目的:探讨Cox比例风险模型与加速失效时间模型(accelerated failure time model,AFT)在基因表达数据生存分析中的应用及比较。方法:针对基因表达数据高维小样本的特性,首先采用偏最小二乘法对基因数据集进行降维,然后以降维后的成分为...目的:探讨Cox比例风险模型与加速失效时间模型(accelerated failure time model,AFT)在基因表达数据生存分析中的应用及比较。方法:针对基因表达数据高维小样本的特性,首先采用偏最小二乘法对基因数据集进行降维,然后以降维后的成分为协变量对两类生存模型进行拟合并比较其性能。结果:两类模型中病人生存时间的对数秩检验表明,不同风险组生存时间的差异均有统计学意义(P<0.01),而AFT模型比Cox模型具有更大的检验统计量的值。结论:Cox模型和AFT模型都适用于基因表达数据的生存分析,在某些实际应用中AFT模型的拟合效果可能更优于Cox模型。展开更多
文摘目的:探讨Cox比例风险模型与加速失效时间模型(accelerated failure time model,AFT)在基因表达数据生存分析中的应用及比较。方法:针对基因表达数据高维小样本的特性,首先采用偏最小二乘法对基因数据集进行降维,然后以降维后的成分为协变量对两类生存模型进行拟合并比较其性能。结果:两类模型中病人生存时间的对数秩检验表明,不同风险组生存时间的差异均有统计学意义(P<0.01),而AFT模型比Cox模型具有更大的检验统计量的值。结论:Cox模型和AFT模型都适用于基因表达数据的生存分析,在某些实际应用中AFT模型的拟合效果可能更优于Cox模型。
基金Supported by National Natural Science Foundation of China(1150157811701571+2 种基金1150157941572315)Fundamental Research Funds for the Central Universities,China University of Geosciences(Wuhan)(CUGW150809)