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肿瘤抗原MAGE-A家族成员进化关系的初步研究
被引量:
3
1
作者
耿淼
吴玉章
万瑛
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期341-344,共4页
目的:探讨肿瘤抗原MAGE-A家族成员间的同源性,发现公共CTL表位对抗肿瘤逃逸。方法:采用1999DNNAstar软件Windwow95/98平台支持下的蛋白质核酸序列编辑、分析工具对MAGE-A家族成员进行开放阅读框、蛋白及其CTL序列同源性分析井构建种...
目的:探讨肿瘤抗原MAGE-A家族成员间的同源性,发现公共CTL表位对抗肿瘤逃逸。方法:采用1999DNNAstar软件Windwow95/98平台支持下的蛋白质核酸序列编辑、分析工具对MAGE-A家族成员进行开放阅读框、蛋白及其CTL序列同源性分析井构建种系发生树。结果:表明MAGE-A家族核苷酸同源性高达57.6%-98.0%,种系发生树显示各成员来源于同一祖先井在不同时间分野,且部分CIL表位高度相似。结论:MAGE-A 家族成员来自于同一祖先的同一家族,在肿瘤细胞中表达存在异质性,故此研究结果将有利于在发展肿瘤治疗性细胞免疫疫苗中选择合适的CTL表位。
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关键词
mage-a家族
序列比较
种系发生树
肿瘤抗原
肿瘤免疫学
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职称材料
肿瘤抗原MAGE-A亚家族共同B细胞表位预测及分析
被引量:
5
2
作者
龙海霞
万瑾
+4 位作者
王远强
朱波
倪兵
吴玉章
林治华
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期572-576,587,共6页
目的预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的B细胞表位,为基于多靶点的肿瘤疫苗设计提供依据。方法基于MAGE亚家族各成员蛋白质序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案,Karplus方案和Jameson-wolf抗原指数方案,并辅以MAGE蛋白的二级结构柔...
目的预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的B细胞表位,为基于多靶点的肿瘤疫苗设计提供依据。方法基于MAGE亚家族各成员蛋白质序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案,Karplus方案和Jameson-wolf抗原指数方案,并辅以MAGE蛋白的二级结构柔性区域分析,预测MAGE基因家族的B细胞共同表位。结果共预测出了5条共同表位,且部分B细胞表位高度相似或一致。结论二级结构与B细胞表位相结合的预测方法为一种高效、准确的表位预测方法,可为肿瘤治疗性疫苗的设计提供实验依据。
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关键词
mage-a
亚
家族
二级结构
B细胞表位
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职称材料
肿瘤抗原MAGE-A亚家族HLA-A2限制性CTL表位的预测及分析
被引量:
2
3
作者
张秀敏
隋延仿
+3 位作者
罗二平
李增山
黄亚渝
司少艳
《第四军医大学学报》
北大核心
2004年第24期2222-2225,共4页
目的 :预测肿瘤抗原MAGE A亚家族的HLA A2限制性CTL表位 ,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据 .方法 :用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA A2限制性CTL表位预测 ,采用DNAstar软件提供的蛋白质核...
目的 :预测肿瘤抗原MAGE A亚家族的HLA A2限制性CTL表位 ,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据 .方法 :用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA A2限制性CTL表位预测 ,采用DNAstar软件提供的蛋白质核酸序列编辑、分析工具 ,对MAGE A亚家族成员进行CTL序列同源性分析 .结果 :共预测出了 5 0个HLA A2限制性CTL表位 ,且部分CTL表位高度相似或一致 .结论 :SYFPEITHI超基序法和量化基序多项式法结合的预测方法是一种高效、准确的表位预测方法 ,结合CTL表位的同源性分析 ,可为肿瘤治疗性疫苗的制备中选择合适的CTL表位提供依据 .
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关键词
抗原
肿瘤
mage-a
亚
家族
T淋巴细胞
细胞毒性
表位
预测
序列分析
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职称材料
题名
肿瘤抗原MAGE-A家族成员进化关系的初步研究
被引量:
3
1
作者
耿淼
吴玉章
万瑛
机构
全军免疫学研究所
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第5期341-344,共4页
文摘
目的:探讨肿瘤抗原MAGE-A家族成员间的同源性,发现公共CTL表位对抗肿瘤逃逸。方法:采用1999DNNAstar软件Windwow95/98平台支持下的蛋白质核酸序列编辑、分析工具对MAGE-A家族成员进行开放阅读框、蛋白及其CTL序列同源性分析井构建种系发生树。结果:表明MAGE-A家族核苷酸同源性高达57.6%-98.0%,种系发生树显示各成员来源于同一祖先井在不同时间分野,且部分CIL表位高度相似。结论:MAGE-A 家族成员来自于同一祖先的同一家族,在肿瘤细胞中表达存在异质性,故此研究结果将有利于在发展肿瘤治疗性细胞免疫疫苗中选择合适的CTL表位。
关键词
mage-a家族
序列比较
种系发生树
肿瘤抗原
肿瘤免疫学
Keywords
Keywords:
mage-a
family Sequence comparison Phylogenetic tree
分类号
R730.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
肿瘤抗原MAGE-A亚家族共同B细胞表位预测及分析
被引量:
5
2
作者
龙海霞
万瑾
王远强
朱波
倪兵
吴玉章
林治华
机构
重庆工学院生物工程学院分子设计实验室
第三军医大学新桥医院全军肿瘤研究所
第三军医大学基础部全军免疫学研究所
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期572-576,587,共6页
基金
国家自然科学基金(30471579
30571714)
+1 种基金
新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-06-0780)
全国博士学位论文作者专项资金资助项目(200776)
文摘
目的预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的B细胞表位,为基于多靶点的肿瘤疫苗设计提供依据。方法基于MAGE亚家族各成员蛋白质序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案,Karplus方案和Jameson-wolf抗原指数方案,并辅以MAGE蛋白的二级结构柔性区域分析,预测MAGE基因家族的B细胞共同表位。结果共预测出了5条共同表位,且部分B细胞表位高度相似或一致。结论二级结构与B细胞表位相结合的预测方法为一种高效、准确的表位预测方法,可为肿瘤治疗性疫苗的设计提供实验依据。
关键词
mage-a
亚
家族
二级结构
B细胞表位
Keywords
mage-a
sub-family
secondary structure
B cell epitope
分类号
R392.11 [医药卫生—免疫学]
下载PDF
职称材料
题名
肿瘤抗原MAGE-A亚家族HLA-A2限制性CTL表位的预测及分析
被引量:
2
3
作者
张秀敏
隋延仿
罗二平
李增山
黄亚渝
司少艳
机构
第四军医大学基础部病理学教研室
第四军医大学生物医学工程系军队卫生装备与计量学教研室
出处
《第四军医大学学报》
北大核心
2004年第24期2222-2225,共4页
基金
国家自然科学基金重点资助项目 (39830 4 2 0 )
文摘
目的 :预测肿瘤抗原MAGE A亚家族的HLA A2限制性CTL表位 ,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据 .方法 :用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA A2限制性CTL表位预测 ,采用DNAstar软件提供的蛋白质核酸序列编辑、分析工具 ,对MAGE A亚家族成员进行CTL序列同源性分析 .结果 :共预测出了 5 0个HLA A2限制性CTL表位 ,且部分CTL表位高度相似或一致 .结论 :SYFPEITHI超基序法和量化基序多项式法结合的预测方法是一种高效、准确的表位预测方法 ,结合CTL表位的同源性分析 ,可为肿瘤治疗性疫苗的制备中选择合适的CTL表位提供依据 .
关键词
抗原
肿瘤
mage-a
亚
家族
T淋巴细胞
细胞毒性
表位
预测
序列分析
Keywords
antigens, neoplasms
mage-a
sub-family
T-lymphocytes, cytotoxic
epitopes
forecasting
sequence analysis
分类号
R392.11 [医药卫生—免疫学]
R394.2 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肿瘤抗原MAGE-A家族成员进化关系的初步研究
耿淼
吴玉章
万瑛
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2002
3
下载PDF
职称材料
2
肿瘤抗原MAGE-A亚家族共同B细胞表位预测及分析
龙海霞
万瑾
王远强
朱波
倪兵
吴玉章
林治华
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
下载PDF
职称材料
3
肿瘤抗原MAGE-A亚家族HLA-A2限制性CTL表位的预测及分析
张秀敏
隋延仿
罗二平
李增山
黄亚渝
司少艳
《第四军医大学学报》
北大核心
2004
2
下载PDF
职称材料
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