我国内脏利什曼病山丘疫区与平原疫区利什曼原虫SSUrDNA多变区序列分析

[目的 ]分析我国内脏利什曼病 (VL)山丘疫区与平原疫区利什曼原虫 (L .d )分离株小亚基核糖体DNA (SSUrDNA)多变区的序列差异。 [方法 ]nDNA进行PCR扩增 ,将扩增出的SSUrDNA基因的特异片段克隆于 pGEMR TEasyVector上 ,采用通用引物M 13进行PCR扩增 ,全自动测序仪测序。 [结果 ]序列分析显示 ,扩增的 5株利什曼原虫SSUrDNA序列大小均为 392bp ;序列差异均发生在两个独特序列区 (UQ Ⅰ和UQ Ⅱ ) ;山丘疫区L .d甘肃分离株和四川分离株均在UQ Ⅱ区上有 2个相同的碱基突变 ,L .d甘肃分离株UQ Ⅰ区上有 1个碱基突变 ;无移码突变。 [结论 ]山丘疫区分离株与平原疫区分离株之间的碱基序列有差异 ,平原疫区L .d山东分离株与婴儿利什曼原虫 (L .infantum)

利什曼原虫中国分离株SSU rDNA多变区序列分析

目的分析我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株的 SSU r DNA多变区序列差异。方法 n DNA进行PCR扩增 ,将扩增出的 SSU r DNA基因的特异片段克隆于 p GEMR-T Easy Vector上 ,采用通用引物 M1 3进行 PCR扩增 ,全自动测序仪测序。结果序列分析显示本文报道的荒漠、山丘疫区的 2株利什曼原虫 (L.d.XJ771、L.d.SC6)的 SSU r DNA序列大小均为 3 92 bp;序列差异发生在两个独特序列区 (UQ- 和 UQ- ) ,无移码突变 ;与 Gene Bank中的利什曼原虫比较分析 ,同源性在 98%以上。结论我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株之间的 SSU r DNA多变区的碱基序列有差异 ;荒漠疫区分离株 L.d.XJ771与国际标准株 L.d.DD8的 SSU r

我国新疆皮肤利什曼病病原体SSU rDNA多变区序列分析

我国新疆皮肤利什曼病病原体（ＣＬＰ）种株鉴定尚有分歧。本研究用一对利什曼原虫属特异引物Ｒ２２２和Ｒ３３３，直接从皮肤利什曼病病人皮肤病变组织、热带利什曼原虫（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａｔｒｏｐｉｃａ）和婴儿利什曼原虫（Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ）基因组ＤＮＡ中扩增出一ＳＳＵｒＤＮＡ特异片段，克隆到ｐＧＥＭ○Ｒ－ＴＥａｓｙＶｅｃｔｏｒ上，并以双脱氧链末端终止法测序。序列分析显示扩增的ＣＬＰ、Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ和Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａＳＳＵｒＤＮＡ序列皆为３９１ｂｐ长，Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａ与ＣＬＰ的序列之间３８７个碱基相同，存在４个点突变；Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ与ＣＬＰ的序列之间３８３个碱基相同，存在７个点突变和２个移码突变；Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａ与Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ的序列之间３８７个碱基相同，存在３个点突变和２个移码突变。表明扩增的ＣＬＰ、Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ和Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａＳＳＵｒＤ－ＮＡ多变区序列高度同源，但仍存在少数点突变，或插入／缺失；该ＳＳＵｒＤＮＡ序列变异可反应种间差异；新疆皮肤利什曼病病原体与Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａ较相近。

云南省间日疟原虫SSUrRNA基因片段的体外扩增、克隆及序列分析

根据已知间日疟原虫、其它相关原虫及人小亚单位核糖体核糖核酸(SSUrRNA)基因序列,借助计算机程序分析,设计一对寡聚核苷酸引物。采用聚合酶链式反应(PCR)技术,从云南省两例间日疟患者血样DNA抽提物中,均扩增出长约641个碱基对(bp)的SSUrRNA基因特定片段;双脱氧链末端终止法测序结果表明,两份样本扩增片段DNA序列完全相同,但与背景序列比较,在第269位出现碱基置换由G变为A,而在第630位则缺失一碱基C,从而导致该两处限制性内切酶位点的改变。

我国内脏利什曼病不同疫区病原体小亚基核糖体DNA可变区序列差异(英文)

试验证实我国黑热病不同疫区分离出的 5个L d 分离株的小亚基核糖体DNA可变区序列存在点突变。方法 将 7个利什曼原虫种 /株的nDNA进行PCR扩增 ,将扩增出的SSUrDNA基因的特异片段克隆于pGEMR TEasyVector上 ,采用通用引物M1 3进行PCR扩增 ,全自动测序仪测序。结果 序列分析显示 ,扩增的 7种 /株利什曼原虫SSUrDNA序列大小为 3 92bp ,5个点突变均发生在两个独特序列区 (UQ I和UQ II) ;无移码突变。经与基因库中利什曼原虫序列类似性比较 ,同源性在 98%以上。结论 首次报道我国黑热病不同疫区的 5个L d 分离株的SSUrDNA可变区存在 5个点突变。