LINC01614在结直肠癌中的表达及其生物学功能

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)LINC01614在结直肠癌中的表达及其生物学功能。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行结直肠癌中LINC01614的表达水平分析,并探究其与患者生存预后以及临床病理特征之间的关系。通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析(GSEA)探究LINC01614的在结直肠癌中的功能和参与的调控通路。通过CCK-8增殖实验、划痕实验和Transwell实验进一步探究LINC01614下调后对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。通过Western blot实验和qRT-PCR实验研究结直肠癌中LINC01614与上皮细胞-间充质转化(EMT)的关系。结果相比于癌旁组织,LINC01614在结直肠癌组织中的表达显著升高(P<0.05),并且LINC01614高表达患者生存率显著低于低表达患者(P<0.05)。LINC01614与结直肠癌患者TNM分期、T分期、N分期相关(P<0.05)。LINC01614可能通过上皮细胞-间充质转化(EMT)和Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)信号通路来促进癌症的恶性进展。下调LINC01614后,结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力都明显降低。下调LINC01614的表达后,E-cadherin的表达上调,N-cadherin、Vimentin和Snail的表达均下调。结论LINC01614在结直肠癌中高表达,且与结直肠癌患者预后与临床病理特征相关。LINC01614可以促进结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭,这可能是通过影响转录因子Snail的活性来调节EMT导致的。

LINC01614对非小细胞肺癌A549细胞增殖、侵袭、细胞周期以及凋亡的影响

目的研究LINC01614对非小细胞肺癌A549细胞增殖、侵袭、细胞周期以及凋亡的影响。方法(1)生物信息学分析LINC01614的表达对生存期以及临床病理特征的影响。(2)qRT-PCR法检测LINC01614在A549细胞与人肺上皮细胞BEAS-2B的表达。(3)脂质体转染法向A549细胞中转染LINC01614小干扰RNA(si-LINC01614)。(4)CCK实验与长时间动态活细胞成像仪(IncuCyte S3)检测LINC01614对细胞增殖的影响。(5)Transwell实验检测LINC01614对细胞侵袭的影响。(6)流式细胞术检测LINC01614对细胞周期以及凋亡的影响。结果(1)生物信息学分析显示,与正常组织相比,LINC01614在非小细胞肺癌组织中的表达显著上调(P<0.05);其高表达与远处转移、肿瘤分期相关(P<0.05)。(2)与BEAS-2B细胞相比,LINC01614在A549细胞上的表达显著上调(P<0.05)。(3)沉默LINC01614可抑制A549细胞的增殖、侵袭以及凋亡,使细胞的G0/G1期延长,S期缩短(P<0.05)。结论LINC01614可促进非小细胞肺癌A549细胞的增殖、侵袭以及凋亡。

LINC01614在胃癌中的表达及利用生物信息学分析其临床意义

目的:阐明LINC01614在胃癌组织中的表达及利用生物信息学分析其在胃癌中潜在的价值。方法:通过qRT-PCR在胃癌组织和细胞中分析LINC01614的表达情况。通过TCGA和GEO数据库分析、验证LINC01614在配对的胃癌组织及癌旁组织中表达。通过TCGA数据库中患者的临床资料,联合分析LINC01614表达和临床病理特征和预后的关系。通过生物信息学分析,预测LINC01614潜在靶基因的通路富集,分析其可能的生物学功能。结果:qRT-PCR显示LINC01614在胃癌组织和配对的癌旁组织、人胃癌细胞株和人正常胃上皮细胞株中存在差异表达(P<0.05)。生物信息学分析显示LINC01614在胃癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.005)。LINC01614高、低表达与组织学分级、残余癌灶相关(P<0.05)。根据生存分析结果,LINC01614高表达组患者总生存期短(HR=1.520,95%CI:1.094~2.110)。通路富集结果显示,LINC01614可能参与多条癌症相关通路。结论:LINC01614在胃癌组织中高表达,并与胃癌预后相关,可作为潜在的胃癌标志物。

LINC01614对肺癌A549细胞的转录组影响以及耐药相关性的研究

目的研究LINC01614在非小细胞肺癌A549细胞中的生物学作用及其耐药相关机制。方法采用CRISPR/Cas9技术构建敲除LINC01614的A549细胞模型。对敲除LINC01614的A549细胞进行转录组测序。对转录组差异基因MCAM和ABCC3进行基因水平的验证。对化疗耐药相关基因MCAM进行蛋白水平的验证。检测不同浓度顺铂作用下,敲除LINC01614后的A549细胞IC50变化。检测敲除LINC01614对A549细胞迁移能力的影响。结果差异基因表达分析结果显示,敲除LINC01614后,共得到2713个DEGs,其中上调基因1626个,下调基因1087个。GO分析结果显示,DEGs与细胞内信号转导、细胞黏附等有关。KEGG分析结果显示,DEGs与Wn t信号通路、TGF-β信号通路以及Rap1信号转导途径等有关。从DEGs中选择耐药相关基因ABCC3与MCAM进行验证,qRT-PCR结果显示,敲除LINC01614后,MCAM在A549细胞上的表达显著下调(P<0.05),ABCC3在A549细胞上的表达显著上调(P<0.05)。敲除LINC01614后,A549细胞中化疗耐药相关基因MCAM的蛋白表达量显著下降(P<0.05);A549细胞对顺铂的IC50显著上升(P<0.05);A549细胞的划痕愈合率显著降低(P<0.05)。结论LINC01614可能与A549细胞的增殖、侵袭以及凋亡通路有关。LINC01614可能通过MCAM来发挥其自身的迁移能力以及对顺铂的化疗耐药性。

LINC01614 expression in gastric cancer and its prognostic value based on bioinformatics analyses

Objective:To identify the potential role and prognostic value of LINC01614 in gastric cancer. Methods: qRT-PCR was applied to analyze the LINC01614 expression in gastric cancer tissue and paired adjacent normal tissue, and gastric cell line. And the RNA-Seq data downloaded from the TCGA and GEO database was employed to analyze and validate the LINC01614 expression in gastric cancer tissue and adjacent normal tissue. And the analyses of relationship between LINC01614 expression level and clinical features was done to clarify the role of LINC01614 in gastric cancer. The survival analysis was used to identify the prognostic value of LINC01614. And the pathways that LINC01614 may enroll was predicted.Results: The qRT-PCR showed that LINC01614 was increased in gastric cancer tissue and gastric cancer cell line (P < 0.005). And the expression of LINC01614 was significantly different in cancer tissue and adjacent normal tissue according to datasets analyses (P < 0.001). And it was found that LINC01614 expression was significantly correlated with histologic grade and residual tumor (P = 0.0177 and 0.0218, respectively). Survival analysis indicated that low expression of LINC01614 patients have longer overall survival than high expression one (HR = 1.520, 95% CI: 1.094 ~ 2.110). After all, enriched pathways showed that LINC01614 may act in carcinogenesis through various pathways.Conclusions: LINC01614 is high expressed in gastric cancer and high expression of LINC01614 is related to poor prognosis. LINC01614 may be a potential prognostic biomarker for gastric cancer.

长链非编码RNA LINC01614在恶性肿瘤中作用的研究进展

长链非编码RNA在恶性肿瘤组织中差异表达已被大量研究证实。长链非编码RNA LINC01614在多种恶性肿瘤组织中均呈高表达,且与肿瘤患者的临床病理指标密切相关,并通过多种机制影响肿瘤的发生与发展,其被认为可能具有作为诊断或判断肿瘤预后生物标志物以及有效治疗靶点的潜力。该文对LINC01614在恶性肿瘤中的作用及其机制进行综述。

非小细胞肺癌患者癌组织中长链非编码RNA LINC01614表达及临床意义

目的探讨非小细胞肺癌患者癌组织中长链非编码RNA LINC01614表达及临床意义。方法选取2016年1月至2017年12月在鞍钢集团总医院行手术切除的75例原发性NSCLC患者癌组织为研究对象,并选取相对应癌旁组织(距肿瘤边缘>5 cm)作为对照,回顾性分析NSCLC相关lncRNA的表达,用实时荧光RT-PCR法检测组织中LINC01614水平,分析LINC01614的表达与NSCLC患者临床病理特征的相关性,绘制受试者工作特征曲线确定LINC01614诊断NSCLC的效能参数;采用Kaplan-Meier曲线进行生存分析。结果对16个样本进行lncRNA微阵列分析(癌组织和癌旁组织各8个),NSCLC患者中发现3261个lncRNA表达水平显著不同,其中1205个表达上调,2056个表达下调。同时,LINC01614为最紊乱的lncRNA,在癌组织中表达上调,是癌旁组织的22.92倍。TNM分期越高、组织分化程度越低、发生淋巴结转移患者,LINC01614相对表达量越高。曲线下面积为0.788(95%CI:0.710~0.821),其诊断敏感度为58.62%,特异度为87.24%;以LINC01614相对表达量26.14作为截断值,将NSCLC患者分为高表达组(26例)和低表达组(49例),高表达组和低表达组的总生存期分别为22.2个月(95%CI:20.1~34.6)和38.5个月(95%CI:25.3~45.5),高表达组的生存时间明显低于低表达组(Z=10.248,P<0.05)。多元COX比例风险逐步回归分析显示LINC01614高表达为非小细胞肺癌患者预后的独立危险因素(HR=2.25,95%CI:1.30~3.90)。结论LINC01614在NSCLC组织中高表达,并与NSCLC的恶性程度有关,可能对NSCLC的预后判断具有一定的指导意义。

LINC01614通过miR-34a/Notch2轴促进胃癌发展机制的研究

目的检测LINC01614在胃癌组织中的表达水平,研究其通过miR-34a/Notch2轴促进胃癌发展的机制。方法构建含有LINC01614荧光素酶质粒的胃癌细胞株,采用qRT-PCR方法检测胃癌组织及细胞株中LINC01614及miR-34a的表达水平;采用荧光素酶报告试验及RIP试验,研究LINC01614对miR-34a的结合作用;采用qRT-PCR方法检测胃癌组织及细胞株中LINC01614及miR-34a的表达水平;采用荧光素酶报告试验及RIP试验,研究LINC01614与miR-34a的相互作用关系;采用qRT-PCR、荧光素酶报告试验及RIP试验,研究LINC01614与miR-34a/Notch2通路间的关系,研究LINC01614参与调控胃癌进展的分子机制。结果LINC01614在胃癌组织及细胞株中表达上调(P<0.01)。MiR-34a在胃癌组织中表达下调,与LINC01614的表达水平呈负相关(P<0.05)。Notch2在胃癌组织中表达上调,与miR-34a的表达水平呈负相关,与LINC01614的表达水平呈正相关(P<0.05)。结论LINC01614在胃癌组织中通过竞争性结合miR-34a抑制其表达,促进Notch2的表达,最终促进胃癌发展。