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鮰爱德华菌密度感应系统LuxI/LuxR的克隆及生物信息学分析
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作者 郭锦志 马士杰 +1 位作者 韩先干 付立霞 《安徽农业科学》 CAS 2023年第18期107-114,共8页
克隆鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)YCH株酰基高丝氨酸内酯(Acyl homoserine lactones, AHLs)合成酶(LuxI)和AHLs受体蛋白(LuxR)的全长基因,并对其进行生物信息学分析。序列分析结果显示,LuxI全长666 bp,共编码221个氨基酸;LuxR全长... 克隆鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)YCH株酰基高丝氨酸内酯(Acyl homoserine lactones, AHLs)合成酶(LuxI)和AHLs受体蛋白(LuxR)的全长基因,并对其进行生物信息学分析。序列分析结果显示,LuxI全长666 bp,共编码221个氨基酸;LuxR全长720 bp,编码239个氨基酸。构建LuxI/LuxR的系统发生树,结果显示,鮰爱德华菌LuxI/LuxR与迟缓爱德华菌(Edwardsiella tarda)、杀鱼爱德华菌(Edwardsiella piscicida)、保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae)等有较近亲缘关系。利用SWISS-Model软件,分别以1K4J.1.A(46.15%)和5l09.1.A(40.83%)蛋白作为模板对LuxI蛋白的8-189区域和LuxR蛋白2个功能结构域Pfam:Autoind_bind(9~151氨基酸)和HTH_LUXR(171~228氨基酸)进行分子模拟,其中LuxI结构域内有明显的“V”形疏水腔结构,LuxR的N-端结构域有α-β-α排列,C-端结构域内有螺旋—转角—螺旋结构。 展开更多
关键词 鮰爱德华菌 密度感应系统 LuxI/luxr 基因克隆 生物信息学
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密旋链霉菌Act12中调控因子AdpA-s和LuxR-2306对寡霉素合成的影响 被引量:2
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作者 颜华 赵康康 +3 位作者 张媛 陈欢 郝鹏泽 贾良辉 《中南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第4期418-424,共7页
为揭示密旋链霉菌Act12(Streptomycespactum)中全局调控因子AdpA-s和途径特异调控因子LuxR-2306对寡霉素合成的影响,构建了AdpA-s和LuxR-2306的阻断突变株和高表达菌株,采用滤纸片法检验了发酵液对苹果腐烂菌(Valsamali)的抑生活性,利... 为揭示密旋链霉菌Act12(Streptomycespactum)中全局调控因子AdpA-s和途径特异调控因子LuxR-2306对寡霉素合成的影响,构建了AdpA-s和LuxR-2306的阻断突变株和高表达菌株,采用滤纸片法检验了发酵液对苹果腐烂菌(Valsamali)的抑生活性,利用高效液相色谱法(HPLC)分析了寡霉素的产量,通过定量PCR分析AdpA-s、LuxR-2306转录水平与寡霉素合成之间的关系.结果表明:高表达突变株AdpA-s HE和LuxR-2306 HE对苹果腐烂菌的抑生能力显著增强;而基因阻断突变株Spa LuxR-2306不再对苹果腐烂菌的生长具有抑制效果.AdpA-s HE和LuxR-2306 HE发酵液中寡霉素产量分别提高了1.8和1.9倍;Spa LuxR-2306中完全检测不到寡霉素的存在.实时定量PCR结果表明,LuxR-2306的转录水平与寡霉素生物合成核心酶的转录水平呈显著正相关.AdpA-s高表达突变株中LuxR-2306的转录水平也得到了显著提高.以上结果表明:LuxR-2306为寡霉素生物合成的途径特异性正调控因子,可以通过正调控寡霉素生物合成基因簇中核心酶的转录,进而促进寡霉素的合成.而全局性调控因子AdpA-s可能通过对LuxR-2306的转录调控,间接影响寡霉素的生物合成,后续实验将对此展开进一步的深入研究.此研究为后续对生防菌Act12中次级代谢的调控研究提供了一定的理论基础. 展开更多
关键词 密旋链霉菌Act12 寡霉素 次级代谢 全局调控因子AdpA-s 途径特异调控因子luxr
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茂原链霉菌luxR基因对TGase生物合成的作用
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作者 张莉丽 薛慧 +3 位作者 邸维 张功圣 刘宁 韩雪 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期173-177,共5页
前期研究表明,MgCl_2胁迫不但可以提高TGase的产量,还会影响微生物次级代谢产物合成的一个重要调节因子LuxR家族蛋白的表达.为了研究LuxR家族蛋白对茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)TGase生物合成以及菌体生长的调控作用,利用pKC1... 前期研究表明,MgCl_2胁迫不但可以提高TGase的产量,还会影响微生物次级代谢产物合成的一个重要调节因子LuxR家族蛋白的表达.为了研究LuxR家族蛋白对茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)TGase生物合成以及菌体生长的调控作用,利用pKC1139为载体,构建luxR基因阻断质粒,通过PEG介导的质粒转化将其转入S.mobaraensis原生质体中,利用单交换同源重组法将整个重组质粒插入到茂原链霉菌基因组中构建S.mobaraensis luxR家族蛋白基因阻断突变菌.利用菌体干重法对比突变菌和野生菌菌体生长变化,利用比色法研究两株菌TGase生物合成的变化,找到LuxR家族蛋白基因表达与TGase生物合成之间的关系.结果发现,本研究采用单交换同源重组的方法可以成功地构建出S.mobaraensis luxR基因阻断突变菌株.通过对比野生菌与阻断菌株生长和TGase活力的变化发现阻断luxR基因会导致菌体生长受阻,TGase合成延迟,并且表达量显著下降.这些研究结果表明本文研究的luxR基因可能是S.mobaraensis合成TGase必不可少的正向调控因子. 展开更多
关键词 茂原链霉菌 谷氨酰胺转氨酶 luxr基因 生物合成
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luxR基因调控嗜水气单胞菌耐药性的分子机制初探 被引量:3
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作者 毛磊磊 鄢庆枇 +4 位作者 黄力行 张梅梅 王素云 张萌萌 覃映雪 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第4期147-155,共9页
LuxR家族蛋白是一类在革兰氏阴性细菌中发挥重要作用的调控蛋白,参与细菌多项重要生理活动。采用RNAi技术构建嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) luxR05735稳定沉默菌株luxR05735-RNAi,并利用qRT-PCR检测基因沉默效果。结果显示,与野... LuxR家族蛋白是一类在革兰氏阴性细菌中发挥重要作用的调控蛋白,参与细菌多项重要生理活动。采用RNAi技术构建嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila) luxR05735稳定沉默菌株luxR05735-RNAi,并利用qRT-PCR检测基因沉默效果。结果显示,与野生株相比,沉默株中luxR05735的表达量降低了96.8%。药物敏感性实验表明,与野生株相比,luxR05735-RNAi对庆大霉素、诺氟沙星、卡那霉素、吡哌酸的耐药性显著降低。对野生株与沉默株luxR05735-RNAi的转录组数据进行分析发现,表达差异显著的基因共有1286个,其中,上调基因353个,下调基因933个;显著富集的通路4条,分别是核糖体通路、精氨酸生物合成通路、硫代谢通路、硒化合物代谢通路;在这4条通路中可能与嗜水气单胞菌耐药性相关的重要功能基因包括metE、glnA、rplB、rplX、rpsA、rpsJ等,这些功能基因编码的蛋白主要与细菌的生物成膜及核糖体蛋白合成相关。综合以上研究结果,可以推测嗜水气单胞菌的luxR05735通过调控细菌的生物膜形成相关基因及核糖体蛋白相关基因的表达,从而调控细菌对药物的耐受性。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 luxr调控蛋白 耐药 转录组
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LuxR脉冲光脱毛的临床疗效观察 被引量:2
5
作者 赵晴 赵广琼 +3 位作者 赵爱莲 陈思瑜 骆丽 谢彩英 《遵义医学院学报》 2015年第6期633-635,共3页
目的评价Palomar LuxR脉冲光祛除体毛的临床疗效。方法采用LuxR脉冲光对112例脱毛需求的患者进行脱毛治疗,治疗间隔2-8周,观察患者治疗前后及随访6-12个月的临床疗效。112例患者脱毛部位包括6个,分别为腋下、双上肢、双下肢、唇毛、络... 目的评价Palomar LuxR脉冲光祛除体毛的临床疗效。方法采用LuxR脉冲光对112例脱毛需求的患者进行脱毛治疗,治疗间隔2-8周,观察患者治疗前后及随访6-12个月的临床疗效。112例患者脱毛部位包括6个,分别为腋下、双上肢、双下肢、唇毛、络腮胡、胸腹毛。其中对42例脱腋毛患者每次脱毛前后进行疗效观察。结果 112例患者经3-6次治疗后,其中110例患者治疗有效,有效率达98.83%,86例患者痊愈,治愈率76.00%。42例脱腋毛患者随着治疗次数增加,总有效率和治愈率均增加。结论 Palomar LuxR脉冲光脱毛疗效确切,脱毛时间相对较短,过程安全舒适,不良反应少,可推广应用。 展开更多
关键词 Palomar luxr脉冲光 脱毛 疗效
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沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析
6
作者 杨艳北 许晶 +2 位作者 李袁飞 贡继尚 饶友生 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第6期40-45,共6页
LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构... LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。 展开更多
关键词 沼泽红假单胞菌 luxr 生物信息学 生物被膜
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绿针假单胞菌HT66中luxR_19对吩嗪-1-甲酰胺合成的影响 被引量:2
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作者 陈亚汶 彭华松 +1 位作者 王威 张雪洪 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期166-173,共8页
旨在研究调控基因lux R_19对绿针假单胞菌HT66中的抑菌物质吩嗪-1-甲酰胺(phenazine-1-carboxamide,PCN)合成及菌体生长的影响,通过分子操作构建了lux R_19基因敲除株、回补菌株、过表达菌株以及lux R_19(G85A)点突变菌株,检测了目标菌... 旨在研究调控基因lux R_19对绿针假单胞菌HT66中的抑菌物质吩嗪-1-甲酰胺(phenazine-1-carboxamide,PCN)合成及菌体生长的影响,通过分子操作构建了lux R_19基因敲除株、回补菌株、过表达菌株以及lux R_19(G85A)点突变菌株,检测了目标菌株生长曲线、PCN发酵结果、细菌泳动性与从动性等。结果显示,将lux R_19敲除后PCN产量明显降低,对lux R_19基因进行过表达,发现能够将PCN产量提高2倍;lux R_19对于吩嗪合成的多个调控基因以及合成基因表达均产生影响;lux R_19的敲除对HT66的生长及泳动性不产生影响,而对细菌的从动性有一定的促进作用;lux R_19(G85A)点突变菌株吩嗪产量较野生型相差很小。结果表明,lux R_19对PCN的合成为正调控基因,一定程度上影响HT66的从动性,第254位碱基突变对PCN合成产量不产生影响。 展开更多
关键词 绿针假单胞菌 HT66 吩嗪-1-甲酰胺 LUX R家族转录调控因子
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西瓜嗜酸菌LuxR家族基因luxR(4229)的功能研究 被引量:7
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作者 王铁霖 杨玉文 +1 位作者 关巍 赵廷昌 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期198-206,共9页
瓜类细菌性果斑病是葫芦科作物上的一种严重的世界性病害,其病原菌为西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)。本研究以野生型菌株Ac-5为研究对象,通过同源重组双交换的方法,构建了LuxR家族功能基因luxR_(4229)的全基因缺失突变株,并对突变株... 瓜类细菌性果斑病是葫芦科作物上的一种严重的世界性病害,其病原菌为西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)。本研究以野生型菌株Ac-5为研究对象,通过同源重组双交换的方法,构建了LuxR家族功能基因luxR_(4229)的全基因缺失突变株,并对突变株进行致病性、生物膜形成能力和运动能力等生物学特性测定。同时,qRT-PCR定量检测了鞭毛基因fliR和fliC以及III型分泌系统功能基因hrpE和hrcN的表达水平。结果显示:与野生型相比,突变株致病力明显降低,运动能力减弱,而生物膜形成能力增强。fliR、fliC、hrpE和hrcN基因在突变株中的表达量下调,luxR4229对fliR、fliC、hrpE和hrcN基因均为正调控。基因luxR_(4229)在对西瓜嗜酸菌致病力、运动能力及生物膜的形成具有重要调控作用。 展开更多
关键词 西瓜嗜酸菌 luxr家族调控因子 luxr_(4229)
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LuxR家族调控因子LuxR-2460对西瓜嗜酸菌致病力及生物膜形成的调控(英文)
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作者 王铁霖 杨玉文 赵廷昌 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期328-337,共10页
LuxR家族的调控因子在革兰氏阴性细菌中起重要作用。对西瓜嗜酸菌一个LuxR家族的调控因子LuxR-2460的调控作用进行研究。生物信息学分析表明该调控因子有2个保守结构域:N-末端为REC结构域,C-末端为HTH结构域。通过同源重组双交换的方法... LuxR家族的调控因子在革兰氏阴性细菌中起重要作用。对西瓜嗜酸菌一个LuxR家族的调控因子LuxR-2460的调控作用进行研究。生物信息学分析表明该调控因子有2个保守结构域:N-末端为REC结构域,C-末端为HTH结构域。通过同源重组双交换的方法,构建了luxR-2460全基因缺失的突变株,该基因缺失突变株能够引起菌株致病力、运动能力及蹭行运动能力的下降及生物膜形成能力的增强。qRT-PCR检测结果表明,该基因缺失导致鞭毛基因fliR在突变株中的表达量下调,影响病菌鞭毛的形成。说明luxR-2460基因对西瓜嗜酸菌的致病能力及相关因子具有重要调控作用,可以作为该病害防控的潜在靶标。 展开更多
关键词 西瓜嗜酸菌 luxr调控因子 调控作用
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LuxR家族调控蛋白的结构及功能 被引量:7
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作者 郑世超 罗瑛 鲁涛 《生命科学》 CSCD 北大核心 2010年第9期886-895,共10页
LuxR家族调控蛋白是一类在革兰氏阴性细菌群体感应中起重要作用的调控蛋白,它们参与由酰基高丝氨酸内酯介导的多种生物学过程,调控细菌生物发光、质粒转移、生物膜形成以及多种胞外酶、毒力因子和次生代谢产物的合成。LuxR家族蛋白的研... LuxR家族调控蛋白是一类在革兰氏阴性细菌群体感应中起重要作用的调控蛋白,它们参与由酰基高丝氨酸内酯介导的多种生物学过程,调控细菌生物发光、质粒转移、生物膜形成以及多种胞外酶、毒力因子和次生代谢产物的合成。LuxR家族蛋白的研究在医学、环境监测、生物防治和微生物发酵等方面具有巨大的应用潜力。该文综述了LuxR家族调控蛋白近期的研究进展、存在问题及应用前景。 展开更多
关键词 luxr 调控蛋白 群体感应
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luxR基因对希瓦氏菌群体感应特性的影响研究 被引量:8
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作者 韩云燕 李渐鹏 +2 位作者 于红雷 刘尊英 曾名湧 《食品科技》 CAS 北大核心 2019年第3期27-32,共6页
希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏水产品常见的优势腐败菌,可通过LuxR受体系统感受酰基高丝氨酸内酯(AHLs)和二酮哌嗪类化合物(DKPs)信号分子,从而调控水产品的腐败进程。通过构建希瓦氏菌LuxR基因不同片段缺陷菌株,对比研究希瓦氏... 希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏水产品常见的优势腐败菌,可通过LuxR受体系统感受酰基高丝氨酸内酯(AHLs)和二酮哌嗪类化合物(DKPs)信号分子,从而调控水产品的腐败进程。通过构建希瓦氏菌LuxR基因不同片段缺陷菌株,对比研究希瓦氏菌野生型与LuxR基因缺陷型菌株生长、生物膜形成、蛋白酶产生、产硫能力等群体感应特性的差异,揭示希瓦氏菌的致腐机制。结果表明,希瓦氏菌LuxR基因缺陷菌株生长、产蛋白酶能力及生物膜形成能力均降低,部分缺陷菌株群集运动能力和产硫能力也同步降低。希瓦氏菌群体感应相关的大部分性状受LuxR基因影响,且不同LuxR基因片的片段所控制的群体感性状不同。研究结果为LuxR系统作为希瓦氏菌控制的新靶点提供了理论依据与技术支撑。 展开更多
关键词 希瓦氏菌 luxr缺陷菌株 群体感应
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细菌群体感应LuxR solos蛋白研究进展 被引量:3
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作者 叶晓锋 朱军莉 汪海峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期341-349,共9页
N-酰基高丝氨酸内酯(N-acyl-L-homoserine lactones,AHLs)信号分子介导的群体感应(quorum sensing,QS)是一种普遍的革兰氏阴性细菌信息交流方式。AHL-QS系统包括Lux I型AHLs合成酶和LuxR型受体蛋白。然而,部分革兰氏阴性菌缺失1个或多个... N-酰基高丝氨酸内酯(N-acyl-L-homoserine lactones,AHLs)信号分子介导的群体感应(quorum sensing,QS)是一种普遍的革兰氏阴性细菌信息交流方式。AHL-QS系统包括Lux I型AHLs合成酶和LuxR型受体蛋白。然而,部分革兰氏阴性菌缺失1个或多个LuxI型AHLs合成酶,仅有未配对的LuxR型受体蛋白,该LuxR型受体蛋白称为LuxR solo或Orphan蛋白。LuxR solos蛋白在细菌窃听、种间和种内的信号交流中起重要作用,为群体感应研究领域的热点。本文主要综述细菌LuxR solos蛋白的发现、基本概念、蛋白结构及类型,阐述感应AHLs和非AHLs信号分子的重要LuxR solos蛋白及功能,并对群体感应LuxR solos蛋白的研究前景和意义进行了展望。 展开更多
关键词 luxr solos蛋白 群体感应 细菌交流
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革兰氏阴性细菌LuxR/Ⅰ型群体感应抑制剂研究进展 被引量:2
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作者 孔凡栋 周丽曼 +2 位作者 马青云 黄圣卓 赵友兴 《现代生物医学进展》 CAS 2017年第30期5984-5988,共5页
细菌群体感应(Quorum sensing,QS)被视为对抗细菌感染与解决细菌耐药性问题的新靶点。以AHLs为信号分子的LuxR/Ⅰ型群体感应系统广泛存在于革兰氏阴性菌包括多种临床致病菌中,因此寻找LuxR/Ⅰ型群体感应抑制剂(Quorum sensing inhibitor... 细菌群体感应(Quorum sensing,QS)被视为对抗细菌感染与解决细菌耐药性问题的新靶点。以AHLs为信号分子的LuxR/Ⅰ型群体感应系统广泛存在于革兰氏阴性菌包括多种临床致病菌中,因此寻找LuxR/Ⅰ型群体感应抑制剂(Quorum sensing inhibitors,QSIs)是研发抗革兰氏阴性致病菌药物的重要途径。迄今为止,已知的LuxR/Ⅰ型小分子QSIs来源包括化学合成、天然产物与已知药物库的化合物,大分子则包括群体感应淬灭酶与群体感应淬灭抗体。本文总结了近年来LuxR/Ⅰ型QSIs研究进展,为新型抗菌药物研发提供理论依据。 展开更多
关键词 细菌群体感应 LUX R/I型群体感应系统 群体感应抑制剂 研究进展
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两个luxR基因对洛蒙真菌素生物合成的影响
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作者 杨迪 王威 张雪洪 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期5296-5303,共8页
洛蒙真菌素是由洛蒙德链霉菌合成的具有广谱抗菌活性的吩嗪类化合物。luxR调控基因是细菌中一类非常重要的调控基因,广泛参与调控细菌的初级代谢和次级代谢过程。本研究分析了洛蒙德链霉菌S015中两个luxR基因luxR4和luxR13对洛蒙真菌素... 洛蒙真菌素是由洛蒙德链霉菌合成的具有广谱抗菌活性的吩嗪类化合物。luxR调控基因是细菌中一类非常重要的调控基因,广泛参与调控细菌的初级代谢和次级代谢过程。本研究分析了洛蒙德链霉菌S015中两个luxR基因luxR4和luxR13对洛蒙真菌素合成的影响。通过在野生株中单基因过表达luxR4与luxR13,发现这两个基因均能促进洛蒙真菌素的合成,菌株S015L4和S015L13中洛蒙真菌素的产量分别达到野生株的3.7倍和2.4倍。进一步通过luxR4和luxR13双基因共表达,得到高产洛蒙真菌素的菌株S015L4-13,其洛蒙真菌素的产量达到野生株的4.2倍,为(230.2±8.3)mg/L。结果表明,基因luxR4和luxR13对洛蒙真菌素的合成起正调控作用,且两个基因具有一定的协同作用。本研究为揭示洛蒙真菌素的合成的调控机制及高产菌株的构建提供了依据。 展开更多
关键词 洛蒙真菌素 luxr调控基因 双基因共表达
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A LuxR family transcriptional regulator AniF promotes the production of anisomycin and its derivatives in Streptomyces hygrospinosus var.beijingensis 被引量:10
15
作者 Jufang Shen Lingxin Kong +5 位作者 Yan Li Xiaoqing Zheng Qing Wang Weinan Yang Zixin Deng Delin You 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE 2019年第1期40-48,共9页
The protein synthesis inhibitor anisomycin features a unique benzylpyrrolidine system and exhibits potent selective activity against pathogenic protozoa and fungi.It is one of the important effective components in Agr... The protein synthesis inhibitor anisomycin features a unique benzylpyrrolidine system and exhibits potent selective activity against pathogenic protozoa and fungi.It is one of the important effective components in Agricultural Antibiotic120,which has been widely used as naturally-originated agents for treatment of crop decay in China.The chemical synthesis of anisomycin has recently been reported,but the complex process with low productivity made the biosynthesis still to be a vital mainstay in efforts.The biosynthetic gene cluster(BGC)of anisomycin in Streptomyces hygrospinosus var.beijingensis has been identified in our previous work,while poor understanding of the regulatory mechanism limited the yield enhancement via regulation engineering of S.hygrospinosus var.beijingensis.In this study here,we characterized AniF as an indispensable LuxR family transcriptional regulator for the activation of anisomycin biosynthesis.The genetic manipulations of aniF and the real-time quantitative PCR(RT-qPCR)revealed that it positively regulated the transcription of the anisomycin BGC.Moreover,the overexpression of aniF contributed to the improvement of the production of anisomycin and its derivatives.Dissection of the mechanism underlying the function of AniF revealed that it directly activated the transcription of the genes aniR-G involved in anisomycin biosynthesis.Especially,one AniF-binding site in the promoter region of aniR was identified by DNase I footprinting assay and an inverted repeat sequence(5′-GGGC-3′)composed of two 4-nt half sites in the protected region was found.Taken together,our systematic study confirmed the positive regulatory role of AniF and might facilitate the future construction of engineering strains with high productivity of anisomycin and its derivatives. 展开更多
关键词 ANISOMYCIN Agricultural Antibiotic120 BIOSYNTHESIS AniF luxr regulator STREPTOMYCES
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一个新型原核诱导表达系统的建立
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作者 刘征 高双成 +3 位作者 杨尚君 孙宁 杜蕊 赵彦宏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期145-149,共5页
群体感应是细菌依赖于种群密度进行信息交流、协调群体行为并调控基因表达的一种方式。海洋发光弧菌Vibriofischeri利用该机制合成化学物质N-酰基-高丝氨酸内酯(AHLs),与LuxR蛋白结合,随后驱动下游生物荧光基因的高量表达。基于植物叶... 群体感应是细菌依赖于种群密度进行信息交流、协调群体行为并调控基因表达的一种方式。海洋发光弧菌Vibriofischeri利用该机制合成化学物质N-酰基-高丝氨酸内酯(AHLs),与LuxR蛋白结合,随后驱动下游生物荧光基因的高量表达。基于植物叶绿体起源于原始古细菌-蓝藻的假设以及叶绿体内的转录、翻译机制与原核生物高度近似,构建了luxR基因调控下游报告基因GFP表达的叶绿体遗传转化载体。将该载体转入大肠杆菌后,当无外加信号物质AHLs时,GFP不表达;而外加AHLs后,GFP大量表达,证明luxR和GFP基因的组合在大肠杆菌中是理想的化学诱导基因表达系统,可应用于大肠杆菌基因功能的研究。 展开更多
关键词 群体感应 luxr基因 AHLs 化学诱导基因表达 叶绿体表达载体
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嗜水气单胞菌中转录因子AHA_1581对细菌生理功能调控机制 的研究 被引量:4
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作者 李碗芯 赵怡扬 +1 位作者 林玲 林向民 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期3594-3606,共13页
【目的】LuxR家族转录因子能够抑制或刺激不同功能类型基因的表达,来维持细胞功能的稳定性。嗜水气单胞菌是水产养殖中重要的致病菌之一,目前对该菌中的LuxR家族转录因子功能的研究还较少。【方法】本研究利用含有sacB标记的自杀载体pRE... 【目的】LuxR家族转录因子能够抑制或刺激不同功能类型基因的表达,来维持细胞功能的稳定性。嗜水气单胞菌是水产养殖中重要的致病菌之一,目前对该菌中的LuxR家族转录因子功能的研究还较少。【方法】本研究利用含有sacB标记的自杀载体pRE112和同源重组技术敲除LuxR家族转录因子AHA_1581基因。【结果】生理表型测定结果发现,ΔAHA_1581的运动与胞外蛋白的酶活增强、生物被膜形成能力降低,且耐受低温、卡那霉素、庆大霉素胁迫,但是对K_(2)Cr_(2)O_(7)更加敏感。进一步对野生型Ah和ΔAHA_1581的定量蛋白质组学分析,共鉴定到2654个蛋白,其中59个蛋白下调表达,142个蛋白上调表达。生物信息学分析表明AHA_1581参与调控双组分调节系统、丙酮酸代谢、碳代谢、TCA循环等细菌重要生理过程,以及细菌耐药基因和毒力因子的差异表达。【结论】了解AHA_1581基因在调控细菌毒力以及生物过程中所起的重要作用,对预防和控制嗜水气单胞菌引起疾病的发生和传播可能具有重要的科学意义。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 luxr家族转录因子 AHA_1581 定量蛋白质组学 生理功能
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卡西霉素生物合成调控基因calR2的功能 被引量:3
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作者 盖婧璇 韩铁生 +3 位作者 刘文秀 武策 汪志军 苟丽霞 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1518-1526,共9页
【背景】卡西霉素(Calcimycin)是由教酒链霉菌NRRL3882产生的吡咯聚醚类抗生素,结构独特且具有广泛的生物活性,但其生物合成调控机制尚不清楚。【目的】研究卡西霉素生物合成基因簇上编码LuxR家族同源蛋白的潜在调控基因calR2的功能。... 【背景】卡西霉素(Calcimycin)是由教酒链霉菌NRRL3882产生的吡咯聚醚类抗生素,结构独特且具有广泛的生物活性,但其生物合成调控机制尚不清楚。【目的】研究卡西霉素生物合成基因簇上编码LuxR家族同源蛋白的潜在调控基因calR2的功能。【方法】通过PCR-targeting的方法对卡西霉素基因簇上的calR2基因进行中断,HPLC对突变株及回补菌株的代谢产物进行分析。利用荧光定量RT-PCR分析ΔcalR2突变菌株和野生菌株的基因转录水平差异。【结果】calR2基因中断的突变株不能产生卡西霉素,回补菌株则恢复产生卡西霉素的能力。RT-PCR结果表明卡西霉素生物合成的一些重要骨架基因在ΔcalR2突变株中的转录水平明显降低。【结论】LuxR家族转录调控基因calR2在卡西霉素生物合成过程中起正调控作用。 展开更多
关键词 卡西霉素 luxr家族 调控基因 生物合成
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Asm8, a specific LAL-type activator of 3-amino-5-hydroxy-benzoate biosynthesis in ansamitocin production 被引量:4
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作者 PAN WenQin KANG QianJin +2 位作者 WANG Lei BAI LinQuan DENG ZiXin 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第7期601-608,1-3,共8页
The highly potent antitumor agent ansamitocin P3 is a macrolactam isolated from Actinosynnema pretiosum ATCC 31565. A 120-kb DNA fragment was previously identified as the ansamitocin biosynthetic gene cluster, and con... The highly potent antitumor agent ansamitocin P3 is a macrolactam isolated from Actinosynnema pretiosum ATCC 31565. A 120-kb DNA fragment was previously identified as the ansamitocin biosynthetic gene cluster, and contains genes for polyketide assembly, precursor synthesis, post-polyketide synthesis modification, and regulation. Within the biosynthetic gene cluster, asm8 encodes an 1117-amino-acid protein with a high degree of similarity to the large ATP-binding LuxR family-type regulators. In the current study, we determined that inactivation of asm8 by gene replacement in ATCC 31565 resulted in the complete loss of ansamitocin production, and that complementation with a cloned asm8 gene restored ansamitocin biosynthesis. Interestingly, the disruption of asm8 decreased the transcription of genes responsible for 3-amino-5-hydroxybenzoate (AHBA) formation, the starter unit required for ansamitocin biosynthesis. Subsequently, feeding of exogenous AHBA to the asm8 mutant restored ansamitocin biosynthesis, which showed that Asm8 is a specific positive regulator in AHBA biosynthesis. In addition, investigation of asm8 homologs identified two new ansamitocin producers, and inactivation of the asm8 homolog in A. pretiosum ATCC 31280 abolished ansamitocin production in this strain. Characterization of the positive regulator Asm8 and discovery of the two new ansamitocin producers paves the way for further improving production of this important antitumor agent. 展开更多
关键词 生物合成基因簇 羟基苯甲酸 生产商 氨基酸 苯甲酸酯 活化剂 AL型 短管赤眼蜂
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肺炎克雷伯菌KP1_2626基因突变株的构建及其对细胞毒性的影响
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作者 张仲双 苏克文 +5 位作者 李璇 刘品 彭丹 何蔷 邱景富 李迎丽 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期4834-4839,共6页
为探讨KP12626基因对菌株毒力的影响,本研究通过构建KP12626基因缺失的突变株Kp-Δ2626及其回补株Kpc-Δ2626,以野生株NTUH-K2044为对照,分析突变株和回补株对细胞毒性的差别,为进一步研究KP12626对菌株毒力的的调控机制提供基础。通过... 为探讨KP12626基因对菌株毒力的影响,本研究通过构建KP12626基因缺失的突变株Kp-Δ2626及其回补株Kpc-Δ2626,以野生株NTUH-K2044为对照,分析突变株和回补株对细胞毒性的差别,为进一步研究KP12626对菌株毒力的的调控机制提供基础。通过同源重组得到突变株Kp-Δ2626,然后将含有KP12626基因片段的重组质粒转化入突变株中得到回补株Kpc-Δ2626。分别测定3株菌株的生长曲线,了解KP12626基因对细菌生长的影响。用野生株、突变株和回补株3种菌株感染A549细胞,通过检测细胞乳酸脱氢酶LDH释放量来反应细菌对细胞的毒性。本实验成功构建了突变株Kp-Δ2626和回补株Kpc-Δ2626。生长曲线的测定结果表明KP12626基因的缺失不影响细菌的生长。与野生株比较突变株的细胞毒性明显减弱,回补株的细胞毒性介于野生株和突变株之间,表明突变株的细胞毒性减弱是由KP12626基因的缺失引起的,KP12626基因影响菌株的毒力。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 KP12626 毒力 A549细胞
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