1株抗肝肿瘤新城疫病毒溶瘤株F基因的克隆和测序

目的对我们发现的1株高效抗肝肿瘤新城疫病毒溶瘤株的F基因进行扩增、序列测定和分析。方法RT-PCR扩增F基因片段,序列测定后与国际标准株弱毒株LaSota、B1及强毒株HER33、ITA/45、TEX/48、JS206WD、YG03的F基因比较研究,并对这株病毒F蛋白分子结构的疏水性、抗原表位及进化树分析。结果扩增出的F基因片段核苷酸长度为1656bp,单一的开放读码框编码552个氨基酸,其核苷酸序列与以上7种NDV的F基因同源性分别为:87.1%、87.5%、91.4%、91.7%、87.5%、90.7%、92.4%,氨基酸序列同源性为:90.2%、89.7%、94.9%、93.8%、90.8%、94.4%、95.5%。F基因裂解位点的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,与所有强毒株在这一区域的序列(112R/K-R-Q-K/R-R-F117)相符,疏水性与抗原表位均与强毒株相似,进化树分析属于基因VI型。结论推测新发现的1株高效抗肝肿瘤新城疫病毒为NDV基因Ⅵ型强毒株。