肿瘤抗原MAGE-A亚家族共同B细胞表位预测及分析

目的预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的B细胞表位,为基于多靶点的肿瘤疫苗设计提供依据。方法基于MAGE亚家族各成员蛋白质序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案,Karplus方案和Jameson-wolf抗原指数方案,并辅以MAGE蛋白的二级结构柔性区域分析,预测MAGE基因家族的B细胞共同表位。结果共预测出了5条共同表位,且部分B细胞表位高度相似或一致。结论二级结构与B细胞表位相结合的预测方法为一种高效、准确的表位预测方法,可为肿瘤治疗性疫苗的设计提供实验依据。

肿瘤抗原MAGE-A亚家族HLA-A2限制性CTL表位的预测及分析

目的 :预测肿瘤抗原MAGE A亚家族的HLA A2限制性CTL表位 ,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据 .方法 :用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA A2限制性CTL表位预测 ,采用DNAstar软件提供的蛋白质核酸序列编辑、分析工具 ,对MAGE A亚家族成员进行CTL序列同源性分析 .结果 :共预测出了 5 0个HLA A2限制性CTL表位 ,且部分CTL表位高度相似或一致 .结论 :SYFPEITHI超基序法和量化基序多项式法结合的预测方法是一种高效、准确的表位预测方法 ,结合CTL表位的同源性分析 ,可为肿瘤治疗性疫苗的制备中选择合适的CTL表位提供依据 .