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结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322人T细胞抗原表位的多态性研究
被引量:
1
1
作者
郑玉红
刘海灿
+2 位作者
赵秀芹
蒋毅
万康林
《医学研究杂志》
2015年第6期19-23,共5页
目的探讨中国结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322的多态性及对其T细胞抗原表位的影响。方法选取中国多省的173株临床分离株,采用L-J培养基对菌株进行培养,PCR扩增Lppx和MT0322基因序列,Bioedit软件进行比对,比较其T细胞抗原表位区与非表位区...
目的探讨中国结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322的多态性及对其T细胞抗原表位的影响。方法选取中国多省的173株临床分离株,采用L-J培养基对菌株进行培养,PCR扩增Lppx和MT0322基因序列,Bioedit软件进行比对,比较其T细胞抗原表位区与非表位区的多态性。最后用Mega5软件分别计算同义突变率(d S)和非同义突变率(d N)及其比值。结果在173株菌株中,基因Lppx表现为4个非同义突变和1个同义突变位点,基因MT0322出现了3个非同义突变和1个同义突变位点。其中,有9株菌在Lppx152位的氨基酸和在MT0322的159位分别发生了1个同义突变和1个非同义突变,表现较高的多态性。Lppx有15个T细胞抗原表位中有6个发生了改变,而在MT0322中,2个表位中有1个发生了1个氨基酸的改变。Lppx的d N/d S值为0.19,MT0322的d N/d S值达到了3.69。MT0322的表位区的d N/d S值高于非表位区。结论结核分枝杆菌基因Lppx和MT0322序列具有多态性,并可能反映了这两个抗原参与了逃避宿主免疫的分化选择。
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关键词
结核分枝杆菌
lppx
MT0322
多态性
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职称材料
题名
结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322人T细胞抗原表位的多态性研究
被引量:
1
1
作者
郑玉红
刘海灿
赵秀芹
蒋毅
万康林
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
出处
《医学研究杂志》
2015年第6期19-23,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(81401647)
国家科技重大专项基金资助项目(2013ZX10003006-002-001)
文摘
目的探讨中国结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322的多态性及对其T细胞抗原表位的影响。方法选取中国多省的173株临床分离株,采用L-J培养基对菌株进行培养,PCR扩增Lppx和MT0322基因序列,Bioedit软件进行比对,比较其T细胞抗原表位区与非表位区的多态性。最后用Mega5软件分别计算同义突变率(d S)和非同义突变率(d N)及其比值。结果在173株菌株中,基因Lppx表现为4个非同义突变和1个同义突变位点,基因MT0322出现了3个非同义突变和1个同义突变位点。其中,有9株菌在Lppx152位的氨基酸和在MT0322的159位分别发生了1个同义突变和1个非同义突变,表现较高的多态性。Lppx有15个T细胞抗原表位中有6个发生了改变,而在MT0322中,2个表位中有1个发生了1个氨基酸的改变。Lppx的d N/d S值为0.19,MT0322的d N/d S值达到了3.69。MT0322的表位区的d N/d S值高于非表位区。结论结核分枝杆菌基因Lppx和MT0322序列具有多态性,并可能反映了这两个抗原参与了逃避宿主免疫的分化选择。
关键词
结核分枝杆菌
lppx
MT0322
多态性
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
lppx
MT0322
Polymorphisms
分类号
R1 [医药卫生—公共卫生与预防医学]
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作者
出处
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1
结核分枝杆菌抗原Lppx和MT0322人T细胞抗原表位的多态性研究
郑玉红
刘海灿
赵秀芹
蒋毅
万康林
《医学研究杂志》
2015
1
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