LINC00092介导谷氨酸的兴奋性毒性在肝性脑病中的作用机制

目的:探索LINC00092在肝性脑病(HE)的发生发展中的作用机制.方法:从基因表达数据库(GEO)下载芯片GSE57193的数据,并使用R-limma包筛选出HE组和健康对照组中的差异表达基因,接着利用R-clusterProfiler包对差异表达基因进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析.从miRcode数据库预测差异表达长链非编码RNA(LncRNA)靶向的miRNA,然后使用Targetscan、miRdb和miRTarBase预测miRNA靶向的mRNA,与差异表达mRNA取交集得到目标mRNA,Cytoscape用于构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络.通过RNA结合蛋白数据库预测LINC00092的结合蛋白,根据表达的相关性和RNA结合蛋白,提出LINC00092在肝性脑病中的机制假说.结果:从正常脑组织中筛选出HE的9个特异的LncRNA和728个特异的mRNA,其中LINC00092相对健康对照组在HE中特异性高表达.差异表达基因的KEGG富集分析显示它们主要集中在脂肪酸降解、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、矿物质的吸收、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解、β-丙氨酸新陈代谢、脂肪酸代谢通路上.结合ceRNA网络和LINC00092的结合蛋白,LINC00092在HE中可能存在3个调控路径:(1)LINC00092/hsa-miR206/GJA1轴介导谷氨酸的神经兴奋性毒性损伤;(2)LINC00092/hsa-miR184/LRRC8A轴介导星形胶质细胞的溶胀激活和ATP诱导的兴奋性氨基酸释放;(3)LINC00092-A2BP1轴介导的谷氨酸再摄取.结论:LINC00092在HE中特异性高表达,一方面通过半通道和体积调节阴离子通道介导谷氨酸的释放,同时使细胞内线粒体Ca2+超载而造成神经元功能障碍和细胞死亡,另一方面LINC00092-A2BP1轴介导的谷氨酸-谷氨酰胺循环障碍,导致谷氨酸的细胞外蓄积,两方面共同导致神经元的兴奋性毒性.

LINC00092对神经胶质瘤增殖、迁移和侵袭的影响

目的探究长链非编码RNA LINC00092对神经胶质瘤增殖、迁移和侵袭的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型-基因表达量关联数据库(GTEx),分析LINC00092在泛癌中的表达情况以及对神经胶质瘤预后的影响。另外,构建了LINC00092过表达质粒。通过细胞增殖实验、迁移实验(Transwell)和流式细胞术,检测LINC00092对神经胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。最后,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot检测过表达LINC00092对胰岛素样生长因子2结合蛋白1(IGF2BP1)表达水平的影响。结果公共数据库的分析显示LINC00092在肿瘤中普遍低表达,且LINC00092与多形成性胶质细胞瘤(GBM)和脑低级别胶质瘤(LGG)的预后存在相关性。体外实验表明过表达LINC00092显著降低了神经胶质瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,神经胶质瘤细胞的凋亡增加。过表达LINC00092减低了IGF2BP1的表达水平。结论LINC00092可能通过靶向IGF2BP1抑制神经胶质瘤的增殖、迁移和侵袭,促进神经胶质瘤细胞的凋亡。