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我国华南蔗区甘蔗宿根矮化病的PCR分子检测 被引量:1
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作者 尉耀升 许珲镁 +4 位作者 呼忠婷 刘婷 刘玮婷 高三基 傅华英 《中国糖料》 2023年第2期61-67,共7页
宿根矮化病Ratoon stunting diseases(RSD)是由木质部限制性赖氏细菌木质部变种Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx)引起的一种主要甘蔗细菌性病害之一,在世界各甘蔗产区普遍发生。为明确我国主要蔗区RSD发生率和收获方式对RSD发生率的影响... 宿根矮化病Ratoon stunting diseases(RSD)是由木质部限制性赖氏细菌木质部变种Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx)引起的一种主要甘蔗细菌性病害之一,在世界各甘蔗产区普遍发生。为明确我国主要蔗区RSD发生率和收获方式对RSD发生率的影响,本文从广东和福建的罹病甘蔗蔗茎样品成功分离获得病原细菌,基于细菌16S核糖体和16-23S核糖体间隔序列(ITS)证实为Lxx。随后,从广西、广东和福建主要蔗区采集甘蔗品种蔗茎样品1446份,以靶标16-23S核糖体ITS区域的Lxx-F/Lxx-R为检测引物,开展RSD分子检测。结果表明,福建蔗区RSD检出率较低,为0~9.4%,广西、广东蔗区RSD检出率分别为20.4~85.2%和82.1%,尤其是广西龙州县和广东遂溪县蔗区,RSD检出率高达80%以上。在机械收获和人工砍刀收获方式下的宿根蔗蔗茎样品RSD检出率没有显著差异。本研究结果为我国蔗区RSD的科学防控提供依据。 展开更多
关键词 甘蔗 宿根矮化病 木质部限制性赖氏细菌木质部变种 PCR检测 检出率
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甘蔗宿根矮化病研究进展 被引量:7
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作者 徐景升 许莉萍 +2 位作者 阙友雄 高三基 陈如凯 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期184-188,共5页
综述了近年来甘蔗宿根矮化病的检测、传播、防治及其致病菌Leifsoniaxyli subsp.xyli的分类归属和致病机理等方面的研究进展,并探讨了研究策略。
关键词 甘蔗 RSD(Ratoon stunthlg disease) leifsonia xyli subsp.xyli
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甘蔗宿根矮化病菌PCR检测技术研究 被引量:19
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作者 周凌云 周国辉 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2006年第2期172-174,共3页
以甘蔗茎组织总DNA为模板,以16S rRNA基因赖氏细菌属(L eif son ia)通用引物为第一轮引物、甘蔗宿根矮化病菌(L eif son ia xy li subsp.xy li,Lxx)亚种特异引物为第二轮引物建立了Lxx巢式PCR检测技术。根据已报道的Lxx巴西分离物基因... 以甘蔗茎组织总DNA为模板,以16S rRNA基因赖氏细菌属(L eif son ia)通用引物为第一轮引物、甘蔗宿根矮化病菌(L eif son ia xy li subsp.xy li,Lxx)亚种特异引物为第二轮引物建立了Lxx巢式PCR检测技术。根据已报道的Lxx巴西分离物基因组全序列(G enB ank登录号AE 016822.1)设计了扩增致病相关基因片段的3个引物对,经多种组合进行了RCR检验,筛选出两个特异性好、灵敏高的引物对,建立了Lxx的多重PCR检测技术。克隆测序表明,PCR产物与巴西分离物基因组相应区段同一率为99%以上,从而证实了上述PCR技术的正确性。检测结果表明,广东样品的阳性率为90%,海南样品的阳性率为60%。 展开更多
关键词 甘蔗宿根矮化病菌 甘蔗 巢式PCR 双重PCR 检测
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Lxx侵染甘蔗后在蔗茎中的积累及对蔗茎组织结构的影响 被引量:2
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作者 郭莺 林志楷 +2 位作者 汪文华 刘黎卿 何恩铭 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期359-364,共6页
以接种病原菌Leifsonia xyli subsp.Xyli(Lxx)的‘拔地拉’(‘Badila’)甘蔗为研究材料,利用实时定量PCR技术研究病原菌Lxx在蔗茎中的积累情况,采用半薄切片技术研究茎维管束的病变规律。结果表明,在接种Lxx的Badila中,Lxx菌量积累随蔗... 以接种病原菌Leifsonia xyli subsp.Xyli(Lxx)的‘拔地拉’(‘Badila’)甘蔗为研究材料,利用实时定量PCR技术研究病原菌Lxx在蔗茎中的积累情况,采用半薄切片技术研究茎维管束的病变规律。结果表明,在接种Lxx的Badila中,Lxx菌量积累随蔗茎由基层到尾层呈现递减趋势。半薄切片结果表明,接种Lxx蔗茎基部维管组织中的韧皮部和木质部损坏严重,甘蔗茎节处相对茎间的基本细胞小得多,且具有木质部异形、细胞大小不一、细胞整体较为密集。接种Lxx蔗茎维管组织中的韧皮部和木质部损坏程度与Lxx菌量分布呈正相关。甘蔗茎节与茎间的组织结构差异是Lxx菌量由基层到尾层呈现递减的原因之一。本研究为进一步研究Lxx与甘蔗寄主的互作提供了理论依据。 展开更多
关键词 甘蔗 甘蔗宿根矮化病 Lxx 实时定量PCR 半薄切片
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甘蔗宿根矮化病菌PCR检测体系的优化与应用
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作者 李文凤 卢文洁 +3 位作者 黄应昆 王明强 王晓燕 罗志明 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期598-601,共4页
为建立能快速灵敏检测甘蔗宿根矮化病(ratoon stuning disease,RSD)的PCR检测方法。本文通过改进模板DNA的制备方法,在PCR基本程序的基础上,以甘蔗宿根矮化病菌(Leifsonia xyli subsp.xyli,Lxx)16S-23SrDNA基因间隔区特异性引物,调整PC... 为建立能快速灵敏检测甘蔗宿根矮化病(ratoon stuning disease,RSD)的PCR检测方法。本文通过改进模板DNA的制备方法,在PCR基本程序的基础上,以甘蔗宿根矮化病菌(Leifsonia xyli subsp.xyli,Lxx)16S-23SrDNA基因间隔区特异性引物,调整PCR扩增反应体系各组分的浓度、反应的退火温度、循环参数等主要因子,优化PCR反应体系。此检测体系能从感染RSD的样品中扩增出大小为438 bp的特异性片段,而阴性对照和未感染样品则未扩增出任何片断;未优化仅从稀释30倍的蔗汁总DNA中扩增出RSD的特异性片段,优化后可以从稀释3 000倍的蔗汁总DNA中扩增出RSD的特异性片段。对31份田间采集样品检测,未优化的阳性检出率为32.26%;优化后阳性检出率74.19%,与I-ELISA检测结果一致。应用此检测方法可稳定、快速地检测出蔗株是否感染RSD,且检测效率高,适合于田间大批量样品快速检测。 展开更多
关键词 甘蔗宿根矮化病菌 PCR检测 16S-23SrDNA 间接酶联免疫吸附法
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新引进果蔗品种宿根矮化病菌检测 被引量:3
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作者 吴夏明 沈万宽 +3 位作者 罗明珠 饶得花 陈培寿 姜子德 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期1046-1051,共6页
采用PCR和巢式PCR技术对6个新引进果蔗品种黔蔗08-1497,黔糖5号,云南红皮,广东黄皮,黔蔗08-688,黔糖3号和广东主栽果蔗品种黑皮果蔗(Badila)进行宿根矮化病菌检测,并对其中广东黄皮、云南红皮、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)的巢式PCR第二... 采用PCR和巢式PCR技术对6个新引进果蔗品种黔蔗08-1497,黔糖5号,云南红皮,广东黄皮,黔蔗08-688,黔糖3号和广东主栽果蔗品种黑皮果蔗(Badila)进行宿根矮化病菌检测,并对其中广东黄皮、云南红皮、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)的巢式PCR第二轮扩增产物(编号依次为Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4)进行核苷酸序列测定及分析。结果表明,PCR检测,仅黔蔗08-688甘蔗宿根矮化病菌检出率为20%(1/5),其余6个果蔗品种的宿根矮化病菌检出率均为0%;巢式PCR检测,黔蔗08-1497及黔糖5号宿根矮化病菌检出率为0%,广东黄皮检出率为75%;云南红皮、黔蔗08-688、黔糖3号及黑皮果蔗(Badila)检出率均为100%。Lxx-Gd-gz1、Lxx-Gd-gz2、Lxx-Gd-gz3及Lxx-Gd-gz4基因组相应区段核苷酸序列同源率为100%,均与巴西、澳大利亚、美国路易斯安娜州、中国云南、中国福建及广东湛江株系核苷酸序列同源率均为99%。表明该病菌遗传稳定性极高,变异极小。 展开更多
关键词 果蔗 宿根矮化病菌 PCR 巢式PCR 序列分析
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甘蔗宿根矮化病菌实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:7
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作者 王恒波 陈平华 +2 位作者 高三基 郭晋隆 陈如凯 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期232-238,共7页
甘蔗宿根矮化病是由Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx)引起的一种世界性甘蔗细菌病害。根据Lxx的Pat1基因保守序列,设计并合成了一对特异性引物Pat1F(5'-GGTTCCATTGCTTACCGATT-3')/Pat1R(5'-CAAGTTTCGACAGGAACAGC-3'),和... 甘蔗宿根矮化病是由Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx)引起的一种世界性甘蔗细菌病害。根据Lxx的Pat1基因保守序列,设计并合成了一对特异性引物Pat1F(5'-GGTTCCATTGCTTACCGATT-3')/Pat1R(5'-CAAGTTTCGACAGGAACAGC-3'),和一条Taq M an探针(FAM-5'-CCACGGCTACGTCAATTCGGG-3'-TAM RA),建立了一种特异性强、灵敏度高的甘蔗宿根矮化病菌实时荧光定量PCR检测方法。结果表明,本研究建立的实时荧光定量PCR方法,对Lxx的检测最低下限为102copies·μL-1。应用实时荧光定量PCR与常规PCR方法对14个甘蔗品种进行Lxx检测,阳性检出率分别为86%和43%,表明实时荧光定量PCR比常规PCR检测方法具有更高的灵敏度。研究结果为甘蔗宿根矮化病的诊断、田间发生动态监测、脱毒健康种苗检测及品种/材料交换检疫检测提供了新技术支撑。 展开更多
关键词 甘蔗 宿根矮化病菌 实时荧光定量PCR 检测
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甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR检测 被引量:8
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作者 沈万宽 刘睿 邓海华 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期508-512,共5页
为了探索甘蔗宿根矮化病快速检测技术,以细菌16S-23S rDNA内转录间隔区(ITS)通用引物ITS1/ITS2为第1轮引物,以甘蔗宿根矮化病菌特异引物Lxx1/Lxx2为第2轮引物,建立甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR检测技术。巢式PCR能扩增出438 bp的目的条带,... 为了探索甘蔗宿根矮化病快速检测技术,以细菌16S-23S rDNA内转录间隔区(ITS)通用引物ITS1/ITS2为第1轮引物,以甘蔗宿根矮化病菌特异引物Lxx1/Lxx2为第2轮引物,建立甘蔗宿根矮化病菌巢式PCR检测技术。巢式PCR能扩增出438 bp的目的条带,其核苷酸序列与巴西、澳大利亚及美国甘蔗宿根矮化病菌分离物核苷酸序列同源率为100%或99.8%;其检测灵敏度为10fg甘蔗宿根矮化病菌基因组DNA,较常规PCR提高100倍;样品检测结果也表明巢式PCR检测灵敏度明显优于常规PCR,可用于+1片嫩叶和心叶等微量病菌样品的检测。 展开更多
关键词 甘蔗 宿根矮化病菌 巢式PCR
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云南甘蔗宿根矮化病调查及种茎温水处理脱菌效果检测 被引量:3
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作者 李文凤 王晓燕 +2 位作者 黄应昆 卢文洁 罗志明 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期556-560,共5页
Based on the specific primer from the nucleotide sequences between 16S-23S rDNA,Polymerase chain reaction(PCR) approach for detecting Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx) was established.The approach was applied to detect L... Based on the specific primer from the nucleotide sequences between 16S-23S rDNA,Polymerase chain reaction(PCR) approach for detecting Leifsonia xyli subsp.xyli(Lxx) was established.The approach was applied to detect Lxx from 30 cultivars collected from two main sugar cane producing areas in Yunnan and 10 hot-water treatment samples.The results showed that 80% of the cultivars were infected by Lxx and hot-water treatment was proved to be an efficient measure to control but not completely eliminate Lxx in sugar cane tissues.The PCR products amplified from six infected cultivars were cloned and sequenced,six sequences were acquired and analyzed.It indicated that the six sequences were identical and showed 100% similarity with the isolates from Brazil,Australia and Fujian,and 99.54% with the isolate from Louisiana. 展开更多
关键词 甘蔗宿根矮化病 效果检测 温水处理 脱菌 种茎 云南 木质部 澳大利亚
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