目的:基于网络药理学和分子对接探讨连朴饮治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)伴胃肠道症状的作用机制和作用靶点。方法:运用中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,...目的:基于网络药理学和分子对接探讨连朴饮治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)伴胃肠道症状的作用机制和作用靶点。方法:运用中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)检索连朴饮的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库收集疾病相关靶点。借助String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并使用Cytoscape对网络进行拓扑分析,获取核心靶点,通过R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最终将核心基因与主要活性成分进行分子对接验证。结果:本研究预测连朴饮所含中药的有效成分43个,对应靶点197个;拓扑分析得到转录活化蛋白1、白细胞介素-8、环氧合酶2、低氧诱导因子-1等12个核心靶点。KEGG通路富集分析筛选得到连朴饮治疗COVID-19合胃肠道症状154条通路,主要包含脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路,集中抗炎、抗病毒、调节免疫。分子对接结果表明,活性成分能分别与核心靶点结合,具有较好的亲和力。结论:连朴饮可能通过槲皮素、山柰酚等活性成分作用于STAT1、CXCL8、PTGS2、HIF1A等关键靶点,并通过调节AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路等相关通路调控体内炎症水平,起到治疗COVID-19治疗胃肠道症状的作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学和分子对接探讨连朴饮治疗新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)伴胃肠道症状的作用机制和作用靶点。方法:运用中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)检索连朴饮的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库收集疾病相关靶点。借助String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并使用Cytoscape对网络进行拓扑分析,获取核心靶点,通过R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最终将核心基因与主要活性成分进行分子对接验证。结果:本研究预测连朴饮所含中药的有效成分43个,对应靶点197个;拓扑分析得到转录活化蛋白1、白细胞介素-8、环氧合酶2、低氧诱导因子-1等12个核心靶点。KEGG通路富集分析筛选得到连朴饮治疗COVID-19合胃肠道症状154条通路,主要包含脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路,集中抗炎、抗病毒、调节免疫。分子对接结果表明,活性成分能分别与核心靶点结合,具有较好的亲和力。结论:连朴饮可能通过槲皮素、山柰酚等活性成分作用于STAT1、CXCL8、PTGS2、HIF1A等关键靶点,并通过调节AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路等相关通路调控体内炎症水平,起到治疗COVID-19治疗胃肠道症状的作用。