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Mining lycodine-type alkaloid biosynthetic genes and genetic markers from transcriptome of Lycopodiastrum casuarinoides
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作者 Gang Chen Qiu-mei Lin +1 位作者 Lin Zeng Yi-ping Zou 《Chinese Herbal Medicines》 CAS 2020年第2期133-141,共9页
Objective:Lycopodiastrum casuarinoides,a fern of the Lycopodiaceae family,is a traditional Chinese medicine,which has similar efficacy to that of Huperzia serrata in treating rheumatoid arthritis(RA).However,they are ... Objective:Lycopodiastrum casuarinoides,a fern of the Lycopodiaceae family,is a traditional Chinese medicine,which has similar efficacy to that of Huperzia serrata in treating rheumatoid arthritis(RA).However,they are different in the contents and compositions of lycopodium alkaloids.In this study,the biosynthesis related genes of lycopodium alkaloids and genetic markers are discovered in L.casuarinoides transcriptome.Methods:The plant of L.casuarinoides was collected and was subjected to the RNA isolation,c DNA library construction,high throughput RNA sequencing and bioinformatics analysis.Results:Totally 124,524 high-quality unigenes were assembled from RNA sequencing reads,with an average sequence length of 601 bp.Among the L.casuarinoides transcripts,61,304 shared the significant similarity(E-value<10-5)with existing protein sequences in the public databases.From 124,524 unigenes,47,538 open reading frames(ORFs)were predicted.Based on the bioinformatics analysis,all possible enzyme genes involved in the lycodine-type alkaloids biosynthetic pathway of L.casuarinoides were identified,including lysine decarboxylase(LDC),primary amine oxidase(PAO),malonyl-Co A decarboxylase,etc.Sixty-four putative cytochrome p450(CYP)and 827 putative transcription factors were selected from the transcriptome unigenes as the candidates of lycodine-type alkaloids biosynthesis modifiers.Furthermore,13,352 simple sequence repeats(SSRs)were identified from 124,524 unigenes,of which dinucleotide motifs AG/CT were the most abundant(50.1%).Meanwhile,we confirmed the amplification effectiveness of25 PCR primer pairs for randomly selected SSRs.Conclusion:We obtained the comprehensive transcriptomic information from the high throughput RNA sequencing and bioinformatics analysis,which provided a valuable resource of transcript sequences of L.casuarinoides in public databases. 展开更多
关键词 lycopodiastrum casuarinoides(spring)Holub ex Dixit llycodine-type alkaloids biosynthesis simple sequence repeat(SSR) TRANSCRIPTOME
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藤石松乙酸乙酯部位的化学成分研究 被引量:2
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作者 姚晓长 蒋梅香 +3 位作者 刘阳 邹振兴 谭桂山 李静 《中南药学》 CAS 2021年第12期2536-2540,共5页
目的研究藤石松的化学成分。方法藤石松干燥全草用75%乙醇提取,所得流浸膏加3%酒石酸水溶液分散后,依次用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇萃取,将所得的乙酸乙酯部分采用硅胶、ODS、聚酰胺及半制备HPLC等方法进行分离,根据化合物的理化性质和... 目的研究藤石松的化学成分。方法藤石松干燥全草用75%乙醇提取,所得流浸膏加3%酒石酸水溶液分散后,依次用石油醚、乙酸乙酯、正丁醇萃取,将所得的乙酸乙酯部分采用硅胶、ODS、聚酰胺及半制备HPLC等方法进行分离,根据化合物的理化性质和波谱数据进行结构鉴定。结果分离得到10个化合物,分别鉴定为呋喃甲醛(1)、富马酸单甲酯(2)、二氢阿魏酸甲酯(3)、二氢阿魏酸乙酯(4)、咖啡酸乙酯(5)、5,7-二羟基-2-甲基色原酮(6)、脱落酸(7)、苔色酸乙酯(8)、4-甲氧基苯甲酸(9)、香草酸(10)。结论化合物1~10均为首次从藤石松属植物中分离得到。 展开更多
关键词 藤石松 化学成分 分离鉴定
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中药伸筋草的生药鉴别 被引量:5
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作者 戴克敏 叶青 《上海医科大学学报》 CSCD 1991年第5期387-392,T019,共7页
报道市售伸筋草来源于石松科6种不同植物:石松Lycopodium japonicum Thun-b.,华中石松五L.centro-chinense Ching,垂穗石松Phahinhaea cernua (Linn.)Franco etVase,玉柏石松Lycopodium obscurum Linn.,扁枝石松Diphasiastrum complarna... 报道市售伸筋草来源于石松科6种不同植物:石松Lycopodium japonicum Thun-b.,华中石松五L.centro-chinense Ching,垂穗石松Phahinhaea cernua (Linn.)Franco etVase,玉柏石松Lycopodium obscurum Linn.,扁枝石松Diphasiastrum complarnatum(Li-nn.)Holub.及藤石松Lycopodiastrum casuarinoides(Spring)Holub。对6种药材全草的生药性状、组织构造和粉末特征进行了比较鉴定。 展开更多
关键词 石松 鉴定
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藤石松化学成分的研究 被引量:3
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作者 蒋梅香 姚晓长 +2 位作者 刘阳 谭桂山 李静 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期821-824,共4页
目的研究藤石松Lycopodiastrum casuarinoides(Spring)Holub的化学成分。方法藤石松75%乙醇提取物采用硅胶、半制备HPLC等进行分离纯化,根据理化性质及波谱数据鉴定所得化合物的结构。结果从中分离得到11个化合物,分别鉴定为月桂醇(1)... 目的研究藤石松Lycopodiastrum casuarinoides(Spring)Holub的化学成分。方法藤石松75%乙醇提取物采用硅胶、半制备HPLC等进行分离纯化,根据理化性质及波谱数据鉴定所得化合物的结构。结果从中分离得到11个化合物,分别鉴定为月桂醇(1)、4-酮松脂酚(2)、穗花杉双黄酮7,4′,7″,4-四甲基醚(3)、苜蓿素(4)、7-甲氧基苜蓿素(5)、东莨菪内酯(6)、异东莨菪内酯(7)、秦皮乙素(8)、桦木酸(9)、4-羟基苯甲醛(10)、4-羟基苯甲酸甲酯(11)。结论所有化合物均为首次从藤石松属植物中分离得到。 展开更多
关键词 藤石松 化学成分 分离鉴定
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抗菌消炎妇科中药的筛选及临床前实验研究 被引量:4
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作者 左春连 韩成云 +1 位作者 刘智凯 晏渠如 《中国当代医药》 2016年第36期121-124,共4页
目的探讨妇科生殖系统感染的治疗药物,筛选抗菌消炎效果特别显著的中药。方法选择抗菌消炎的4种中药:树参、藤石松、松萝和石仙桃,分别用水提法和醇提法提取其组分,将其提取物配为相同浓度的溶液,分组为中药处理组(n=25)和水CK1、乙醇CK... 目的探讨妇科生殖系统感染的治疗药物,筛选抗菌消炎效果特别显著的中药。方法选择抗菌消炎的4种中药:树参、藤石松、松萝和石仙桃,分别用水提法和醇提法提取其组分,将其提取物配为相同浓度的溶液,分组为中药处理组(n=25)和水CK1、乙醇CK2对照组(n=25)。培养大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌和产气大肠埃希菌,采用管碟法测定中药提取液的抑菌圈,评价抑菌效果。结果 4种中药水提液中,抑菌效果最好的是藤石松,对3种细菌的抑制效果都很明显,与对照组差异有统计学意义(P<0.01),树参对金黄色葡萄球菌的抑制效果较强,抑菌效果与对照组差异有统计学意义(P<0.05),其次是松萝,与对照组差异有统计学意义(P<0.05)。4种中药醇提液中,抑菌效果最好的是树参,对3种菌的抑制效果都很明显,与对照组差异有统计学意义(P<0.05),树参和松萝的醇提液抑菌效果几乎相当,与对照组差异有统计学意义(P<0.05)。结论树参和松萝醇提液、藤石松水提液的抑菌效果显著,适合在妇产科临床上外用,树参的水煎煮汁液口服,临床上均有抗菌消炎效果。 展开更多
关键词 妇科炎症 树参提取物 藤石松提取物 抗菌消炎 筛选
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藤石松的生物碱类成分研究
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作者 陈烨琪 潘亚茹 +2 位作者 卓越 张一帆 顾继洪 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1460-1465,共6页
目的研究藤石松Lycopodiastrum casuarinoides的生物碱类成分。方法利用多种色谱方法对藤石松总生物碱部位进行分离纯化。通过多种波谱技术以及单晶X-射线衍射鉴定化合物的结构。结果从藤石松全株植物中分离到11个化合物,分别鉴定为6-羟... 目的研究藤石松Lycopodiastrum casuarinoides的生物碱类成分。方法利用多种色谱方法对藤石松总生物碱部位进行分离纯化。通过多种波谱技术以及单晶X-射线衍射鉴定化合物的结构。结果从藤石松全株植物中分离到11个化合物,分别鉴定为6-羟基-β-玉柏碱(1)、去-N-甲基-β-玉柏碱(2)、casuarine B(3)、石杉碱乙(4)、casuarinine B(5)、β-玉柏碱(6)、蛇足石杉碱(7)、N-demethylhuperzinine(8)、石杉碱丙(9)、8,15-dihydrohuperzinine(10)、casuarinine I(11)。结论化合物1为新的石松碱类化合物。 展开更多
关键词 藤石松 石松碱 6-羟基-β-玉柏碱 去-N-甲基-β-玉柏碱 石杉碱乙 蛇足石杉碱
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药用植物藤石松生药和饮片中的微小RNA差异表达研究
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作者 陈刚 董彦彦 邹一平 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第24期5230-5241,共12页
目的拟利用藤石松Lycopodiastrum casuarinoides生药与饮片中微小RNA(mi RNA)表达谱,鉴定其中热稳定存在的mi RNA,为今后藤石松mi RNA生物药效研究奠定基础。方法选取藤石松的2种加工形态生药与饮片全株样品(包含茎、叶、分枝),采用Illu... 目的拟利用藤石松Lycopodiastrum casuarinoides生药与饮片中微小RNA(mi RNA)表达谱,鉴定其中热稳定存在的mi RNA,为今后藤石松mi RNA生物药效研究奠定基础。方法选取藤石松的2种加工形态生药与饮片全株样品(包含茎、叶、分枝),采用Illumina Hi SeqTM 2500高通量测序方法,根据mi RNA家族在不同物种中的保守性,将mi RBase数据库中的已知植物mi RNA与通过高通量测序获得的藤石松mi RNA序列进行比对,利用生物信息学方法,注释藤石松中的所有mi RNA序列,并鉴定生药与饮片之间的差异表达mi RNA分子,同时完成它们相应的人类靶基因预测,此外,对这些mi RNA及靶基因进行GO和KEGG功能注释分析。结果生药组与饮片组分别获得9 898 332、10 099 918条序列,其长度基本呈正态分布,而且均在21、24 nt的位置上形成2个峰值。两组显著差异表达的mi RNA共计25个,其中22个表达上调,3个表达下调。GO分析结果表明mi RNA靶基因涉及富集与结合、催化、分子转导等分子功能以及细胞调控、代谢过程等生物过程。KEGG通路富集分析表明靶基因多集中于癌症与免疫相关通路,如pathways in cancer、proteoglycans in cancer等信号通路。结论首次揭示了藤石松生药与饮片的mi RNA表达谱,存在潜在的可利用的植物来源的稳定mi RNA分子,为进一步研究藤石松中与癌症或免疫相关的mi RNAs分子药理功能奠定基础。 展开更多
关键词 藤石松 生药 饮片 小RNA测序 微小RNA 差异表达
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