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苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析
被引量:
5
1
作者
田丹
朵虎
+2 位作者
刘河
吕前前
左存武
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期421-432,共12页
以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性...
以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性状、进化特征、亚细胞定位、染色体位置和表达模式进行分析。通过鉴定,共获得41个成员,其氨基酸序列大小介于423~1 291 aa,分子量介于47.12~143.27 kD,等电点介于5.50~8.91,其中28个成员位于质膜。根据进化分析将拟南芥、水稻、马铃薯、杨树和苹果等5个物种的L-LEC-RLKs分为8个亚组,苹果L-LEC-RLKs分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅷ。染色体位置分析表明苹果L-LEC-RLKs存在多个串联重复。该家族成员在不同组织中存在多样化的表达模式。27个成员在苹果接种腐烂病菌(Valsa mali,Vm)或斑点落叶病菌(Alternaria alternata apple pathotype,AAAP)后存在差异表达。其中,MD15G1226500和MD14G1055200的表达量在两种病害发生后都发生了显著的差异。以上差异基因可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。
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关键词
苹果
l-lec-rlk
生物信息学分析
苹果腐烂病
苹果斑点落叶病
原文传递
题名
苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析
被引量:
5
1
作者
田丹
朵虎
刘河
吕前前
左存武
机构
甘肃农业大学园艺学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期421-432,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31860545)
甘肃农业大学引进人才专项(GSAU-RCZX201712)
+2 种基金
甘肃农业大学园艺学科建设专项基金项目(GAU-XKJS-2018-217)
甘肃省科技重大专项(18ZD2NA006)
甘肃高等学校科研项目(2018B-034)
文摘
以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性状、进化特征、亚细胞定位、染色体位置和表达模式进行分析。通过鉴定,共获得41个成员,其氨基酸序列大小介于423~1 291 aa,分子量介于47.12~143.27 kD,等电点介于5.50~8.91,其中28个成员位于质膜。根据进化分析将拟南芥、水稻、马铃薯、杨树和苹果等5个物种的L-LEC-RLKs分为8个亚组,苹果L-LEC-RLKs分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅷ。染色体位置分析表明苹果L-LEC-RLKs存在多个串联重复。该家族成员在不同组织中存在多样化的表达模式。27个成员在苹果接种腐烂病菌(Valsa mali,Vm)或斑点落叶病菌(Alternaria alternata apple pathotype,AAAP)后存在差异表达。其中,MD15G1226500和MD14G1055200的表达量在两种病害发生后都发生了显著的差异。以上差异基因可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。
关键词
苹果
l-lec-rlk
生物信息学分析
苹果腐烂病
苹果斑点落叶病
Keywords
apple
l-lec-rlk
bioinformatic analysis
valsa canker of apple
alternaria blotch of apple
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析
田丹
朵虎
刘河
吕前前
左存武
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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