目的探讨m^(7)G相关基因能否作为肝细胞性肝癌预后的生物标志物。方法采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选肝细胞性肝癌组织和癌旁组织中有表达差异的m^(7)G相关基因组,m^(7)G相关基因和临床数据中的生存时间...目的探讨m^(7)G相关基因能否作为肝细胞性肝癌预后的生物标志物。方法采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选肝细胞性肝癌组织和癌旁组织中有表达差异的m^(7)G相关基因组,m^(7)G相关基因和临床数据中的生存时间及生存状态按照样本ID号匹配合并后筛选预后基因组,将两组的交集基因纳入lasso回归,对筛选出来的基因进行风险评分,基于风险评分的中位数值将所有肝细胞性肝癌患者分为高、低两个风险组,并对高分险组和低风险组进行单因素和多因素的Cox回归分析,评价风险评分在预后中的差异。结果经lasso回归筛选出4个模型基因(AGO2、NCBP1、NCBP2、WDR4),高风险组的生存率显著低于低风险组(P=0.027),ROC曲线显示风险模型对患者1,2,3年生存预测的曲线下面积(AUC)分别为0.683,0.604,0.602。肿瘤分期、T分期、M分期和风险评分是肝细胞性肝癌预后的相关因素(P<0.05),其中风险评分是影响肝细胞性肝癌患者生存率的独立预后因素(P=0.044,HR=1.637)。结论m^(7)G相关基因可作为肝细胞性肝癌预后的生物标志物。AGO2、NCBP1、NCBP2和WDR4构建的风险模型对肝细胞性肝癌具有重要的预后价值。展开更多
文摘目的探讨m^(7)G相关基因能否作为肝细胞性肝癌预后的生物标志物。方法采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选肝细胞性肝癌组织和癌旁组织中有表达差异的m^(7)G相关基因组,m^(7)G相关基因和临床数据中的生存时间及生存状态按照样本ID号匹配合并后筛选预后基因组,将两组的交集基因纳入lasso回归,对筛选出来的基因进行风险评分,基于风险评分的中位数值将所有肝细胞性肝癌患者分为高、低两个风险组,并对高分险组和低风险组进行单因素和多因素的Cox回归分析,评价风险评分在预后中的差异。结果经lasso回归筛选出4个模型基因(AGO2、NCBP1、NCBP2、WDR4),高风险组的生存率显著低于低风险组(P=0.027),ROC曲线显示风险模型对患者1,2,3年生存预测的曲线下面积(AUC)分别为0.683,0.604,0.602。肿瘤分期、T分期、M分期和风险评分是肝细胞性肝癌预后的相关因素(P<0.05),其中风险评分是影响肝细胞性肝癌患者生存率的独立预后因素(P=0.044,HR=1.637)。结论m^(7)G相关基因可作为肝细胞性肝癌预后的生物标志物。AGO2、NCBP1、NCBP2和WDR4构建的风险模型对肝细胞性肝癌具有重要的预后价值。