown in the dark or in SD conditions, respectively. Transcript abundance of VTM8 and VSOC1 was highest in LD. 展开更多
关键词 Grapevine ROOT PHOTOPERIOD madS-Box Genes CAllUS Vitis VINIFERA l.
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钙影响花生胚发育相关MADS box基因的克隆与初步鉴定 被引量:3
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作者 张君诚 张新文 +2 位作者 宋育红 刘思衡 庄伟建 《中国农学通报》 CSCD 2008年第6期180-185,共6页
缺钙花生严重空荚(胚胎败育)导致减产降质长期困扰南方花生生产。以大田种植为基础,通过mRNA基因差异显示从花生幼胚筛选得到一个包含编码区和3’-UTR在内的cDNA近全长序列,命名为pMADS08(GenBank登录号:AY517932)。该cDNA长度为785bp,... 缺钙花生严重空荚(胚胎败育)导致减产降质长期困扰南方花生生产。以大田种植为基础,通过mRNA基因差异显示从花生幼胚筛选得到一个包含编码区和3’-UTR在内的cDNA近全长序列,命名为pMADS08(GenBank登录号:AY517932)。该cDNA长度为785bp,编码261个氨基酸,由MADS区、I区、K区和C末端组成。序列相似性分析结果表明,该基因具有典型的植物MIKC型MADS box基因结构,其氨基酸序列与豌豆(Pisum sativum)的AP1/AGL9亚族的一个MADS box转录因子有很高的同源性(84%),该基因在豌豆种皮发育过程中表达。pMADS08基因在足、缺钙组花生的不同组织(叶片、花、果实<9d>)表达量明显不同,提示该基因可能与花生抗缺钙等营养逆境有关。 展开更多
关键词 胚发育 madS BOX基因 抗逆境 花生(Arachis HYPOGAEA l.)
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棉花MADS-box蛋白基因(GhMADS-13)的克隆和表达分析 被引量:7
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作者 吴东 喻树迅 +2 位作者 范术丽 宋美珍 王力娜 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期223-228,共6页
一组具有MADS-box结构域的转录因子在控制花器官的诱导与发育中起着重要作,以中棉所36(CCRI)均一化全长cDNA文库为基础,结合EST测序分析,分离获得一个棉花的MADS-box基因全长cDNA。该基因cDNA全长1079bp,包含一个732bp的完整的开放阅读... 一组具有MADS-box结构域的转录因子在控制花器官的诱导与发育中起着重要作,以中棉所36(CCRI)均一化全长cDNA文库为基础,结合EST测序分析,分离获得一个棉花的MADS-box基因全长cDNA。该基因cDNA全长1079bp,包含一个732bp的完整的开放阅读框,编码234个氨基酸,具有典型的MADS-box结构域和完整的K区,命名为GhMADS-13(GenBank:FJ409870)。与拟南芥、葡萄等植物的AGL6类基因具有高度的同源性。实时定量RT-PCR分析表明,GhMADS-13在CCRI36的花器官发育中早期表达量逐步增加,后期有下降趋势。推测GhMADS-13可能在开花诱导和花器官发育过程中起着重要作用。 展开更多
关键词 棉花 madS-BOX基因 表达分析
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水稻与拟南芥中控制花器官发育MADS-box基因的比较研究进展 被引量:7
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作者 田大刚 刘华清 +2 位作者 苏军 张礼华 王锋 《福建农业学报》 CAS 2011年第2期309-320,共12页
MADS-box基因编码的蛋白在植物花发育过程中起着重要的调控作用。单子叶模式植物水稻与双子叶模式拟南芥是两个关系很远的种类,通过对它们花器官功能保守因子的比较研究,将有助于提高对水稻基因功能的认知以及加快对水稻花器官发育研究... MADS-box基因编码的蛋白在植物花发育过程中起着重要的调控作用。单子叶模式植物水稻与双子叶模式拟南芥是两个关系很远的种类,通过对它们花器官功能保守因子的比较研究,将有助于提高对水稻基因功能的认知以及加快对水稻花器官发育研究的步伐。 展开更多
关键词 ABCDE模型 拟南芥 madS-BOX 栽培稻 进化 花发育
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农杆菌介导的MADS-box基因转化黄瓜初步研究 被引量:18
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作者 赖来 潘俊松 +1 位作者 何欢乐 蔡润 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2007年第4期374-382,共9页
试验通过叶盘转化法,利用根癌农杆菌介导,将从黄瓜中克隆到的MADS-box同源基因—CSMADS06基因,转化到烟草和2种不同品系的黄瓜S06和S52中,经过除草剂筛选获得14株转化烟草和28株转化黄瓜。PCR检测和GFP荧光检测证实,外源的CSMADS06基因... 试验通过叶盘转化法,利用根癌农杆菌介导,将从黄瓜中克隆到的MADS-box同源基因—CSMADS06基因,转化到烟草和2种不同品系的黄瓜S06和S52中,经过除草剂筛选获得14株转化烟草和28株转化黄瓜。PCR检测和GFP荧光检测证实,外源的CSMADS06基因已转入这些植株中。阳性率分别为2.36%(烟草),4.1%和2.9%(黄瓜)。抗性植株已开花结果并获得子一代植株。 展开更多
关键词 黄瓜 根癌农杆菌 madS-BOX基因 遗传转化
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红莲型水稻不育系统花粉发育不同时期MADS-box基因家族的表达分析 被引量:11
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作者 孙清萍 汪莉 +1 位作者 易平 朱英国 《武汉植物学研究》 CSCD 2002年第5期325-328,共4页
以红莲型水稻不育系、保持系、恢复系和杂种为材料 ,根据 MADS- box的保守序列设计特异引物 ,并分别以 Oligo d T1 2 GC和 Oligo d T1 2 CG为锚定引物对花粉发育单核期和二核期的花药进行了差异展示分析。扩增共得到 382条带 ,其中有组... 以红莲型水稻不育系、保持系、恢复系和杂种为材料 ,根据 MADS- box的保守序列设计特异引物 ,并分别以 Oligo d T1 2 GC和 Oligo d T1 2 CG为锚定引物对花粉发育单核期和二核期的花药进行了差异展示分析。扩增共得到 382条带 ,其中有组成型表达带 2 2× 8=176条。对差异带的统计分析表明 :MADS- box基因家族参与了水稻CMS和育性恢复的核质互作。最后 ,对这些差异带与 CMS和育性恢复之间的关系以及特异引物在研究复杂生物学现象中的应用进行了讨论。 展开更多
关键词 红莲型水稻不育系统 花粉发育 时期 madS-box基因家族 表达分析 细胞质雄性不育 育性恢复 差异展示
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甜樱桃B类MADS-box基因的分离与序列分析 被引量:3
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作者 林苗苗 赵长竹 +4 位作者 顾红 张慧琴 陈锦永 谢鸣 方金豹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1082-1085,共4页
为研究MADS-box基因在甜樱桃花发育中的作用,以甜樱桃品种拉宾斯为试材,根据多种植物MADS-box基因保守序列设计引物,采用RT-PCR和RACE方法克隆基因cDNA全长,并用半定量PCR法研究基因在不同组织中的表达。克隆得到1个基因全长962 bp,命名... 为研究MADS-box基因在甜樱桃花发育中的作用,以甜樱桃品种拉宾斯为试材,根据多种植物MADS-box基因保守序列设计引物,采用RT-PCR和RACE方法克隆基因cDNA全长,并用半定量PCR法研究基因在不同组织中的表达。克隆得到1个基因全长962 bp,命名为PaMADS2(GenBank登录号:HQ229606),包含1个633 bp的开放阅读框,编码210个氨基酸。序列比对和进化分析表明,PaMADS2与B类的PI基因家族亲缘关系最近。组织特异性分析表明PaMADS2在雄蕊和花瓣中表达。推断所克隆的PaMADS2基因为MADS-box B类家族成员。 展开更多
关键词 甜樱桃 花器官 雄蕊 花瓣 madS—box
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