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Laser Capture Microdissection Combined with RNA in vitro Linear Amplification Detecting the Relevant Genes of Bladder Cancer
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作者 郝权 徐勇 +2 位作者 李文录 赵小鸽 刘文欣 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2005年第5期309-313,327,共6页
Objective: Laser capture microdisection has become indispensable to the analysis of the difference of gene expression between human bladder transitional cell and bladder transitional cell carcinoma (BTCC). However,... Objective: Laser capture microdisection has become indispensable to the analysis of the difference of gene expression between human bladder transitional cell and bladder transitional cell carcinoma (BTCC). However, to obtain sufficient RNA from laser-capture microdissected cells is quite difficult. The study was designed to determinc a feasible technical routine to isolate transitional cells from bladder membrane, separate carcinoma cclls from stromal cells and to amplify the RNA isolated from laser-capture microdissected cells. Methods: Bladder transitional cell were obtained from frozen sections of bladder membrane applying LCM, by the same token, BTCC cells from frozen sections of BTCC tissue. Then RNA was extracted and linearly amplified in vitro. The expression levels of β-actin in primary total RNA and amplified RNA were detected using RT-PCR. Results: That RNA integrity was good after LCM was confirmed by control experiment Ⅰ; By control experiment Ⅱ, the correlation between the number of LCM-shooting and RNA quantity undcr arranged conditions was preliminarily confirmed. About 0.5-2.5kb RNA fragments were obtained after RNA amplification and β-actin levels were integral. Conclusion: Laser capture microdissection combined with RNA linear amplification in vitro can be successfully applied to obtain pure objective cells for research. The integrity of the amplified RNA is good and can be employed in further research. 展开更多
关键词 aser capture microdissection rna linear amplification in vitro rt-pcr bladder transitionalcell bladder transitional cell carcinoma
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Isolation of cardiac conduction system of rat heart by laser capture microdissection
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作者 欧妍 牛小麟 +4 位作者 任付先 黄辰 雷聪 李喆 陈伟 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2005年第6期327-332,共6页
Objective:To isolate ceils of cardiac conduction system (CCS) with laser capture microdissec tion (LCM) and extract and evaluate quality of small amount of RNA from ceils of CCS. Methods: Cryo star sections were... Objective:To isolate ceils of cardiac conduction system (CCS) with laser capture microdissec tion (LCM) and extract and evaluate quality of small amount of RNA from ceils of CCS. Methods: Cryo star sections were followed by H-E staining. 20 pieces of H-E stained eryostat sections were scraped and its RNA was assessed to insure that RNA didn't degrade in dyeing and dehydration process. Ceils of CCS were captured with LCM and quality of small amount of RNA was verified with RT-PCR. Results: Ceils of CCS isolated with LCM had clear morphology after staining. High quality RNA was extracted from LCM samples and scraped tissues; 18S rRNA and 28S rRNA were seen distinctly on gel eleetrophoresis. Low level of small amount of RNA extracted from LCM sample was below the limit of detection on gel eleetrophoresis or ultraviolet speetrophotometer. The housekeeping genes β-aetin and GAPDH were successfully amplified with small amount of RNA. Conclusion :This study resolves the problem of acquiring material of CCS precisely that hinders gene research of CCS. It is found out that the method is easy and reliable to extract and assess the quality of small amount of RNA from mierodisseeted ceils of CCS. 展开更多
关键词 laser capture microdissection cardiac conduction system rna rt-pcr
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激光显微切割分离细胞的微量RNA质量鉴定体系的建立 被引量:4
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作者 杨燕青 张雯 +2 位作者 张宝峰 郜恒骏 张庆华 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1521-1526,共6页
探索一套激光显微切割(Laser capture microdissection,LCM)分离细胞后获得的微量RNA质量鉴定标准操作流程。选取3个低温保存的胃癌旁组织样本,冰冻切片进行甲酚紫染色和病理学检查,利用激光显微切割技术分离非癌上皮细胞,提取RNA并以Ag... 探索一套激光显微切割(Laser capture microdissection,LCM)分离细胞后获得的微量RNA质量鉴定标准操作流程。选取3个低温保存的胃癌旁组织样本,冰冻切片进行甲酚紫染色和病理学检查,利用激光显微切割技术分离非癌上皮细胞,提取RNA并以Agilent 2100生物分析仪鉴定RNA的纯度和完整性。同时,选择高、中、低3种不同表达丰度的6个基因(EF1A,ACTB,GAPHD,B2M,MED1,CK20),在每个基因的5′和3′端设计引物,RT-PCR扩增。以3个培养细胞制备的高质量RNA和3个有降解的胃癌旁组织样本RNA作对照,RT-PCR扩增结果与Agilent 2100生物分析仪的结果高度一致。结果显示冻存组织进行冰冻切片结合病理学检查后,LCM获取细胞提取微量RNA采用RT-PCR进行质量鉴定是一种操作简单的稳定方法,可以作为肿瘤基因组研究的有效和常规方法。 展开更多
关键词 激光显微切割 rt-pcr rna完整性 质量鉴定
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激光微切割与定量PCR技术分析肾脏病理切片RNA 被引量:2
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作者 吕杨 尹忠 +4 位作者 王兆霞 师锁柱 洪权 张雪光 陈香美 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期695-699,共5页
采用激光微切割与定量PCR技术,分析使用不同提取方法从不同固定方法固定的病理切片中提取的RNA.用70%乙醇、丙酮、甲醇、4%多聚甲醛固定肾脏冰冻切片,使用激光微切割技术切取肾小球,用硫氰酸胍方法(guanidinethiocyanatemethods,GTC)和T... 采用激光微切割与定量PCR技术,分析使用不同提取方法从不同固定方法固定的病理切片中提取的RNA.用70%乙醇、丙酮、甲醇、4%多聚甲醛固定肾脏冰冻切片,使用激光微切割技术切取肾小球,用硫氰酸胍方法(guanidinethiocyanatemethods,GTC)和Trizol试剂方法提取RNA,使用Taqman定量PCR方法分析比较各组RNA的量;选取丙酮固定的石蜡切片,使用激光微切割技术切取肾小球,采用RNA裂解液提取RNA,使用Taqman定量PCR方法,比较石蜡切片和冰冻切片中RNA含量.结果显示:提取沉淀性固定剂如乙醇、丙酮、甲醇固定的冰冻切片的RNA时,2种提取方法和3种固定方法对RNA含量的影响都无明显差异;但在提取4%多聚甲醛固定冰冻切片时,使用Trizol提取RNA含量明显高于使用GTC方法,且其含量与沉淀性固定剂固定的切片RNA含量无明显差异.石蜡切片中经激光微切割肾小球的RNA含量与冰冻切片经激光微切割肾小球的RNA含量无明显差异.结果提示:切片的固定方法和RNA的提取方法是影响切片RNA提取量的主要原因. 展开更多
关键词 激光微切割 定量PCR rna 冰冻切片 石蜡切片
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一种简易可行的激光捕获显微切割样本RNA质控方法 被引量:1
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作者 田英芳 魏朝明 +7 位作者 陈新林 邱芬 肖新莉 康前雁 朱波峰 田玉梅 张军峰 刘勇 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1782-1785,共4页
目的建立一种简易可行的激光捕获显微切割样本RNA质控方法。方法分别提取捕获样本和染色前、染色后1和2h、持续捕获1和2h切片及残余组织的RNA,琼脂糖电泳检测;激光捕获显微切割(LCM)样本RNA的产率可通过理论值初步估计。结果当染色前后... 目的建立一种简易可行的激光捕获显微切割样本RNA质控方法。方法分别提取捕获样本和染色前、染色后1和2h、持续捕获1和2h切片及残余组织的RNA,琼脂糖电泳检测;激光捕获显微切割(LCM)样本RNA的产率可通过理论值初步估计。结果当染色前后、捕获后的切片或切片残余组织RNA质量完好时,捕获样本的RNA质量完好,实时定量PCR亦获得了良好的扩增结果。结论使用琼脂糖凝胶电泳分别检测染色前后、捕获后的切片或切片残余组织RNA的质量,可以从不同的环节和过程对捕获样本RNA进行间接检测,该方法简单方便有效,并可进一步用于LCM样本蛋白质及DNA等大分子的质控。 展开更多
关键词 激光捕获显微切割 rna质控 琼脂糖凝胶电泳
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激光显微切割联合功能分类表达谱芯片技术在脑缺血研究中的应用 被引量:3
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作者 田英芳 魏朝明 +3 位作者 张蓬勃 邱芬 陈新林 刘勇 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期395-398,共4页
目的探讨激光捕获显微切割分离大鼠脑微血管和神经元联合功能分类表达谱cDNA芯片技术在脑缺血研究的应用.方法激光捕获显微切割获取脑切片微血管和神经元,微量RNA提取试剂盒提取总RNA,线性扩增mRNA,紫外分光光度计定量所得aRNA(antisens... 目的探讨激光捕获显微切割分离大鼠脑微血管和神经元联合功能分类表达谱cDNA芯片技术在脑缺血研究的应用.方法激光捕获显微切割获取脑切片微血管和神经元,微量RNA提取试剂盒提取总RNA,线性扩增mRNA,紫外分光光度计定量所得aRNA(antisense RNA)扩增效率,基因特异性引物进行cDNA探针合成,进行芯片杂交反应.结果微血管和神经元各自捕获的总点数大约为8000~10000,T7线性扩增所得aRNA的量约为500~1000ng,探针合成效率高,杂交反应格局清晰良好.结论激光捕获显微切割,结合T7 RNA线性扩增及基因特异性引物线性扩增技术,可成功的应用于功能分类表达谱cDNA芯片的分析研究. 展开更多
关键词 激光捕获显微切割 微血管 神经元 线性扩增 芯片
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激光捕获技术在心房细胞定位分离中的应用
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作者 欧妍 牛小麟 +2 位作者 黄辰 任付先 陈伟 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期467-470,共4页
目的探索激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)定位分离心房细胞,并对提取的微量RNA进行β-actin及GAPDH基因扩增。方法首先验证预做LCM样品的完整性,然后常规制备冰冻切片,采用改进的HE快速染色脱水法染色... 目的探索激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)定位分离心房细胞,并对提取的微量RNA进行β-actin及GAPDH基因扩增。方法首先验证预做LCM样品的完整性,然后常规制备冰冻切片,采用改进的HE快速染色脱水法染色,提取刮片组织的RNA验证其质量,确保在切片染色过程中RNA的完整性.最后进行LCM分离纯化心房细胞,通过逆转录-聚合酶链反应(RT—PCR)扩增β-actin及GAPDH基因.结果经快速HE染色心房细胞形态学清晰;预做LCM的样品和染色后组织刮片可提取出高质量的RNA,紫外分光光度计测定吸光度值A260/A80为1.9~2.0之间。甲醛变性凝胶电泳显示清晰的28SrRNA和18SrRNA条带,捕获细胞提取的微量RNA经RT—PCR后进行凝胶电泳显示有300bp及357bp的扩增条带.结论LCM可以分离出纯度较高的心房细胞,提取的微量RNA可以扩增出管家基因β-actin和GAPDH. 展开更多
关键词 激光捕获 rna rt-pcr 离心房细胞 定位分离
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