基于网络药理学探讨益气化痰活血方治疗冠心病的机制

目的运用网络药理学研究方法探讨益气化痰活血方治疗冠心病的作用机制。方法在中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选益气化痰活血方的成分和靶点;并通过相关数据库检索冠心病相关靶点;通过韦恩图得到益气化痰活血方和冠心病的共同靶点,然后利用STRING网站进行化合物-疾病共同靶点蛋白互作分析;利用David数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,采用Cytoscape3.82软件构建药物-成分-作用靶点-通路-疾病的网络模型。结果通过筛选得到益气化痰活血方的潜在主要活性成分154个,涉及71个疾病作用靶点,主要活性化合物为柚皮素、槲皮素、川陈皮素、山奈酚等,调节机制与脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素17(IL-17)信号通路、细胞凋亡、流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路有关,从而发挥治疗冠心病的作用。结论益气化痰活血方治疗冠心病是多成分、多靶点、多途径相互作用的结果,为益气化痰活血方的基础或临床研究提供一定的理论依据。

基于网络药理学研究清热化痰通腑方治疗缺血性脑卒中的机制

目的:基于网络药理学与动物实验验证探讨清热化痰通腑方(HTF)治疗缺血性脑卒中(IS)的潜在作用机制。方法:通过TCMSP、BATMAN筛选HTF的活性成分,预测活性成分的潜在靶点;GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank筛选疾病相关靶点;String数据库获得蛋白互作关系;Metascape对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。构建动物模型进行实验验证,采用神经功能评分、2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)染色、苏木精—伊红(HE)染色、尼氏(Nissl)染色、脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法(TUNEL)染色以及免疫组化等方法验证网络药理学富集结果。结果:通过网络药理学分析,预测到主要的活性成分为芹菜素、槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等;作用于丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、转化相关蛋白53(TP53)等潜在靶点,涉及到的关键通路有脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号传导途径等。实验结果显示HTF能显著降低脑缺血再灌注大鼠神经功能评分与脑梗死率(P<0.05),能提高神经元存活率(P<0.05),显著降低细胞凋亡率(P<0.05)。结论:基于网络药理学与动物实验验证,发现HTF通过多成分作用于多靶点,从抗炎、抗凋亡等多种途径发挥治疗IS的作用。

基于网络药理学探讨清热散结化痰方治疗亚急性甲状腺炎的分子机制

目的:基于网络药理学研究清热散结化痰方治疗亚急性甲状腺炎(SAT)的分子机制。方法:采用TCMSP、HIT 2.0数据库获取清热散结化痰方各中药的主要化学成分并筛选其活性成分,通过GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库获取SAT主要治疗靶点,采用String蛋白互作平台进行蛋白质间相互作用分析。采用Cytoscape 3.7.2软件构建“清热散结化痰方活性成分-SAT靶点-通路”网络,在微生信平台进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KECG)通路富集分析,通过分子对接验证有效成分与靶蛋白结合。结果:清热散结化痰方治疗SAT的有效活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚等,核心靶点有丝氨酸/苏氨酸激酶1、表皮生长因子受体、非受体酪氨酸激酶、信号转导子和转录激活子3、雌激素受体1、基质金属肽酶9等。清热散结化痰方治疗SAT的生物通路主要有氮代谢、类固醇激素生物合成、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、化学致癌-活性氧、卵巢类固醇生成、癌症中的蛋白聚糖等。结论:本研究初步揭示了清热散结化痰方通过多成分、多靶点、多通路治疗SAT的分子作用机制,为清热散结化痰方治疗SAT提供了理论依据。

理脾降浊方治疗2型糖尿病的网络药理学和蛋白质组学研究

目的:研究理脾降浊方(LPJZF)治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在分子机制。方法:首先,基于网络药理学筛选出LPJZF中的活性成分和作用靶点,通过基因表达综合数据库筛选出与T2DM相关的差异表达基因,并运用蛋白质-蛋白质相互作用、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析LPJZF在治疗T2DM中的作用靶点和通路。其次,用LPJZF对T2DM大鼠进行干预,采用蛋白质组学鉴定差异蛋白,然后用KEGG和GO分析探究LPJZF干预T2DM的潜在机制。最后,运用分子对接技术评估T2DM潜在靶点与LPJZF活性成分之间的结合亲和力。结果:网络药理学分析共筛选出LPJZF干预T2DM的63个有效成分和135个靶点;蛋白质组学共鉴定出LPJZF干预T2DM的964个差异表达蛋白,以及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、核因子κB和叉头框蛋白O(FoxO)等4条关键通路;分子对接结果显示,T2DM相关蛋白细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤蛋白P53(TP53)、热休克蛋白90 kDa αA类成员1(HSP90AA1)和小鼠双微体2(MDM2)与LPJZF中的黄芩素、芒柄花黄素、山柰酚、汉黄芩素、β-谷甾醇和豆甾醇具有良好的亲和力。结论:LPTZF能有效改善胰岛素抵抗,促进胰腺B细胞再生,是治疗T2DM的有效方剂。

基于网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方对肺癌的作用机制

运用网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方治疗肺癌的分子机制.通过TCMSP、化学专业数据库收集健脾益肾化痰方的活性成分,并通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点,Gene Cards、Gene、CTD数据库收集肺癌相关靶点,将肺癌相关靶点与健脾益肾化痰方活性成分靶点取交集即为健脾益肾化痰方治疗肺癌的潜在靶点.利用Cytoscape软件构建健脾益肾化痰方干预肺癌的中药复方网络图、STRING数据库构建潜在靶点的蛋白质互作网络、Cytoscape进行可视化、Metascape数据库对健脾益肾化痰方抗肺癌的潜在靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析.选取Degree排名前6位的活性成分与靶点分别运用AutoDockTools进行分子对接及可视化.结果筛选到111个健脾益肾化痰方相关活性成分,涉及966个靶点,其中与肺癌相关的靶点有373个.健脾益肾化痰方可能通过β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等核心成分,作用于SRC、MAPK1、ATK1等核心靶点,干预肺癌中肿瘤通路、PI3K-AKT信号通路和肿瘤中的蛋白聚糖等信号通路,参与了细胞迁移的正调控、细胞运动的正调节、细胞成分运动的正调节等生物过程以干预肺癌.表明健脾益肾化痰方可能通过多靶标、多途径干预肺癌.其核心成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等.为进一步研究健脾益肾化痰方防治肺癌的机制提供理论支持.

理脾化痰方对食饵性动脉粥样硬化症家兔血管平滑肌细胞增殖和凋亡的调控

【目的】探讨由法半夏、白术、天麻、橘红、丹参等组成的理脾化痰方抗早期动脉粥样硬化症(atherosclerosis,AS)的可能性和作用机制。【方法】通过组织形态学 (包括光镜和电镜 )、免疫组化和TUNEL等方法观察了该方对食饵性动脉粥样硬化症家兔脂纹脂斑期主动脉内膜形态和相对厚度、血管平滑肌细胞 (vascularsmoothmusclecells ,VSMCs)ki- 6 7和凋亡细胞阳性率的影响。【结果】理脾化痰方确能阻抑早期AS的形成 ,观察组主动脉内膜相对厚度小于模型组 (P <0 .0 5) ,VSMCski- 6 7的表达率和凋亡的VSMCs阳性率均低于模型组 (P <0 .0 5)。【结论】该方抗早期AS的机制与其同时抑制VSMCs的增殖和过高水平的凋亡有关。

基于网络药理学研究化痰祛瘀方对自发性高血压大鼠早期肾损害的作用机制

目的基于网络药理学探索化痰祛瘀方对自发性高血压大鼠早期肾损害保护的作用机制。方法采用网络药理学的理论框架,中药活性成分筛选、潜在靶点预测、通络富集分析等方法对化痰祛瘀方治疗高血压早期肾损害的作用机制进行分析。试验验证:50只自发性高血压大鼠(SHR)随机分为,模型组、化痰祛瘀方组、氯沙坦钾组、中西医结合组、化痰祛瘀方+NOS抑制剂组,另外取10只正常血压大鼠(Wistar-kyoto,WKY)作为对照组,灌胃治疗4周,观察各组早期肾损害相关指标及肾组织一氧化氮合成的限速酶(NOS)及NO的变化。结果(1)化痰祛瘀方中8味中药具有较好ADME性质的潜在主要活性成分共100个,其中86个活性成分及对应的58个靶点与高血压肾损害关系密切,可能通过cGMP-PKG信号通络、PI3K-Ak信号通络、MAPK信号通络、VEGF信号通络、NF-kappa B信号通络、Renin-angiotensin系统等途径治疗高血压肾损害。(2)化痰祛瘀方组、氯沙坦钾组及中西医结合组均能减轻SHR的早期肾损害,但中西医结合组更加明显(P<0.05),其余各组作用不明显(P>0.05)。(3)氯沙坦钾组及中西医结合组能升高SHR肾组织NO浓度及增强NOS活性(P<0.05),但氯沙坦钾组及化痰祛瘀方+NOS抑制剂组无此作用(P>0.05)。结论化痰祛瘀方通过保护血管内皮功能以改善SHR的早期肾损害。

清金化痰汤治疗支气管扩张症的作用机制

目的:采用网络药理学研究方法探究清金化痰汤治疗支气管扩张症的作用机制。方法:通过数据库及相关文献获取清金化痰汤化学成分,利用胃肠道吸收利用度及类药性等方面筛选活性成分并预测靶点,与检索出的支气管扩张症致病基因取交集获得共同靶点。分析“复方-成分-疾病-靶点”相互作用关系,得核心成分。对共同靶点实现PPI分析、GO及KEGG富集分析,得出核心靶点。最后进行虚拟分子对接,验证亲和力。结果:清金化痰汤含484个活性成分,1140个药物活性靶点,支气管扩张症含靶点1348个,二者有210个共同靶点。GO富集结果为炎症细胞间的黏附、免疫细胞分化与激活、蛋白质特异性结合等。富集通路结果显示,晚期糖基化终产物及其受体AGE-RAGE信号通路、Th17细胞分化、缺氧诱导因子-1信号通路、NF-κB信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等很关键。结论:清金化痰汤可通过减少粘液分泌、拮抗炎症反应、提高机体免疫力、延缓气道重塑等方面,多成分、多靶点、多通路治疗支气管扩张。