泛癌分析LDHB基因在预测患者预后和免疫治疗反应中的应用

目的通过泛癌分析确定LDHB基因是预测肿瘤患者预后和免疫治疗反应的有价值的生物标志物。方法在癌症基因组图谱的镜像数据库中,下载33种肿瘤的转录组测序数据及对应患者的临床信息及肿瘤突变的数据,使用R软件进行统计分析,研究LDHB在33种肿瘤细胞中的表达量及其与正常细胞之间表达活性的差异,分析LDHB在泛癌中的预后价值,评估LDHB表达量与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性间的关系。结果在多种肿瘤组织中LDHB基因表达水平升高,且与不良预后密切相关。在特定的肿瘤组织中LDHB基因与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性具有明显相关性,在胸腺癌(THYM)中r=-0.7,P<0.001,在DLBC中r=0.4,P<0.01。结论LDHB可作为预测患者预后和免疫治疗反应的有价值的生物标志物。LDHB基因的测定有助于早期识别出肿瘤高危患者,及时制订个性化的预防和治疗方案,加强随访将有望改善疾病预后。同时,LDHB对于肿瘤免疫治疗的药物反应具有相关作用,可用于指导和监测免疫检查点抑制剂的选择和作用效果。

牦牛多条带型乳酸脱氢酶同工酶的H亚基由杂合型Ldhb基因编码

通过聚丙烯酰胺凝胶电泳在背最长肌匀浆液中检测到呈多条带型的乳酸脱氢酶(LDH)同工酶谱的麦洼牦牛个体,从此个体背最长肌中提取总RNA,采用RT-PCR方法克隆编码LDH的H亚基的Ldhb基因cDNA序列.序列比对分析结果为两种序列,分别对应GenBank中牦牛的Ldhb-F和Ldhb-S的基因序列,证实了这种LDH特殊带型是由Ldhb-F和Ldhb-S杂合型基因编码的.

LLC-PK1细胞中LDHB蛋白的体外表达及小RNA干扰

为了观察与猪流行性腹泻病毒(PEDV)NSP12互作蛋白乳酸脱氢酶B(LDHB)的体外表达情况和小RNA干扰效果,构建了真核表达载体pcDNA4.0-LDHB-3*Flag,并在Vero细胞中过表达LDHB,发现在37 kDa处有大小相符的明显条带。设计的2条小干扰RNA能降低LLC-PK1细胞中LDHB的mRNA和蛋白质水平,经one-way ANOVA检验证明干扰实验组2-ΔΔct的平均值显著低于对照组(P<0.05)。该结果为研究LDHB在PEDV感染LLC-PK1和Vero细胞过程中的作用提供了基础数据。

mTOR和LDHB在肝细胞癌组织中的表达及意义

目的探讨肝细胞癌组织中的mTOR、LDHB表达情况,分析其与临床病理特征的关系。方法利用免疫组化SP法和western blotting检测mTOR、LDHB在肝癌组织中的表达。结果肝癌中心癌组织mTOR、LDHB蛋白水平的表达明显高于癌旁正常组织(P<0.05);LDHB和mTOR在肝癌组织中表达呈正相关。结论肝细胞癌组织中mTOR、LDHB过度表达;mTOR的过度活化可能上调LDHB表达,而mTOR活化可能促使或激活LDHB的过表达而参与肝癌的发生发展。

人LDHB的原核表达及体外抑制剂筛选模型的建立

目的建立人乳酸脱氢酶B(LDHB)体外抑制剂筛选模型。方法用一对5'端分别带NdeⅠ、XhoⅠ位点的引物扩增LDHB cDNA。LDHB cDNA经NdeⅠ+XhoⅠ双酶切后与同样酶切的pET-28a质粒连接,连接产物转化大肠杆菌DH5α。将筛选的重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3),用0.2 mmol/L IPTG诱导LDHB表达,镍离子亲和层析柱纯化LDHB。以丙酮酸钠和NADH为底物,通过检测340 nm波长处光密度值的变化,确定LDHB及其抑制剂棉酚的最适浓度,并计算模型的Z因子。结果 LDHB的表达量为25 mg/L,LDHB、棉酚的最适浓度分别为22.5μg/L、10μmol/L,筛选模型的Z因子为0.91。结论建立了成本低、可靠性强、适合高通量的LDHB体外抑制剂筛选模型。

LDHB在肝细胞癌索拉非尼耐药中的作用及相关机制研究

目的 通过生物信息学分析研究索拉非尼(sorafenib)耐药及敏感的肝癌细胞间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测在肝细胞癌对索拉非尼耐药发生发展中的关键基因。方法 从GEO数据库中下载GSE26391基因数据(包含4个对索拉非尼敏感的肝癌细胞样本,4个对索拉非尼耐药的肝癌细胞样本)。利用Morpheus在线软件分析,筛选出差异表达基因。运用Human Protein Atlas数据库分析差异表达基因乳酸脱氢酶B(LDHB)在肝癌与正常肝组织中的蛋白表达水平。并进一根据LDHB在肝癌患者中的表达高低进行分组后行生存分析。利用在线数据库LinkedOmics分析肝癌中与LDHB表达相关的靶基因。结果 基因芯片GSE26391数据分析显示,相比于对索拉非尼敏感肝癌细胞,在索拉非尼耐药肝癌细胞中LDHB表达上调。Human Protein Atlas数据库分析显示,与正常肝组织相比,LDHB在肝细胞癌组织中表达上调。生存分析显示,LDHB高表达的肝癌患者预后相对较差。LinkedOmics数据库分析显示Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial等EMT相关关键蛋白与LDHB表达正相关。结论 LDHB通过上调Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial蛋白,可能促进EMT的发生,从而介导肝癌中索拉非尼的耐药。

MCT1和LDHB在荷乳腺癌小鼠髓系抑制性细胞中的表达及意义

目的比较正常小鼠和荷乳腺癌小鼠骨髓中髓系抑制性细胞(MDSCs)的含量,探讨其产生免疫抑制功能的可能机制。方法建立荷乳腺癌小鼠模型,利用BD FACSAriaⅢ流式分选仪分选正常小鼠组和荷乳腺癌小鼠组骨髓中的MDSCs(CD11b+Gr-1+),比较其含量;q-PCR法检测两组MDSCs中MCT1及LDHB的mRNA水平。结果荷乳腺癌小鼠骨髓中MDSCs的比例为(48.92±3.13)%高于正常小鼠(25.13±1.95)%,差异有统计学意义(P<0.001);荷乳腺癌小鼠MDSCs中MCT1的mRNA相对表达量(0.010±0.005)为正常小鼠(0.003±0.001)的3.33倍,差异有统计学意义(P<0.05);荷乳腺癌小鼠MDSCs中LDHB的mRNA相对表达量(0.008±0.002)为正常小鼠(0.004±0.001)的2.00倍,差异极显著(P<0.01)。结论 MDSCs在荷乳腺癌小鼠骨髓中的比例显著高于正常小鼠,其能量代谢关键分子MCT1、LDHB的表达也显著高于正常小鼠。MDSCs的能量代谢特点可能正是其发挥免疫抑制功能的重要基础。

LDHB调控PDK1/Akt/GSK3β信号通路促进脑胶质瘤细胞生长的研究

该研究旨在探讨乳酸脱氢酶B(lactate dehydrogenase B,LDHB)基因对胶质瘤细胞生长的影响。用sh-LDHB或sh-EGFP质粒转染胶质瘤细胞,q RT-PCR和Western blot分别检测m RNA和蛋白质水平,CCK-8法和克隆形成实验分析细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞周期和凋亡情况。结果表明,转染sh-LDHB质粒后,脑胶质瘤细胞中LDHB的m RNA和蛋白质水平显著降低。敲低LDHB基因后,脑胶质瘤细胞的增殖能力明显降低,出现细胞凋亡峰(sub-G1),细胞增殖相关基因c-Myc和Cylin D1表达水平降低,同时,PDK1、Akt和GSK3β的磷酸化水平降低。研究结果表明,LDHB基因可以通过激活PDK1/Akt/GSK3β信号通路促进脑胶质瘤细胞的生长。

肿瘤中乳酸脱氢酶B作用机制的研究进展

有氧糖酵解增加是肿瘤代谢重编程的主要特征。有氧糖酵解不仅为癌细胞提供能量而且为其生物合成提供必要的前体,这对促进肿瘤生长非常重要。癌细胞通过对糖酵解酶进行调节来满足其自身需求,糖酵解酶在促进肿瘤存活、转移、侵袭等方面发挥着积极作用。乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)作为有氧糖酵解的关键酶,由乳酸脱氢酶A(lactate dehydrogenase A,LDHA)和乳酸脱氢酶B(lactate dehydrogenase B,LDHB)两种亚基组成。LDHA被认为在有氧糖酵解过程中起着关键作用,并得到了广泛的研究,然而对于LDHB的研究却较少。但目前LDHB在各种肿瘤进展中的重要作用已被越来越多的报道,大量研究表明,LDHB在多种肿瘤中异常表达,与肿瘤恶性进展相关。本文从LDHB在肿瘤中的调控机制、与肿瘤发生发展的关系以及作为肿瘤诊断的生物标志物等方面综述了其近10年的研究进展,有助于深入了解该蛋白在肿瘤中的作用机制。

类乌齐牦牛乳酸脱氢酶基因克隆及组织表达

旨在克隆西藏类乌齐牦牛乳酸脱氢酶(LDHB)基因并检测其组织表达情况,为给进一步研究LDHB在高海拔地区的极端低氧适应性及能量代谢中的调控作用提供依据。结果表明,类乌齐牦牛LDHB基因CDS区全长1 004bp,编码334个氨基酸,存在2处碱基突变,导致密码子分别由AAG→GAG(赖氨酸→谷氨酸)、ATC→AGC(异亮氨酸→丝氨酸);编码蛋白分子质量为36.72ku,为疏水稳定性蛋白,功能预测在糖酵解及氧化还原等过程中发挥主要功能;系统进化树表明,西藏类乌齐牦牛与九龙牦牛、黄牛的氨基酸序列相似性最高,亲缘关系最近,其次为山羊、宽吻海豚、猪、马、羊驼和野生双峰骆驼,与鸡、乌鸦、非洲爪蟾和鲤鱼较远;定量分析显示,LDHB基因在牦牛肺脏中的表达水平显著高于心脏和肝脏,推测该基因与牦牛抗缺氧性状相关。

非小细胞肺癌中乳酸脱氢酶A/B的表达特点及其与肿瘤临床病理参数的关系

目的:探讨非小细胞肺癌中乳酸脱氢酶A/B(lactate dehydrogenase A/B,LDHA/LDHB)表达特征及其与肿瘤临床病理参数的关系。方法:从GEO、TCGA数据库获取非小细胞肺癌、肺腺癌、肺鳞癌基因表达数据及临床信息,通过非参数检验分析LDHA/LDHB在癌组织和正常肺组织的表达差异,通过Kaplan-Meier法和Log-rank test评估癌患者生存状况,采用chi-square test和Spearman's test分析LDHA/LDHB表达与临床特征及肿瘤恶性生物学标志物的关系。结果:LDHA/LDHB在非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞癌中均高表达。在肺腺癌中,高表达LDHA的病人具有更短的总生存期和无进展生存期,高表达LDHB的病人总生存期更短,LDHA与LDHB均高表达的患者总生存期和无进展生存期皆最短。在肺鳞癌中,LDHA/LDHB表达与生存期无关。在肺腺癌中,LDHA表达与淋巴结转移、肿瘤分期相关,LDHB表达与肿瘤分期相关。在肺鳞癌中,LDHA表达与临床特征关联均不明显,LDHB表达与年龄、淋巴结转移相关。在肺腺癌中,LDHA表达水平与PCNA、Ki67、CDH2正相关,与CDH1无关,而LDHB表达水平与PCNA、Ki67正相关,与CDH2负相关,与CDH1无关。结论:LDHA与LDHB表达和肺腺癌恶性程度相关,高表达LDHA与LDHB可能预示着较差的预后及临床特征。