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生物信息学方法解析食管鳞状细胞癌中的配体-受体相互作用图谱和预后影响
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作者 朱元增 张秀磊 +4 位作者 王剑南 张倩 杨志煜 鲁迪 孙培春 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2024年第5期532-538,共7页
目的探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的作用及关键的LR对及其对预后的影响,以深入理解ESCC的预后机制。方法基于TCGA-ESCC数据集,通过对单细胞RNA测序(single-ce... 目的探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的作用及关键的LR对及其对预后的影响,以深入理解ESCC的预后机制。方法基于TCGA-ESCC数据集,通过对单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)数据的分析,研究了ESCC样本中的关键基因表达和细胞类型相互作用。研究基于16种LR的表达,将79个ESCC样本分为两组,并通过Lasso分析识别出关键基因。进一步,本研究通过分析GSE154763数据集,揭示了ESCC的细胞类型和相互作用。结果通过Lasso分析,识别出IL1A、LAMA3、TMEM45A和IGF2BP2四个关键基因,这些基因对ESCC生存有显著影响,并据此构建了有效的预后模型。通过进一步分析GSE154763数据集,鉴定出19个簇和10种细胞类型,发现4种细胞群体在ESCC与正常组织中的表达差异显著。结论本研究通过分析单细胞RNA和TCGA-ESCC数据,揭示了ESCC中关键的LR和细胞亚群。我们构建的基于四个基因的预后模型显示出优异的预测能力,为ESCC的治疗提供了新的生物标志物和潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 配体 受体 单细胞RNA测序 细胞通讯 预后
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可溶性CD40配体通过长链非编码RNA linc00239对THP-1细胞生物学行为的影响
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作者 封忠昕 李梅 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期88-96,共9页
目的:探讨CD40配体(CD40L)通过长链非编码RNA(lncRNA)linc00239对人单核细胞白血病THP-1细胞生物学行为的影响,阐明其可能的作用机制。方法:构建linc00239过表达载体(pcDNA-linc00239)和干扰载体(sh-linc00239),转染至THP-1细胞,采用实... 目的:探讨CD40配体(CD40L)通过长链非编码RNA(lncRNA)linc00239对人单核细胞白血病THP-1细胞生物学行为的影响,阐明其可能的作用机制。方法:构建linc00239过表达载体(pcDNA-linc00239)和干扰载体(sh-linc00239),转染至THP-1细胞,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测转染效率。THP-1细胞分为对照组、空载体(vector)组、pcDNA-linc00239组、sh-linc00239组、vector+CD40L组、pcDNA-linc00239+CD40L组和sh-linc00239+CD40L组。RT-qPCR法检测各组细胞中linc00239表达水平,CCK-8法检测各组细胞增殖活性,流式细胞术检测各组不同细胞周期细胞百分率和细胞凋亡率,RT-qPCR法和Western blotting法检测各组细胞中B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)和Bcl-2关联X蛋白(Bax)mRNA和蛋白表达水平,Western blotting法检测各组细胞中蛋白激酶B(AKT)和磷酸化AKT(p-AKT)蛋白表达水平并计算p-AKT/AKT比值。结果:与vector组比较,pcDNA-linc00239组细胞增殖活性和G_(2)期细胞百分率明显升高(P<0.05或P<0.01),细胞中linc00239、Bcl-2 mRNA及蛋白表达水平和p-AKT/AKT比值明显升高(P<0.05或P<0.01),G_(1)期细胞百分率、细胞凋亡率和细胞中Bax mRNA及蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与vector组比较,sh-linc00239组和vector+CD40L组细胞增殖活性和G_(2)期细胞百分率明显降低(P<0.05或P<0.01),细胞中linc00239、Bcl-2 mRNA和蛋白表达水平及p-AKT/AKT比值明显降低(P<0.05或P<0.01),G_(1)期细胞百分率、细胞凋亡率和细胞中Bax mRNA及蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01)。与pcDNA-linc00239组比较,pcDNA-linc00239+CD40L组细胞增殖活性和G_(2)期细胞百分率明显降低(P<0.05或P<0.01),细胞中linc00239、Bcl-2 mRNA和蛋白表达水平及p-AKT/AKT比值明显降低(P<0.05或P<0.01),G_(1)期细胞百分率、细胞凋亡率和细胞中Bax mRNA及蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01);与sh-linc00239组比较,sh-linc00239+CD40L组细胞增殖活性和G_(2)期细胞百分率明显降低(P<0.05或P<0.01),细胞中linc00239、Bcl-2 mRNA和蛋白表达水平及p-AKT/AKT比值明显降低(P<0.05或P<0.01),G_(1)期细胞百分率、细胞凋亡率和细胞中Bax mRNA及蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01)。结论:CD40L可通过linc00239抑制THP-1细胞增殖和细胞周期进展,并诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 CD40配体 长链非编码RNA linc00239 急性髓系白血病 细胞周期 细胞凋亡
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子宫动脉超声血流参数、血清LncRNA FAM99A、CCL21水平与妊娠期高血压疾病患者病情程度及预后的相关性分析
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作者 袁梅 刘芳 孙改艳 《黑龙江医药科学》 2024年第4期24-28,共5页
目的:探讨妊娠期高血压疾病(hypertensive disorders of pregnancy,HDP)患者子宫动脉超声血流参数、血清长链非编码RNA家族成员A序列相似性99(LncRNA FAM99A)、CC趋化因子配体21(CCL21)水平变化,并分析其与病情程度相关性及其对预后的... 目的:探讨妊娠期高血压疾病(hypertensive disorders of pregnancy,HDP)患者子宫动脉超声血流参数、血清长链非编码RNA家族成员A序列相似性99(LncRNA FAM99A)、CC趋化因子配体21(CCL21)水平变化,并分析其与病情程度相关性及其对预后的评估价值。方法:回顾性选取2021年1月至2023年12月于开封市第三人民医院诊治的126例HDP患者作为研究组,另选取健康孕产妇42例作为对照组。比较两组不同病情程度者子宫动脉超声血流参数[子宫动脉收缩期/舒张期血流最大速度(systolic/diastolic,S/D)、子宫动脉阻力指数(resistance index,RI)、子宫动脉搏动指数(pulsation index,PI)]、血清LncRNA FAM99A、CCL21水平。分析子宫动脉超声血流参数、血清LncRNA FAM99A、CCL21与病情程度相关性。依据预后情况分为预后不良亚组27例、预后良好亚组99例,比较其子宫动脉超声血流参数、血清LncRNA FAM99A、CCL21水平。分析预后不良的影响因素。评价子宫动脉超声血流参数、血清LncRNA FAM99A、CCL21对预后不良的评估价值。结果:研究组S/D、RI、PI及血清CCL21水平高于对照组,血清LncRNA FAM99A水平低于对照组(P<0.05);S/D、RI、PI、CCL21与病情程度呈正相关(r=0.526、0.418、0.509、0.624,P<0.05),LncRNA FAM99A与病情程度呈负相关(r=-0.637,P<0.05);预后不良亚组S/D、RI、PI及血清CCL21水平高于预后良好亚组,血清LncRNA FAM99A水平低于预后良好亚组(P<0.05);S/D、RI、PI、CCL21为预后不良的危险因素,LncRNA FAM99A为预后不良的保护因素(P<0.05);S/D、RI、PI、LncRNA FAM99A、CCL21联合评估预后的AUC大于单项指标评估(P<0.05)。结论:HDP患者S/D、RI、PI及血清CCL21水平升高,血清LncRNA FAM99A水平降低,且与病情程度及预后密切相关,联合检测其水平对预后具有一定评估价值。 展开更多
关键词 妊娠期高血压疾病 子宫动脉超声血流参数 长链非编码RNA家族成员A序列相似性99 CC趋化因子配体21 预后
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CircPARD3调控miR-326/CXCL3轴对口腔鳞状细胞癌细胞迁移、侵袭及上皮间质转化的影响
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作者 尹江 唐平 +1 位作者 张慧 杨森 《河北医药》 CAS 2023年第24期3697-3702,共6页
目的探究环状RNA PARD3(circPARD3)靶向微小RNA-326(miR-326)/趋化因子配体3(CXCL3)轴对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移、侵袭及上皮间质转化(EMT)的影响。方法qRT-PCR法分析OSCC组织及细胞中circPARD3和miR-326表达水平。双荧光素酶实... 目的探究环状RNA PARD3(circPARD3)靶向微小RNA-326(miR-326)/趋化因子配体3(CXCL3)轴对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移、侵袭及上皮间质转化(EMT)的影响。方法qRT-PCR法分析OSCC组织及细胞中circPARD3和miR-326表达水平。双荧光素酶实验验证circPARD3和miR-326、CXCL3和miR-326的靶向关系。在OSCC细胞CAL-27中转染si-NC、si-circPARD3、si-circPARD3+anti-NC、si-circPARD3+anti-miR-326、miR-NC、miR-326 mimics,将未转染的CAL-27细胞设为对照组。平板克隆实验检测细胞增殖;细胞划痕实验检测细胞迁移;Transwell实验检测细胞侵袭能力。Western blot法检测上皮细胞钙粘蛋白(E-cadherin)、神经性钙黏附蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(Vimentin)的蛋白表达。小鼠移植瘤实验验证circPARD3对OSCC肿瘤生长及miR-326/CXCL3的影响。结果在OSCC组织与细胞中,circPARD3表达上调,miR-326表达下调,抑制circPARD3表达可以显著抑制OSCC细胞增殖、迁移、侵袭及EMT。抑制miR-326可以逆转抑制circPARD3表达对OSCC细胞增殖、迁移、侵袭及EMT的抑制作用。小鼠移植瘤实验结果显示,抑制circPARD3表达,移植瘤体积及质量降低,miR-326表达水平升高,CXCL3表达水平降低。结论circPARD3在OSCC组织与细胞中表达上调,抑制circPARD3表达,上调miR-326表达,进而抑制CXCL3表达,抑制OSCC细胞迁移、侵袭及EMT。 展开更多
关键词 环状RNA PARD3 微小RNA-326 趋化因子配体3 口腔鳞状细胞癌 迁移 侵袭 上皮间质转化
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MiR-424-5p调控PD-1/PD-L1信号通路对弥漫大B细胞淋巴瘤细胞耐药性的影响 被引量:3
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作者 袁军 韩虎 +2 位作者 董巍 王瑞仓 郝洪岭 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期96-103,共8页
目的:探讨微小RNA-424-5p(mi R-424-5p)调控程序性死亡受体-1(PD-1)/程序性死亡配体-1(PD-L1)信号通路对弥漫大B细胞淋巴瘤细胞耐药性的影响。方法:诱导人弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系CRL2631细胞构建CRL2631-CHOP耐药细胞株。RT-q PCR和Wes... 目的:探讨微小RNA-424-5p(mi R-424-5p)调控程序性死亡受体-1(PD-1)/程序性死亡配体-1(PD-L1)信号通路对弥漫大B细胞淋巴瘤细胞耐药性的影响。方法:诱导人弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系CRL2631细胞构建CRL2631-CHOP耐药细胞株。RT-q PCR和Western blot分别检测CRL2631细胞和CRL2631-CHOP细胞中mi R-424-5p、PD-L1 m RNA和蛋白及多元药物抗性基因-1(MDR-1)蛋白表达水平。双荧光素酶报告基因实验验证mi R-424-5p的靶标基因。使用mi RNA模拟/干扰技术和噻唑蓝法检测CRL2631细胞和CRL2631-CHOP细胞对CHOP方案化疗药物的耐药性。结果:与CRL2631细胞相比,CRL2631-CHOP细胞对CHOP方案化疗药物的耐药性显著增高,细胞中MDR-1蛋白水平(P<0.05)、PD-L1 m RNA和蛋白水平显著增高(均P<0.001),而mi R-424-5p相对水平显著降低(P<0.001)。双荧光素酶报告基因实验结果显示,PD-L1是mi R-424-5p下游直接靶标基因(P<0.001)。转染mi R-424-5p inhibitor后,CRL2631细胞对CHOP方案化疗药物的耐药性增高,且MDR-1蛋白水平(P<0.01)、PD-L1 m RNA和蛋白水平显著增高(均P<0.01);转染mi R-424-5p mimics后,CRL2631-CHOP细胞对CHOP药物的耐药性降低,且MDR-1蛋白水平(P<0.001)、PD-L1 m RNA和蛋白水平显著降低(均P<0.001);过表达PD-L1可逆转上调mi R-424-5p对PD-L1的抑制作用(P<0.001)。结论:下调mi R-424-5p通过调控PD-1/PD-L1信号通路增强了弥漫大B细胞淋巴瘤细胞的耐药性。 展开更多
关键词 微小RNA-424-5p 程序性死亡受体-1 程序性死亡配体-1 弥漫大B细胞淋巴瘤 耐药性
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RNA干扰肺癌细胞H460 FasL表达对T细胞凋亡的影响 被引量:7
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作者 向明章 蒋耀光 +1 位作者 王慧春 林一丹 《中国肺癌杂志》 CAS 2007年第1期5-8,共4页
背景与目的已有的研究表明肺癌细胞可通过上调Fas配体(FasL)表达、借助FasL/Fas凋亡途径反杀伤Fas阳性肿瘤浸润淋巴细胞(TIL),主动逃避免疫监视,导致肿瘤局部抗肿瘤免疫下降。本研究旨在探讨遗传修饰调节肺癌细胞FasL基因表达对T细胞凋... 背景与目的已有的研究表明肺癌细胞可通过上调Fas配体(FasL)表达、借助FasL/Fas凋亡途径反杀伤Fas阳性肿瘤浸润淋巴细胞(TIL),主动逃避免疫监视,导致肿瘤局部抗肿瘤免疫下降。本研究旨在探讨遗传修饰调节肺癌细胞FasL基因表达对T细胞凋亡的影响。方法通过质粒载体,将体外化学合成的靶向FasL的小干扰RNA(siRNA)直接转染人大细胞肺癌细胞株H460,采用RT-PCR和Westernblot技术观察肺癌细胞FasLmRNA及蛋白表达的变化及其诱导T细胞凋亡的改变。结果化学合成的靶向FasL基因的siRNA能够显著下调肺癌细胞H460FasLmRNA和蛋白表达水平,产生序列特异性干扰效果。RNA干扰(RNAi)抑制H460细胞FasL表达后可以降低和逆转肺癌细胞诱导的T细胞凋亡,恢复T细胞增殖能力。结论FasL是一新的具有发展前途的肺癌基因治疗靶位。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 FASL RNAI 凋亡
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慢病毒介导RNAi抑制大肠癌细胞APRIL表达对化疗敏感性的影响 被引量:4
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作者 关婧 孙爱民 +1 位作者 王莉慧 何美蓉 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1600-1604,共5页
目的探讨慢病毒介导的RNA干扰(RNA interference,RNAi)沉默APRIL基因对大肠癌细胞株LOVO化疗敏感性的影响。方法实验分为3组:siRNA-APRIL组、非特异性序列组和空白对照组。制备siRNA-APRIL慢病毒表达载体,PCR筛选阳性克隆,测序鉴定。转... 目的探讨慢病毒介导的RNA干扰(RNA interference,RNAi)沉默APRIL基因对大肠癌细胞株LOVO化疗敏感性的影响。方法实验分为3组:siRNA-APRIL组、非特异性序列组和空白对照组。制备siRNA-APRIL慢病毒表达载体,PCR筛选阳性克隆,测序鉴定。转染LOVO细胞48 h后,Western blot检测LOVO细胞的APRIL表达水平;同时用10μg/ml5-FU处理细胞,5-FU作用72 h后,采用流式细胞仪检测细胞凋亡和细胞周期变化,MTT法检测细胞增殖抑制率。结果PCR和测序证实,成功构建siRNA-APRIL慢病毒表达载体。Western blot检测表明siRNA-APRIL组的APRIL表达水平下调。5-FU处理LOVO细胞后,流式细胞仪检测各组的凋亡率分别为(21.12±3.35)%、(13.06±1.92)%和(12.28±1.79)%,siRNA-APRIL组显著高于另两组(P<0.01),且G0/G1期细胞增多,G2/M期细胞减少(P<0.05);MTT法检测显示各组的增殖抑制率分别为(59.67±5.03)%、(42.33±4.16)%、和(39.67±4.73)%,siRNA-APRIL组显著高于另两组(P<0.01)。结论以APRIL为靶标的RNA干扰能下调大肠癌细胞株LOVO中的APRIL表达,增强其对5-FU的化疗敏感性。 展开更多
关键词 增殖诱导配体 RNA干扰 LOVO细胞 5-氟尿嘧啶
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大肠癌细胞表达的Fas配体具有功能性 被引量:1
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作者 丁尔迅 王强 +1 位作者 付志仁 陈学云 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第9期803-805,共3页
目的 :探讨大肠癌细胞 Fas配体 (Fas L ) m RNA和蛋白的表达及其功能。方法 :分别采用 RT- PCR和 Western印迹法以及氚释放细胞活性测定技术检测大肠癌细胞株中 Fas L m RNA和蛋白的表达及其功能。结果 :所检测的 6株大肠癌细胞(RPMI 4... 目的 :探讨大肠癌细胞 Fas配体 (Fas L ) m RNA和蛋白的表达及其功能。方法 :分别采用 RT- PCR和 Western印迹法以及氚释放细胞活性测定技术检测大肠癌细胞株中 Fas L m RNA和蛋白的表达及其功能。结果 :所检测的 6株大肠癌细胞(RPMI 4788、HCT- 116、DL D- 1、L o Vo、Wi Dr和 COL O 32 0 DM)全部表达 Fas L m RNA和蛋白 ;DL D- 1,L o Vo和 Wi Dr等部分大肠癌细胞具有 Fas依赖的细胞毒活性。其中 DL D- 1细胞活性具有量效关系 ,并且乙酸肉豆蔻佛波醇 (PMA )和离子霉素(ionom ycine )刺激能显著增强 DL D- 1的细胞活性。结论 :DL D- 1、L o Vo和 Wi Dr等 3株大肠癌细胞表达功能性 Fas配体 ,并可能以此反击机体免疫系统 ,逃避免疫监督。 展开更多
关键词 FAS配体 MRNA 大肠癌 PT-PCR Westem印迹法 氚释放细胞活性
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靶向胰腺癌细胞株增殖诱导配体基因小干扰RNA的制备及纯化 被引量:1
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作者 毛振彪 邵建国 +3 位作者 王唯一 谭畅 黄伟达 黄介飞 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期827-832,共6页
目的:制备及纯化针对增殖诱导配体基因(APRIL)的小干扰RNA(APRIL siRNA),为进一步研究APRIL基因在人胰腺癌中的作用奠定基础。方法:构建靶向胰腺癌CFPAC-1细胞株APRIL基因双链RNA(APRIL dsRNA)的表达质粒pET-22b-APRIL,在大肠杆菌中发... 目的:制备及纯化针对增殖诱导配体基因(APRIL)的小干扰RNA(APRIL siRNA),为进一步研究APRIL基因在人胰腺癌中的作用奠定基础。方法:构建靶向胰腺癌CFPAC-1细胞株APRIL基因双链RNA(APRIL dsRNA)的表达质粒pET-22b-APRIL,在大肠杆菌中发酵表达APRIL dsRNA,并利用CF-11树脂亲和层析纯化;用大肠杆菌Ⅲ型RNA水解酶(RNaseⅢ)水解dsRNA,制备APRIL siRNA,应用DEAE树脂离子交换层析使RNaseⅢ与核苷酸分离,分子筛层析进一步分离纯化APRIL siRNA。将纯化后的APRIL siRNA转染CHO细胞,荧光显微镜下观察转染后CHO细胞APRIL蛋白的表达情况。结果:pET-22b-APRIL转染大肠杆菌后,经IPTG诱导能大量表达APRIL dsRNA,表达产物经CF-11树脂纯化能得到纯化的APRIL dsRNA;dsRNA经RNaseⅢ水解后,过DEAE树脂离子交换层析柱,经5%PAGE、12%SDS-PAGE电泳证实RNaseⅢ与核苷酸分离,进一步经分子筛层析分离纯化,得到纯化APRIL siRNA。荧光显微镜下观察结果表明,APRIL siR- NA转染CHO细胞能明显抑制APRIL蛋白的表达。结论:成功制备了靶向CFPAC-1细胞株的APRIL siRNA,为下一步敲减CFPAC-1细胞APRIL基因的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 增殖诱导配体 RNA干扰 胰腺肿瘤 体外转录法
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不同浓度葡萄糖对MG63细胞株护骨素及其配体mRNA表达的影响 被引量:4
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作者 周玮 张南雁 姬秋和 《医学临床研究》 CAS 2005年第12期1651-1653,共3页
【目的】观察不同浓度葡萄糖对具有成骨细胞表型特征的MG63细胞株护骨素(OPG)、护骨素配体(OPGL)mRNA表达的影响。【方法】用MTT比色分析法测定细胞增殖,流式细胞仪检测细胞周期,用逆转录PCR(RT-PCR)法检测基因表达情况。【结果】①葡... 【目的】观察不同浓度葡萄糖对具有成骨细胞表型特征的MG63细胞株护骨素(OPG)、护骨素配体(OPGL)mRNA表达的影响。【方法】用MTT比色分析法测定细胞增殖,流式细胞仪检测细胞周期,用逆转录PCR(RT-PCR)法检测基因表达情况。【结果】①葡萄糖以浓度依赖方式抑制MG63细胞的增殖,并将细胞阻滞于G1期。②高糖下调MG63细胞中OPG的表达,上调OPGL的表达。【结论】高糖可抑制MG63细胞的增殖,减少MG63细胞中OPG的表达,增加OPGL的表达,使破骨细胞的数目和活性增加,骨吸收增强和骨量丢失,这可能是糖尿病骨质疏松症的一个重要的发病机制。 展开更多
关键词 骨质疏松 葡萄糖 配体 RNA 信使
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慢病毒载体介导RNA干扰体外抑制人胰腺癌细胞增殖诱导配体的表达 被引量:1
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作者 王峰 陈琳 +1 位作者 邵建国 毛振彪 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期53-58,共6页
目的:观察慢病毒表达载体介导的RNA干扰(RNAi)对人胰腺癌细胞株CFPAC-1增殖诱导配体(a proliferation-inducingligand,APRIL)表达的影响,为后续的以APRIL基因为靶点的胰腺癌基因治疗研究奠定基础。方法:应用基因工程技术,筛选出3条针对A... 目的:观察慢病毒表达载体介导的RNA干扰(RNAi)对人胰腺癌细胞株CFPAC-1增殖诱导配体(a proliferation-inducingligand,APRIL)表达的影响,为后续的以APRIL基因为靶点的胰腺癌基因治疗研究奠定基础。方法:应用基因工程技术,筛选出3条针对APRIL基因的RNAi靶序列,分别与pGCL-GFP载体连接,构建3个重组慢病毒表达载体LV-APRILshRNA1、LV-APRIL shRNA2、LV-APRIL shRNA3;将连接产物转化到DH5α感受态细胞,经PCR筛选阳性克隆、测序鉴定。将LV-APRIL shRNA、pHelper1.0、pHelper2.0共转染293T细胞,包装产生慢病毒颗粒并测定病毒滴度。将包装产生的3种重组慢病毒分别感染CFPAC-1细胞,实时定量PCR和Western印迹检测CFPAC-1细胞APRIL mRNA和蛋白的表达,并与未转染及空转染细胞进行比较。结果:3个慢病毒载体PCR和测序结果与预期结果一致,经包装产生的病毒滴度分别为5×107、6×107、4×107TU/ml。感染CFPAC-1细胞后,APRIL基因mRNA和蛋白的表达量与未感染慢病毒的细胞组及空载体感染组相比均明显下降(P<0.05),其中LV-APRIL shRNA1、LV-APRIL shRNA2作用较明显,使mRNA表达分别下降73%和68%,蛋白表达分别下降66%和59%(P<0.05);而未感染慢病毒的细胞组与空载体组相比无统计学差异。结论:成功构建针对APRIL基因的3个慢病毒载体LV-APRIL shRNA,体外感染CFPAC-1细胞后可有效抑制APRIL基因和蛋白的表达。 展开更多
关键词 增殖诱导配体 RNA干扰 慢病毒 胰腺癌
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可溶性FasL联合survivin RNA干扰诱导肺腺癌细胞凋亡 被引量:3
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作者 刘黎明 陈昌杰 +3 位作者 陈正徐 胡博 段光军 胡华成 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期615-619,共5页
目的:探讨可溶性FasL(sFasL)联合survivin RNA干扰对肺腺癌细胞A549增殖和凋亡的影响。方法:构建survivin特异RNA小干扰表达载体,DNA测序,转染A549细胞。G418(geneticin)筛选稳定表达survivin RNA小干扰细胞株,荧光实时定量RT-PCR、免... 目的:探讨可溶性FasL(sFasL)联合survivin RNA干扰对肺腺癌细胞A549增殖和凋亡的影响。方法:构建survivin特异RNA小干扰表达载体,DNA测序,转染A549细胞。G418(geneticin)筛选稳定表达survivin RNA小干扰细胞株,荧光实时定量RT-PCR、免疫印迹(Western blot)和免疫组化法检测survivin mRNA和蛋白表达。sFasL作用于转染后细胞,四甲基偶氮唑蓝(MTT)法和流式细胞仪检测细胞活性和凋亡率。结果:成功构建survivin-siRNA表达载体,筛选出稳定表达单克隆细胞。Survivin mRNA和蛋白表达分别下降76.4%(P<0.01)和84.5%,免疫组化也显示survivin下调。sFasL联合survivinRNA干扰细胞,光密度值在各时间点较siRNA组、sFasL组和对照组均明显降低(P<0.01),抑制率增加;凋亡率较siRNA组、sFasL组和对照组明显增加(P<0.01)。结论:Survivin RNA干扰表达载体可降低survivin的表达。sFasL联合survivin RNA干扰较单用sFasL或survivin RNA干扰能更有效地抑制肺腺癌细胞A549增殖,促进凋亡。 展开更多
关键词 细胞系 肿瘤 RNA干扰 细胞凋亡 Fas配体蛋白
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Peptide-RNA complexation-induced fluorescence“turn on”displacement assay for the recognition of small ligands targeting HIV-1 RNA 被引量:1
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作者 Liang Qi Jiayun Zhang +5 位作者 Ying Gao Pin Gong Chengyuan Liang Yao Su Qiao Zeng Yafeng Zhang 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 SCIE CAS CSCD 2022年第6期923-928,共6页
The regulator of expression of virion(Rev)protein binds specifically to the Rev-responsive element(RRE)RNA in order to regulate the expression of the human immunodeficiency virus(HIV)-1 genes.Fluorescence indicator di... The regulator of expression of virion(Rev)protein binds specifically to the Rev-responsive element(RRE)RNA in order to regulate the expression of the human immunodeficiency virus(HIV)-1 genes.Fluorescence indicator displacement assays have been used to identify ligands that can inhibit the ReveRRE interaction;however,the small fluorescence indicators cannot fully replace the Rev peptide or protein.As a result,a single rhodamine B labeled Rev(RB-Rev)model peptide was utilized in this study to develop a direct and efficient ReveRRE inhibitor screening model.Due to photon-induced electron transfer quenching of the tryptophan residue on the RB fluorophore,the fluorescence of RB in Rev was weakened and could be dramatically reactivated by interaction with RRE RNA in ammonium acetate buffer(approximately six times).The interaction could reduce the electron transfer between tryptophan and RB,and RRE could also increase RB fluorescence.The inhibitor screening model was evaluated using three known positive ReveRRE inhibitors,namely,proflavin,6-chloro-9-[3-(2-chloroethylamino)propylamino]-2-methoxyacridine(ICR 191),and neomycin,as well as a negative drug,arginine.With the addition of the positive drugs,the fluorescence of the ReveRRE decreased,indicating the displacement of RB-Rev.This was confirmed using atomic force microscopy(AFM)and the fluorescence was essentially unaffected by the addition of arginine.The results demonstrated that RB-Rev can be used as a fluorescent probe for recognizing small ligands that target RRE RNA.The ReveRRE inhibitor screening model offers a novel approach to evaluating and identifying long-acting Rev inhibitors. 展开更多
关键词 RRE RNA Rev protein Fluorescence enhancement ligand-rna interaction Drug screening
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Dll4基因靶向RNAi重组腺相关病毒载体的构建和高滴度病毒制备 被引量:2
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作者 吕伟 陈凛 +5 位作者 卫勃 赵云山 李涛 彭正 唐云 李荣 《军医进修学院学报》 CAS 2009年第3期354-356,共3页
目的:构建一个表达肿瘤血管生成调节基因Delta-like ligand4(Dll4)小干扰RNA的重组腺相关病毒载体,制备靶向性抑制Dll4表达的高滴度重组腺相关病毒。方法:将包含肿瘤血管生成调节基因Dll4特异性小干扰RNA片段的质粒用EcoRI+SalI双酶切,... 目的:构建一个表达肿瘤血管生成调节基因Delta-like ligand4(Dll4)小干扰RNA的重组腺相关病毒载体,制备靶向性抑制Dll4表达的高滴度重组腺相关病毒。方法:将包含肿瘤血管生成调节基因Dll4特异性小干扰RNA片段的质粒用EcoRI+SalI双酶切,回收目的片段,将pSNAV2.0质粒用EcoRI+SalI双酶切后同目的片段连接,脂质体法转染BHK-2l细胞,G418筛选后以辅助病毒感染获取病毒。结果:PCR和测序证实,成功构建包含U6启动子和肿瘤血管生成调节基因Dll4特异性RNA干扰片段的重组腺相关病毒载体,并制备出滴度为2.4×l011vectorgenome/L高滴度腺相关病毒。结论:成功构建携带Dll4基因短发夹状干扰RNA的腺相关病毒载体。为下一步探索抗肿瘤血管生成基因治疗的新途径提供实验基础。 展开更多
关键词 Delta-likeligand4(Dll4) RNA干扰 重组腺相关病毒
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苦瓜籽核糖体失活蛋白的理化性质及生物活性 被引量:21
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作者 孟延发 杜毅峰 张雪梅 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 1999年第6期920-923,共4页
采用硫酸铵分级分离,假配基亲和层析和SephacrylS-100分子筛层析等方法,从苦瓜籽中获得核糖体失活蛋白(RIP).经SDS-PAGE、PAGE、IEF和PAS方法分析均表明为单一蛋白着色带或单一糖蛋白着色带.... 采用硫酸铵分级分离,假配基亲和层析和SephacrylS-100分子筛层析等方法,从苦瓜籽中获得核糖体失活蛋白(RIP).经SDS-PAGE、PAGE、IEF和PAS方法分析均表明为单一蛋白着色带或单一糖蛋白着色带.根据SDS-PAGE和Sephadex G-150分子筛层析结果计算其相对分子质量为3.0×104,经IEF-PAGE结果计算其pI为8.9~9.0.对无细胞系统中蛋白质生物合成抑制活性明显,其IC50为5.3×10- 10 m ol/L左右.体外生物活性试验结果表明其对人肝癌细胞、Vero、SP2/0、3T3、Kb、Navana 等肿瘤细胞株均表现有不同程度的抑制作用.而对完整细胞人胚肺二倍体细胞却毒性极小.因此,上述实验结果为该RIP的进一步深入研究和有可能开发成免疫毒素的高效弹头药物提供了一定的工作基础. 展开更多
关键词 理化性质 亲和层析 苦瓜 RIP 蛋白毒素 生物活性
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siRNA介导的PD-L1沉默可增强人CD8~+T淋巴细胞的体外杀伤作用 被引量:1
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作者 王震 黄文 +4 位作者 岑柏宏 魏媛怡 廖路敏 黎国仙 季爱民 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期800-806,共7页
目的设计并筛选多条可高效特异性降低肿瘤细胞表面沉默程序性死亡受体-配体1(PD-L1)表达的小干扰RNA(siRNA)序列,并研究其增强人CD8^+T淋巴细胞对人胶质瘤细胞(U87 MG)免疫杀伤作用。方法根据siRNA设计法则,并通过siDirect软件在线设计... 目的设计并筛选多条可高效特异性降低肿瘤细胞表面沉默程序性死亡受体-配体1(PD-L1)表达的小干扰RNA(siRNA)序列,并研究其增强人CD8^+T淋巴细胞对人胶质瘤细胞(U87 MG)免疫杀伤作用。方法根据siRNA设计法则,并通过siDirect软件在线设计针对PD-L1基因的几种不同的siRNA序列,并运用BLAST进行同源性分析,最终确定候选序列;通过RT-qPCR、Western blot及流式细胞术实验,选出高效抑制PD-L1 mRNA及蛋白表达的siRNA序列;通过流式细胞术及CCK8检测PD-L1siRNA沉默U87 MG细胞的PD-L1后,人CD8^+T细胞对U87 MG的细胞凋亡及增殖的影响。结果设计了10条针对人PD-L1基因具有不同核苷酸序列的siRNA。采用RT-qPCR、Western blot及流式细胞术在mRNA及蛋白水平上检测siRNA的沉默效率,与对照组相比,siPD-L1-1、siPD-L1-2、siPD-L1-3、siPD-L1-4、siPD-L1-5及siPD-L1-8均显著降低U87 MG中PD-L1基因的表达(P<0.05),其中siPD-L1-3的沉默效率最高。与对照组相比,流式细胞术及CCK8结果显示,siPD-L1-3及siPD-L1-8均可显著增强人CD8^+T细胞对U87 MG细胞的杀伤作用,且该杀伤作用可显著抑制U87 MG细胞增殖(P<0.05)。结论本文设计并筛选了能有效沉默PD-L1基因表达的siPD-L1-1、siPD-L1-2、siPD-L1-3、siPD-L1-4、siPD-L1-5及siPD-L1-8的6条序列,其中siPD-L1-3和siPD-L1-8可高效增强T淋巴细胞对U87 MG细胞免疫杀伤作用,且siPD-L1-3的作用最为显著。本文设计的PD-L1siRNA分子可以用于设计和制备预防、治疗多种癌症的核酸药物。 展开更多
关键词 程序性死亡受体-配体1 小干扰RNA 神经胶质瘤细胞 CD8+T细胞 核酸药物
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沉默CX3CL1基因对骨髓间充质干细胞生长及其趋化效应的影响 被引量:4
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作者 郝磊 田洪 +4 位作者 牟长河 张玉波 周虎传 宋川 刘磊 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期34-41,共8页
目的构建大鼠趋化因子CX3C的配体1(chemokine CX3C ligand 1,CX3CL1)基因慢病毒RNA干扰(RNA interference,RNAi)载体,观测其沉默CX3CL1基因对骨髓间充质干细胞(bone marrow derived mesenchymal stem cells,b MSCs)生长及其趋化效应的... 目的构建大鼠趋化因子CX3C的配体1(chemokine CX3C ligand 1,CX3CL1)基因慢病毒RNA干扰(RNA interference,RNAi)载体,观测其沉默CX3CL1基因对骨髓间充质干细胞(bone marrow derived mesenchymal stem cells,b MSCs)生长及其趋化效应的影响。方法首先分离、培养大鼠骨髓b MSCs,并予以流式细胞术检测鉴定。针对CX3CL1基因mRNA序列,筛选3个小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)靶点并予以合成。把合成的siRNA导入b MSCs,Western blot检测其对靶基因编码蛋白的抑制效应,以此明确最佳siRNA。设计与合成针对最佳siRNA序列的短发夹RNA(short hair RNA,shRNA),连入CD513B-1慢病毒载体,构建CD513B-1/CX3CL1 shRNA慢病毒,并行测序鉴定。测序正确者用293T细胞包装成具有高效感染力的CD513B-1/CX3CL1 shRNA重组慢病毒,该重组病毒用于感染b MSCs。分离培养大鼠脾巨噬细胞,将其与被感染的b MSCs共培养。倒置显微镜下观测被感染b MSCs的绿色荧光蛋白(GFP)的表达情况;CCK-8检测被感染b MSCs的生长变化;Real-time PCR检测被感染b MSCs的CX3CL1与核抗原PCNA基因的表达变化;Western blot检测被感染b MSCs的CX3CL1和PCNA蛋白,与被感染的b MSCs共培养的脾巨噬细胞的趋化因子M-CSF和IL-8的表达变化。结果大鼠b MSCs得以分离、培养和鉴定。筛检得CX3CL1基因的最佳干扰序列:CTCTATGAGCAATTATTTA;测序证实,成功构建重组慢病毒载体CD513B-1/CX3CL1 shRNA。荧光观察表明,被CD513B-1/CX3CL1shRNA病毒感染的b MSCs明显表达GFP。CCK-8检测结果显示,与对照细胞比较,沉默CX3CL1的b MSCs的生长减慢,48 h开始更为明显(P<0.01);Real-time PCR、Western blot检测结果证实,CX3CL1基因的shRNA慢病毒能有效沉默b MSCs的CX3CL1,并下调其核抗原基因PCNA及其蛋白的表达,沉默CX3CL1的b MSCs能下调与其共培养的脾巨噬细胞的趋化因子M-CSF、IL-8的表达。结论成功构建CX3CL1基因RNAi重组慢病毒载体。该病毒载体能有效沉默b MSCs的CX3CL1基因,使b MSCs的生长减慢并下调其核抗原PCNA基因及其编码蛋白的表达。沉默CX3CL1的b MSCs能下调与其共培养的脾巨噬细胞的趋化因子M-CSF、IL-8的表达。 展开更多
关键词 趋化因子CX3C的配体1基因 短发夹RNA 骨髓间充质干细胞 慢病毒 趋化效应
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体外RNA干扰抑制RANKL表达对成骨细胞功能的影响 被引量:3
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作者 高延征 高坤 +1 位作者 于正红 司文腾 《河南医学研究》 CAS 2009年第1期1-5,共5页
目的:观察用RNA干扰的方法抑制大鼠成骨细胞核激活因子受体配体(Ligand of receptor activator ofNF-κB,RANKL)mRNA表达后,成骨细胞RANKL、OPG蛋白表达和I型胶原表达、细胞增殖能力的时间变化规律。方法:设计4条RANKL序列特异性小干扰R... 目的:观察用RNA干扰的方法抑制大鼠成骨细胞核激活因子受体配体(Ligand of receptor activator ofNF-κB,RANKL)mRNA表达后,成骨细胞RANKL、OPG蛋白表达和I型胶原表达、细胞增殖能力的时间变化规律。方法:设计4条RANKL序列特异性小干扰RNA(siRNA),用Lipofectamin2000转染成骨细胞,采用荧光实时定量聚合酶链反应(PCR)检测RANKL的表达,筛选出最有效的干扰序列,并用Western blot检测转染后1、2、3、5、7天RANKL、OPG蛋白的表达,同时观察成骨I型胶原表达、细胞增殖能力在相同时间点的变化。结果:对siRNA中有一对可使大鼠成骨细胞的RANKLmRNA水平下降89%。用最佳siRNA转染后1、2、3、5、7天,与空白对照组相比,RANKL蛋白表达率分别为59.1%、39.5%、26.6%、40.0%、57.3%(P<0.05),OPG蛋白表达率较空白对照组降低,但差异不具有显著性(P>0.05)。成骨细胞的I型胶原表达、增殖能力在相同时间点较空白对照组降低,差异也不具有显著性(P>0.05)。结论:靶向siRNA可显著下调成骨细胞RANKL表达,同时对OPG表达及成骨细胞的主要功能无显著影响。 展开更多
关键词 核激活因子受体配体 RNA干扰 大鼠 成骨细胞 基因沉默
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护骨素配基反义RNA对破骨细胞样细胞生成的影响
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作者 王宝利 邱明才 +2 位作者 梁东春 郭刚 张镜宇 《天津医药》 CAS 北大核心 2004年第1期31-34,共4页
目的 :研究护骨素配基 (OPGL)反义RNA对成骨细胞OPGL和护骨素 (OPG)mRNA表达及破骨细胞样细胞 (OLC)生成的影响。方法:构建小鼠OPGLcDNA反义表达载体 ,转染小鼠成骨细胞 ,筛选稳定表达细胞 ,通过RT -PCR研究其OPGL和OPGmRNA表达的变化... 目的 :研究护骨素配基 (OPGL)反义RNA对成骨细胞OPGL和护骨素 (OPG)mRNA表达及破骨细胞样细胞 (OLC)生成的影响。方法:构建小鼠OPGLcDNA反义表达载体 ,转染小鼠成骨细胞 ,筛选稳定表达细胞 ,通过RT -PCR研究其OPGL和OPGmRNA表达的变化。将转染有OPGL反义基因的成骨细胞与小鼠骨髓细胞共培养 ,观察OPGL反义RNA对OLC生成的影响。结果:转染有反义OPGLcDNA的成骨细胞OPGLmRNA表达水平显著降低 ,OPGmRNA表达不受影响。其诱导的OLC数目显著减少。结论:OPGL反义RNA抑制了OPGL基因的表达 ,使得成骨细胞促进破骨细胞形成、分化的能力减弱。 展开更多
关键词 护骨素配基 反义RNA 破骨细胞样细胞生成 成骨细胞 小鼠 基因表达
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APRIL shRNA表达载体的构建与筛选
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作者 丁伟峰 王峰 +5 位作者 王惠民 孙宝兰 丛辉 孙长江 鞠少卿 王跃国 《现代检验医学杂志》 CAS 2010年第2期27-30,共4页
目的构建并筛选有效的、编码短发夹RNA(shRNA)的增殖诱导配体(APRIL)基因特异性真核表达载体。方法分别设计、合成4对寡核苷酸单链,经退火、连接得到APRIL—shRNA双链,定向克隆至带有H1启动子、绿色荧光蛋白(green fluorescent p... 目的构建并筛选有效的、编码短发夹RNA(shRNA)的增殖诱导配体(APRIL)基因特异性真核表达载体。方法分别设计、合成4对寡核苷酸单链,经退火、连接得到APRIL—shRNA双链,定向克隆至带有H1启动子、绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)基因和Neo基因的pGCsi—H1/Neo/GFP质粒载体中,构建4条含APRIL基因shRNA的pGCsi—H1/Neo/GFP—APRIL—shRNA真核表达载体,转染高表达APRIL的结直肠癌细胞株SW480,G418筛选,荧光显微镜下观察转染效率,FQ—RT—PCR检测APRIL mRNA水平,Western印迹分析APRIL蛋白表达。结果测序证实pGCsi—H1/Neo/GFP—APRIL—shRNA(APRIL shRNA)构建成功,无碱基突变,4种不同shRNA质粒转染细胞后APRIL mRNA弄口蛋白表达差别有统计学显著性意义(P〈0.01)。结论成功地构建APRIL shRNA真核表达载体,敲低效率85%以上,可用于后续的实验研究。 展开更多
关键词 增殖诱导配体 短发夹RNA G418 真核表达载体
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