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Vanillylacetone attenuates cadmium chloride-induced hippocampal damage and memory loss through upregulation of nuclear factor erythroid 2-related factor 2 gene and protein expression
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作者 Fahaid H.A.L-Hashem Salah O.Bashir +4 位作者 Amal F.Dawood Moutasem S.Aboonq Ismaeel Bin-Jaliah Abdulaiziz M.Al-Garni Mohamed D.Morsy 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第12期2750-2759,共10页
Memory loss and dementia are major public health concerns with a substantial economic burden.Oxidative stress has been shown to play a crucial role in the pathophysiology of hippocampal damage-induced memory impairmen... Memory loss and dementia are major public health concerns with a substantial economic burden.Oxidative stress has been shown to play a crucial role in the pathophysiology of hippocampal damage-induced memory impairment.To investigate whether the antioxidant and anti-inflammatory compound vanillyla cetone(zingerone) can protect against hippocampal damage and memory loss induced by cadmium chloride(CdCl_(2)) administration in rats,we explo red the potential involvement of the nuclear factor erythroid 2-related factor 2(Nrf2) signaling pathway,which is known to modulate oxidative stress and inflammation.Sixty healt hy male Wistar rats were divided into five groups:vehicle-treated(control),vanillylacetone,CdCl_(2),vanillylacetone+ CdCl_(2),vanillylacetone+ CdCl_(2)+ brusatol(a selective pharmacological N rf2inhibitor) groups.Vanillylacetone effectively attenuated CdCl_(2)-induced damage in the dental gyrus of the hippocampus and improved the memory function assessed by the Morris Water Maze test.Additionally,vanillylacetone markedly decreased the hippocampal tissue levels of inflammatory biomarkers(interleukin-6,tumor necrosis factor-α,intracellular cell adhesive molecules) and apoptosis biomarkers(Bax and cleaved caspase-3).The control and CdCl_(2)-treated groups treated with va nillylacetone showed reduced generation of reactive oxygen species,decreased malondialdehyde levels,and increased superoxide dismutase and glutathione activities,along with significant elevation of nuclear Nrf2 mRNA and protein expression in hippocampal tissue.All the protective effects of vanillylacetone we re substantially blocked by the co-administration of brusatol(a selective N rf2 inhibitor).Va nillylacetone mitigated hippocampal damage and memory loss induced by CdCl_(2),at least in part, by activating the nuclear transcription factor Nrf2.Additionally,vanillylacetone exerted its potent antioxidant and antiinflammatory actions. 展开更多
关键词 HIPPOCAMPUS NEUROPROTECTIVE Nrf2 gene oxidative stress vanillylacetone
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Identification of hub genes associated with Helicobacter pylori infection and type 2 diabetes mellitus:A pilot bioinformatics study
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作者 Han Chen Guo-Xin Zhang Xiao-Ying Zhou 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2024年第2期170-185,共16页
BACKGROUND Helicobacter pylori(H.pylori)infection is related to various extragastric diseases including type 2 diabetes mellitus(T2DM).However,the possible mechanisms connecting H.pylori infection and T2DM remain unkn... BACKGROUND Helicobacter pylori(H.pylori)infection is related to various extragastric diseases including type 2 diabetes mellitus(T2DM).However,the possible mechanisms connecting H.pylori infection and T2DM remain unknown.AIM To explore potential molecular connections between H.pylori infection and T2DM.METHODS We extracted gene expression arrays from three online datasets(GSE60427,GSE27411 and GSE115601).Differentially expressed genes(DEGs)commonly present in patients with H.pylori infection and T2DM were identified.Hub genes were validated using human gastric biopsy samples.Correlations between hub genes and immune cell infiltration,miRNAs,and transcription factors(TFs)were further analyzed.RESULTS A total of 67 DEGs were commonly presented in patients with H.pylori infection and T2DM.Five significantly upregulated hub genes,including TLR4,ITGAM,C5AR1,FCER1G,and FCGR2A,were finally identified,all of which are closely related to immune cell infiltration.The gene-miRNA analysis detected 13 miRNAs with at least two gene cross-links.TF-gene interaction networks showed that TLR4 was coregulated by 26 TFs,the largest number of TFs among the 5 hub genes.CONCLUSION We identified five hub genes that may have molecular connections between H.pylori infection and T2DM.This study provides new insights into the pathogenesis of H.pylori-induced onset of T2DM. 展开更多
关键词 Helicobacter pylori Type 2 diabetes mellitus Bioinformatics analysis Differentially expressed genes Hub genes
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腺苷脱氨酶2缺乏症临床特征与基因型分析
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作者 周洋 武亚丽 丁艳 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期116-120,126,共6页
目的总结3例腺苷脱氨酶2(ADA 2)缺乏症患儿的临床特征及基因型特点,提高对该病的认识。方法回顾性分析3例ADA2缺乏症患儿的临床特点并利用全外显子测序进行遗传学分析。利用试剂盒测定患儿血浆中ADA2酶的活性。总结该病的临床及基因型... 目的总结3例腺苷脱氨酶2(ADA 2)缺乏症患儿的临床特征及基因型特点,提高对该病的认识。方法回顾性分析3例ADA2缺乏症患儿的临床特点并利用全外显子测序进行遗传学分析。利用试剂盒测定患儿血浆中ADA2酶的活性。总结该病的临床及基因型特征。结果本组3例患儿均存在ADA2基因变异,例1以反复发热、皮疹、惊厥为主要临床表现,合并脑卒中,伴炎症指标明显升高,ADA2基因存在复合杂合变异:c.139G>T和c.484T>C突变。例2以反复发热、皮疹为主要临床表现,病程中合并消化道穿孔、脑卒中,炎症指标明显升高。WES检测发现ADA2基因存在c.916C>T及c.1069G>A复合杂合突变。例3以反复发热、咳嗽为主要临床表现,合并心肌炎,伴免疫功能明显下降;WES检测发现患者ADA2基因存在c.849T>G纯合突变。血浆ADA2酶活性测定发现例1和2酶活性显著降低。结论ADA2缺乏症国内罕见,临床特征多变,掌握其临床特征及基因特点,有助于提高诊断水平。 展开更多
关键词 2型腺苷脱氨酶缺乏症 ADA2基因 基因变异 儿童
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丛枝菌根真菌对褐土玉米氮素吸收和土壤N_(2)O排放的影响
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作者 王艳芳 刘金钊 +1 位作者 李志超 刘领 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1972-1984,共13页
探究不同氮肥水平下丛枝菌根(AM)真菌对褐土玉米土壤N_(2)O排放和氮转化功能基因的影响,为阐明AM真菌在褐土N_(2)O排放中的作用和效应提供理论依据。设置氮肥用量(NⅠ:105 mg/kg;NⅡ:210 mg/kg)、AM真菌(M0:不接种AM真菌;M1:接种根内根... 探究不同氮肥水平下丛枝菌根(AM)真菌对褐土玉米土壤N_(2)O排放和氮转化功能基因的影响,为阐明AM真菌在褐土N_(2)O排放中的作用和效应提供理论依据。设置氮肥用量(NⅠ:105 mg/kg;NⅡ:210 mg/kg)、AM真菌(M0:不接种AM真菌;M1:接种根内根孢囊霉(Rhizophagus intraradices);M2:接种摩西斗管囊霉(Funneliformis mosseae);M3:接种Rhizophagus intraradices+Funneliformis mosseae等比例混合)双因素盆栽试验。测定植株地上部全氮含量、土壤铵态氮、硝态氮含量和N_(2)O排放量,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)法分析土壤硝化功能基因(amoA-AOA和amoA-AOB)和反硝化功能基因(nirS、nirK和nosZ)的丰度。结果表明,两种施氮水平下,接种AM真菌均可显著降低土壤N_(2)O排放通量和累积排放量,不同AM真菌处理下N_(2)O累积排放量表现为:M0>M2>M1>M3。相同AM真菌处理的土壤N_(2)O排放通量和累积排放量在NⅡ施氮水平高于NⅠ施氮水平;相同AM真菌处理的玉米菌根侵染率在NⅡ施氮水平低于NⅠ施氮水平。与M0相比,NⅠ条件下M1、M2和M3处理土壤铵态氮含量分别降低24.5%、20.8%和45.3%,硝态氮含量分别降低19.7%、14.9%和30.2%,植株地上部全氮含量分别增加16.3%、35.2%和59.6%;与M0相比,NⅡ条件下M1、M2和M3处理土壤铵态氮含量分别降低20.9%、24.8%和40.0%,硝态氮含量分别降低36.3%、25.6%和45.2%,植株地上部全氮含量分别增加33.2%、43.9%和95.4%。两种施氮水平下,AM真菌可显著降低土壤硝化功能基因(amoA-AOA和amoA-AOB)丰度,增加反硝化功能基因(nirS、nirK和nosZ)丰度。AM真菌与N_(2)O排放通量呈极显著负相关。本盆栽试验条件下,接种AM真菌均可增强两种氮肥用量玉米植株氮素吸收能力,调节硝化、反硝化相关功能基因的丰度,减少土壤N_(2)O气体的排放,且两种AM真菌混合处理的N_(2)O减排效应强于单一AM真菌接种。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 N_(2)O排放 氮转化功能基因 褐土 玉米
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血清IL-2、sST2表达与特发性膜性肾病免疫抑制剂治疗反应性的相关性
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作者 王念华 吴玉彩 《河南医学研究》 CAS 2024年第8期1433-1436,共4页
目的探讨特发性膜性肾病患者血清白介素-2(IL-2)、可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)表达水平与免疫抑制剂治疗反应性的相关性。方法选取2020年1月至2022年10月于医院接受免疫抑制剂治疗的135例特发性膜性肾病患者,于入院时检测患者血... 目的探讨特发性膜性肾病患者血清白介素-2(IL-2)、可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)表达水平与免疫抑制剂治疗反应性的相关性。方法选取2020年1月至2022年10月于医院接受免疫抑制剂治疗的135例特发性膜性肾病患者,于入院时检测患者血清IL-2、sST2,并于治疗完成后测定24 h尿蛋白定量,依据患者治疗反应性分为缓解组与未缓解组。对比两组患者一般资料及入院时血清IL-2、sST2水平,采用点二列相关性分析血清IL-2、sST2水平与特发性膜性肾病免疫抑制剂治疗反应性的关系,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估血清IL-2、sST2水平预测特发性膜性肾病免疫抑制剂治疗反应性的价值。结果135例特发性膜性肾病患者中共有132例完成规律治疗,经免疫抑制剂治疗6个月后,101例患者疾病缓解,纳入缓解组,其余31例患者纳入未缓解组。未缓解组年龄、入院时肾功能分级、疾病分期、血清IL-2、sST2水平均高于缓解组,差异有统计学意义(P<0.05);点二列相关性分析显示,血清IL-2、sST2水平与特发性膜性肾病免疫抑制剂治疗反应性不良风险呈正相关(r 1=0.428,P 1<0.001;r 2=0.344,P 2<0.001);绘制ROC曲线,结果显示,血清IL-2、sST2预测特发性膜性肾病免疫抑制剂治疗反应性不良的曲线下面积均>0.7,具有一定预测价值,且联合预测价值更高。结论血清IL-2、sST2表达水平与特发性膜性肾病患者免疫抑制剂治疗反应性密切相关,二者表达水平越高,治疗反应性越差,且联合检测可作为预测特发性膜性肾病患者免疫抑制剂治疗反应性的敏感指标。 展开更多
关键词 特发性膜性肾病 免疫抑制剂 白介素-2 可溶性生长刺激表达基因2蛋白 治疗反应性
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X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系TRAPPC2基因缺失突变的高通量测序分析
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作者 刘宇 王环环 +1 位作者 肖冰 唐利芳 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期407-411,共5页
目的·研究一个X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)家系的致病基因及突变类型。方法·提取一个SEDT家系6名成员外周血基因组DNA。应用Clearseq遗传性疾病试剂盒靶向捕获先证者基因组样本中... 目的·研究一个X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)家系的致病基因及突变类型。方法·提取一个SEDT家系6名成员外周血基因组DNA。应用Clearseq遗传性疾病试剂盒靶向捕获先证者基因组样本中与罕见遗传性疾病相关的致病区域,并进行高通量测序,过滤去除高频突变。采用外显子组隐马尔科夫模型(exome hidden Markov model,XHMM)分析拷贝数变异(copy number variant,CNV),并进一步对6名家系成员基因缺失片段的拷贝数进行实时定量PCR分析。结果·高通量测序分析结果显示,先证者X染色体存在2.5 kb缺失(chrX:13732385~13734927),该区域覆盖转运蛋白复合体亚单位2(transport protein particle complex subunit 2,TRAPPC2)基因的第4~6个外显子。定量PCR结果证实先证者及其表哥均存在该缺失,先证者母亲为杂合缺失,先证者父亲、姐姐和表型正常的舅舅拷贝数均正常。结论·TRAPPC2基因第4~6个外显子片段的缺失为SEDT的致病性突变;同时高通量测序分析中运用XHMM算法可检测到致病基因多个外显子的缺失。 展开更多
关键词 迟发性脊椎骨骺发育不良 高通量测序 转运蛋白复合体亚单位2基因
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低剂量CT结合SHOX2、RASSF1A甲基化在肺癌早期预警中的应用
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作者 李志娟 董红 +2 位作者 田涛 于哲 李晓敏 《中国CT和MRI杂志》 2024年第2期73-76,共4页
目的探讨低剂量CT结合Ras相关区域家族蛋白1A(RASSF1A)、矮小同源盒基因2(SHOX2)甲基化在肺癌早期预测中的应用价值。方法选取2021年1月~2023年1月我院90例拟行肺结节手术患者,根据手术病理学分为肺良性结节组和肺癌组。2组均于术前行... 目的探讨低剂量CT结合Ras相关区域家族蛋白1A(RASSF1A)、矮小同源盒基因2(SHOX2)甲基化在肺癌早期预测中的应用价值。方法选取2021年1月~2023年1月我院90例拟行肺结节手术患者,根据手术病理学分为肺良性结节组和肺癌组。2组均于术前行低剂量CT检查、SHOX2、RASSF1A甲基化检测,采用Kappa指数分析上述检查结果与手术病理学一致性,分析低剂量CT、SHOX2、RASSF1A甲基化与血清肿瘤标志物[癌胚抗原(CEA)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、鳞状细胞癌抗原(SCC-Ag)、细胞角蛋白19片段(CYFRA21)]对肺癌诊断效能,采用Spearman低剂量CT检查、SHOX2、RASSF1A甲基化与临床病理特征相关性。结果低剂量CT、SHOX2、RASSF1甲基化及三者联合分别确定40例、43例、46例、58例肺癌,三者联合与手术病理学诊断肺癌效能一致性Kappa值为0.951;三者联合诊断肺癌敏感度96.67%、准确度97.78%均高于三者单一诊断效能(P<0.05);肺癌患者血清CEA、SCC、NSE、CYFRA21水平均高于肺良性结节患者(P<0.05);低剂量CT联合SHOX2、RASSF1甲基化诊断肺癌效能的AUC为0.983,近似于四种血清肿瘤标志物诊断肺癌效能的AUC 0.933;不同肿瘤直径、临床分期、组织学分化肺癌患者低剂量CT检出率及SHOX2、RASSF1A甲基化阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05);肺癌患者低剂量CT检出率、SHOX2及RASSF1A甲基化阳性率与肿瘤直径、临床分期呈正相关,与组织学分化呈负相关(P<0.05)。结论低剂量CT联合SHOX2及RASSF1A甲基化可用于肺癌早期预警中,临床可通过其进行早期诊断、评估病情进展程度,以针对性展开后续治疗,改善预后。 展开更多
关键词 低剂量CT 矮小同源盒基因2 Ras相关区域家族蛋白1A 肺癌 血清肿瘤标志物
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miR-10b介导NKG2D调节脑胶质瘤细胞免疫效应的实验研究
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作者 袁岗 巨虎 +3 位作者 肖宗宇 李文辉 曹立新 惠超杰 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期507-512,共6页
目的:观察微小核糖核酸-10b(miR-10b)对脑胶质瘤细胞免疫效应的调节作用并探讨其作用机制。方法:取人脑胶质瘤细胞U251进行培养和传代,获得处于对数生长期的细胞。按照1.0×105个/ml浓度制备细胞悬液,并设置对照组、过表达组、低表... 目的:观察微小核糖核酸-10b(miR-10b)对脑胶质瘤细胞免疫效应的调节作用并探讨其作用机制。方法:取人脑胶质瘤细胞U251进行培养和传代,获得处于对数生长期的细胞。按照1.0×105个/ml浓度制备细胞悬液,并设置对照组、过表达组、低表达组、空白组,每组6个复孔。对照组、过表达组、低表达组分别采用脂质体转染法转染阴性对照、miR-10b模拟物、miR-10b抑制剂,空白组予以等量无菌生理盐水。分离和培养1例健康志愿者外周血自然杀伤(NK)细胞。MTT法检测不同效靶比时NK细胞的杀伤活性;流式细胞仪检测各组NK细胞表面NK细胞激活受体(NKG2D)表达,并检测各组人脑胶质瘤细胞U251表面主要组织相容性复合物Ⅰ链相关基因A(MICA)、UL16结合蛋白2(ULBP2)、UL16结合蛋白3(ULBP3)表达。结果:对照组、过表达组、低表达组转染效率分别为(93.55±2.05)%、(95.67±3.14)%、(94.18±3.26)%;与对照组和空白组相比,过表达组miR-10b表达升高,低表达组miR-10b表达降低,差异均有统计学意义(P<0.05),且对照组和空白组miR-10b表达差异无统计学意义(P>0.05);与对照组和空白组相比,过表达组NK细胞不同效靶比杀伤活性均降低、NKG2D表达降低,低表达组NK细胞不同效靶比杀伤活性均增高、NKG2D表达增高,差异均有统计学意义(P<0.05),各组NK细胞杀伤活性均随效靶比增加而增高,差异均有统计学意义(P<0.05),且对照组与空白组相比,相同效靶比NK细胞杀伤活性、NKG2D表达差异均无统计学意义(P>0.05);与对照组和空白组相比,过表达组人脑胶质瘤细胞U251表面MICA、ULBP2、ULBP3表达均降低,低表达组人脑胶质瘤细胞U251表面MICA、ULBP2、ULBP3表达均增高,差异均有统计学意义(P<0.05),且对照组与空白组人脑胶质瘤细胞U251表面MICA、ULBP2、ULBP3表达差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:抑制miR-10b表达能够增加NK细胞表面NKG2D和人脑胶质瘤细胞U251表面MICA、ULBP2、ULBP3表达,增强NK细胞对人脑胶质瘤细胞U251的杀伤活性。 展开更多
关键词 微小核糖核酸-10b 脑胶质瘤 NK细胞激活受体 主要组织相容性复合物Ⅰ链相关基因A UL16结合蛋白2 UL16结合蛋白3
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The Alzheimer's disease-associated gene TREML2 modulates inflammation by regulating microglia polarization and NLRP3 inflammasome activation 被引量:2
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作者 Si-Yu Wang Xin-Xin Fu +6 位作者 Rui Duan Bin Wei Hai-Ming Cao Yan E Shuai-Yu Chen Ying-Dong Zhang Teng Jiang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第2期434-438,共5页
Triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2(TREML2)is a newly identified susceptibility gene for Alzheimer's disease(AD).It encodes a microglial inflammation-associated receptor.To date,the potential rol... Triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2(TREML2)is a newly identified susceptibility gene for Alzheimer's disease(AD).It encodes a microglial inflammation-associated receptor.To date,the potential role of mic roglial TREML2 in neuroinflammation in the context of AD remains unclear.In this study,APP/PS1 mice were used to investigate the dynamic changes of TREML2 levels in brain during AD progression.In addition,lipopolysaccharide(LPS)stimulation of primary microglia as well as a lentivirus-mediated TREML2 overexpression and knockdown were employed to explore the role of TREML2 in neuroinflammation in the context of AD.Our res ults show that TREML2 levels gradually increased in the brains of AP P/PS1 mice during disease progression.LPS stimulation of primary microglia led to the release of inflammato ry cytokines including interleukin-1β,inte rleukin-6,and tumor necrosis factor-a in the culture medium.The LPS-induced mic roglial release of inflammatory cytokines was enhanced by TREML2 overexpression and was attenuated by TREML2 knoc kdown.LPS increased the levels of mic roglial M1-type polarization marker inducible nitric oxide synthase.This effect was enhanced by TREML2 overexpression and ameliorated by TREML2 knockdown.Furthermore,the levels of microglial M2-type polarization markers CD206 and ARG1 in the primary microglia were reduced by TREML2 overexpression and elevated by TREML2 knockdown.LPS stimulation increased the levels of NLRP3 in primary microglia.The LPS-induced increase in NLRP3 was further elevated by TREML2 overexpression and alleviated by TREML2 knockdown.In summary,this study provides the first evidence that TREML2 modulates inflammation by regulating microglial polarization and NLRP3 inflammasome activation.These findings reveal the mechanisms by which TREML2 regulates microglial inflammation and suggest that TREML2 inhibition may represent a novel therapeutic strategy for AD. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease APP/PS1 mice inflammatory cytokine lipopolysaccharide MICROGLIA NEUROINFLAMMATION NLRP3 inflammasome POLARIZATION susceptibility gene TREML2
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Association of Haplotypes in Exon 4 of KLK2 Gene with Raised Serum Prostate-Specific Antigen
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作者 Innocent S. I. Ogbu Ogochukwu A. Nwankwo +4 位作者 Chinemere C. Ogbu Emmanuel Nna Kingsley K. Anya Malachy O. Odoh David C. Obasi 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2023年第1期57-66,共10页
The standard diagnostic modalities for Prostate Cancer (PC) include serum Prostate-Specific Antigen (PSA) assay, Digital Rectal Examination (DRE), and histological examination of prostate biopsy. They are limited by l... The standard diagnostic modalities for Prostate Cancer (PC) include serum Prostate-Specific Antigen (PSA) assay, Digital Rectal Examination (DRE), and histological examination of prostate biopsy. They are limited by low predictive potential and inability to predict which patients are at risk of developing metastatic disease. The aim of this study is to investigate the exon 4 of the KLK2 gene of subjects for changes in its nucleotide sequences (SNPs) and determine the correlation of these changes with serum PSA in an Igbo population of Nigeria. One hundred male subjects aged 40 years and above, who gave their consent, were used for the study. Their PSA determinations were done using ELISA technique while genetic studies were carried out using real-time PCR. tPSA, fPSA, and % fPSA of the subjects ranged between 0.8% - 18.30%, 0.10% - 1.60% and 0.0% - 0.7% respectively. Of the 100 subjects, 28 subjects had tPSA levels above 4.0 ng/ml with a mean of 7.10 (±3.30) ng/ml. Those with tPSA less than 4 ng/ml had a mean of 1.87 (±0.85) ng/m. 15 subjects showed SNPs with a mean tPSA of 6.87 (±4.82) ng/ml while the remaining 85 subjects without SNPs had a mean of 1.86 (±0.80) ng/ml. Results from direct DNA sequencing showed 11 SNPs. Ten subjects are curated in SNP database while one is uncurated. The Chi-square test showed significant association (p = 0.00) between tPSA levels and SNPs mutation (X<sup>2</sup> = 17.35, p = 0.00). A Kruskal-Wallis test demonstrated that the positional arrangement of the SNP mutations had no effect on PSA-total or free-values (H (10) = 10.92, p = 0.28;H (10) = 10.07, p = 0.38 respectively). Two SNPs: rs6072 and rs74478031 were associated with elevated PSA levels (p < 0.05). Their presence, therefore, has the potential to serve, in conjunction with raised PSA, as biomarkers of prostate cancer in the study population. 展开更多
关键词 Prostate Cancer Prostate-Specific Antigen Kallikrein 2 gene genetic Mutations Haplotypes Short Nucleotidepolymorphism
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o2突变引起糯玉米籽粒淀粉积累差异研究
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作者 韩洁楠 张泽 +11 位作者 刘晓丽 李冉 上官小川 周婷芳 潘越 郝转芳 翁建峰 雍洪军 周志强 徐晶宇 李新海 李明顺 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1207-1222,共16页
糯玉米是主要鲜食玉米类型,opaque2(o2)基因导入可增加籽粒赖氨酸含量,但同时引起籽粒皱缩、淀粉含量下降等,限制了其育种应用。为发掘优良糯玉米受体,以籽粒饱满圆型o2近等基因系(o2-NIL)糯2/wx1wx1o2o2和皱缩型黄糯2/wx1wx1o2o2为研... 糯玉米是主要鲜食玉米类型,opaque2(o2)基因导入可增加籽粒赖氨酸含量,但同时引起籽粒皱缩、淀粉含量下降等,限制了其育种应用。为发掘优良糯玉米受体,以籽粒饱满圆型o2近等基因系(o2-NIL)糯2/wx1wx1o2o2和皱缩型黄糯2/wx1wx1o2o2为研究材料,通过对鲜食期、成熟期的百粒重和籽粒成分测定,发现淀粉和可溶性糖含量不同可能是导致2份糯玉米o2-NILs表型差异的主要原因。利用实时荧光定量PCR技术分析,发现授粉后10~24 d两糯玉米o2-NILs中6个淀粉合成基因动态表达模式不同,其中Sh1、Sh2、SSIIIa和SBEIIb差异较大。分析胚乳转录组数据,发现两糯玉米o2-NILs中24个海藻糖和糖基水解酶编码基因和48个o2胚乳修饰基因变化不同,以上结果表明淀粉合成关键基因前期表达量高,后期与对照无差异,且糖代谢基因表达变化有利于淀粉合成可能是糯2/wx1wx1o2o2淀粉含量和百粒重不受o2突变影响,籽粒性状明显优于黄糯2/wx1wx1o2o2的重要原因,同时多个胚乳修饰基因的差异表达可能与该结果直接相关。本研究结果可为o2突变体在玉米育种中的应用提供重要参考。 展开更多
关键词 糯玉米 2/wx1wx1o2o2 黄糯2/wx1wx1o2o2 籽粒饱满度 淀粉 糖代谢 差异基因
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多浪羊PROKR 2基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析
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作者 黄巧艳 李伟 +1 位作者 王鑫昆 邢凤 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1339-1348,共10页
【目的】克隆多浪羊促动力素受体2(prokineticin receptor 2,PROKR2)基因,并检测初情期启动过程中PROKR 2基因在多浪羊不同组织中的表达水平,为探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的作用提供依据。【方法】以初情期后多浪羊下丘脑c... 【目的】克隆多浪羊促动力素受体2(prokineticin receptor 2,PROKR2)基因,并检测初情期启动过程中PROKR 2基因在多浪羊不同组织中的表达水平,为探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的作用提供依据。【方法】以初情期后多浪羊下丘脑cDNA为模板,PCR扩增PROKR 2基因并克隆测序。利用DNAMAN软件对测序结果进行拼接,采用MegAlign软件进行物种间相似性比对并构建系统进化树,并利用生物信息学软件预测多浪羊PROKR2蛋白理化性质和结构功能。使用实时荧光定量PCR技术检测PROKR 2基因在多浪羊下丘脑、垂体、卵巢、输卵管及子宫中初情期前、初情期及初情期后的表达水平。【结果】克隆获得PROKR 2基因序列大小为2641 bp,包括5′-UTR 143 bp、3′-UTR 1343 bp和CDS区1155 bp,编码384个氨基酸,与GenBank中绵羊预测mRNA序列(登录号:XM_004014342.5)相似性为99.83%。系统进化树表明,多浪羊PROKR 2基因的遗传距离与山羊最近,与鸡最远。生物信息学分析表明,PROKR2蛋白为疏水稳定碱性蛋白,有7个跨膜结构,属于跨膜蛋白,存在31个磷酸化位点,主要在质膜上发挥作用。多浪羊PROKR2蛋白与GnRH1、PROK1、ANOS1等蛋白存在相互作用关系。实时荧光定量PCR结果显示,在多浪羊下丘脑各时期中PROKR 2基因表达量均显著高于其他组织(P<0.05),且在初情期后的表达量最高;垂体中PROKR 2基因表达量无显著变化(P>0.05);子宫中PROKR 2基因在初情期前的表达量显著高于初情期和初情期后(P<0.05);卵巢和输卵管中PROKR 2基因在初情期的表达量显著高于初情期前和初情期后(P<0.05)。【结论】试验成功克隆了多浪羊PROKR 2基因CDS区序列,PROKR2蛋白属于疏水稳定碱性蛋白,含有7个跨膜结构,主要在下丘脑中表达,且在卵巢和输卵管中的总趋势为先升后降。研究结果可为进一步探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的调控作用提供参考。 展开更多
关键词 多浪羊 PROKR 2基因 克隆 初情期 表达
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CRISPR/Cas9技术高效制备山羊SOCS2基因编辑胚胎
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作者 张晨俭 李隐侠 +5 位作者 丁强 刘伟佳 王慧利 何南 吴家顺 曹少先 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期129-141,共13页
旨在设计、筛选高效编辑山羊胚胎生长负调控因子SOCS2基因的sgRNA,为通过SOCS2基因编辑创制快长型山羊奠定技术基础。本研究利用在线网站对山羊SOCS2基因SH2结构域保守序列设计2条sgRNA,构建表达载体,体外转录获得sgRNA及Cas9 mRNA;体... 旨在设计、筛选高效编辑山羊胚胎生长负调控因子SOCS2基因的sgRNA,为通过SOCS2基因编辑创制快长型山羊奠定技术基础。本研究利用在线网站对山羊SOCS2基因SH2结构域保守序列设计2条sgRNA,构建表达载体,体外转录获得sgRNA及Cas9 mRNA;体外检测sgRNA+Cas9蛋白切割靶DNA的效率;在此基础上将屠宰场山羊卵巢分离培养的442个孤雌胚胎进行分组,2个试验组显微注射sgRNA和Cas9 mRNA混合物,对照组注射超纯水,以单个囊胚全基因组DNA扩增产物为模板,PCR扩增靶区域并测序鉴定,发生编辑的样本进行T-A克隆测序检测编辑形式;根据在线网站预测,每条sgRNA选择5个错配数最少的潜在脱靶位点进行脱靶检测。结果表明,在SOCS2基因83和96号氨基酸密码子附近区域获得2条sgRNA并成功构建表达载体,体外转录获得高质量sgRNA和Cas 9 mRNA;两条sgRNA均可引导Cas9蛋白在体外完全切割靶DNA;SOCS2-sg-83对胚胎的编辑效率为94.1%,160个T-A克隆中有152个在靶位点出现插入、缺失或替换,概率为95.0%,其中81.3%发生了移码突变,9.4%的克隆缺失83号氨基酸密码子,累计90.6%的克隆实现了SOCS2基因功能性敲除;SOCS2-sg-96对胚胎的编辑效率为50.0%,80个T-A克隆中有70个在靶位点出现插入、缺失或替换,概率为87.5%,移码突变概率为75.0%,5.0%的克隆缺失了96号氨基酸密码子,累计80.0%的克隆实现了SOCS2基因功能性敲除。另外,在所有已编辑胚胎中均未发现脱靶。综上,SOCS2-sg-83可实现山羊胚胎SOCS2基因的高效、精准编辑和敲除,为高效制备SOCS2基因敲除山羊,培育快长型肉用山羊奠定了技术基础。 展开更多
关键词 山羊胚胎 细胞因子信号传导抑制因子2 CRISPR/Cas9 基因编辑
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大豆C_(2)H_(2)型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 郭智滨 张亚坤 +4 位作者 贺紫航 周强华 蔡占东 马启彬 年海 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期139-150,共12页
为进一步寻找与大豆产量相关的潜在候选基因,利用生物信息学与转录组学技术,通过拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)C_(2)H_(2)型锌指蛋白(C_(2)H_(2)zinc finger protein)序列BLAST映射,将从大豆(Glycine max)的基因组数据库中筛选出的44... 为进一步寻找与大豆产量相关的潜在候选基因,利用生物信息学与转录组学技术,通过拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)C_(2)H_(2)型锌指蛋白(C_(2)H_(2)zinc finger protein)序列BLAST映射,将从大豆(Glycine max)的基因组数据库中筛选出的44个C_(2)H_(2)锌指蛋白家族成员分成11个亚家族,并对其进行系统进化、保守结构域、顺式作用元件、测序数据和转录组数据等相关分析。结果表明:C_(2)H_(2)锌指蛋白家族成员分布于17条大豆染色体中,且每个亚家族的基因结构域较为相近,呈高度保守性。成员启动子部分含有抗逆境胁迫以及激素相关的调控元件。RNA-seq结果显示,有8个基因在不同植物组织内表达差异显著。荧光定量PCR分析表明,3个基因的分析结果为SUPERMAN的转录调节因子,GmC1-1iZFP42为Ln位点的相应基因,参与大豆叶形和籽粒的调控,GmC1-1iZFP12、GmC1-1iZFP30为SUPERMAN基因的转录调节因子,GmC1-1iZFP21可能参与大豆籽粒形成和发育的过程,为调控相关过程的候选基因。本研究为进一步寻找和挖掘大豆高产基因提供方向,也为C_(2)H_(2)型锌指蛋白和生物信息学在植物中的利用提供参考和启示。 展开更多
关键词 大豆 C_(2)H_(2) 基因家族 表达分析
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绝经后2型糖尿病患者护骨因子基因rs4355801、rs6993813位点多态性及突变与骨代谢的关系
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作者 王丽珍 李军 +3 位作者 李思源 向清淋 任艳霞 王娅宁 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期189-197,共9页
目的探讨绝经后2型糖尿病患者护骨因子(OPG)基因rs4355801、rs6993813位点多态性及突变与骨代谢的关系。方法选取2020年10月至2021年10月就诊于石河子大学第一附属医院的绝经后女性200例,根据病情分为糖耐量及骨量正常组(A组,52例)、糖... 目的探讨绝经后2型糖尿病患者护骨因子(OPG)基因rs4355801、rs6993813位点多态性及突变与骨代谢的关系。方法选取2020年10月至2021年10月就诊于石河子大学第一附属医院的绝经后女性200例,根据病情分为糖耐量及骨量正常组(A组,52例)、糖耐量正常但骨量异常组(B组,43例)、骨量正常的2型糖尿病组(C组,47例)、2型糖尿病合并骨量异常组(D组,58例)。收集患者年龄、身高、体重、绝经年限等基线资料,计算BMI、腰臀比。用罗氏全自动生化分析仪测定甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、血钙、血磷、碱性磷酸酶(ALP)、空腹血糖(FPG)等生物化学指标,HPLC测量糖化血红蛋白(HbA1c),双能X线测量L1~4椎体及股骨颈骨密度,飞行时间质谱测定OPG基因rs4355801、rs6993813位点多态性及基因型分型。采用多元线性回归分析筛选骨密度的影响因素。使用SHEsis软件进行单核苷酸多态性位点的连锁不平衡分析及单体型分析。结果4组间年龄、BMI、腰臀比存在差异(P<0.05)。与A组、B组相比,C组、D组的FPG、HbA1c水平均升高(均P<0.05);与B组相比,C组HDL-C水平升高、ALP水平降低(均P<0.05);与C组相比,D组ALP水平升高(P<0.05);与A组、C组相比,B组、D组的L_(1~4)椎体骨密度及股骨颈骨密度水平均降低(均P<0.05)。OPG基因rs4355801、rs6993813位点均符合Hardy-Weinberg平衡。rs4355801位点基因型及等位基因频率分布组间差异均无统计学意义(均P>0.05);与A组相比,C组、D组rs6993813位点基因型分布均存在差异(均P<0.05),而等位基因频率分布在各组间差异均无统计学意义(均P>0.05)。C组rs4355801位点突变型患者FPG、HbA1c水平均低于野生型患者(均P<0.05),D组rs4355801位点突变型患者L_(1~4)椎体骨密度水平高于野生型患者(P<0.05),D组rs6993813位点突变型患者血磷水平低于野生型患者、股骨颈骨密度水平高于野生型患者(均P<0.05)。多元线性回归分析显示,绝经年限增加及BMI、TG、LDL-C、HDL-C降低是绝经后女性L_(1~4)椎体骨密度降低的危险因素,绝经年限增加、HDL-C降低、血磷降低是股骨颈骨密度降低的危险因素;rs4355801位点AG基因型是绝经后女性L_(1~4)椎体骨密度、股骨颈骨密度增加的保护因素(均P<0.05)。rs4355801、rs6993813位点野生型与突变型绝经后女性骨密度的差异均无统计学意义(均P>0.05)。OPG基因rs4355801、rs6993813位点之间存在明显连锁不平衡关系(D’>0.9,r^(2)>0.3);携带GT单体型的绝经后女性骨量异常风险增高(P<0.05),携带AT单体型的绝经后女性骨量异常风险降低(P<0.05)。OPG基因rs4355801、rs6993813位点的交互作用未对绝经后女性骨密度产生影响(均P>0.05)。结论rs4355801位点突变可能参与了绝经后女性的骨代谢、糖代谢,rs6993813位点突变及多态性参与了绝经后女性的骨代谢。OPG基因rs4355801、rs6993813位点的明显连锁关系可能影响绝经后女性的骨密度。 展开更多
关键词 绝经后女性 2型糖尿病 护骨因子 骨质疏松症 基因多态性 基因突变
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Co-existing squamous cell carcinoma and chronic myelomonocytic leukemia with ASXL1 and EZH2 gene mutations:A case report
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作者 Lai-Jun Deng Yang Dong +1 位作者 Mi-Mi Li Chang-Gang Sun 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第15期3643-3650,共8页
BACKGROUND Chronic myelomonocytic leukemia(CMML),a rare clonal hematopoietic stem cell disorder characterized by myelodysplastic syndrome and myeloproliferative neoplasms,has a generally poor prognosis,and easily prog... BACKGROUND Chronic myelomonocytic leukemia(CMML),a rare clonal hematopoietic stem cell disorder characterized by myelodysplastic syndrome and myeloproliferative neoplasms,has a generally poor prognosis,and easily progresses to acute myeloid leukemia.The simultaneous incidence of hematologic malignancies and solid tumors is extremely low,and CMML coinciding with lung malignancies is even rarer.Here,we report a case of CMML,with ASXL1 and EZH2 gene mutations,combined with non-small cell lung cancer(lung squamous cell carcinoma).CASE SUMMARY A 63-year-old male,suffering from toothache accompanied by coughing,sputum,and bloody sputum for three months,was given a blood test after experiencing continuous bleeding resulting from a tooth extraction at a local hospital.Based on morphological results,the patient was diagnosed with CMML and bronchoscopy was performed in situ to confirm the diagnosis of squamous cell carcinoma in the lower lobe of the lung.After receiving azacitidine,programmed cell death protein 1,and platinum-based chemotherapy drugs,the patient developed severe myelosuppression and eventually fatal leukocyte stasis and dyspnea.CONCLUSION During the treatment and observation of CMML and be vigilant of the growth of multiple primary malignant tumors. 展开更多
关键词 Squamous cell carcinoma Chronic myelomonocytic leukemia Myeloproliferative neoplasms MYELODYSPLASTIC ASXL1 gene mutations EZH2 gene mutations Case report
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Genome-Wide Identification, Evolution and Expression Analyses of GA2ox Gene Family in Brassica napus L.
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作者 Yanhua Li Hualei Huang +8 位作者 Youming Shi Shuqin Huang Tao Liu Changming Xiao Xiaoqing Tian Ping Zhao Xiaoyan Dai Taocui Huang Yan Zhou 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第3期815-835,共21页
Gibberellin 2-oxidases(GA2ox)are important enzymes that maintain the balance of bioactive GAs in plants.GA2ox genes have been identified and characterized in many plants,but these genes were not investigated in Brassi... Gibberellin 2-oxidases(GA2ox)are important enzymes that maintain the balance of bioactive GAs in plants.GA2ox genes have been identified and characterized in many plants,but these genes were not investigated in Brassica napus.Here,we identified 31 GA2ox genes in B.napus and 15 of these BnaGA2ox genes were distributed in the A and C subgenomes.Subcellular localization predictions suggested that all BnaGA2ox proteins were localized in the cytoplasm,and gene structure analysis showed that the BnaGA2ox genes contained 2–4 exons.Phylogenetic analysis indicated that BnGA2ox family proteins in monocotyledons and dicotyledons can be divided into four groups,including two C_(19)-GA2ox and two C_(20)-GA2ox clades.Group 4 is a C_(20)-GA2ox Class discovered recently.Most BnaGA2ox genes had a syntenic relationship with AtGA2ox genes.BnaGA2ox genes in the C subgenome had experienced stronger selection pressure than genes in the A subgenome.BnaGA2ox genes were highly expressed in specific tissues such as those involved in growth and development,and most of them were mainly involved in abiotic responses,regulation of phytohormones and growth and development.Our study provided a valuable evolutionary analysis of GA2ox genes in monocotyledons and dicotyledons,as well as an insight into the biological functions of GA2ox family genes in B.napus. 展开更多
关键词 Brassica napus GA2ox gene family EVOLUTION expression patterns
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一个格里塞利综合征2型家系分析
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作者 赵倩 陈俊羽 +2 位作者 唐雪梅 赵晓东 杨曦 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期345-350,共6页
目的探讨由RAB27A基因缺陷导致的格里塞利综合征2型(Griscelli syndrome type 2,GS2)的临床及免疫学特征。方法收集1家系2例GS2患儿组成的临床资料、生化检查及病理活检结果,采集头发显微镜检查,抽取外周静脉血进行免疫系统基因外显子... 目的探讨由RAB27A基因缺陷导致的格里塞利综合征2型(Griscelli syndrome type 2,GS2)的临床及免疫学特征。方法收集1家系2例GS2患儿组成的临床资料、生化检查及病理活检结果,采集头发显微镜检查,抽取外周静脉血进行免疫系统基因外显子阵列测序,桑格测序验证患儿及父母RAB27A基因突变位点,采用蛋白印迹法检测外周血单个核细胞RAB27A蛋白表达水平,采用流式细胞术进行CTL细胞及NK细胞毒性功能检测,健康对照为正常同龄儿童。结果2例患者为亲兄妹,生后均表现毛发色素减退合,均以反复发热、反复呼吸道感染合并噬血细胞性淋巴组织细胞增生症(HLH)为主要临床表现,妹妹伴全身弥漫靶形损害样皮疹。2例患者头发内均有不规则黑色素团块堆积,妹妹皮损组织病理示表皮基底层黑色素细胞不规则分布,RAB27A基因5号外显子发生c.377 delC纯合移码突变,其父母为近亲结婚,均为携带者,2例患儿RAB27A蛋白表达均明显降低,NK细胞及CTL的细胞毒功能均受损。2例患儿均未接受化疗及造血干细胞移植(HSCT),先后因HLH死亡。结论GS2的确诊依赖临床表现及基因检测,免疫功能检测亦有助于诊断,同种异体造血干细胞移植是目前根治GS2的唯一方法。 展开更多
关键词 格里塞利综合征2 RAB27A基因 家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症
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分子伴侣prsA2基因缺失对单增李斯特菌致病性的影响
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作者 胡文洁 方小伟 +5 位作者 郭骞 杨雨婷 刘晶 梁雄燕 杨玉莹 方春 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期338-346,共9页
【目的】构建单增李斯特菌分子伴侣prsA2基因缺失株与回补株,探究其对单增李斯特菌内化素B(InlB)锚定能力以及致病性的影响。【方法】利用穿梭质粒pKSV7和回补质粒pIMK2分别构建prsA2基因缺失株与回补株;通过生长曲线分析亲本株10403S... 【目的】构建单增李斯特菌分子伴侣prsA2基因缺失株与回补株,探究其对单增李斯特菌内化素B(InlB)锚定能力以及致病性的影响。【方法】利用穿梭质粒pKSV7和回补质粒pIMK2分别构建prsA2基因缺失株与回补株;通过生长曲线分析亲本株10403S、缺失株ΔprsA2和回补株CΔprsA2生长能力;利用Western blotting检测prsA2基因缺失对单增李斯特菌InlB锚定的影响;通过肠上皮细胞(Caco-2)黏附侵袭试验与免疫荧光试验、小鼠毒力试验分析prsA2基因缺失对单增李斯特菌黏附侵袭能力、在宿主细胞间迁移能力及小鼠致病性的影响。【结果】PCR扩增结果显示,试验成功构建了缺失株ΔprsA2和回补株CΔprsA2。生长曲线结果显示,prsA2基因缺失不影响单增李斯特菌在BHI培养基中的生长能力(P>0.05)。Western blotting结果显示,缺失株ΔprsA2细菌表面的InlB锚定量极显著低于10403S和CΔprsA2(P<0.01),细菌培养上清中InlB锚定量极显著高于10403S和CΔprsA2(P<0.01)。细胞试验结果显示,缺失株ΔprsA2对Caco-2细胞的黏附率、侵袭率均极显著低于10403S和CΔprsA2(P<0.01);prsA2基因缺失减弱了单增李斯特菌募集肌动蛋白形成肌动蛋白尾巴在细胞间迁移的能力。小鼠毒力试验结果显示,缺失株ΔprsA2在小鼠肝脏与脾脏中的细菌载量均显著低于10403S和CΔprsA2(P<0.05)。【结论】分子伴侣prsA2基因缺失不影响单增李斯特菌在BHI培养基中的生长能力,但缺失株ΔprsA2表面的InlB锚定量显著下降,缺失prsA2基因减弱单增李斯特菌对Caco-2细胞的黏附侵袭能力、在细胞间迁移能力以及对小鼠的致病性。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 分子伴侣 prsA2基因 缺失 致病性
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辽宁沈阳株猫泛白细胞减少症病毒VP2基因扩增及生物信息学分析
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作者 刘琪 刘正伟 +4 位作者 梁琳 张利 郝春晖 李玥 赵福庆 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期23-32,共10页
【目的】通过生物信息学方法分析1株2022年辽宁沈阳地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus, FPV)LN3株VP2蛋白的分子特征。【方法】利用FPV胶体金试纸条对临床上表现呕吐、腹泻等症状的患病猫粪便进行检测,提取该病猫粪... 【目的】通过生物信息学方法分析1株2022年辽宁沈阳地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus, FPV)LN3株VP2蛋白的分子特征。【方法】利用FPV胶体金试纸条对临床上表现呕吐、腹泻等症状的患病猫粪便进行检测,提取该病猫粪便的病毒DNA进行FPV VP2基因PCR扩增及测序,使用Seqman软件对序列进行拼接。将所获序列与NCBI数据库中FPV和犬细小病毒(Canine parvovirus, CPV)的VP2基因进行相似性比对及遗传进化分析。使用生物信息学软件对该毒株VP2蛋白进行预测,包括理化性质、亲/疏水性、跨膜区、糖基化位点、亚细胞定位、二级结构、三级结构等。【结果】FPV LN3株VP2基因全长1 755 bp,编码584个氨基酸;与GenBank上登录的15株FPV同属一个大分支,相似性为98.9%~99.7%;与CPV处于不同分支上。生物信息学软件预测显示,FPV LN3株VP2蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构;含有7个潜在N-糖基化位点、86个O-糖基化位点和50个磷酸化位点;VP2蛋白在细胞质、细胞核、线粒体中的可能性分别为43.5%、34.8%和21.7%;VP2蛋白二级结构中无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-转角分别占61.82%、8.90%、24.32%及4.97%,三级结构预测结果与其一致;VP2蛋白共有20个抗原表位。【结论】VP2是FPV遗传变异的关键基因,FPV LN3株VP2蛋白属于亲水性、非跨膜稳定蛋白,共存在20个抗原表位。试验结果为进一步研究FPV VP2蛋白功能及研发新型疫苗提供理论依据。 展开更多
关键词 猫泛白细胞减少症病毒 VP2基因 生物信息学 蛋白结构
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