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题名杂交鹅掌楸LhARF2基因的克隆及功能分析
被引量:1
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作者
刘立盘
钟永达
杨爱红
李彦强
余发新
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机构
江西省科学院生物资源研究所
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期3807-3818,共12页
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基金
国家自然科学基金项目(31500460)
江西省科学院重点项目(2018-YZD2-16)
江西省科学院普惠项目(2016-XTPH1-01)共同资助。
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文摘
生长素响应因子ARF在植物生长发育过程中发挥着重要的作用。本研究采用同源克隆和RACE相结合的方法,从杂交鹅掌楸叶片中克隆ARF2的同源基因,命名为LhARF2,对基因蛋白序列进行生物信息学分析,基因全长3193 bp,包含2589 bp的开放阅读框,编码862个氨基酸的蛋白质。蛋白质分子量为96.19 kD,理论等电点为6.21,为不稳定蛋白质;蛋白质二级结构包括α-螺旋、β-折叠、不规则卷曲和延伸链,以不规则卷曲为主;蛋白质三级结构分析显示该蛋白与拟南芥生长素响应因子(SMTL编号:4ldy.1)的序列相似性最高(67.89%)。功能结构域分析显示该蛋白质包括B3、Auxin_resp和AUX_IAA结构域。系统进化树分析表明LhARF2所编码的蛋白质与莲(Nelumbo nucifera)XP_010250544.1亲缘关系最近。激素诱导生根试验表明,拟南芥T2代幼苗相比较野生型,在没有激素处理下,根系长度差异不大;在外源激素IBA处理下,根系长度明显伸长。实时定量分析显示在IBA激素诱导下,根系和叶片表达量均上调,根系中LhARF2上调幅度分别高于WT和叶片。结果表明LhARF2基因在拟南芥中对根的生长具有促进作用,LhARF2基因受IBA激素正向调控。该研究结果为进一步分析杂交鹅掌楸LhARF2基因的功能及利用奠定基础。
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关键词
杂交鹅掌楸(liriodendron
hybrids)
克隆
LhARF2
基因
根系长度
表达分析
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Keywords
liriodendron hybrids
Cloning
LhARF2 gene
Root length
Expression analysis
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分类号
S792.21
[农业科学—林木遗传育种]
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题名杂交鹅掌楸胚性能力获得磷酸化蛋白质组探讨
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作者
李春映
殷梓苡
陈金慧
施季森
甄艳
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机构
南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室
南京林业大学南方现代林业协同创新中心
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期1-10,共10页
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基金
国家高技术研究发展863计划项目(2013AA102705)
江苏省政府优势学科建设项目(PAPD)共同资助
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文摘
为了探索胚性能力获得过程中的蛋白质磷酸化作用,本研究利用杂交鹅掌楸未成熟种子诱导的胚性和非胚性愈伤组织为材料,通过2-DE技术分离蛋白质,Pro-Q磷酸化蛋白质染色,软件Imagemaster 6.0来检测蛋白质的差异表达。利用质谱鉴定得到了41个差异表达蛋白质。这些蛋白质参与愈伤组织胚性能力的获得,如eukaryotuc release factor1影响着细胞的伸长和径向细胞分裂,EF-hand域蛋白有助于胚性干细胞分裂和维持,Ca^2+离子信号结合蛋白、Sec14p类磷酸酰肌醇转运家族蛋白参与细胞极性和器官形态建成,Mediator of RNA polymeraseⅡtranscription subunit调控基因的转录激活及染色质重塑因子介导胚形态建成和器官发生等,为体胚发生过程中体细胞胚性能力获得提供科学依据。
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关键词
杂交鹅掌楸(liriodendron
hybrid)
胚性能力
磷酸化蛋白质组
质谱
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Keywords
liriodendron hybrid
Embryogenic ability
Phosphoproteome
Mass spectrometry
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分类号
S792.21
[农业科学—林木遗传育种]
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