23个油橄榄品种的RAPD分析

采用RAPD技术对23个引种的油橄榄品种进行分类和鉴定研究。从80个10bp的随机引物中筛选出11个扩增效果较好的引物进行扩增,共产生127条带,其中78条为多态性带,占61.4%,平均每个引物扩增的DNA多态性带数为7.09条。4个品种具有特异的位点,可作为种质鉴定的依据。根据扩增结果构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,23个品种可划分为2大类。

不同金银花种源间遗传关系的RAPD分析

利用RAPD分析技术对金银花(Lonicera japonicaThunb.)6个种源的遗传多样性及遗传关系进行了研究。结果表明,23个引物共扩增出105条DNA片段,其中,多态性片段83条,占扩增总数的79.05%。聚类分析结果表明,金银花的6个种源可聚为2大类,产自山东平邑、湖南隆回和江苏南京的野生金银花种源遗传距离较近,聚为一类;来自河南封丘的2个野生种源和来自河南密县的1个栽培种源聚为一类。不同金银花种源间的遗传关系与地理分布有一定的相关性。

长江口日本鳗鲡群体遗传多样性RAPD初步分析

对2005年采集自长江口地区4个采样点、5批、共10尾性成熟前成鳗、82尾玻璃鳗的日本鳗鲡样本的遗传多样性进行了RAPD分析。在51条随机引物中筛选出具有稳定扩增、条带清晰的多态性引物16条,16条引物共检测到132个位点,其中多态位点114个(86.36%)。五个采样群体各自的平均杂合度(Hc)在0.205 3-0.315 0之间,平均基因多样性指数(Ho)在0.297 4-0.452 6之间;采样群体两两间的遗传分化指数FST在0.050 8-0.152 4之间。群体内遗传变异和群体间遗传变异对群体总遗传变异的贡献率分别为79.18%和20.82%;Ne i的遗传距离在0.059 3-0.142 5之间;在玻璃鳗采样群体间未发现遗传差异同采样地点及月份有何显著关系,显示它们可能同属一个大混合群体。而遗传距离、遗传分化指数及NJ树分析结果一致表明:成鳗和玻璃鳗之间可能存在相当的遗传距离和遗传分化。

药用植物华南忍冬居群遗传多样性的RAPD分析

目的:分析药用植物华南忍冬5个居群的遗传多样性和分化程度。方法:应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术扩增可分析位点。结果:10条随机引物扩增出100个可分析位点,多态位点百分率(PPL)为87.00%。经POPGENE分析发现,华南忍冬居群平均水平的多态位点百分率为58.86%,Ne i′s基因多样性(H)为0.2647,Shannon′s信息指数(I)为0.4022,具有较高水平的遗传多样性。居群间遗传分化程度较高(Gst=0.3839);地理距离与遗传距离之间具有显著相关性(r=0.8504,P=96.80%),表明地理隔离效应是导致居群间遗传分化的重要因素。根据遗传距离(POPGENE软件)和遗传相似系数(NTSYS-pc软件)的UPGMA聚类分析,罗浮山居群(LFS)和新兴居群(XX)先聚在一起,再与南宁居群(NN)聚成一类,而徐闻居群(XW)和海口居群(HK)聚成另一类。结论:基于华南忍冬的物种保护与资源利用,建议加强现有自然居群的就地保护,促进居群的自然更新;建立种质资源库,从中选育优良品系用于药材的规范化种植。

胶东地区金银花品种间遗传关系的RAPD分析

[目的]探讨不同金银花(Lonicera japonica)品种间的遗传关系。[方法]利用RAPD分子标记技术对胶东地区31个金银花品种的遗传多样性及遗传关系进行研究。[结果]5个引物共扩增出650条带,每个引物可扩增出0~9个条带。聚类分析结果表明,31个金银花品种可以分为两大类,采自昆嵛山太白顶的金银花品种为一类,其余30个金银花品种为一类。从遗传距离来看,采自昆嵛山太白顶的品种与中医世家引进金银花品种大毛花遗传距离最远,为2.507;采自龙口兰高镇马蔺塂(Ⅱ)与中医世家引进金银花品种四季丰遗传距离最近,为0.020。[结论]不同金银花种源间具有较高的遗传多样性,不同金银花种源间的遗传关系与地理分布有一定的相关性。

蓝果忍冬种间遗传多样性及亲缘关系的RAPD研究

用27个随机引物,对蓝果忍冬(Lonicera L.subsect.Caeruleae L.)8个种的28份材料进行了RAPD分析,共检测出283个位点,平均每个引物检测出10.48个位点,其中存在多态位点217个,多态位点比率76.68%。说明蓝果亚组种间遗传多样性比较丰富。RAPD研究结果可以将蓝果忍冬进行2个等级的划分。第一等级划分将8个种分成二倍体和四倍体2个类群:第一类群为二倍体的2个种L.edulis和L.boczkarnikowii,第二类群为四倍体的6个亚种L.subsp.kamtschatica,L.subsp.pallasii,L.subsp.emphyllocalyx,L.subsp.venulosa,L.subsp.altaica和L.subsp.stenantha。第一等级的划分突出了蓝靛果忍冬二倍体和四倍体两大类群间的遗传差异,揭示了蓝果亚组的种间存在十分可观的遗传分化。第二等级划分将8个种类的28份材料划分为6个类群,其中有4个类群为独立组,对应的种为L.kamtschatica,L.emphyllocalyx,L.turczaninowii,L.stenantha;2个类群为复合组,第1个复合组为L.pallasiii和L.altaica,第2个复合组为L.edulis和L.boczkarnikowii2个种。

珞珈山东亚三角头涡虫群体遗传多样性贫乏的RAPD证据

无脊椎动物是在生物多样性中占优势的类群,生物多样性研究还未受人们重视。遗传多样性研究是生物多样性研究的重要方面,采用RAPD技术分析了取样于武汉大学珞珈山的一个东亚三角头涡虫群体,该群体多态位点比例为11.3%,遗传相似度0.9505～1.0000,平均遗传相似度为0.9784,Shannon多样性指数为0.180,UPGMA聚类分析显示该群体分为两个大的分支,各项参数显示该群体的遗传多样性贫乏。根据RAPD分析结果,该东亚三角头涡虫群体遗传多样性贫乏与其周围生境退化有关,也可能与东亚三角头涡虫具有无性生殖和有性生殖这一独特的繁殖方式相关。

山东平邑金银花三个品系RAPD分析及绿原酸含量分析

目的:分析山东平邑金银花3个品系的遗传信息和绿原酸含量,为金银花品系的研究开发提供科学数据。方法:运用RAPD分析技术和HPLC方法采集数据。结果 :金银花3种品系的RAPD遗传距离结果是:新品种与鸡爪花的遗传距离较近,在聚类分支图上归为一类;毛花与鸡爪花的遗传距离稍远。绿原酸含量结果 :毛花品系>新品种>鸡爪花品系。结论:山东平邑金银花的新品种从遗传距离上分析与鸡爪花品系的亲缘关系较近,与毛花品系的稍远;新品种的绿原酸含量介于毛花品系与鸡爪花品系之间。

忍冬属植物的遗传多样性及其种间关系研究

应用RAPD标记技术对甘肃省境内的23种忍冬属(LoniceraLinn.)植物的遗传多样性及其种间关系进行了探讨。从34个随机引物中共选出9个多态性和重复性较好且谱带清晰的引物,这9个引物扩增出的DNA片段大多在300～3000bp之间,所形成的多态性位点数差距较大。POPGENE1.31软件分析结果表明:甘肃省忍冬属植物具有较为丰富的遗传多样性,其多态性比率为71.93%,Shannon多样性指数与Nei指数分别为0.3230和0.2086。Neis遗传距离和UPGMA分析结果显示,23种忍冬明显地聚为2大类,其下又有较多分支,即隶属于同一亚组或相近亚组的不同种基本归为一类,其种间关系与传统的形态学分类结果基本一致。但也有个别种的归属及种间关系稍有变化,如形态学上差异较大的毛药忍冬和毛花忍冬在本研究中聚在一起。这可能与不同的分类水平有关。

金银花种质资源及育种研究进展

综合国内外对金银花的相关研究,对金银花种质资源调查收集、遗传多样性、品质评价及遗传育种等方面进行了阐述,旨在为金银花种质资源的开发利用和新品种选育提供参考。

金银花种质资源遗传多样性的ISSR分析

目的:探讨金银花种质资源的遗传多样性,为其育种提供参考。方法:对采自金银花主产区的18个农家品种及野生忍冬和近缘种灰毡毛忍冬共计36个样品进行ISSR-PCR分析,采用NTSYS-pc软件计算金银花不同农家品种及近缘种间的Jaccard遗传相似系数,按非加权配对算术平均法(UPGMA)建立所研究类群的系统聚类图。结果:12条引物共扩增出129个条带,其中多态带为114条,占总扩增条带数的88.37%,金银花种质资源具有较丰富的遗传多样性。从聚类分析图可以看出,金银花不同样本首先聚在一起,表明是一自然类群;野生忍冬与栽培品种具有明显的遗传差异;主产区传统品系毛花系列遗传相对较稳定,而鸡爪花系列品种繁杂,遗传变异大;新品种九丰一号已独立成一稳定品种。结论:ISSR标记可以为金银花的种质资源鉴定、遗传关系分析及栽培育种提供分子生物学依据。

我国金银花栽培品种的遗传多样性

目的:对国内金银花主产区的栽培品种进行遗传多样性分析,为了解不同产区金银花栽培品种的亲缘关系以及金银花新品种选育提供参考。方法:利用RAPD技术分析国内不同产区采集的11份栽培金银花和1份山银花样品,用NTSYS 2.10e软件对统计结果进行聚类分析。结果:17条RAPD引物共扩增出150条清晰可辨的DNA条带,其中113条在不同样品间具有多态性,通过聚类分析可将12份金银花样品分为4个大类。结论:河南封丘、河北巨鹿的金银花品种遗传差异较小,品种较为单一;山东平邑的金银花种质资源相对丰富。研究还发现,不同金银花种源间的遗传关系与地理分布存在相关性。

金银花的过氧化物酶和淀粉酶同工酶遗传多样性研究

[目的]探讨不同产区金银花的亲缘关系。[方法]采用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳技术,利用过氧化物(POD)同工酶和淀粉酶(AS)同工酶对10个地区11个金银花样品的遗传多样性进行分析。[结果]金银花过氧化物酶同工酶谱带形成2个电泳区域,共有3个酶位点,Rf值分别为0.324、0.671和0.863。其淀粉酶同工酶谱也形成2个电泳区域,共有4个酶位点,Rf值分别为0.125、0.306、0.67和0.792。不同产区金银花的过氧化物酶和淀粉酶具有较丰富的多态性,说明金银花不同居群在遗传本质上是有区别的。聚类分析表明10个产区的11个金银花样品可聚为3个类群。[结论]不同产区金银花的亲缘关系与其遗传本质和地理位置有关。

七个不同来源金银花品种遗传多样性分析

【目的】根据金银花植物学性状,分析不同种质材料间的遗传多样性和亲缘关系,建立基于植物学性状、RAPD分子标记的遗传性状数据库,为金银花种质收集、鉴定、创新、合理利用和杂交育种中的亲本选配提供科学依据。【方法】以7个不同来源的金银花品种的植物学性状为基础,在形态标记聚类分析的基础上,进一步利用RAPD分子标记技术进行遗传多样性分析,比较不同聚类分析的结果。【结果】植物学性状聚类分析结果表明,供试金银花材料之间遗传距离较远,以遗传距离7.5cM为界,可将7份不同材料分为3个组,其中金花3号、巨花1号、九丰1号、金塔1号和鲁峰巨丰为一组,湘蕾金银花和华南忍冬各为一组,与各品种种属关系划分一致。RAPD聚类分析结果表明,以遗传距离14.0cM为界,可将7个不同金银花种质分为3大类:第Ⅰ类为湘蕾金银花与华南忍冬,第Ⅱ类为巨花1号与金塔1号,第Ⅲ类为九丰1号、鲁峰巨丰与金花3号。【结论】在DNA分子水平上对金银花种质资源遗传多样性的分析结果与传统形态学分析结果相似,形态标记与分子标记适用于金银花种质资源的遗传多样性分析。

中药金银花植物遗传多样性研究进展

对金银花在我国的分布及基因型分类进行分析,利用形态学标记、生化标记和分子生物学技术对中药金银花植物的遗传多样性进行研究,以期全面准确地了解金银花的遗传多样性并对其进行保护,同时为开展金银花遗传改良提供理论依据。

药用植物金银花根围AM真菌遗传多样性

2011年3月、6月、9月和12月在河北省安国市中药材基地分0～10、10～20和20～30cm3个土层采集金银花根围土样，应用PCR-DGGE与克隆测序技术相结合的方法研究AM真菌遗传多样性及其与土壤因子的关系。结果表明，金银花根围AM真菌最佳DGGE条件为80g·L-1的丙烯酰胺、PCR产物上样量25μL、变性剂范围40％～60％、电泳时间8h、电压130V、温度60℃。以DGGE共分离出15条AM真菌条带，从中选取10条清晰粗亮的优势条带进行测序，通过同源性比对发现，10个序列均与未培养球囊霉属菌种相似性高（≥95％），说明球囊霉属为优势菌群。系统发育分析表明，10条优势条带聚为5个系统发育种，系统发育种在季节和土层上差异显著，但4个季节均未出现特有种。RDA分析表明，影响AM真菌分布的主要土壤因子是全氮、有机碳和pH。其中，AM真菌遗传多样性与土壤全氮和有机碳呈显著负相关，与pH呈显著正相关。

日本稻蝗部分种群遗传多样性研究

采用随机引物扩增多态性分析方法,研究我国长江以南地理距离跨度较大的6个不同种群日本稻蝗Oxya japonica的种群遗传学关系。10条随机引物对57个日本稻蝗个体共扩增出131个片段,其中多态性位点为128个,总的多态位点百分率是97.7%。种群间的遗传分化系数表明:日本稻蝗的遗传变异大部分存在于种群内。Neis遗传距离显示:日本稻蝗种群间的遗传距离存在较大差异,河北平山种群和云南种群遗传距离最大,为0.1715,广东广州种群和广西南宁种群遗传距离最小,为0.0770。聚类结果分析表明,地理上相距较近的种群优先相聚,遗传距离、地理距离和亲缘关系间呈现出一定的相关趋势。

运用分子标记辅助构建海带核心种质资源

海带(Saccharina japonica)是一种具有重要经济和生态价值的大型海藻,配子体是其种质资源保存的形式,也是海带杂交育种、育苗的材料。为有效管理和评价海带种质资源,初步构建了海带核心种质资源,利用RAPD标记技术对海带"早厚成一号"的28份配子体进行了遗传学评价。采用UPGMA聚类法,根据遗传相似性系数进行分组,采用简单比例法进行取样(25%、35%、50%、65%)分析,计算不同取样比例时的遗传多样性参数,结合样本的生长状态和雌、雄比例,综合评价遗传多样性的各种参数,取样比例为50%时构建的核心种质库相对合理。本研究为海带品种(系)的核心种质的筛选和遗传学评价打下基础。

基于ISSR技术的封丘不同品种忍冬遗传多样性研究

目的:分析河南封丘现有的5个主流忍冬品种的遗传多样性和亲缘关系,为忍冬品种鉴定、种质资源的保护和开发利用提供理论依据。方法:采用ISSR分子标记技术,优化忍冬的ISSR-PCR反应体系,筛选忍冬ISSR-PCR引物,利用Popgene32软件计算遗传距离和遗传相似系数,并对其数据进行聚类分析。结果:优化忍冬ISSR-PCR反应的最佳体系为:20μL体系中含2×Taq Plus Master Mix(Dye) 9.4μL、DNA模板1.9μL、引物2.5μL。筛选出5条引物共扩增出93个条带,其中多态性条带75条,多态性条带比率为80.65%;四季花与豫金1号遗传一致性达0.8710,北花1号和羊角花的遗传一致性达0.6452,基于遗传距离的聚类也可看出,四季花和豫金1号聚为一类,北花1号和羊角花聚为一类,豫金2号单独为一类。结论:ISSR分子标记技术可有效地鉴定金银花的不同品种,封丘忍冬种质资源具有较丰富的遗传多样性。

金银花及近缘种遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建

为了解金银花及近缘种之间的遗传背景差异与亲缘关系远近,本研究利用SSR分子标记技术对35份药用金银花种质资源进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果表明,所选用的23对引物有效等位基因数和期望杂合度的平均值分别为2.891和0.618,Shannon信息指数和Nei's遗传多样性指数的平均值分别为1.300和0.609,各位点的多态性信息含量平均值为0.597,表现出较高的多态性。在遗传相似系数为0.250处,可将35份供试材料分为4类。本研究运用核心引物法构建了金银花及其近缘种的指纹图谱,实现了从分子水平上对金银花种质资源的快速鉴别。本研究为区分金银花真伪品、丰富优良性状和选育优质品种提供了科学依据。