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基于LiCl法优化酿酒葡萄叶片的RNA提取
1
作者
成丹丹
范丽娜
+2 位作者
王美娇
于放
王燕燕
《山西农业科学》
2024年第2期50-57,共8页
为获得纯度高、质量好的酿酒葡萄植株叶片RNA以用于荧光实时定量分析,为后续以酿酒葡萄叶片RNA为材料研究相关转录水平的调控提供技术保障,以经典酿酒葡萄赤霞珠叶片为试验材料,比较分析了重蒸酚法、Trizol法、改良的十六烷基三甲基溴化...
为获得纯度高、质量好的酿酒葡萄植株叶片RNA以用于荧光实时定量分析,为后续以酿酒葡萄叶片RNA为材料研究相关转录水平的调控提供技术保障,以经典酿酒葡萄赤霞珠叶片为试验材料,比较分析了重蒸酚法、Trizol法、改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和LiCl法(基于改良的SDS法)4种方法对酿酒葡萄叶片RNA提取的影响。结果表明,重蒸酚法提取RNA浓度较低,完整性较差,存在部分降解;Trizol法提取的RNA则有部分DNA污染;改良CTAB法提取浓度较高,但蛋白和DNA污染严重;LiCl法提取结果显示,28S的条带亮度是18S的2倍,条带无拖尾,完整性较好,存在DNA污染和少量的蛋白污染。进一步在LiCl法基础上利用醋酸钠、DNAase消化、苯酚抽提法进一步优化,并采用荧光实时定量验证,结果表明,醋酸钠的加入RNA质量无明显改善;然而,经氯仿和水饱和酚(体积比1∶1)抽提2次,氯仿抽提1次,氯仿和水饱和酚(体积比1∶1)抽提1次,并经DNAase进行消化,最终提取出质量浓度为173.611μg/mL、A_(260/280)为1.803纯度高、完整性较好且无蛋白和DNA污染的葡萄叶片总RNA;经实时荧光定量PCR进一步验证,该方法提取的RNA经反转录后获得较好的扩增曲线以及融解曲线,并能够对相关基因进行定量分析。
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关键词
酿酒葡萄
赤霞珠
RNA提取
licl法
优化
QRT-PCR
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职称材料
山药组织总RNA提取方法的比较与分析
被引量:
18
2
作者
覃芳
王军民
+5 位作者
何海旺
何龙飞
李创珍
韦本辉
何虎翼
甘秀芹
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期755-759,共5页
采用异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法、Trizol法和CTAB-LiCl法等3种方法,分别对山药叶片和块茎进行总RNA提取效果进行了比较。结果表明,Trizol法难以提取RNA,异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法提取RNA效果不理想,存在DNA污染,这2种方法不适...
采用异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法、Trizol法和CTAB-LiCl法等3种方法,分别对山药叶片和块茎进行总RNA提取效果进行了比较。结果表明,Trizol法难以提取RNA,异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法提取RNA效果不理想,存在DNA污染,这2种方法不适合于富含多糖类物质的山药组织总RNA的提取;CTAB-LiCl法提取叶片和块茎组织总RNA质量高、完整性好、成功率高,可作为山药类植物总RNA提取的首选方法。
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关键词
山药
RNA提取
异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性
法
TRIZOL
法
CTAB—
licl法
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职称材料
半夏叶片总RNA四种提取方法及效果的比较
被引量:
7
3
作者
吴林
薛建平
+1 位作者
徐有明
田振东
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期901-905,共5页
目的 针对三叶半夏成熟叶片化学成分复杂,富含多糖、酚类及其他多种化学物质的特点,选择优化一种简便、经济、高效的半夏成熟叶片高质量总RNA提取方法。方法 用4种不同的RNA抽提方法如异硫氰酸胍法、皂土法、CTAB—LiCl法和改进的SDS...
目的 针对三叶半夏成熟叶片化学成分复杂,富含多糖、酚类及其他多种化学物质的特点,选择优化一种简便、经济、高效的半夏成熟叶片高质量总RNA提取方法。方法 用4种不同的RNA抽提方法如异硫氰酸胍法、皂土法、CTAB—LiCl法和改进的SDS/酚法提取总RNA,通过电泳、紫外分光光度计检测以及RT-PCR验证等对提取结果进行分析比较。结果 4种方法均能从半夏成熟叶片中提取到总RNA。其中皂土法的提取过程只需3~4h,是其他3种提取方法所用时间的一半。提取1g叶片的成本只有其他3种方法的1/13~1/14。此法提取的总RNA18S、28S带型清晰无弥散,完整性好,无严重的蛋白质和其他杂质污染,A260/A280为1.8~2.O,A260/A230大于2.O,且总RNA的产率高,为365.744μg/g鲜重,提取的总RNA适用于RT-PCR试验。结论 皂土法提取的RNA完全适用于DDRT-PCR、Northern blotting、cDNA文库构建等分子生物学研究,是一种快速、经济,适于抽提半夏总RNA的好方法。
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关键词
半夏
RNA提取
皂土
法
异硫氰酸胍
法
CTAB—
licl法
SDS/酚
法
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职称材料
嗜酸乳杆菌表层蛋白提取方法及影响因素的研究
被引量:
5
4
作者
李振梅
陈营
+1 位作者
安利国
邵占涛
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2007年第1期44-47,共4页
对嗜酸乳杆菌S层蛋白的提取方法进行了改进.用酸性5mol/LLiCl法,中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法提取嗜酸乳杆菌的表层蛋白,考马斯亮兰法测蛋白浓度,进行常规SDS-PAGE,用Gel-Pro软件进行数据分析,得出其中酸性5mol/LLiCl法提取表层蛋白...
对嗜酸乳杆菌S层蛋白的提取方法进行了改进.用酸性5mol/LLiCl法,中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法提取嗜酸乳杆菌的表层蛋白,考马斯亮兰法测蛋白浓度,进行常规SDS-PAGE,用Gel-Pro软件进行数据分析,得出其中酸性5mol/LLiCl法提取表层蛋白百分含量最多.分析影响提取条件的因素,设置0、4、室温(25℃)3个温度梯度和10、15、20、25、30min5个时间梯度,进行常规SDS-PAGE,检测提取表层蛋白的效果.Sephadex G-100柱分离中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法提取嗜酸乳杆菌的表层蛋白获得SA蛋白.酸性5mol/LLiCl法可用于分析各种表层蛋白;中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法用于提取43kDa的SA蛋白.25℃处理15min得到最大量的表层蛋白.
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关键词
嗜酸乳杆菌
S层蛋白
酸性5
mol/L
licl法
中性5
mol/L
licl法
8
mol/L尿素
法
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职称材料
从茶树种胚中提取总RNA方法的研究
被引量:
2
5
作者
胥振国
江昌俊
+3 位作者
张莉
杨书运
袁支红
谭振
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第6期66-68,共3页
茶树种胚中富含多糖和多酚类化合物,这增加了总RNA的提取难度。试验以茶树种胚为研究对象,通过对几种提取总RNA方法的比较与分析,认为用改进的CTAB-LiCl法提取茶树种胚总RNA的产率较高,质量好,可直接用于cDNA的合成、cDNA-AFLP分析等分...
茶树种胚中富含多糖和多酚类化合物,这增加了总RNA的提取难度。试验以茶树种胚为研究对象,通过对几种提取总RNA方法的比较与分析,认为用改进的CTAB-LiCl法提取茶树种胚总RNA的产率较高,质量好,可直接用于cDNA的合成、cDNA-AFLP分析等分子生物学实验操作。
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关键词
苍树种胚
多糖
多酚
总RNA
CTAB—
licl法
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职称材料
高效海藻DNA提取方法研究
被引量:
1
6
作者
韩静
余舜武
罗利军
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2008年第5期530-534,共5页
简单、高效的抽提DNA是进行分子生物学研究的基础。选取三种不同海藻纲中的条斑紫菜、条浒苔、钝顶螺旋藻为材料,通过采用改良的CTAB法、LiCl法及试剂盒法抽提基因组DNA并进行比较,以找出适用于各种藻类DNA提取的快速有效方法。结果表...
简单、高效的抽提DNA是进行分子生物学研究的基础。选取三种不同海藻纲中的条斑紫菜、条浒苔、钝顶螺旋藻为材料,通过采用改良的CTAB法、LiCl法及试剂盒法抽提基因组DNA并进行比较,以找出适用于各种藻类DNA提取的快速有效方法。结果表明适当提高裂解液与样品比能有效降低材料中多糖与蛋白质、酚类等杂质,提高DNA纯度和得率。经过修改后,三种方法都能有效抽提DNA,其中试剂盒法省时,所得到的DNA纯度最高,但得率较低且成本高。CTAB法与LiCl法也均能得到高质量的DNA,但LiCl法相对而言更简捷有效。此外,抽提前的材料预处理对DNA质量有明显影响。
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关键词
海藻
DNA提取
licl法
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职称材料
芳纶1313/芳纶1414纤维混纺织物定量化学分析方法探讨
7
作者
赵玄熙
江敏
+2 位作者
孙建科
张广东
苏凤辉
《纺织标准与质量》
2020年第6期30-34,共5页
为了准确、快速、稳定地定量分析芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织物,采用正交试验法对LiCl/DMF(N,N-二甲基甲酰胺)法定量分析其混纺织物的试验环境进行了优选方案的设计、分析、选择与验证。该试验结果表明,芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织...
为了准确、快速、稳定地定量分析芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织物,采用正交试验法对LiCl/DMF(N,N-二甲基甲酰胺)法定量分析其混纺织物的试验环境进行了优选方案的设计、分析、选择与验证。该试验结果表明,芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织物可采用4.0%的LiCl/DMF(N,N-二曱基曱酰胺)溶液在90℃恒温水浴中振荡溶解60min的方法进行定量分析,LiCl/DMF(N,N-二曱基甲酰胺)溶液对不溶纤维(芳纶1414)的质量修正系数(d)为1.00。该试验表明,采用4.0%的LiCl/DMF(N,N-二甲基甲酰胺)法定量分析芳纶1313/芳纶1414纤维混纺织物有很好的准确性和稳定性。
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关键词
纤维
芳纶1313
芳纶1414
定量分析
licl
/DMF
法
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职称材料
题名
基于LiCl法优化酿酒葡萄叶片的RNA提取
1
作者
成丹丹
范丽娜
王美娇
于放
王燕燕
机构
大连工业大学生物工程学院
出处
《山西农业科学》
2024年第2期50-57,共8页
基金
国家自然科学基金面上项目(31970324)
辽宁省教育厅基础研究项目(J2020042)。
文摘
为获得纯度高、质量好的酿酒葡萄植株叶片RNA以用于荧光实时定量分析,为后续以酿酒葡萄叶片RNA为材料研究相关转录水平的调控提供技术保障,以经典酿酒葡萄赤霞珠叶片为试验材料,比较分析了重蒸酚法、Trizol法、改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和LiCl法(基于改良的SDS法)4种方法对酿酒葡萄叶片RNA提取的影响。结果表明,重蒸酚法提取RNA浓度较低,完整性较差,存在部分降解;Trizol法提取的RNA则有部分DNA污染;改良CTAB法提取浓度较高,但蛋白和DNA污染严重;LiCl法提取结果显示,28S的条带亮度是18S的2倍,条带无拖尾,完整性较好,存在DNA污染和少量的蛋白污染。进一步在LiCl法基础上利用醋酸钠、DNAase消化、苯酚抽提法进一步优化,并采用荧光实时定量验证,结果表明,醋酸钠的加入RNA质量无明显改善;然而,经氯仿和水饱和酚(体积比1∶1)抽提2次,氯仿抽提1次,氯仿和水饱和酚(体积比1∶1)抽提1次,并经DNAase进行消化,最终提取出质量浓度为173.611μg/mL、A_(260/280)为1.803纯度高、完整性较好且无蛋白和DNA污染的葡萄叶片总RNA;经实时荧光定量PCR进一步验证,该方法提取的RNA经反转录后获得较好的扩增曲线以及融解曲线,并能够对相关基因进行定量分析。
关键词
酿酒葡萄
赤霞珠
RNA提取
licl法
优化
QRT-PCR
Keywords
wine grape
Cabernet Sauvignon
RNA extraction
licl
method optimization
Real-time fluorescence quantita-tive PCR(qRT-PCR)
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
山药组织总RNA提取方法的比较与分析
被引量:
18
2
作者
覃芳
王军民
何海旺
何龙飞
李创珍
韦本辉
何虎翼
甘秀芹
机构
广西大学农学院
广西农业科学院经济作物研究所
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期755-759,共5页
基金
国家自然科学基金(30760126)资助
文摘
采用异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法、Trizol法和CTAB-LiCl法等3种方法,分别对山药叶片和块茎进行总RNA提取效果进行了比较。结果表明,Trizol法难以提取RNA,异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性法提取RNA效果不理想,存在DNA污染,这2种方法不适合于富含多糖类物质的山药组织总RNA的提取;CTAB-LiCl法提取叶片和块茎组织总RNA质量高、完整性好、成功率高,可作为山药类植物总RNA提取的首选方法。
关键词
山药
RNA提取
异硫氰酸胍-巯基乙醇联合变性
法
TRIZOL
法
CTAB—
licl法
Keywords
Dioseorea opposita Tbunb., RNA extraction, Guanidinium isothiocyanate method, Trizol method, CTAB-
licl
method
分类号
S632.1 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
半夏叶片总RNA四种提取方法及效果的比较
被引量:
7
3
作者
吴林
薛建平
徐有明
田振东
机构
淮北煤炭师范学院生物系
华中农业大学园艺林学学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期901-905,共5页
基金
国家农业成果转化资金资助项目(05EFN213400124)
文摘
目的 针对三叶半夏成熟叶片化学成分复杂,富含多糖、酚类及其他多种化学物质的特点,选择优化一种简便、经济、高效的半夏成熟叶片高质量总RNA提取方法。方法 用4种不同的RNA抽提方法如异硫氰酸胍法、皂土法、CTAB—LiCl法和改进的SDS/酚法提取总RNA,通过电泳、紫外分光光度计检测以及RT-PCR验证等对提取结果进行分析比较。结果 4种方法均能从半夏成熟叶片中提取到总RNA。其中皂土法的提取过程只需3~4h,是其他3种提取方法所用时间的一半。提取1g叶片的成本只有其他3种方法的1/13~1/14。此法提取的总RNA18S、28S带型清晰无弥散,完整性好,无严重的蛋白质和其他杂质污染,A260/A280为1.8~2.O,A260/A230大于2.O,且总RNA的产率高,为365.744μg/g鲜重,提取的总RNA适用于RT-PCR试验。结论 皂土法提取的RNA完全适用于DDRT-PCR、Northern blotting、cDNA文库构建等分子生物学研究,是一种快速、经济,适于抽提半夏总RNA的好方法。
关键词
半夏
RNA提取
皂土
法
异硫氰酸胍
法
CTAB—
licl法
SDS/酚
法
Keywords
Pinellia ternata (Thunb.) Breit.
RNA extraction
bentonite method
guanidine isothiocyanate method
CTAB-
licl
method~ SDS/phenol method
分类号
R282.1 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
嗜酸乳杆菌表层蛋白提取方法及影响因素的研究
被引量:
5
4
作者
李振梅
陈营
安利国
邵占涛
机构
山东师范大学生命科学院动物抗性实验室
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2007年第1期44-47,共4页
文摘
对嗜酸乳杆菌S层蛋白的提取方法进行了改进.用酸性5mol/LLiCl法,中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法提取嗜酸乳杆菌的表层蛋白,考马斯亮兰法测蛋白浓度,进行常规SDS-PAGE,用Gel-Pro软件进行数据分析,得出其中酸性5mol/LLiCl法提取表层蛋白百分含量最多.分析影响提取条件的因素,设置0、4、室温(25℃)3个温度梯度和10、15、20、25、30min5个时间梯度,进行常规SDS-PAGE,检测提取表层蛋白的效果.Sephadex G-100柱分离中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法提取嗜酸乳杆菌的表层蛋白获得SA蛋白.酸性5mol/LLiCl法可用于分析各种表层蛋白;中性5mol/LLiCl法和8mol/L尿素法用于提取43kDa的SA蛋白.25℃处理15min得到最大量的表层蛋白.
关键词
嗜酸乳杆菌
S层蛋白
酸性5
mol/L
licl法
中性5
mol/L
licl法
8
mol/L尿素
法
Keywords
Lactobacillus brevis
S-layer protein
5 mol / L
licl
(pH 2) method
5 mol / L LiC1 (pH 7) method
8 mol/L urea method
分类号
Q939 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
从茶树种胚中提取总RNA方法的研究
被引量:
2
5
作者
胥振国
江昌俊
张莉
杨书运
袁支红
谭振
机构
安徽农业大学茶叶生物化学与生物技术重点实验室
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第6期66-68,共3页
基金
安徽省教育厅自然科学研究计划重点项目(2004kj137zd)
文摘
茶树种胚中富含多糖和多酚类化合物,这增加了总RNA的提取难度。试验以茶树种胚为研究对象,通过对几种提取总RNA方法的比较与分析,认为用改进的CTAB-LiCl法提取茶树种胚总RNA的产率较高,质量好,可直接用于cDNA的合成、cDNA-AFLP分析等分子生物学实验操作。
关键词
苍树种胚
多糖
多酚
总RNA
CTAB—
licl法
Keywords
tea plant embryos
polysaccharides
polyphenols
total RNA
CTAB-
licl
method
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
高效海藻DNA提取方法研究
被引量:
1
6
作者
韩静
余舜武
罗利军
机构
上海海洋大学水产与生命学院
上海市农业生物基因中心作物遗传改良国家重点实验室种质资源分室
出处
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2008年第5期530-534,共5页
基金
上海市青年科技启明星计划(06QA1404)
文摘
简单、高效的抽提DNA是进行分子生物学研究的基础。选取三种不同海藻纲中的条斑紫菜、条浒苔、钝顶螺旋藻为材料,通过采用改良的CTAB法、LiCl法及试剂盒法抽提基因组DNA并进行比较,以找出适用于各种藻类DNA提取的快速有效方法。结果表明适当提高裂解液与样品比能有效降低材料中多糖与蛋白质、酚类等杂质,提高DNA纯度和得率。经过修改后,三种方法都能有效抽提DNA,其中试剂盒法省时,所得到的DNA纯度最高,但得率较低且成本高。CTAB法与LiCl法也均能得到高质量的DNA,但LiCl法相对而言更简捷有效。此外,抽提前的材料预处理对DNA质量有明显影响。
关键词
海藻
DNA提取
licl法
Keywords
algae
DNA isolation
LiC1 method
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
芳纶1313/芳纶1414纤维混纺织物定量化学分析方法探讨
7
作者
赵玄熙
江敏
孙建科
张广东
苏凤辉
机构
深圳市计量质量检测研究院
出处
《纺织标准与质量》
2020年第6期30-34,共5页
文摘
为了准确、快速、稳定地定量分析芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织物,采用正交试验法对LiCl/DMF(N,N-二甲基甲酰胺)法定量分析其混纺织物的试验环境进行了优选方案的设计、分析、选择与验证。该试验结果表明,芳纶1313与芳纶1414纤维混纺织物可采用4.0%的LiCl/DMF(N,N-二曱基曱酰胺)溶液在90℃恒温水浴中振荡溶解60min的方法进行定量分析,LiCl/DMF(N,N-二曱基甲酰胺)溶液对不溶纤维(芳纶1414)的质量修正系数(d)为1.00。该试验表明,采用4.0%的LiCl/DMF(N,N-二甲基甲酰胺)法定量分析芳纶1313/芳纶1414纤维混纺织物有很好的准确性和稳定性。
关键词
纤维
芳纶1313
芳纶1414
定量分析
licl
/DMF
法
分类号
TS107 [轻工技术与工程—纺织工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于LiCl法优化酿酒葡萄叶片的RNA提取
成丹丹
范丽娜
王美娇
于放
王燕燕
《山西农业科学》
2024
0
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职称材料
2
山药组织总RNA提取方法的比较与分析
覃芳
王军民
何海旺
何龙飞
李创珍
韦本辉
何虎翼
甘秀芹
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009
18
下载PDF
职称材料
3
半夏叶片总RNA四种提取方法及效果的比较
吴林
薛建平
徐有明
田振东
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
下载PDF
职称材料
4
嗜酸乳杆菌表层蛋白提取方法及影响因素的研究
李振梅
陈营
安利国
邵占涛
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2007
5
下载PDF
职称材料
5
从茶树种胚中提取总RNA方法的研究
胥振国
江昌俊
张莉
杨书运
袁支红
谭振
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008
2
下载PDF
职称材料
6
高效海藻DNA提取方法研究
韩静
余舜武
罗利军
《上海水产大学学报》
CSCD
北大核心
2008
1
下载PDF
职称材料
7
芳纶1313/芳纶1414纤维混纺织物定量化学分析方法探讨
赵玄熙
江敏
孙建科
张广东
苏凤辉
《纺织标准与质量》
2020
0
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职称材料
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