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Genome-wide identification and characterization of the abiotic-stress-responsive lipoxygenase gene family in diploid woodland strawberry(Fragaria vesca)
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作者 LI Zhi-qi XIE Qian +2 位作者 YAN Jia-hui CHEN Jian-qing CHEN Qing-xi 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第7期1982-1996,共15页
Lipoxygenase(LOXs)is a kind of dioxygenase without heme and iron,which plays an important role in the development and adaptation of many plants to the environment.However,the study of strawberry LOX gene family has no... Lipoxygenase(LOXs)is a kind of dioxygenase without heme and iron,which plays an important role in the development and adaptation of many plants to the environment.However,the study of strawberry LOX gene family has not been reported.In this study,14 LOX genes were identified from the diploid woodland strawberry genome.The phylogenetic tree divides the FvLOX gene into two subfamilies:9-LOX and 13-LOX.Gene duplication event analysis showed that whole-genome duplication(WGD)/segmental duplication and dispersed duplication effectively promoted the expansion of strawberry LOX family.QRT-PCR analysis showed that FvLOX genes were expressed in different tissues.Expression profile analysis showed that FvLOX1 and FvLOX8 were up-regulated under low temperature stress,FvLOX3 and FvLOX7 were up-regulated under drought stress,FvLOX6 and FvLOX9 were up-regulated under salt stress,FvLOX2,FvLOX3 and FvLOX6 were up-regulated under salicylic acid(SA)treatment,FvLOX3,FvLOX11 and FvLOX14 were up-regulated under methyl jasmonate(MeJA)treatment,FvLOX4 and FvLOX14 were up-regulated under abscisic acid(ABA)treatment.Promoter analysis showed that FvLOX genes were involved in plant growth and development and stress response.We analyzed and identified the whole genome of strawberry FvLOX family and characterized a variety of FvLOX candidate genes involved in abiotic stress response.This study laid a theoretical and empirical foundation for the response mechanism of strawberry to abiotic stress. 展开更多
关键词 lipoxygenase gene family STRAWBERRY abiotic stress expression pattern cis-acting element
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Cloning and Sequence Analysis of Lipoxygenase Gene cDNA from Cucumber Fruit (Cucumis sativus L.) 被引量:1
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作者 Z.K. Wang  Z.W. Qin  X.Y. Zhou  D.Y. Song 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第2期188-189,共2页
Lipoxygenases are nonheme-iron-containing dioxygenases that catalyze the hydroperoxidation of unsatrated fatty acids containing a cis, cis-1,4-pentadiene structure producing hydroperoxy acids with conjugated dienes.
关键词 脂加氧酶 基因克隆 黄瓜 种植
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猕猴桃6个LOX基因家族成员实时定量PCR引物特异性的检测与应用 被引量:5
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作者 张波 徐昌杰 陈昆松 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期262-267,共6页
从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电... 从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电泳、交叉PCR扩增和PCR产物测序等分析手段,有效消除其它成员的交叉扩增干扰,为利用QPCR检测基因家族成员表达提供了特异、准确与可行的途径. 展开更多
关键词 猕猴桃脂氧合酶基因家族成员 引物 特异性 实时定量PCR
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鲜食糯玉米己醛和己醇的生成与LOX活性及其基因表达的相关性 被引量:3
4
作者 牛丽影 沈凌雁 +3 位作者 刘春菊 李大婧 刘春泉 肖丽霞 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期1138-1143,共6页
为探讨生鲜糯玉米汁主要挥发性成分己醛与己醇的生成与脂氧合酶(LOX)的关系,对4个籽粒发育期的鲜食糯玉米京甜紫花糯2号和苏玉糯11号生鲜玉米汁中己醛与己醇含量、脂氧合酶活性以及Zm LOX1、ZmLOX2、Zm LOX3、Zm LOX10基因的相对表达量... 为探讨生鲜糯玉米汁主要挥发性成分己醛与己醇的生成与脂氧合酶(LOX)的关系,对4个籽粒发育期的鲜食糯玉米京甜紫花糯2号和苏玉糯11号生鲜玉米汁中己醛与己醇含量、脂氧合酶活性以及Zm LOX1、ZmLOX2、Zm LOX3、Zm LOX10基因的相对表达量进行了测定和比较。结果显示己醛与己醇含量显著正相关(P<0. 05),4种LOX基因的表达量之间显著正相关(P<0. 05),但LOX活性与其他指标之间未表现出显著的相关关系。主成分分析(PCA)结果显示所有指标聚为3类:4种LOX基因表达量、己醛与己醇含量、LOX活性,三者之间未表现出显著的相关性关系。 展开更多
关键词 鲜食糯玉米 己醛 脂氧合酶(lox) 基因表达量
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野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析 被引量:4
5
作者 宋辉 赵术珍 +4 位作者 侯蕾 乔善良 赵传志 李爱芹 王兴军 《山东农业科学》 2015年第10期1-7,共7页
脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 ... 脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。 展开更多
关键词 野生花生 lox 基因家族 抗病 系统发育 选择压力
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胡麻脂氧合酶基因LuLOX1的克隆与表达分析 被引量:1
6
作者 姜晓东 杨建春 +3 位作者 韩梅 谢冬微 李新凤 张春来 《激光生物学报》 CAS 2019年第5期431-438,共8页
胡麻的籽粒富含多不饱和脂肪酸-亚麻酸,易被脂氧合酶(LOX)氧化,导致油脂的酸败。因此,油脂的稳定性和风味是影响胡麻油质量的重要因素。脂氧合酶是一类非血红素双加氧酶,其催化不饱和脂肪酸如亚油酸和亚麻酸的氢过氧化反应。本研究旨在... 胡麻的籽粒富含多不饱和脂肪酸-亚麻酸,易被脂氧合酶(LOX)氧化,导致油脂的酸败。因此,油脂的稳定性和风味是影响胡麻油质量的重要因素。脂氧合酶是一类非血红素双加氧酶,其催化不饱和脂肪酸如亚油酸和亚麻酸的氢过氧化反应。本研究旨在阐明在胡麻种子发育时期脂氧合酶基因(LuLOX1)的表达、酶活性与品质的关系。本试验利用基于亚麻全基因组DNA测序数据,对LuLOX1基因进行克隆,利用RT-PCR方法进行LuLOX1基因表达分析,采用分光光度计法进行LOX酶活性测定。结果显示,LuLOX1基因的cDNA全长为2 607 bp,编码868个氨基酸,LuLOX1蛋白分子质量和等电点分别为98.87 kD、6.36。LuLOX1在种子发育早期高表达,之后呈下降的趋势,成熟期几乎检测不到该基因的表达。LuLOX1的酶活性变化与LuLOX1基因表达模式一致。该研究结果表明,LuLOX1可能参与了种子发育过程中脂肪酸氧化的调控。本研究为进一步研究其功能,通过脂氧合酶调控改进胡麻油脂品质奠定了基础。 展开更多
关键词 胡麻 脂氧合酶基因(Lulox1) 基因表达 脂氧合酶活性
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星星草脂氧合酶基因家族鉴定及生物信息学分析
7
作者 冯慧婷 李跃跃 +1 位作者 齐家兴 李莹 《现代农业科技》 2024年第3期157-161,共5页
星星草具有较强的耐盐碱特性,是改良土壤盐碱化的优良牧草。脂氧合酶(lipoxygenase,LOXs)广泛存在于动植物中,催化多不饱和脂肪酸的双加氧反应,最终生成各种氧脂素,从而在植物生长发育、响应逆境胁迫中发挥重要的生物学功能。目前,星星... 星星草具有较强的耐盐碱特性,是改良土壤盐碱化的优良牧草。脂氧合酶(lipoxygenase,LOXs)广泛存在于动植物中,催化多不饱和脂肪酸的双加氧反应,最终生成各种氧脂素,从而在植物生长发育、响应逆境胁迫中发挥重要的生物学功能。目前,星星草中的LOXs家族基因仍未见报道。本研究利用生物信息学方法对PutLOXs基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位和系统进化进行了分析。结果表明,星星草基因组中共有8个LOX基因,它们均具有lipoxygenase homology 2(简称LH2)和lipoxygenase结构域,均不包含跨膜结构域,预测定位于细胞质或叶绿体。系统发生分析表明PutLOXs蛋白分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,并且与水稻和玉米这类单子叶植物的LOXs蛋白系统发生关系更近。本研究将为后期深入分析星星草耐盐碱分子机制提供理论依据。 展开更多
关键词 脂氧合酶 基因家族 星星草 生物信息学分析
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高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析 被引量:4
8
作者 刘梦 魏玉磊 +3 位作者 丁冬 赵训超 罗伟毅 徐晶宇 《河南农业科学》 北大核心 2020年第11期37-44,共8页
利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置... 利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置命名为SbLOX1—SbLOX11,该家族基因可分为2个亚族(9-LOX、13-LOX)且同一亚族基因结构基本相似。表达分析发现,不同基因家族成员在不同组织部位的表达模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各个组织部位中表达量均较低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各个组织部位中表达量均较高。对低温(4℃)处理下高粱LOX基因转录组数据进行分析发现,耐冷型高粱9-LOX亚族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亚族中的SbLOX4、SbLOX9在大多时间点均呈上调表达,且在冷敏感材料中表达量也较高,推测LOX基因在低温胁迫响应中具有重要作用。 展开更多
关键词 高粱 脂氧合酶基因家族 基因结构 进化关系 表达模式
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油棕脂氧合酶(LOX)家族成员全基因组鉴定及表达分析
9
作者 周丽霞 吴秋妃 +2 位作者 曾春茹 曹红星 李睿 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第20期6719-6730,共12页
为了明确油棕LOX基因种类、特性及其在油棕生长发育中的调控作用,本研究以拟南芥LOX蛋白序列为标签,在油棕全基因组数据库中BLAST同源LOX蛋白序列,并通过CDD和PFAM数据库对LOX蛋白序列进行分析,利用生物信息学对油棕LOX家族成员进行染... 为了明确油棕LOX基因种类、特性及其在油棕生长发育中的调控作用,本研究以拟南芥LOX蛋白序列为标签,在油棕全基因组数据库中BLAST同源LOX蛋白序列,并通过CDD和PFAM数据库对LOX蛋白序列进行分析,利用生物信息学对油棕LOX家族成员进行染色体定位、进化树、基因结构及保守结构域等可视化分析。结果表明,共获得75个油棕LOX基因,其中有61个基因在油棕的15条染色体上分布不均匀,在12号染色体上分布的基因最多,为10个;基因长度范围为1550~99179 bp,外显子数目为1~24个;油棕LOX基因家族共含有10个motif保守基序;通过预测蛋白的二级结构,发现EgLOX蛋白均存在α-螺旋、β-转角、无规卷曲及延伸链这4种结构,其中57个蛋白以无规卷曲为主要结构,18个蛋白以α-螺旋为主要结构,而β-转角及延伸链所占比例均较少;通过表达模式分析发现EgLOX基因在油棕中果皮、果仁、根、叶、茎和花中均有不同程度的表达,具有组织和时空表达特异性。基因重复和组织表达特异性是油棕EgLOX基因家族的两大特点,推测该家族基因在油棕脂质降解过程中起调控作用。本研究为油棕LOX的功能研究提供一定的参考。 展开更多
关键词 油棕 脂氧合酶(lox) 生物信息学 表达分析
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基于EST库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆 被引量:17
10
作者 张波 李鲜 陈昆松 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期337-342,共6页
利用猕猴桃EST库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了LOX基因家族成员6个,命名为AdLox1-6。AdLox1、AdLox2、AdLox3和AdLox4为全长cDNA,编码区长度分别为2739、2595、2739和2709bp,AdLox5和AdLox6为cDNA片段,长度为1359和1557bp。猕... 利用猕猴桃EST库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了LOX基因家族成员6个,命名为AdLox1-6。AdLox1、AdLox2、AdLox3和AdLox4为全长cDNA,编码区长度分别为2739、2595、2739和2709bp,AdLox5和AdLox6为cDNA片段,长度为1359和1557bp。猕猴桃AdLox2和AdLox5氨基酸序列同源性最高,约74%,而AdLox3和AdLox5仅为49%。生物信息学分析表明,AdLox1、AdLox3、AdLox4和AdLox6可能具有13-LOX活性,在N端含有额外约60个氨基酸残基,而AdLox2和AdLox5则属于9-LOX类型。猕猴桃AdLox1与番茄TomLoxD具有最高氨基酸序列同源性(约80%),AdLox2和AdLox5与TomLoxA高度聚类,序列同源性分别为68%和75%,AdLox4和AdLox6与TomLoxC的氨基酸序列同源性分别为62%和63%,AdLox3与番茄LOX基因序列同源性低于55%。 展开更多
关键词 猕猴桃 脂氧合酶 lox基因家族 EST 克隆
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脂氧合酶基因家族成员与果实成熟衰老研究进展 被引量:50
11
作者 张波 李鲜 陈昆松 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期245-250,共6页
综述了LOX在果实成熟衰老进程中的最新研究进展,主要包括LOX与乙烯合成、果实软化、香气物质合成以及LOX基因家族成员的表达和功能研究。
关键词 果实 成熟 脂氧合酶 基因家族 功能 综述
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水稻脂氧合酶-3基因启动子的特性分析 被引量:4
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作者 刘南南 张文伟 +3 位作者 江玲 沈文飚 翟虎渠 万建民 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1-7,共7页
从栽培水稻品种越光中克隆了水稻脂氧合酶-3基因(Lox-3)的启动子,长度为1343bp,其序列与日本晴对应的序列完全相同。生物信息学分析表明,该启动子序列中包含受信号诱导的元件(G-box)、温度响应元件(CCGAAA)和水分胁迫响应元件(CACATG)... 从栽培水稻品种越光中克隆了水稻脂氧合酶-3基因(Lox-3)的启动子,长度为1343bp,其序列与日本晴对应的序列完全相同。生物信息学分析表明,该启动子序列中包含受信号诱导的元件(G-box)、温度响应元件(CCGAAA)和水分胁迫响应元件(CACATG)等顺式作用元件;进一步构建了Lox-3基因启动子与gus和gfp基因的融合表达载体并获得转基因植株,发现报告基因在转基因植株的根、茎、叶、花药、种胚及种皮中均有表达,在萌发种子的胚和胚芽中也有表达,但在胚乳中不表达。此外,经ABA、NaCl及人工陈化处理后对报告基因的表达进行了定量分析,发现这些非生物胁迫可能通过诱导启动子顺式元件致使报告基因表达活性增强。 展开更多
关键词 脂氧合酶-3基因 启动子 水稻 转基因植株 逆境胁迫
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宁夏小麦品种(系)脂肪氧化酶基因的检测与分布 被引量:4
13
作者 杨杰 亢玲 +5 位作者 王宪国 马丽 张博 马木或灵 张晓科 陈东升 《麦类作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第7期896-902,共7页
为给宁夏优质小麦育种和推广提供依据,本研究以180份宁夏小麦品种(系)为材料,利用分子标记检测脂肪氧化酶(LOX)基因在QLpx.caas-1AL和TaLOX-B1位点的组成情况,分析其分布特点。结果表明,不同等位变异及其组合类型的分布比例不同。在QLpx... 为给宁夏优质小麦育种和推广提供依据,本研究以180份宁夏小麦品种(系)为材料,利用分子标记检测脂肪氧化酶(LOX)基因在QLpx.caas-1AL和TaLOX-B1位点的组成情况,分析其分布特点。结果表明,不同等位变异及其组合类型的分布比例不同。在QLpx.caas-1AL位点,除了原有的3种等位变异Xwmc312-227、Xwmc312-235和Xwmc312-247外,还发现了2种新的等位变异。经测序分析,两种新变异条带大小分别为199bp和223bp,暂命名为Xwmc312-199和Xwmc312-223。该位点5种等位变异的分布比例分别为46.11%、32.78%、18.89%、1.11%和1.11%。在TaLOX-B1位点存在2种等位变异,即TaLOX-B1a和TaLOX-B1b,分别占15.56%和84.44%。宁夏小麦LOX基因位点存在8种等位变异组合类型,其中Xwmc312-227/TaLOX-B1b组合类型比例(40.56%)最高,Xwmc312-235/TaLOX-B1b次之(27.78%),Xwmc312-199/TaLOX-B1b和Xwmc 312-223/TaLOX-B1b最低(均为1.11%)。同时,在不同地区和相同地区不同来源品种(系)间,LOX基因的分布也存在差异。总体来看,宁夏小麦低活性LOX基因等位变异类型(Xwmc312-227/TaLOX-B1b)所占的比例明显高于高活性类型(Xwmc312-235/TaLOX-B1a)。 展开更多
关键词 脂肪氧化酶(lox)基因 等位变异 QLpx.caas-1AL Talox-B1
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袋装临沧铁壳麦种子生活力及a-淀粉酶、脂肪氧化酶活性与表达量分析 被引量:1
14
作者 周国雁 隆文杰 +3 位作者 陈丹 武晓阳 伍少云 蔡青 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2273-2281,共9页
【目的】研究铝箔袋真空密封和尼龙网袋非密封方法包装贮藏的临沧铁壳麦种子生活力指标、贮藏期、a-淀粉酶和脂肪氧化酶(LOX)活性及其基因相对表达量间的关系,了解其a-淀粉酶和LOX活性及其基因相对表达量变化影响种子贮藏期的酶学机制,... 【目的】研究铝箔袋真空密封和尼龙网袋非密封方法包装贮藏的临沧铁壳麦种子生活力指标、贮藏期、a-淀粉酶和脂肪氧化酶(LOX)活性及其基因相对表达量间的关系,了解其a-淀粉酶和LOX活性及其基因相对表达量变化影响种子贮藏期的酶学机制,为更好地保存临沧铁壳麦等云南小麦亚种资源提供参考依据。【方法】将临沧铁壳麦种子真空密封于铝箔袋和非密封包装于尼龙网袋内,在昆明室内温、湿度条件下贮藏63、125、189、210、252和365 d。采用标准发芽试验、3,5-二硝基水杨酸、分光光度计和实时PCR(RT-PCR)方法,分别测量种子的生活力指标、a-淀粉酶和LOX活性及其基因相对表达量,并进行简单相关和逐步回归分析。【结果】真空密封包装的种子在贮藏125 d后,发芽势为78.3%,发芽率为96.7%,加权发芽指数为0.622,发芽指数为30.933,活力指数为539.1,而非密封包装的种子在贮藏125 d后发芽势、加权发芽指数及发芽指数已明显下降,至189 d时观测的5项生活力指标均出现断崖式下降,分别只有125 d时的14.9%~25.0%。两种方法包装贮藏后的种子,a-淀粉酶和LOX活性无明显差异。种子贮藏期与生活力指标、酶活性及其基因相对表达量的简单相关及逐步回归分析结果表明,在昆明室内温、湿度条件下,非密封方法包装贮藏的临沧铁壳麦种子贮藏期随加权发芽指数和LOX活性的增加而缩短,随a-淀粉酶活性和TaLOX3-4A基因相对表达量的增加而延长,但真空密封方法包装贮藏的种子,其贮藏期只随a-淀粉酶基因amy3相对表达量的减少而延长。【结论】真空密封在铝箔袋中的临沧铁壳麦种子具有更长的、保持高生活力的贮藏期,其贮藏期不随a-淀粉酶和LOX活性变化而发生变化。 展开更多
关键词 真空密封包装 临沧铁壳麦种子 a-淀粉酶 脂肪氧化酶(lox) 基因相对表达量 生活力
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光敏核不育水稻幼苗叶片脂氧合酶活性及其基因表达的昼夜变化
15
作者 黄俊宝 曾晓春 +3 位作者 何永明 向妙莲 付永琦 黄友明 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期34-41,共8页
为探查光敏核不育(PGMS)水稻中脂氧合酶(LOX)活性的光暗期变化特性,以PGMS水稻N5088S和D38S、常规水稻中早25、盐粳7号和中嘉早17及三系不育水稻G2A和东B11A为材料,在不同光周期(12L/12D、14L/10D和10L/14D)和光/暗期温度(30℃/30℃和30... 为探查光敏核不育(PGMS)水稻中脂氧合酶(LOX)活性的光暗期变化特性,以PGMS水稻N5088S和D38S、常规水稻中早25、盐粳7号和中嘉早17及三系不育水稻G2A和东B11A为材料,在不同光周期(12L/12D、14L/10D和10L/14D)和光/暗期温度(30℃/30℃和30℃/26℃)下,研究了其幼苗叶片中LOX活性的昼夜变化,并采用RT-PCR方法对PGMS水稻幼苗叶片进行LOX基因的昼夜表达分析。结果表明,在所有光周期和培养温度处理下,PGMS水稻LOX活性均表现出暗期高而光期低的昼夜变化规律,但常规水稻和三系不育水稻的LOX活性均无明显的光暗期差异;暗期PGMS水稻LOX活性显著高于常规水稻和三系不育水稻。在12L/12D光周期和30℃/26℃(L/D)的培养温度下,检测的13个LOX基因中,检测到8个Os LOX基因,OsLOX2、Os LOX3、Os LOX4、Os LOX8和Os LOX13等基因的表达丰度在N5088S和/或D38S幼苗叶片中呈现暗期高光期低的趋势。因此,光敏核不育水稻N5088S和D38S幼苗叶片LOX活性及Os LOX家族的部分基因的表达具有明显的暗期高光期低的变化特征。 展开更多
关键词 水稻 光敏核不育 脂氧合酶活性 脂氧合酶基因表达
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桃脂氧合酶基因家族生物信息学及其表达特性分析 被引量:2
16
作者 郭绍雷 张斌斌 +2 位作者 马瑞娟 俞明亮 宋志忠 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期257-267,共11页
【目的】脂氧合酶(lipoxygenase;LOX;linoleate oxygen oxidoreductase;EC1.13.11.12)作为一种重要的酶,广泛参与植物生长、发育、成熟、衰老及植物抗逆过程,因其重要作用一直是国内外研究的重点和热点。研究利用生物信息学方法对桃LO... 【目的】脂氧合酶(lipoxygenase;LOX;linoleate oxygen oxidoreductase;EC1.13.11.12)作为一种重要的酶,广泛参与植物生长、发育、成熟、衰老及植物抗逆过程,因其重要作用一直是国内外研究的重点和热点。研究利用生物信息学方法对桃LOX基因家族进行发掘和预测,以期为桃LOX家族基因鉴定和功能分析提供基础信息,并在分子水平上为桃品种改良及采后保鲜提供明确的候选基因。【方法】采用生物信息学方法研究了桃LOX基因家族成员数目、系统进化关系、假定蛋白质结构及分类,运用q RT-PCR技术研究LOX基因家族在桃特异组织中的表达模式。【结果】桃LOX基因家族包含13个假定蛋白,9-LOX和13-LOX类型分别有6个成员,另外存在1个特殊类型,与苹果具有相似性;桃LOX蛋白氨基酸序列一致性在33.76%-90.84%;13个LOX家族成员绝大多数是两性氨基酸,9-LOX类型的6个家族成员的理论等电点都小于7,13-LOX类型各等电点没有规律;13个蛋白质的二级结构除ppa017962m外以无规则卷曲为主要构成元件;染色体定位分析表明,LOX家族基因并非平均分布在桃的8条染色体上,其中6号染色体上桃LOX基因分布最多,ppa017962m未定位在任何特异染色体上;q RT-PCR的组织特异性表达结果表明,LOX基因家族主要在果实和茎中的相对表达量较高。【结论】分离并鉴定了13个桃LOX家族基因,其不均匀地分布在桃染色体上;多数桃LOX基因主要在果实和茎部表达;ppa001634m、ppa001082m、ppa001216m、ppa001016m、ppa017962m在果实中的表达量最高,可能参与调控桃果实衰老软化过程。 展开更多
关键词 lox基因家族 生物信息学 基因表达
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杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究 被引量:4
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作者 朱利利 庆军 +2 位作者 杜庆鑫 何凤 杜红岩 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期927-934,共8页
LOX(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对LOX基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特... LOX(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对LOX基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特征、分类和功能等。结果显示:杜仲LOX基因家族有23条LOX基因序列,分别定位于细胞质或叶绿体中,分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,其中9-LOX类型仅包含一个,13-LOX类型包含22个;23个LOX基因非平均分布于12条scaffolds上,一些基因发生串联分布;RNA-Seq表达结果显示6个13-LOX类型基因在杜仲叶、果、树皮和种仁中几乎没有表达,而其他17个LOX基因表达具有组织和时空表达特异性。研究结果为揭示杜仲LOX基因家族成员的功能提供重要线索,为进一步研究LOX基因家族提供理论基础。 展开更多
关键词 杜仲 lox基因家族 生物信息学 基因功能
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苦荞脂氧合酶基因家族的鉴定及其在铝胁迫应答中的表达
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作者 仲雪婷 徐鸿 +7 位作者 李鑫鑫 孙若嘉 付文英 李佳鹏 杨莲莲 吴酬飞 张立钦 王占旗 《湖州师范学院学报》 2021年第10期33-42,共10页
利用生物信息学鉴定苦荞脂氧合酶(FtLOX)基因家族,分析其进化关系和组织表达模式,并进一步利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析FtLOX基因家族在铝胁迫应答中的表达模式.结果表明:苦荞FtLOX基因家族共包含10个成员(FtLOX1-FtLOX10),其可以... 利用生物信息学鉴定苦荞脂氧合酶(FtLOX)基因家族,分析其进化关系和组织表达模式,并进一步利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析FtLOX基因家族在铝胁迫应答中的表达模式.结果表明:苦荞FtLOX基因家族共包含10个成员(FtLOX1-FtLOX10),其可以分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,且FtLOX的基因结构在同一个亚家族中是高度保守的.染色体定位和复制分析表明:FtLOX基因家族既有串联重复又有片段重复,而片段重复可能是苦荞FtLOXs进化的主要驱动力.qRT-PCR分析表明:6个FtLOX基因参与了苦荞铝胁迫的响应,其中FtLOX6、FtLOX8和FtLOX9可能在苦荞铝胁迫应答中起重要作用.这些结果为进一步探究FtLOXs在植物发育和胁迫应答中的功能奠定了良好的基础. 展开更多
关键词 苦荞 脂氧合酶基因家族 系统发育 铝胁迫 基因表达
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黄瓜脂氧合酶(LOX)基因与果实特征芳香物质的关系研究 被引量:3
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作者 徐强 张凯锋 +1 位作者 齐晓花 陈学好 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期3642-3647,共6页
本研究比较了8个黄瓜品系果肉中特征芳香物质2E,6Z-壬二烯醛的含量,并以2E,6Z-壬二烯醛含量高的EP326和含量低的DE843为材料,分析了这2个品系果实发育过程中2E,6Z-壬二烯醛含量变化及5个9-LOX家族基因的表达变化。结果表明:EP326和DE84... 本研究比较了8个黄瓜品系果肉中特征芳香物质2E,6Z-壬二烯醛的含量,并以2E,6Z-壬二烯醛含量高的EP326和含量低的DE843为材料,分析了这2个品系果实发育过程中2E,6Z-壬二烯醛含量变化及5个9-LOX家族基因的表达变化。结果表明:EP326和DE843果肉中的2E,6Z-壬二烯醛含量呈先上升后下降的变化趋势,且分别在授粉后9 d和12 d出现最大值;9-LOX家族的Csa007837主要在果肉中表达;EP326、DE843果肉中Csa007837表达量的变化与对应品系中的2E,6Z-壬二烯醛含量的变化趋势基本一致;EP326果肉中Csa007837表达量在授粉后不同时期均明显高于DE843,且分别在EP326、DE843授粉后9 d和12 d出现最大值;相关性分析表明,EP326、DE843果肉中2E,6Z-壬二烯醛含量与Csa007837基因表达量之间均呈显著性正相关,而与其它4个9-LOX家族基因无相关性。因此,推测Csa007837基因对控制黄瓜果实芳香物质的合成起到了关键作用。 展开更多
关键词 黄瓜 脂氧合酶(lox) 2E 6Z-壬二烯醛 基因
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