MAGE-4抗原MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽的预测

1目的预测黑色素瘤相关抗原-4(MAGE-4)抗原的MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽。2方法利用NCBI蛋白数据库检索到MAGE-4抗原的氨基酸序列,BIMAS、SYFPEITH1、IEDB等3种方案分别对MAGE-4抗原的HLA-A*0201限制性MHC-Ⅰ类抗原表位进行预测,选出候选肽;然后利用SYFPEITHI服务器和NetMHCIIpan 3.1服务器对候选肽周围的MHC-Ⅱ限制性表位进行预测。综合分析选出MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽。3结果筛选得到3条肽段,既存在MHC-Ⅰ限制性表位又存在MHC-Ⅱ限制性表位肽。4结论为MAGE-4抗原用于结肠癌免疫治疗肽段的选择提供了依据。

探索MAGE-A3和AKAP-4在非小细胞肺癌中的表达及意义

目的检测癌睾丸抗原(CTA)MAGE-A3、AKAP-4在非小细胞肺癌(NSCLC)的表达及意义。方法应用间接酶免疫组化技术检测MAGE-A3、AKAP-4在45例肺癌组织中的表达情况,分析其与组织类型及淋巴结转移的相关性。结果 45例标本中MAGE-A3、AKAP-4在NSCLC中的敏感度分别为62.2%和73.3%,联合两种抗原可显著提高敏感性,为91.1%(P<0.05);MAGE-A3、AKAP-4在鳞癌中的表达率显著高于腺癌,与性别、年龄、淋巴结有无转移不相关。结论 MAGE-A3、AKAP-4是较好的NSCLC辅助诊断指标,联合应用两种蛋白可提高诊断敏感性。

食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测

目的预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析。结果对SYFPEITHI预测>20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分析,并与已报道抗原肽进行比对,初步筛选出了42个潜在的CTL表位。结论这42个九肽均未见文献报道,进一步鉴定将为CTL表位疫苗的研究提供更多的线索。其中,MAGE-422-30、202-210、286-294及COX-2479-4874个九肽具有与HLA-A2和HLA-A3超型潜在的交叉免疫活性,将为研制简约的高效广谱食管癌疫苗提供候选肽。

MAGE—4基因在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的 通过研究ＭＡＧＥ—４基因在肝细胞肝癌组织中的表达，并与患者临床资料进行分析，探讨ＭＡＧＥ—４基因与肝细胞肝癌（ＨＣＣ）患者临床指标及转移与复发的关系，为ＭＡＧＥ—４基因编码蛋白用于ＨＣＣ患者免疫治疗提供依据。方法 用ＲＴ—ＰＣＲ的方法对３１例ＨＣＣ患者癌组织及相应癌旁组织ＭＡＧＥ—４基因表达进行测定，对全部ＲＴ—ＰＣＲ扩增产物中目的基因片段进行ＤＮＡ测序以证实其为ＭＡＧＥ—４基因，患者均测定并统计ＡＦＰ、ＡＦＵ、抗ＨＣＶ、ＨＢｓＡｇ、ＡＦＰ ｍＲＮＡ、肿瘤直径等临床指标。结果 ３１例ＨＣＣ患者肝癌组织中ＭＡＧＥ－４基因表达的阳性率 ３８．７％（１２／３１）明显高于癌旁组织中 ＭＡＧＥ—４基因表达的阳性率０％（０／３１），Ｐ＜０．０１。ＨＣＣ患者肝癌组织中ＭＡＧＥ—４基因表达的阳性率与患者ＡＦＰ、ＡＦＵ、抗ＨＣＶ、ＨＢＶ标志物、ＡＦＰ ｍＲＮＡ、肿瘤直径等临床指标均无关，Ｐ＞０．０５。结论 ＭＡＧＥ－４基因在ＨＣＣ患者肝癌组织中特异高表达，可能作为ＨＣＣ患者免疫治疗攻击的靶点，ＨＣＣ患者肝癌组织中ＭＡＧＥ—４基因表达的阳性率与ＨＣＣ患者肿瘤标忘物、转移、复发均无关。

11种癌-睾丸抗原基因在食管癌中表达的检测

目的研究11种癌-睾丸(CT)抗原基因在食管癌中的表达,明确食管癌辅助免疫治疗疫苗的组成成分,为食管癌肿瘤疫苗的研制提供理论依据。方法用逆转录-聚合酶链反应法(RT-PCR)检测35例食管癌肿瘤组织以及相对应的癌旁正常食管黏膜组织中11种CT抗原基因的表达。结果所检测的11种CT抗原基因在正常食管黏膜中均无表达。在食管癌组织中表达率最高的为MAGE-3(62.9%);其次为MAGE-4(31.4%)、LAGE-1(28.6%)、MAGE-1(25.7%)、CT10(20.0%)、NY-ESO-1(20.0%)、CT7(5.7%)和SCP-1(2.9%),无一例食管癌组织表达SSX-1、SSX-2、SSX-4基因。在35例食管癌组织中,28例(80.0%)表达至少1种CT基因,21例(60.0%)表达2种以上的CT基因。其中,19.0%(4/21)同时表达4种及4种以上CT基因,占总数的11.4%(4/35)。不表达任何CT基因的7例中,Ⅱ期5例,Ⅰ期和Ⅳ期各1例。NY-ESO-1、LAGE-1、MAGE-1、MAGE-3和MAGE-4基因随肿瘤进展,其表达率增加;而SCP-1和CT10的表达主要集中在较早期的Ⅰ期及Ⅱ期食管癌组织。随着肿瘤分期的提高,CT基因的共表达率呈上升趋势,在Ⅲ期时达到最高,为28.6%。结论(1)包含MAGE-3、MAGE-4和LAGE-1等抗原成分的CT抗原疫苗可应用于食管癌患者的免疫治疗;(2)对不同病理分期的食管癌患者应采取含有不同CT抗原成分的疫苗;(3)SSX-1、SSX-2、SSX-4在食管癌组织中无表达,其具体机制有待进一步研究。