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罗汉果查尔酮合成酶基因的生物信息学分析
被引量:
10
1
作者
王志强
蒙姣荣
+4 位作者
邹承武
黄锦宽
林纬
黎起秦
陈保善
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期577-583,共7页
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮生物合成的关键酶,在植物发育、防止UV损伤、抗病和逆境反应中起着重要作用。本研究通过EST测序,获得了罗汉果查尔酮合成酶基因序列(登录号:GU980155)。为了进一步了解罗汉果查尔酮合成酶...
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮生物合成的关键酶,在植物发育、防止UV损伤、抗病和逆境反应中起着重要作用。本研究通过EST测序,获得了罗汉果查尔酮合成酶基因序列(登录号:GU980155)。为了进一步了解罗汉果查尔酮合成酶基因的特征,我们将其与46种植物的查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列进行比对和进化分析。结果表明,罗汉果查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列与其它物种的查尔酮合成酶基因均具较高同源性,编码区相似性约为94%。使用PHYLIP和MEGA4分别构建了邻接树、最大似然树和最大简约树,但经bootstrap检验,最优树未能明确罗汉果查尔酮合成酶基因的系统发育地位。以紫花苜蓿查尔酮合成酶的三维结构为参考,利用同源建模的方法预测了罗汉果查尔酮合成酶的三维结构,发现罗汉果查尔酮合成酶具有保守的活性位点和空间结构。
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关键词
罗汉果
查尔酮合成酶基因
进化分析
下载PDF
职称材料
题名
罗汉果查尔酮合成酶基因的生物信息学分析
被引量:
10
1
作者
王志强
蒙姣荣
邹承武
黄锦宽
林纬
黎起秦
陈保善
机构
广西亚热带生物资源保护利用重点实验室
广西大学生命科学与技术学院
广西大学农学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期577-583,共7页
基金
广西重点实验室能力建设计划(桂科能05112001-1)
广西自然科学基金项目(桂科自0832045)共同资助
文摘
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮生物合成的关键酶,在植物发育、防止UV损伤、抗病和逆境反应中起着重要作用。本研究通过EST测序,获得了罗汉果查尔酮合成酶基因序列(登录号:GU980155)。为了进一步了解罗汉果查尔酮合成酶基因的特征,我们将其与46种植物的查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列进行比对和进化分析。结果表明,罗汉果查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列与其它物种的查尔酮合成酶基因均具较高同源性,编码区相似性约为94%。使用PHYLIP和MEGA4分别构建了邻接树、最大似然树和最大简约树,但经bootstrap检验,最优树未能明确罗汉果查尔酮合成酶基因的系统发育地位。以紫花苜蓿查尔酮合成酶的三维结构为参考,利用同源建模的方法预测了罗汉果查尔酮合成酶的三维结构,发现罗汉果查尔酮合成酶具有保守的活性位点和空间结构。
关键词
罗汉果
查尔酮合成酶基因
进化分析
Keywords
luo han guo(siraitia grosvenorii)
Calcone synthase gene
Phylogeny analysis
分类号
S668.9 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
罗汉果查尔酮合成酶基因的生物信息学分析
王志强
蒙姣荣
邹承武
黄锦宽
林纬
黎起秦
陈保善
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
10
下载PDF
职称材料
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