纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1的筛选及基因组测序

纤维素作为一种资源丰富的天然聚合物,可被微生物降解为可溶性糖,因此筛选高效纤维素降解菌备受关注。本研究利用CMC选择培养基筛选出一株纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1,采用三代Pacbio Sequl和二代Illumina Novaseq平台进行基因组测序,并采用DNS法测定其纤维素酶活。R.ornithinolytica LL1基因组大小为5584354 bp,包含5512个基因,其中NR、Swiss-Prot、Pfam、COG、GO、KEGG和CAZyme数据库中分别注释有5511、4419、4584、4745、3610、3336和128个基因,同时基因组注释有大量木质纤维素降解相关基因。R.ornithinolytica LL1具有较高的纤维素酶活性,其中β-葡萄糖苷酶活性最高,其次是内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶活性最低。本研究通过基因组测序及酶活测定揭示了R.ornithinolytica LL1降解纤维素的能力,为其降解纤维素及进一步纤维素转化奠定了基础。

STAT3抑制剂LL1增强结直肠癌对5-FU的敏感性

目的研究新型小分子STAT3抑制剂LL1对结直肠癌细胞对5-FU敏感性的影响,并初步探讨其机制。方法不同浓度LL1(0,2,4μmol/L)处理结直肠癌HT-29细胞24 h,使用RT-PCR法检测各组细胞c-Myc、Survivin和Bcl-2 mRNA表达水平。CCK-8法检测不同浓度的LL1(0,1,2,4,6,8μmol/L)、5-FU(0.1,1,10,100,1000μmol/L)以及5-FU(0.1,1,10,100,1000μmol/L)+LL1(2μmol/L)联用后结直肠癌HT-29细胞的存活率并比较组间存活率差异性。集落克隆实验检测空白对照组、0.8μmol/L 5-FU组(低浓度5-FU组)和0.8μmol/L 5-FU+0.1μmol/L LL1组(低浓度联用组)细胞集落形成能力。流式细胞仪检测空白对照组、1μmol/L 5-FU+2μmol/L LL1组(高浓度联用组)和1μmol/L 5-FU组(高浓度5-FU组)细胞凋亡。Western blot法检测空白对照组,1μmol/L 5-FU+2μmol/L LL1组与1μmol/L 5-FU组STAT3及下游蛋白c-Myc、Survivin和Bcl-2表达情况。结果与0μmol/L组相比较,2,4μmol/L LL1组HT-29细胞中c-Myc、Survivin和Bcl-2 mRNA表达水平显著下降(P<0.05)。LL1可抑制结直肠癌HT-29细胞增殖。与相应浓度5-FU组相比,5-FU+LL1联用组结直肠癌HT-29细胞存活率明显降低(P<0.05)。与空白对照组相比,低浓度联用组和低浓度5-FU组集落数均显著减少(P<0.05),且低浓度联用组集落数小于低浓度5-FU组(P<0.05)。与空白对照组相比,高浓度联用组和高浓度5-FU组细胞凋亡率均显著增加(P<0.05),且高浓度联用组凋亡率大于高浓度5-FU组(P<0.05)。与高浓度5-FU组相比,高浓度联用组p-STAT3及下游蛋白c-Myc、Survivin和Bcl-2表达水平显著下降(P<0.05)。结论LL1增强结直肠癌HT-29细胞对5-FU敏感性,其可能机制是抑制STAT3基因活化并影响下游基因表达。

一种基于LL1文法实现的解释器

随着计算机技术的快速发展,越来越多的编程语言出现在了大众的视野中。设计一门新的编程语言,最重要的工作就是实现其对应的编译系统。文章基于LL1文法设计并实现了一款解释器。LL1文法是一种上下文无关的简单文法,使用该文法可以简化解释器的实现过程。解释器主要由前端和后端两大部分组成,前端主要包括词法分析和语法分析,后端主要包括解释执行器和符号表。前端通过词法分析和语法分析将用户的源程序转换成抽象语法树,后端将遍历抽象语法树完成类型检查、符号表的建立以及用户程序的执行。

湘西莲花洞石笋TIMS-U系年龄校正研究

能够利用TIMS-U系方法精确定年,是石笋应用于古环境重建的重要优势。但石笋实际测定的TIMS-U系年龄往往出现与石笋自然生长规律不符合的异常序列,从而限制了大批石笋的进一步研究。以湘西龙山莲花洞LL1石笋为例,发现并从地球化学的角度解释了文石向方解石转化,以及方解石次生结晶加大的结构构造转变过程中,石笋具有238U、230Th含量明显减小,石笋测定年龄比实际年龄偏小的趋势。并在排除污染等条件下,以230Th/238U为校正指标,假设其损失率分别为1%、10%、50%,对LL1进行TIMS-U系法测年结果校正。结果发现,230Th/238U损失的百分数与年龄偏小的百分数相差不多,且相同230Th/238U损失比例下,石笋年龄越老,实测年龄比实际年龄却偏年轻。该研究为今后校正石笋异常年龄序列,建立石笋正常、准确年龄时标提供了思路。

基于LL(1)文法的印刷体数学公式结构分析方法

当前的OCR(optica l character recogn ition)系统对手写、打印文本都有很高的识别率,但是缺少对数学公式的结构进行分析及重组的功能.为此,将程序设计语言编译程序的基本设计方法用于数学公式的结构分析.重点介绍了上下标的定位、基于LL(1)文法的表达式构成规则和公式结构分析器的设计,并简略介绍了基于神经网络的数学符号识别方法.对于印刷体科学文献中的数学表达式,先通过预处理和分类过程识别每一个数学符号,得到按左边界排序的一串字符.然后通过结构分析器,进行上下标的定位以及前后关系的确定.最后把结构分析器生成的语法树转换成可编辑的L aT ex格式.实例证明得到了比较满意的结果.

LL(1)文法句法分析程序自动生成的研究及实现

文中分析了对LL(1)文法采用递归子程序的方法进行句法分析的特点 ,讨论了递归子程序自动生成的一般规则 ,最后根据这些规则给出了递归子程序自动生成的算法及其实现。

用递归下降方法实现自底向上的语法分析

针对LR(1)语法分析方法的分析能力较强,但其语法分析器的状态数太多,很难被应用的问题,提出了改进的LR(1)语法分析方法——RDLR(1)(RecursiveDescentLR(1))语法分析方法,同时给出了将LR(1)文法等价变换成RDLR(1)文法的一般方法。结果表明,该文法对语言的识别能力与LR(1)文法相同,比LALR(1)文法强;但其语法分析器的状态数却比LR(1)语法分析器的少,与LALR(1)语法分析器的状态数相当。

一种基于图形可视化的编译原理计算机辅助教学系统

编译原理的很多算法,由于复杂抽象,学习者较难掌握,目前常用的FLEX、YACC等系统由于界面不友好等原因,难以普及应用。针对编译原理算法的特征提出了一种新的编译原理CAI系统的架构,该架构具有图形可视和高可扩展性的优点。以LL(1)语法分析为例,对本架构的界面层、算法逻辑层、数据模型层之间的接口关系和逻辑调用关系进行了说明,并基于数值表达式进行了实验,结果表明本架构具有高可扩展性,可以实现定制化的编译原理CAI系统。

基于多线程LL(1)分析表自动生成的并行算法

为解决编译系统工作中由于文法非终结符数量庞大造成的生成LL(1)分析表速度缓慢的问题,描述了多处理机环境下的LL(1)分析表自动生成的一种并行处理方法,并讨论了LL(1)分析表生成的并行算法的设计思想和实现策略。在采用LL(1)方法实现自顶向下语法分析的并行编译中,LL(1)分析表的生成一直处于关键地位,由于文法中的终结符和非终结符个数很多,分析表的构造成为提高语法分析速度的瓶颈问题,因此考虑采用LL(1)分析表的并行生成。算法采用多线程的工作模式,并借助于线程间的通讯机制实现,此并行处理方法对编译的并行处理和提高效率有理论和现实意义。

LL(1)文法及分析表的自动构造

本文主要讨论了LL(1)文法以及LL(1)分析表的自动构造。LL(1)分析法适用范围较LR分析法为小,但该方法系统开销小,故可用于小型编译程序或命令解释执行系统的语法分析。论文中的相关软件除可用于教学演示外,还可用于实际编译程序LL(1)分析表的自动构造。

《程序设计语言编译原理》教改探讨

说明了编译原理课程改革的原因、办法和意义,详细介绍了改革的具体办法,以期能用于实践,达到培养本科学生计算机综合应用的能力和科研思维方法。

非LL(1)文法的一种改写方法

本文根据LL(1)文法的特点,运用等价替换的思想,结合两种代入法,提出了改写非LL(1)的4条规则,由这4条规则构成的改写方法的能力优于目前其它方法。

案例驱动法在编译原理课程教学中的应用

编译原理课程是计算机相关专业的一门重要专业课,抽象性、理论性强,在多年的教学基础上,以LL(1)文法的判定为例,提出将案例驱动法引入教学过程中,从而不仅让学生掌握学习编译原理的方法,而且也可以对学生逻辑思考能力进行培养。

程序理解中LL(1)抽象文法的设计与实现

采用自顶向下的LL(1)语法分析技术,设计一个程序静态分析器,对源文法进行高级概念化抽象。可以从不同层次不同方面来得到源程序的设计意图,实现语言平台的无关性。系统不仅优于传统的分析工具,而且具有良好的通用性。

基于数据库的通用预测分析法的设计与实现

简要叙述了预测分析法的基本原理,并阐述如何利用数据库存储预测分析表,使得用户可以通过web界面输入任何文法的LL(1)分析表,并保存在数据库中。通过统一的预测分析程序对句子进行解析,从而完成语法分析工作。

高效扩增式LL语法分析表的构造方法

扩增式LL语法分析的效率能极大地影响扩增式编译和解释环境的成功,而生成一个高效的扩增式LL语法分析,首先需要构建一个附加距离入口的扩增式LL预测分析表。在文中构建出了一个高效的表构造算法,并通过实例详细分析了该算法的有效性。

上下文无关文法最左推导的C语言实现

本文介绍了编译程序语法分析中使用的上下文无关文法及最左推导的相关概念,并对如何应用递归下降法来实现上下文无关文法的最左推导进行了详细的阐述。文中主要以简单算术表达式的上下文无关文法为例阐述实现的算法。

LL(1)预测分析器的构造

着重分析了编译原理课程中的LL(1)预测分析器的设计算法。对于给定的代码,求出FIRST、FOLLOW和SELECT集,构造相应的LL(1)预测分析器,给出预测分析表,并对求解FIRST集和FOLLOW集中存在的环问题提出了解决算法。

基于LL(1)分析表的布尔文法语法分析算法

布尔文法是针对特定的形式语言提出的一种新的描述形式,文法以上下文无关文法为基础,在形式规则中加入集合论的相关运算。传统的LL算法只能处理上下文无关文法,通过对布尔文法深入的分析,提出了一种基于LL(1)分析表的布尔文法的语法分析算法。通过实例详细描述了算法处理的过程,验证算法的可行性和正确性。

基于语料库的Will和Shall变化分析研究

帮助或协助主要动词构成谓语动词词组的词被称为助动词。助动词经常放在形容词或动词的前面,用来表示愿望、可能、应该、必须等,它属于动词的一种。本文就基于语料库检索的方法来分析研究will和shall的应用变化,也借此为英语教学提供一些可供参考的建议。