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绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
李杨
颜新敏
+5 位作者
吴国华
李健
叶奕优
赵志荀
朱海霞
张强
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第1期201-207,共7页
为分析绵羊痘病毒L2R蛋白的分子特征,本试验提取了绵羊痘病毒固原株(GY)的基因组DNA,设计L2R基因引物,对L2R基因进行扩增,将扩增的基因连接到pGEM-T Easy载体后转化到大肠杆菌Trans 5α感受态细胞,筛选阳性克隆,进行序列测序。利用生物...
为分析绵羊痘病毒L2R蛋白的分子特征,本试验提取了绵羊痘病毒固原株(GY)的基因组DNA,设计L2R基因引物,对L2R基因进行扩增,将扩增的基因连接到pGEM-T Easy载体后转化到大肠杆菌Trans 5α感受态细胞,筛选阳性克隆,进行序列测序。利用生物信息学软件对L2R基因序列进行预测分析。结果显示,L2R基因序列含有一个由279个核苷酸组成的开放阅读框,编码92个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为10.92ku,理论等电点为6.56。该蛋白质二级结构组成分别是α-螺旋占69.57%,β-折叠占9.78%,无规则卷曲占8.70%,延伸链占11.96%。多序列比对分析结果显示,不同羊痘病毒分离株L2R序列高度保守。进化树分析结果显示,GY株与NK、TU及SA株在一个分支,表明它们之间亲缘关系较近。本试验结果为进一步研究L2R蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。
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关键词
羊痘病毒
l2r基因
基因
克隆
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
李杨
颜新敏
吴国华
李健
叶奕优
赵志荀
朱海霞
张强
机构
中国农业科学院兰州兽医研究所
深圳出入境检验检疫局
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017年第1期201-207,共7页
基金
国家重点研发计划课题(2016YFD0500907)
甘肃省国际科技合作专项(1604WKCA012)
甘肃省国际科技合作专项(1504WKCA055)
文摘
为分析绵羊痘病毒L2R蛋白的分子特征,本试验提取了绵羊痘病毒固原株(GY)的基因组DNA,设计L2R基因引物,对L2R基因进行扩增,将扩增的基因连接到pGEM-T Easy载体后转化到大肠杆菌Trans 5α感受态细胞,筛选阳性克隆,进行序列测序。利用生物信息学软件对L2R基因序列进行预测分析。结果显示,L2R基因序列含有一个由279个核苷酸组成的开放阅读框,编码92个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为10.92ku,理论等电点为6.56。该蛋白质二级结构组成分别是α-螺旋占69.57%,β-折叠占9.78%,无规则卷曲占8.70%,延伸链占11.96%。多序列比对分析结果显示,不同羊痘病毒分离株L2R序列高度保守。进化树分析结果显示,GY株与NK、TU及SA株在一个分支,表明它们之间亲缘关系较近。本试验结果为进一步研究L2R蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。
关键词
羊痘病毒
l2r基因
基因
克隆
生物信息学
Keywords
cap
r
ipox vi
r
us
l
2
r
gene
gene c
l
oning
bioinfo
r
matics
分类号
S852.654 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析
李杨
颜新敏
吴国华
李健
叶奕优
赵志荀
朱海霞
张强
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2017
4
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