LALBA基因SNP与内蒙古白绒山羊经济性状的关联

利用PCR-SSCP和DNA测序技术检测452份内蒙古白绒山羊α-乳白蛋白(LALBA)基因单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP与产绒量、绒厚、绒长和体重性状的关联。结果表明,仅P2引物位点存在SSCP多态,其外显子3区域存在1个突变位点:M63868:g.1897T>C。内蒙古白绒山羊群体LALBA基因M63868:g.1897位点以TT型为主,T等位基因频率为0.983,且处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。方差分析表明,LALBA基因M63868:g.1897位点多态仅与产绒量存在显著相关(P=0.017);1897位点TC基因型个体产绒量比TT基因型个体多产绒142.68g,高26.21%,且差异显著(P<0.05)。因此,TC基因型可作为山羊产绒性状标记辅助选择的有效DNA标记。

牛α-乳清蛋白基因5′调控区多态性研究

试验选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种α-乳清蛋白(alpha-lactalbumin,LALBA)基因5′调控区及第1外显子部分序列总长1126bp。结果表明,LALBA基因5′调控区存在5个SNPs位点:T-114C、C-166T、A-225C、C-344T、T-778C,T-114C仅在务川黑牛表现多态性。生物信息学软件预测LALBA基因核心启动子区及转录因子结合位点,SNP位点导致11个转录因子结合位点消失,其中1个位于核心启动子区,产生5个新的转录因子结合位点。突变前后RNA二级结构发生明显改变,目标序列未发现CpG岛。