DNASE1L3基因变异致狼疮性肾炎的临床及遗传学分析——附1例病例报道及文献复习

目的:分析DNASE1L3基因缺陷导致狼疮性肾炎(LN)患者的临床病理表现及基因变异特征。方法:结合1例伴肺出血的LN患者全外显子测序分析结果,总结DNASE1L3基因缺陷致LN患者的临床特征及致病变异谱。结果:该患者为男性,23岁起病,肾脏表现为大量蛋白尿及镜下血尿,肾活检病理提示LN-Ⅴ+Ⅳ型,合并肺出血、重度贫血、荨麻疹样皮疹、关节炎等表现。全外显子测序检出DNASE1L3基因c.565_568del(p.D189Sfs*17)纯合致病变异,该变异此前未见报道。文献检索报道了25例DNASE1L3基因缺陷致LN病例,结合本病例,共发现9个DNASE1L3基因致病变异位点,53.8%患者为男性,78.6%有血液系统受累,71.4%关节受累,71.4%荨麻疹样皮疹,42.9%肺部受累,35.7%消化系统受累,21.4%眼部受累,21.4%心脏受累,57.7%伴抗中性粒细胞胞质抗体(ANCA)阳性,50%预后不佳。结论:DNASE1L3基因缺陷更常见于男性LN患者,易累及血液系统、关节、皮肤、肺和消化系统,可伴ANCA阳性。对于LN伴ANCA阳性或肺出血的患者,应仔细询问家族史,及时完善基因检测,考虑DNASE1L3基因缺陷可能性。

青鳉eef1a1l3基因的表达特征及抗体制备

青鳉(Oryzias latipes)是研究性别分化和生殖调控的重要模式鱼类,前期通过青鳉性腺转录组发现eef1a1l3 mRNA在卵巢中高表达,而在精巢几乎不表达,推测其参与性别分化和卵巢发育的调控。生物信息学分析显示,Eef1a1l3蛋白在硬骨鱼类中非常保守。为探究eef1a1l3基因的功能,通过半定量PCR(SqRT-PCR)绘制了eef1a1l3基因在不同组织和早期不同发育时期的表达谱。通过抗原选取、原核表达、蛋白纯化以及动物免疫实验获取Eef1a1l3多克隆抗体,并对该抗体进行了特异性的检测以及效价的鉴定。结果显示,eef1a1l3 mRNA在成体组织中仅在卵巢特异表达,在早期胚胎发育阶段呈现母源性表达。制备的Eef1a1l3多克隆抗体与抗原结合的最大稀释倍数为1∶64000,显示出良好的免疫原性,并且Eef1a1l3蛋白在青鳉性腺中的卵巢而非精巢中有表达,这与mRNA表达模式一致。综上,eef1a1l3基因可能是早期胚胎发育和卵巢发育的重要调控因子,并且制备的Eef1a1l3多克隆抗体可以应用于青鳉及其他硬骨鱼类eef1a1l3基因功能的相关研究。

蓝舌病毒L3基因的克隆与表达

目的 通过高效表达，研究蓝舌病毒（ＢＴＶ） ＶＰ３ 的功能，为后续ＢＴＶ病毒样颗粒的装配作准备。方法 克隆出完整的ＢＴＶ１３ Ｌ３ 基因，将其插入杆状病毒表达载体进行表达。结果 获得了含有全长Ｌ３ 基因的克隆，ＶＰ３ 在昆虫细胞中得到了高效表达，表达蛋白占细胞总蛋白的１０％ ～１５％ ，ＶＰ３ 与ＶＰ７ 共表达可装配出ＢＴＶ 核心样颗粒。结论 在昆虫细胞中表达ＢＴＶＶＰ３ 蛋白具有生物学活性。

INSL3基因在单侧隐睾睾丸组织中表达的研究

胰岛素样因子3（INSL3）基因及其表达的多肽对于雄性性腺位置的改变和性腺的发育起到重要作用，在睾丸下降的第一阶段（经腹下降阶段）主要是由INSL3介导；成熟Leydig细胞分泌INSL3能减少生殖细胞凋亡，本研究旨在了解单侧隐睾对丸组织中INSL3基因转录水平的影响。

基于Oncomine数据库及GEPIA数据库分析CHI3L2基因在胶质母细胞瘤中的表达及与预后的相关性

目的:基于Oncomine数据库及GEPIA数据库分析CHI3L2基因在胶质母细胞瘤中的表达及与预后的相关性。方法:检索Oncomine和GEPIA数据库中相关胶质母细胞瘤的数据集,分析胶质母细胞瘤组织与正常对照组织之间基因表达的差异,采用GEPIA数据库进行在线生存分析。结果:Oncomine数据库中共收集了449项关于CHI3L2基因在肿瘤与正常组织中表达比较的研究结果,表达差异有统计学意义的研究结果有23项,其中有9项研究结果呈高表达,14项研究结果呈低表达。与对照组相比,在胶质母细胞瘤组织中CHI3L2的表达显著高于正常组织(P<0.05)。结论:CHI3L2在胶质母细胞瘤组织中呈高表达,且与胶质母细胞瘤患者预后相关,为临床胶质母细胞瘤的治疗及基因靶向药物的研制提供重要理论依据。

江西人群CCL3L1基因拷贝数与HIV感染相关性研究

目的研究江西省HIV/AIDS(艾滋病感染者/艾滋病病人)人群趋化性细胞因子配体蛋白CCL3L1(CC chemokine ligand 3-like-1)的拷贝数及其与HIV病毒(艾滋病病毒)易感性及艾滋病进展的关系。方法收集192例HIV/AIDS和131例阳性者配偶阴性血样标本,提取基因组DNA,应用PRT(the Paralogue Ratio Test)法检测其CCL3L1基因拷贝数,计算江西省人群CCL3L1基因拷贝数中位数,用SPPS统计软件分析CCL3L1拷贝数与HIV感染的关系。结果江西人群CCL3L1基因拷贝数中位数为2;HIV慢性感染者与健康人无显著性差异(P>0.05);第一次CD4淋巴细胞数与基因拷贝数的变化有显著相关(P<0.05)。结论江西人群的CCL3L1基因拷贝数与HIV易感性无相关性,与感染进程有一定相关性。

CCL3L1基因拷贝数目变异与慢性乙肝的易感性相关

目的:研究我国汉族人群CCL3L1基因拷贝数的分布,及其与非静脉吸毒者慢性乙肝的相关关系。方法:选1 477例慢性乙肝病人及1 023例健康人。用qPCR方法检测CCL3L1基因的拷贝数;用qPCR及ELISA方法分别检测CCL3L1基因拷贝数与其mRNA、蛋白质的定量关系,并用Transwell法分析了不同拷贝数目与其趋化效力的关系。用Pearson's卡方检验和Logistic回归方法检测CCL3L1基因拷贝数目变异与乙肝易感性的统计学相关性。结果:CCL3L1基因拷贝数目在我国汉族正常人为0-9(中位数=3),与其mRNA、蛋白质产物呈正相关,也与其趋化性呈正相关关系。低拷贝数目者比健康对照更易患乙肝(P<0.01)。结论:在中国汉族人群中,CCL3L1基因拷贝数目变异与乙型病毒性肝炎易感性存在显著相关,低拷贝数目者更容易患乙肝。

具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶功能的家蚕l(3)neo18基因的克隆与表达特征

果蝇l(3)neo18基因可以通过P转座子诱发致死突变,编码的蛋白质具有还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶(ND)的功能。利用生物信息学、cDNA末端快速扩增(RACE)和反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等方法,克隆了家蚕l(3)neo18同源基因,分析了基因结构与表达谱。Bm-l(3)neo18基因(EU826676)的cDNA全长为868 bp,由573 bp的完整开放读码框(ORF)序列、25 bp的5′端非翻译区序列(5′-UTR)和251 bp的3′端非编码区序列(3′-UTR)组成,编码蛋白质为190个氨基酸残基,分子质量22.7 kD,pI 9.60。Bm-l(3)neo18基因由3个外显子和2个内含子组成,定位于家蚕第3染色体,位于nscaf2930的1 203.8-1 205.6 knt。Bm-l(3)neo18蛋白质在1-185氨基酸残基位置为ND的SGDH亚基保守区,在61-83氨基酸残基位置具有一个保守的跨膜区域。采用Clustal W进行多序列比对发现,Bm-l(3)neo18与埃及伊蚊等昆虫ND具有50%以上的蛋白质同源性,ND的保守区域高度一致,NJ法分子进化分析也显示Bm-l(3)neo18与昆虫ND进化上同源。该基因除在家蚕卵期的表达量较低外,在幼虫、蛹和蛾期均有较高表达,且存在组织差异性。

BNIP3L基因在肺癌组织中的表达及结构分析

背景与目的:BNIP3L(Bcl-2/E1B19kDa-interactingprotein3-like)基因是从人胎肝cDNA文库中克隆得到的具有抑瘤活性的基因,定位于8p21肺癌高频杂合性丢失(lossofheterozygosity,LOH)区;BNIP3L蛋白能与Bcl-2、Bcl-xL、E1B19K等抗凋亡蛋白相互作用,促进细胞凋亡。本研究旨在探讨BNIP3L基因表达、结构异常与肺癌发生、发展的关系。方法:采用免疫组化和免疫印迹技术、半定量逆转录聚合酶链反应(reversetranscription-PCR,RT-PCR)、PCR-单链构象多态性(PCR-singlestrainconformationpolymorphism,PCR-SSCP)分析等方法检测4种肺癌细胞株NCI-H520、A549、NCI-H460、NCI-H446和30例肺癌组织中BNIP3L基因的表达及结构异常。结果:(1)除NCI-H520细胞外,A549、NCI-H460和NCI-H446细胞中均无BNIP3L蛋白表达,NCI-H520细胞中BNIP3L蛋白表达水平也略低于永生化支气管上皮细胞HBE4-E6/E7。30例肺癌组织中BNIP3L蛋白阳性率为46.7%(14/30),12例正常肺组织中阳性率为100%(12/12),二者差异有统计学意义(P<0.05)。(2)4种肺癌细胞株中均存在BNIP3LmRNA表达,其表达水平与HBE4-E6/E7细胞相比无明显差异。30例肺癌组织中8例(26.7%)存在BNIP3LmRNA表达缺失或明显减弱,肺癌组织中BNIP3LmRNA平均表达量为0.404±0.070。

广西狂犬病野毒株L基因3'端的多态性分析

为了解狂犬病病毒(RV)的变异情况,本研究对广西不同地区的22个RV分离株的L基因3'端片段进行克隆和测序,与国内外发表的RV街毒、固定毒株及类RV株相应部分的多态性进行了比较分析。结果表明,所测定的22个广西RV野毒分离株属于基因Ⅰ型,可分为3个群即Ⅰ群、Ⅱ群和Ⅲ群。其中13株属于Ⅰ群,其核苷酸同源性为96.9%～100.0%,氨基酸同源性为98.2%～100.0%;8株属于Ⅱ群,株核苷酸同源性为96.5%～99.7%,氨基酸同源性为97.8%～100.0%。仅1株属于Ⅲ群。22个RV分离株与RV固定毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为79.5%～86.9%和85.8%～96.5%,与类RV核苷酸和氨基酸的同源性分别为65.7%～70.3%和70.4%～76.5%。

DNMT3L基因多态性与子宫内膜异位症合并不孕关系

目的:探讨DNMT3L基因多态性与子宫内膜异位症合并不孕的相关性。方法:选取2016年6月—2018年11月在本院确诊的子宫内膜异位症合并不孕症患者137例作为病例组,选取同期体检137例健康女性作为对照组。采用聚合酶链式反应(PCR)检测DNMT3L基因多态性。采用直接基因计数法计算基因型和等位基因频率,使用Pearson拟合优度卡方统计量评估Hardy-Weinberg(HWE)平衡程度。使用Fisher's检验评估病例组和对照组等位基因和基因型频率的差异。结果:病例组与对照组基因型频率无HWE平衡差异,rs8129776和rs7354779基因多态性无差异(均P>0.05),而rs113593938和rs2276248基因多态性有差异(P<0.05)。在rs113593938多态性的显性和隐性遗传模型中,病例组相较于对照组的OR(95%CI)分别为0.37(0.18~0.79)和2.69(1.23~5.88),在rs2276248多态性的显性和隐性遗传模型中,病例组相较于对照组的OR(95%CI)分别为2.44(1.18~5.06)和0.34(0.15~0.81)。结论:DNMT3L rs8129776和rs7354779位点的基因多态性与子宫内膜异位症合并不孕无关,而rs113593938位点的隐性基因模型和rs2276248显性基因模型可能与子宫内膜异位症合并不孕有关。

支气管哮喘患儿CHI3L1基因多态性与糖皮质激素疗效的关系研究

目的探讨CHI3L1基因rs10399805、rs4950928、rs883125位点单核苷酸多态性与支气管哮喘患儿糖皮质激素治疗疗效的关系。方法选取2018年1月—2018年12月在萍乡市妇幼保健院儿科就诊的慢性中度持续期支气管哮喘患儿130例,均接受布地奈德吸入治疗,连续12周。另取同期在该院儿保科体检的健康儿童50例作为对照组。采用TaqMan-PCR反应检测CHI3L1基因rs10399805、rs4950928、rs883125位点单核苷酸多态性,以及肺功能。结果对照组与哮喘组CHI3L1基因rs10399805位点基因型分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。对照组rs4950928位点CC基因型分布频率高于哮喘组(P<0.05)。对照组rs883125位点GG基因型分布频率低于哮喘组(P<0.05)。130例患儿治疗后疗效良好90例(69.23%),疗效不良40例(30.77%)。疗效良好组与疗效不良组CHI3L1基因rs10399805位点基因型分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。疗效良好组rs4950928位点CC基因型分布频率高于疗效不良组(P<0.05)。疗效良好组rs883125位点GG基因型分布频率低于疗效不良组(P<0.05)。rs10399805位点TT型、CT型和CC型患儿治疗前后FEV1、FVC、FEV1/FVC的差值比较,经方差分析,差异无统计学意义(P>0.05)。rs4950928位点CC型、CG型和GG型患儿治疗前后FEV1、FVC、FEV1/FVC的差值比较,经方差分析,差异有统计学意义(P<0.05);CG型和GG型低于CC型(P<0.05),CG型低于GG型(P<0.05)。rs883125位点CC型、CG型和GG型患儿治疗前后FEV1、FVC、FEV1/FVC的差值比较,经方差分析,差异有统计学意义(P<0.05);CC型和CG型高于GG型(P<0.05)。结论在萍乡地区儿童中,CHI3L1基因rs4950928和rs883125位点基因多态性可能与哮喘易感性和糖皮质激素治疗效果有关。

核糖体蛋白L23在胶质母细胞瘤中的临床意义

目的探讨核糖体蛋白(RP)L23在胶质母细胞瘤(GBM)中的临床意义。方法以3个独立的GBM基因表达数据集GSE42669、GSE7696以及GSE4290为研究对象,分析RPL23基因在正常脑组织和GBM组织中表达的差异,RPL23基因与GBM患者无进展生存期以及总生存期的关系,并运用基因探针富集分析(GSEA)法进一步探讨RPL23基因对GBM细胞增殖的作用机制。结果 RPL23基因在GBM组织中的表达低于正常脑组织(P<0.0001),高表达RPL23基因的GBM患者无进展生存期(Log-rank P<0.0001,HR=5.347,95%CI:2.568~11.060)、总生存期(Log-rank P=0.0046,HR=3.372,95%CI:1.680~6.767)均优于RPL23低表达者。GSEA方法结果提示RPL23基因可能通过p53信号通路、IL6-JAK-STAT3信号通路、IL2-STAT5信号通路、KRAS信号通路、PI3K-AKTm TOR信号通路、细胞凋亡、WNT/β-Catenin信号通路以及NOTCH信号通路等生物学过程影响GBM细胞增殖。结论 RPL23可能是GBM患者独立的保护性因素,高表达RPL23基因的GBM患者临床预后更好。

ZmBK2L3在番茄果实中的特异表达及其功能研究

文章通过构建玉米BK2L3基因果实特异表达的过量表达载体,对转基因番茄果实进行研究,实现以基因工程手段延长番茄果实货架期的目的。利用逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)技术从玉米cDNA中扩增出ZmBK2L3基因全长,导入启动子为果实特异表达的TFM7植物表达载体pBI121上,经农杆菌介导转入野生型番茄中,获得转基因阳性植株。分别以野生型番茄和转基因番茄为材料,分析BK2L3在果实中的表达情况,观察绿熟期果实果皮细胞壁结构,测定红熟期果实的硬度、货架期和果皮纤维素质量比。结果表明:转基因番茄果实中BK2L3的表达量明显高于野生型果实。转基因番茄果实的硬度、果皮纤维素质量比和果皮厚度均比野生型有所提高,果实货架期明显增长。因此,BK2L3基因的过量表达与细胞壁代谢和货架期有关,可改良果实的品质。

DIS3基因在肿瘤中的研究进展

随着医学诊治技术的发展,较多的肿瘤将从基因层面进行分析。DIS3蛋白是一种保守的核糖核酸酶,作为外泌体的催化亚基在细胞核与细胞质RNA加工降解过程中起重要作用。研究显示DIS3基因的异常表达与多种肿瘤发生发展相关,在多发性骨髓瘤患者中检出DIS3基因突变的频率较高。DIS3基因及其功能蛋白的结构和生理作用相对清晰,但是DIS3基因突变与肿瘤的相关性还未探究清楚。本文将对DIS3的结构、分型、同系物DIS3L2和DIS3的部分生理功能,以及DIS3在肿瘤中的研究进展作一综述。

基因在食管鳞癌组织和血浆中的甲基化特征及临床意义

目的:将食管鳞癌组织和癌旁组织相对比,将食管鳞癌患者的血浆与正常人的血浆相对比,检测EPPB41L3的甲基化状态和频率,并结合患者的临床病理特征,分析EPPB41L3基因甲基化在食管鳞癌中的意义。方法:收集42例食管鳞癌组织标本和相对应的癌旁组织标本,同时收集42例食管鳞癌患者和50例正常人的血浆标本;应用甲基化特异性PCR(MSP)结合琼脂糖凝胶电泳检测EPB41L3在组织和血浆中的甲基化情况。结果:EPB41L3在肿瘤组织中的甲基化频率为59.5%,显著高于癌旁组织4.8%(P<0.001)。EPB41L3在肿瘤患者血浆中的甲基化频率为31.0%,在正常对照组的血浆中没有检测到甲基化。组织中的甲基化频率在肿瘤≥5 cm组和病理分期为T3组分别明显高于肿瘤<5 cm组和病理分期T1-T2组。血浆中的甲基化频率在病理分期N2组明显高于病理分期N0-N1组。结论:EPB41L3在食管鳞癌组织的甲基化频率高于癌旁组织,在食管鳞癌患者血浆中的甲基化频率显著高于正常人,且临床分期越晚的甲基化频率越高。

基因转换器决定卵子或精子

对日本稻米鱼所做的新的实验显示，foxl3基因有可能是决定一个生殖细胞究竟是变成卵子是精子的转换器。该发现可帮助研究人员更多地了解脊椎动物生殖细胞的最终性别在发育中是如何决定的。Toshiya Nishimura和同事证明，foxl3会给出一个分子暗示来阻止精子形成的启动；foxl3会在稻米鱼生殖器官内的生殖细胞中表达，但不会在生殖细胞周边的细胞中表达。

绵羊痘病毒E3L基因的克隆和表达及其结构分析

以绵羊痘病毒古浪株基因组DNA为模板,经PCR扩增,获得绵羊痘病毒E3L基因,将其克隆至pGEX4T-1表达载体,以大肠杆菌BL21(DE3)pLysS菌株为宿主菌进行了诱导表达。结果显示,重组菌可以表达出大小约为46ku的重组融合蛋白,表达的蛋白绝大部分以可溶形式存在于菌体中;表达产物经GST结合树脂纯化后可得到纯度较高的目的蛋白,经Western-blot分析,所纯化的蛋白能与绵羊痘病毒阳性血清进行特异的免疫印迹反应,证明表达的蛋白具有良好的反应原性。用纯化的蛋白免疫BALB/c小鼠获得鼠抗血清,经间接ELISA测定效价为1∶100 000。