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亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
王志龙
薛应红
+4 位作者
郝月茹
刘宝玲
苑丽霞
薛金爱
李润植
《作物杂志》
CAS
北大核心
2020年第5期23-32,共10页
对亚麻荠CsLEC2家族进行全基因组鉴定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,检测CsLEC2基因的时空表达特性并通过转录组数据预测CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2调控亚麻荠种子油脂合成和积累等生物学功能。结果表明,在亚麻荠基因组中共鉴定到3个亚麻...
对亚麻荠CsLEC2家族进行全基因组鉴定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,检测CsLEC2基因的时空表达特性并通过转录组数据预测CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2调控亚麻荠种子油脂合成和积累等生物学功能。结果表明,在亚麻荠基因组中共鉴定到3个亚麻荠CsLEC2基因(CsLEC2.1、CsLEC2.2和CsLEC2.3)。蛋白理化性质和高级结构分析显示,亚麻荠CsLEC2蛋白具有与拟南芥AtLEC2相似的理化性质,且其二级结构的主体也相似。系统进化分析表明,亚麻荠CsLEC2蛋白与模式植物拟南芥AtLEC2蛋白及拟南芥琴亚种AlLEC2蛋白亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示亚麻荠CsLEC2在未成熟的种子中高表达。转录组数据分析显示下游基因CsWRI1和CsOLE3高表达,推测CsLEC2可能直接上调CsWRI1和CsOLE3的转录表达,参与油脂代谢调控。
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关键词
亚麻荠
lec2基因家族
表达分析
油脂生物合成
原文传递
题名
亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
王志龙
薛应红
郝月茹
刘宝玲
苑丽霞
薛金爱
李润植
机构
山西农业大学分子农业与生物能源研究所
晋中学院生物科学与技术学院
出处
《作物杂志》
CAS
北大核心
2020年第5期23-32,共10页
基金
国家自然科学基金(31801400)
山西省重点研发项目(201703D221002-3)
+3 种基金
203省1331成果转化培育项目
晋中市科技重点研究项目(Y182009
31401430)
晋中市重点创新团队的“1331项目”(jzxycxtd2019009)。
文摘
对亚麻荠CsLEC2家族进行全基因组鉴定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,检测CsLEC2基因的时空表达特性并通过转录组数据预测CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2调控亚麻荠种子油脂合成和积累等生物学功能。结果表明,在亚麻荠基因组中共鉴定到3个亚麻荠CsLEC2基因(CsLEC2.1、CsLEC2.2和CsLEC2.3)。蛋白理化性质和高级结构分析显示,亚麻荠CsLEC2蛋白具有与拟南芥AtLEC2相似的理化性质,且其二级结构的主体也相似。系统进化分析表明,亚麻荠CsLEC2蛋白与模式植物拟南芥AtLEC2蛋白及拟南芥琴亚种AlLEC2蛋白亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示亚麻荠CsLEC2在未成熟的种子中高表达。转录组数据分析显示下游基因CsWRI1和CsOLE3高表达,推测CsLEC2可能直接上调CsWRI1和CsOLE3的转录表达,参与油脂代谢调控。
关键词
亚麻荠
lec2基因家族
表达分析
油脂生物合成
Keywords
Camelina sativa
lec
2
gene family
Expression analysis
Oil biosynthesis
分类号
S565.9 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析
王志龙
薛应红
郝月茹
刘宝玲
苑丽霞
薛金爱
李润植
《作物杂志》
CAS
北大核心
2020
0
原文传递
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