半定量凯氏定氮法和杜马斯燃烧法在牦牛肉中粗蛋白含量测定的比较

采用杜马斯燃烧法和半定量凯氏定氮法测定西藏类乌齐县6个乡镇共计60个牦牛肉样品中粗蛋白含量。结果表明,杜马斯燃烧法测定得到的牦牛肉(腱子肉)中粗蛋白含量范围在22.13%~26.11%,CV在2.4%~3.8%之间,相对标准偏差为1.04%;半定量凯氏定氮法测定得到的牦牛肉(腱子肉)中粗蛋白含量范围在21.25%~25.68%,CV为2.7%~4.1%,相对标准偏差为1.15%。在大批量牦牛肉的粗蛋白含量测定过程中,杜马斯燃烧法在试验准确性、精密度、稳定性及操作的便捷性方面均优于半定量凯氏定氮法,且该法效率高、操作便捷、更具推广性。

类乌齐牦牛ACTA1基因克隆、分子特性及差异表达分析

【目的】骨骼肌α肌动蛋白1(actin alpha1,ACTA1)主要参与骨骼肌纤维的发育,在骨骼肌活动中发挥重要作用。本试验主要扩增类乌齐牦牛ACTA1基因的cDNA序列,检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律。【方法】采用RT-PCR方法扩增并克隆类乌齐牦牛ACTA1基因CDS区;通过在线软件对其一级结构、二级结构、三级结构进行生物信息学分析;利用核苷酸序列及氨基酸序列进行同源性和系统进化树分析;应用RT-qPCR技术检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达模式。【结果】类乌齐牦牛ACTA1基因编码区全长1134bp,结构稳定,共编码377个氨基酸。生物信息学分析发现,类乌齐牦牛ACTA1基因编码的蛋白质是一种结构较稳定、带负电的亲水性蛋白,二、三级结构以α-螺旋为主,包含2个明显的跨膜区域,无信号肽,属胞内蛋白。保守结构域中含有明显的NDB区域,蛋白结构高度保守。同源性分析表明,类乌齐牦牛与水牛ACTA1基因的核苷酸及氨基酸同源性均较高。系统进化树分析显示,类乌齐牦牛与水牛亲缘关系最近,黄牛次之。实时荧光定量PCR结果显示,ACTA1基因在臀肌和大脑高表达。【结论】获得类乌齐牦牛ACTA1基因的CDS区全长1134bp,ACTA1基因在类乌齐牦牛肌肉和大脑组织中显著表达,为进一步研究分析ACTA1基因在调控牦牛肌肉发育及机制等方面奠定基础。

类乌齐牦牛全基因组RNA编辑位点预测及剖析

为揭示牦牛不同组织间受RNA编辑导致转录产物发生的差异变化,进而为牦牛的组织分化、系统遗传调控等研究提供候选基因。本研究以3头4.5岁类乌齐母牦牛的大脑、小脑、臀部脂肪以及肌肉组织作为试验材料,通过Illumina 4000测序平台对各组织表达产物进行扫描,利用SPRINT和JACUSA筛选差异的RNA编辑位点,分析RNA编辑位点的分类、注释以及变异风险评估等。结果发现了总计24 784个RNA编辑位点,其中在4个组织中均发现存在编辑事件的有4 015个位点;4个组织中的RNA编辑位点主要以A-G和T-C编辑类型为主;发现其中一个高风险编辑位点位于SON基因中,使该基因的翻译提前终止,这将导致该组织一些特定位点的RNA与DNA结合出现问题。本研究预测并分析了类乌齐牦牛大、小脑和臀部肌肉、脂肪组织中RNA编辑差异位点的类型和分布,为进一步研究牦牛组织分化和生长发育中重要的调控基因提供了新的参考。

类乌齐牦牛RNF216基因的克隆及组织表达分析

【目的】为获得类乌齐牦牛环指蛋白216抗体(ring finger protein 216,RNF216)基因的CDS区序列,并研究RNF216基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达情况。【方法】试验以0.5岁龄类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛RNF216基因CDS序列并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR(qPCR)方法检测RNF216基因在臀脂、臀肌、肝脏、肺脏、心脏和脾脏等组织器官中的表达情况。【结果】RNF216基因CDS区全长2610 bp,开放阅读框序列长2223 bp,共编码740个氨基酸。RNF216基因编码蛋白为不稳定亲水酸性蛋白,无信号肽和跨膜结构,主要分布在细胞核中。理化性质分析显示,牦牛RNF216蛋白存在24个丝氨酸、8个苏氨酸和9个酪氨酸磷酸化位点。一致性比较和进化树分析显示,牦牛与黄牛的遗传距离最近,与鼠类的遗传距离最远,且在进化过程中保守性强。组织表达分析显示,RNF216基因在类乌齐牦牛肺脏中的表达水平最高,其次是脾脏,然后是臀脂,在臀肌中的表达水平最低。【结论】本研究为进一步了解RNF216基因在调控牦牛肌肉生长发育方面提供参考数据。

类乌齐牦牛种质特性研究

类乌齐牦牛属以产肉为主的肉乳兼用型牦牛,是经过长期自然选择而形成的能适应当地生态环境的优良牦牛遗传资源,其形成历史悠久,具有基本一致的外貌特征、繁殖性能和生产性能,且适应性好、抗病力强、耐粗饲,主要经济性状遗传稳定。通过对类乌齐牦牛生境、起源、体型外貌、生产性能等资料收集与测定分析,以期为类乌齐牦牛的开发与利用提供可靠的参考。