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基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与支气管哮喘疾病进展研究
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作者 刘锡娇 黎友伦 《现代医药卫生》 2024年第11期1833-1839,共7页
目的基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与支气管哮喘疾病进展。方法选取基因表达公共数据库(GEO)中芯片数据集GSE207751和GEO222894,采用R软件的“Limma”和“DESeq2”软件包分析2个数据集中的差异表达基因(DEGs)和差异miRNA... 目的基于生物信息学探索let-7c-5p通过靶向OLFM4参与支气管哮喘疾病进展。方法选取基因表达公共数据库(GEO)中芯片数据集GSE207751和GEO222894,采用R软件的“Limma”和“DESeq2”软件包分析2个数据集中的差异表达基因(DEGs)和差异miRNA。利用hclust函数进行WCGNA分析。应用“ClusterProfiler”软件包进行基因本体(GO)功能注释富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析,STRING数据库建立蛋白互作网络(PPI网络),Cytoscape筛选严重哮喘患者的核心基因。miRWalk、miRBase和miRTarBase数据库用于靶基因的miRNA预测。结果分析获得80个DEGs,包括上调的OLFM4,进行WCGNA分析后发现和哮喘严重程度相关的Darked模块基因24个,之后进行PPI网格构建和mRNA-miRNA预测筛选出4个核心上调基因(包括OLFM4)和6个miRNA(包括hsa-let-7c-5p)。分析获得98个差异表达miRNA,其中上调5个,下调93个。进行轻度哮喘患者和重度哮喘患者差异miRNA交叉分析发现,let-7c-5p在轻度哮喘患者和重度哮喘患者中表达下调。结论研究多重验证了在哮喘患者中,let-7c-5p通过调控OLFM4影响哮喘的气道炎症和气道重塑,参与哮喘疾病进展,有利于了解哮喘疾病状态进展的潜在分子机制,同时验证了let-7c-5p成为哮喘潜在生物标志物的潜力,为进一步研究哮喘疾病进展提供理论基础。 展开更多
关键词 let-7c-5p OLFM4 支气管哮喘 疾病进展 生物标志物
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ExosomalmicroRNA let-7c-5p enhances cell malignant characteristics by inhibiting TAGLN in oral cancer
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作者 YI LI TIANYI WANG +3 位作者 HAORAN DING SHIYONG ZHUANG XIAOBO DAI BING YAN 《Oncology Research》 SCIE 2024年第10期1623-1635,共13页
Background:Oral cancer,a malignancy that is prevalent worldwide,is often diagnosed at an advanced stage.MicroRNAs(miRNAs)in circulating exosomes have emerged as promising cancer biomarkers.The role of miRNA let-7c-5p ... Background:Oral cancer,a malignancy that is prevalent worldwide,is often diagnosed at an advanced stage.MicroRNAs(miRNAs)in circulating exosomes have emerged as promising cancer biomarkers.The role of miRNA let-7c-5p in oral cancer remains underexplored,and its potential involvement in tumorigenesis warrants comprehensive investigation.Methods:Serum samples from 30 patients with oral cancer and 20 healthy controls were used to isolate exosomes and quantify their RNA content.Isolation of the exosomes was confirmed through transmission electron microscopy.Quantitative PCR was used to assess the miRNA profiles.The effects of let-7c-5p and TAGLN overexpression on oral cancer cell viability,migration,and invasion were analyzed via CCK-8 and Transwell assays.Moreover,we conducted mRNA sequencing of exosomal RNA from exosomes overexpressing let-7c-5p to delineate the gene expression profile and identify potential let-7c-5p target genes.Results:let-7c-5p was upregulated in serumderived exosomes of patients with oral cancer.Overexpression of let-7c-5p in the TCA8113 and CAL-27 cell lines enhanced their proliferative,migratory,and invasive capacities,and overexpression of let-7c-5p cell-derived exosomes promoted oral cancer cell invasiveness.Exosomal mRNA sequencing revealed 2,551 differentially expressed genes between control cell-derived exosomes and overexpressed let-7c-5p cell-derived exosomes.We further identified TAGLN as a direct target of let-7c-5p,which has been implicated in modulating the oncogenic potential of oral cancer cells.Overexpression of TAGLN reverses the promoting role of let-7c-5p on oral cancer cells.Conclusion:Our findings highlight the role of exosomal let-7c-5p in enhancing oral cancer cell aggressiveness by downregulating TAGLN expression,highlighting its potential as a diagnostic and therapeutic strategy. 展开更多
关键词 Oral cancer Exosomal microRNA let-7c-5p Tumorigenesis biomarkers Gene expression profiling TAGLN
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Let-7c-5p在食管鳞癌中的表达及生物学功能
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作者 郑雅心 康敏 《现代消化及介入诊疗》 2024年第3期302-306,共5页
目的探讨食管鳞癌(ESCC)中let-7c-5p的表达,同时分析let-7c-5p对ESCC细胞KYSE150增殖与迁移的影响。方法收集本院食管鳞癌组织标本42例,癌旁组织作为对照组,经由qRT-PCR(实时荧光定量聚合酶链反应)测定ESCC组织与其相邻癌旁组织内let-7c... 目的探讨食管鳞癌(ESCC)中let-7c-5p的表达,同时分析let-7c-5p对ESCC细胞KYSE150增殖与迁移的影响。方法收集本院食管鳞癌组织标本42例,癌旁组织作为对照组,经由qRT-PCR(实时荧光定量聚合酶链反应)测定ESCC组织与其相邻癌旁组织内let-7c-5p表达量;经由脂质体Lipofectamine 2000对KYSE150进行转染,qRT-PCR测定let-7c-5p于转染KYSE150细胞内的表达,借助CCK-8技术测定转染后细胞的增殖情况;通过伤口愈合试验与Transwell迁移试验对细胞迁移活性展开测定。结果ESCC组织内let-7c-5p mRNA表达量较其癌旁正常组织明显偏低(P=0.000);经过KYSE150细胞转染,在表达量上,let-7c-5p mimics较NC组明显偏高(P<0.05);转染组KYSE150增殖功能显示大幅下降,其迁移活性也大幅受抑。结论let-7c-5p在食管鳞癌中呈低表达,上调其表达能够明显抑制食管鳞癌KYSE150细胞增殖和抑制其迁移,为食管鳞癌患者的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。 展开更多
关键词 let-7c-5p 食管鳞癌 细胞增殖 细胞迁移
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双荧光素酶报告法验证乳腺癌中lncRNA PVT1为let-7c-5p的靶基因 被引量:3
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作者 张硕 沈泳 +1 位作者 高秀飞 谢小红 《浙江医学》 CAS 2020年第1期11-15,共5页
目的探索在乳腺癌中长链非编码RNA(lncRNA)浆细胞瘤转化迁移基因1(PVT1)是否为let-7c-5p的靶标基因。方法利用生物信息学软件预测PVT1序列上let-7c-5p的结合位点,PCR扩增出PVT1上包含结合位点的部分原序列片段以及敲除结合位点的突变序... 目的探索在乳腺癌中长链非编码RNA(lncRNA)浆细胞瘤转化迁移基因1(PVT1)是否为let-7c-5p的靶标基因。方法利用生物信息学软件预测PVT1序列上let-7c-5p的结合位点,PCR扩增出PVT1上包含结合位点的部分原序列片段以及敲除结合位点的突变序列片段并连接到pRL-TK载体上,重组成pRL-TK-Pw和pRL-TK-Pm质粒,再与对照质粒pGL3以及let-7c-5p或微小RNA(miRNA)-NC mimics共转染至乳腺癌细胞系MCF-7细胞中。作用48h后,使用双荧光素酶检测试剂盒裂解细胞并检测荧光素酶活性。结果与对照组比较,let-7c-5p能够有效抑制含PVT1原序列的pRL-TK-Pw报告载体的荧光素酶活性,而对敲除了结合位点的pRL-TK-Pm报告载体则无明显抑制作用。结论乳腺癌中PVT1为let-7c-5p的靶标基因。 展开更多
关键词 let-7c-5p pVT1 双荧光素酶报告法 乳腺癌 长链非编码RNA 微小RNA
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miR-let-7c-5p通过靶向HMGA2抑制膀胱癌细胞侵袭和迁移 被引量:4
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作者 姚越 张冲 +3 位作者 熊言骏 韩兵 高幸福 汪盛 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1022-1029,共8页
目的探讨miR-let-7c-5p能否调控HMGA2抑制膀胱癌细胞侵袭和迁移。方法生物信息学方法确定miR-let-7c-5p的关键基因;RT-qPCR和Western blot检测膀胱癌和癌旁组织中miR-let-7c-5p mRNA和HMGA2蛋白相对表达量。以人正常膀胱细胞SV-HUC-1作... 目的探讨miR-let-7c-5p能否调控HMGA2抑制膀胱癌细胞侵袭和迁移。方法生物信息学方法确定miR-let-7c-5p的关键基因;RT-qPCR和Western blot检测膀胱癌和癌旁组织中miR-let-7c-5p mRNA和HMGA2蛋白相对表达量。以人正常膀胱细胞SV-HUC-1作为对照,RT-qPCR和Western blot检测膀胱癌细胞系T24,UM-UC-3,5637细胞中miR-let-7c-5p mRNA和HMGA2蛋白的相对表达量。对UM-UC-3细胞中miR-let-7c-5p分别进行上调和下调,上调实验设模拟物阴性对照组(mimic NC)、miR-let-7c-5p模拟物组(mimicmiR-let-7c-5p)、下调实验设阴性对照组(inhibitor NC)及miR-let-7c-5p抑制剂组(si-miRlet-7c-5p),双荧光素酶实验、RT-qPCR和Western blot法共同验证miR-let-7c-5p和HMGA2的靶向关系;Transwell小室检测单独上调或下调miR-let-7c-5p表达及同时下调miR-let-7c-5p和HMGA2表达UM-UC-3细胞侵袭和迁移的变化;Western blot检测上皮间质转化(EMT)相关蛋白(E-cadherin,N-cadherin,vimentin,Snail)相对表达量。结果HMGA2为miR-let-7c-5p的靶基因之一;与癌旁组织相比,膀胱癌组织中miR-let-7c-5pmRNA相对表达量降低(P<0.05),HMGA2蛋白相对表达量增加(P<0.05);与SV-HUC-1细胞相比,UM-UC-3细胞中miR-let-7c-5p相对表达量显著降低,HMGA2显著增加(P=0.01)。上调miRlet-7c-5p表达,UM-UC-3细胞侵袭和迁移能力均显著下降(P<0.05);下调miR-let-7c-5p表达,UM-UC-3细胞侵袭和迁移能力均显著增加(P<0.05);当同时下调miR-let-7c-5p和HMGA2表达UM-UC-3细胞侵袭和迁移能力显著下降(P<0.05)。Western blot结果显示,上调miR-let-7c-5p表达,E-cadherin表达增加,N-cadherin,vimentin,Snail蛋白表达下降;下调miR-let-7c-5p表达,Ecadherin表达下降,N-cadherin,vimentin,Snail蛋白表达增加;同时下调miR-let-7c-5p和HMGA2表达能够抑制UM-UC-3细胞EMT(P<0.05)。结论miR-let-7c-5p通过靶向HMGA2抑制EMT进而抑制UM-UC-3细胞侵袭和迁移。 展开更多
关键词 膀胱癌 miR-let-7c-5p HMGA2 上皮间质转化 侵袭迁移
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藏红花素调控lncRNA TTTY15/let-7c-5p通路保护帕金森病细胞损伤模型机制研究 被引量:3
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作者 黄宁宁 喻跃国 王晓蓉 《新中医》 CAS 2020年第19期14-20,共7页
目的:探讨藏红花素对帕金森病细胞损伤模型的影响和可能机制。方法:不同浓度(10、50、100μmol/L)的藏红花素作用于1-甲基-4-苯基-吡啶离子(MPP+)诱导SK-N-SH细胞,试剂盒检测细胞中丙二醛(MDA)和还原性谷胱甘肽(GSH)的含量,流式细胞术... 目的:探讨藏红花素对帕金森病细胞损伤模型的影响和可能机制。方法:不同浓度(10、50、100μmol/L)的藏红花素作用于1-甲基-4-苯基-吡啶离子(MPP+)诱导SK-N-SH细胞,试剂盒检测细胞中丙二醛(MDA)和还原性谷胱甘肽(GSH)的含量,流式细胞术检测细胞凋亡,实时荧光定量PCR (RT-qPCR)检测长链非编码RNA (lncRNA)睾丸特异性转录Y-连锁15 (TTTY15)和微小RNA (miRNA) let-7c-5p的表达水平。双荧光素酶报告实验和RT-qPCR确定TTTY15和let-7c-5p之间的靶向关系。分别转染TTTY15小干扰RNA (si-TTTY15)、let-7c-5p模拟物至人神经母细胞瘤细胞(SK-N-SH),采用上述方法检测敲低TTTY15或过表达let-7c-5p对MPP+诱导的SK-N-SH细胞损伤的影响。结果:与Con组比较,MPP+组SK-N-SH细胞MDA含量升高,GSH含量显著降低(P<0.05);与MPP+组比较,MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组SK-N-SH细胞MDA含量降低,GSH含量升高(P<0.05)。MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组3组MDA、GSH变化与藏红花素剂量相关,MDA随剂量增加而降低,GSH随剂量增加而升高(P<0.05)。与Con组比较,MPP+组SK-N-SH细胞凋亡率、Bax蛋白表达升高,Bcl-2蛋白表达降低(P<0.05);与MPP+组比较,MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组SK-N-SH细胞凋亡率、Bax蛋白表达降低,Bcl-2蛋白表达升高(P<0.05)。MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组之间各检测指标比较,差异有统计学意义(P<0.05)。与Con组比较,MPP+组SK-N-SH细胞TTTY15表达升高,let-7c-5p表达降低(P<0.05);与MPP+组比较,MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组SK-N-SH细胞TTTY15表达降低,let-7c-5p表达升高(P<0.05)。MPP++crocin-L组、MPP++crocin-M组、MPP++crocin-H组各指标组间比较,差异有统计学意义(P<0.05)。与miR-NC组比较,let-7c-5p组WT-TTTY15的SK-N-SH细胞荧光素酶活性降低(P<0.05);miR-NC组与let-7c-5p组MUT-TTTY15的SK-N-SH细胞荧光素酶活性比较,差异无统计学意义(P>0.05)。与pcDNA组比较,pcDNA-TTTY15组SK-N-SH细胞let-7c-5p表达降低(P<0.05);与si-NC组比较,si-TTTY15组SK-N-SH细胞let-7c-5p表达升高(P<0.05)。与MPP++si-NC组比较,MPP++si-TTTY15组SK-N-SH细胞TTTY15的表达水平降低,凋亡率、Bax蛋白表达、MDA含量降低,Bcl-2蛋白表达、GSH含量升高(P<0.05)。与MPP++NC组比较,MPP++let-7c-5p组SK-N-SH细胞let-7c-5p的表达水平升高,凋亡率、Bax蛋白表达、MDA含量降低,Bcl-2蛋白表达、GSH含量升高(P<0.05)。结论:藏红花素对帕金森病细胞损伤模型具有保护作用,其机制可能与下调lncRNA TTTY15/let-7c-5p通路有关。 展开更多
关键词 藏红花素 帕金森病 细胞损伤 TTTY15 let-7c-5p 1-甲基-4-苯基-吡啶离子
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RGS16 regulated by let-7c-5p promotes glioma progression by activating PI3K-AKT pathway 被引量:3
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作者 Chaochao Wang Hao Xue +7 位作者 Rongrong Zhao Zhongzheng Sun Xiao Gao Yanhua Qi Huizhi Wang Jianye Xu Lin Deng Gang Li 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2023年第1期143-155,共13页
Gliomas are the most common central nervous system tumours;they are highly aggressive and have a poor prognosis. RGS16 belongs to the regulator of G-protein signalling (RGS) protein family, which plays an important ro... Gliomas are the most common central nervous system tumours;they are highly aggressive and have a poor prognosis. RGS16 belongs to the regulator of G-protein signalling (RGS) protein family, which plays an important role in promoting various cancers, such as breast cancer, pancreatic cancer, and colorectal cancer. Moreover, previous studies confirmed that let-7c-5p, a well-known microRNA, can act as a tumour suppressor to regulate the progression of various tumours by inhibiting the expression of its target genes. However, whether RGS16 can promote the progression of glioma and whether it is regulated by miR let-7c-5p are still unknown. Here, we confirmed that RGS16 is upregulated in glioma tissues and that high expression of RGS16 is associated with poor survival. Ectopic deletion of RGS16 significantly suppressed glioma cell proliferation and migration both in vitro and in vivo. Moreover, RGS16 was validated as a direct target gene of miR let-7c-5p. The overexpression of miR let-7c-5p obviously downregulated the expression of RGS16, and knocking down miR let-7c-5p had the opposite effect. Thus, we suggest that the suppression of RGS16 by miR let-7c-5p can promote glioma progression and may serve as a potential prognostic biomarker and therapeutic target in glioma. 展开更多
关键词 RGS16 let-7c-5p GLIOMA proliferation migration
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miR-let-7c-5p靶向c-myc在白血病细胞定向单核/巨噬细胞分化中的作用机制研究 被引量:2
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作者 孙瑞婧 王玉芳 +4 位作者 王朝喆 吴沄桦 都鹏超 毕可红 姜国胜 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2023年第10期577-586,共10页
目的探讨miR-let-7c-5p/c-myc信号轴在白血病细胞定向单核/巨噬细胞分化中的调控作用。方法采用PMA+LPS+IFN-γ诱导THP-1白血病细胞向单核/巨噬细胞定向分化,PBS作为对照组。诱导48 h后CCK8法测定细胞增殖水平;流式细胞仪测定细胞CD11b... 目的探讨miR-let-7c-5p/c-myc信号轴在白血病细胞定向单核/巨噬细胞分化中的调控作用。方法采用PMA+LPS+IFN-γ诱导THP-1白血病细胞向单核/巨噬细胞定向分化,PBS作为对照组。诱导48 h后CCK8法测定细胞增殖水平;流式细胞仪测定细胞CD11b与CD14分化抗原表达水平;RT-qPCR检测白血病细胞分化前后miR-let-7c-5p和c-myc的表达变化;蛋白质印迹法检测c-myc蛋白表达变化;双荧光素酶结合实验检测miR-let-7c-5p与c-myc的3′UTR靶向结合和活性调控关系;转染miR-let-7c-5p mimic观察c-myc表达变化后细胞的增殖分化水平变化;过表达c-myc拯救实验观察miR-let-7c-5p对PMA+LPS+IFN-γ诱导的THP-1细胞增殖分化的影响。THP-1细胞转染miR-let-7c-5p inhibitor,观察c-myc表达变化对THP-1定向分化为M1样巨噬细胞的影响。结果与PBS对照组相比,PMA+LPS+IFN-γ诱导48 h后,THP-1细胞的增殖能力明显降低(0.64±0.01 vs 0.33±0.01,t=45.190,P<0.001)。PMA+LPS+IFN-γ实验组的CD11b和CD14平均阳性表达率升高[(5.51±0.89)%vs(17.72±0.86)%,t=17.050,P<0.001;(6.22±0.70)%vs(16.42±0.14)%,t=24.650,P<0.001]。PMA+LPS+IFN-γ实验组的c-myc蛋白表达水平降低(0.87±0.02 vs 0.64±0.06,t=6.041,P=0.004)。PMA+LPS+IFN-γ实验组的miR-let-7c-5p基因表达量高于对照组,而c-myc基因表达量低于对照组,均P<0.001。Luciferase实验证实,miR-let-7c-5p mimic+c-myc-WT组的荧光素酶活性明显低于mimics NC+c-myc-WT组(0.88±0.09 vs 0.62±0.05,t=4.320,P=0.013)。转染miR-let-7c-5p mimic后,miR-let-7c-5p mimic组的c-myc蛋白表达水平低于miR-let-7c-5p mimic NC组(1.03±0.08 vs 0.39±0.07,t=10.420,P<0.001),伴有细胞增殖水平的降低(0.64±0.01 vs 0.42±0.01,t=30.160,P<0.001),CD11b和CD14阳性表达率升高[(2.18±0.53)%vs(22.10±0.87)%,t=33.530,P<0.001;(3.37±0.73)%vs(22.98±5.43)%,t=6.195,P=0.004]。拯救实验结果表明,miR-let-7c-5p mimics+c-myc vector组的c-myc蛋白表达水平高于miR-let-7c-5p mimics组(0.53±0.02 vs 0.84±0.05,t=9.250,P<0.001)。miR-let-7c-5p mimics组的THP-1细胞增殖D值低于miR-let-7c-5p mimics+c-myc vector组(0.62±0.01 vs 0.42±0.01,t=20.330,P<0.001)。miR-let-7c-5p mimics组的平均CD11b、CD14阳性表达率高于miR-let-7c-5p mimics+c-myc vector组[(6.17±0.76)%vs(19.57±5.96)%,t=3.865,P=0.018;(10.36±1.13)%vs(34.89±3.19)%,t=12.56,P<0.001]。miR-let-7c-5p inhibitor干预PMA+LPS+IFN-γ实验组结果显示,与对照组相比较,PMA+LPS+IFN-γ诱导THP-1细胞分化后,c-myc蛋白的表达水平显著降低(0.97±0.05 vs 0.34±0.19,t=5.377,P=0.006),CXCL9、CXCL10、iNOS基因的相对表达水平明显升高,均P<0.001。与PMA+LPS+IFN-γ实验组相比较,PMA+LPS+IFN-γ+miR-let-7c-5p inhibitor组的c-myc蛋白相对表达水平显著升高(0.34±0.06 vs 0.96±0.07,t=11.310,P<0.001),而CXCL9、CXCL10、iNOS基因的相对表达水平明显降低,均P<0.001。结论miR-let-7c-5p可以靶向结合c-myc 3′UTR区,miR-let-7c-5p/c-myc信号轴是白血病细胞定向分化为单核/巨噬细胞的重要途径之一。 展开更多
关键词 白血病细胞 诱导分化 单核/巨噬细胞 miR-let-7c-5p c-MYC
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