基于MALDI-TOF-MS技术筛选及鉴定大曲中芽孢杆菌

该研究对基质辅助激光解吸电离-飞行时间-质谱(MALDI-TOF-MS)技术体系进行改进与优化,创新性地引入浓香型大曲中芽孢杆菌(Bacillus)的筛选及鉴定,并结合分子生物学技术对该技术鉴定结果进行验证。结果表明,采用传统微生物培养分离法从大曲中分离得到126株菌株,其中125株通过MALDI-TOF-MS技术筛选鉴定获得9.0以上可信度分值,其中目标菌株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)的鉴定结果与分子生物学鉴定结果一致,说明该技术历经5~6 d可以准确地完成大曲样品中目标菌株的筛选鉴定,比传统微生物筛选鉴定方法至少节约1~2周时间。因此,基于MALDI-TOF-MS技术参与复杂样品中目标菌株的筛选与鉴定是一条高效的、可行的路径。

MALDI-TOF-MS鉴定成人颅内感染人型支原体1例

人型支原体是一类没有细胞壁、具有多形性、可通过滤菌器的已知最小原核型微生物。在人体中,其主要引起泌尿生殖系统感染,而在成人颅内感染中极为少见,且引起的颅内感染在诊断、治疗、预后管理等方面尚缺乏统一的共识。本文报告1例成人因车祸伤行神经外科手术后出现人型支原体颅内感染的病例,旨在为临床此类疾病诊治提供参考。

氮掺杂芦丁基碳点作为MALDI-TOF-MS基质对氨基酸的检测

以芦丁为碳源、乙二胺为氮源,采用水热法制备氮掺杂芦丁基碳点(N-CD)。通过优化温度、时间、碳源质量等反应条件得到N-CD荧光最大值。将N-CD作为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)基质对氨基酸进行检测。结果显示:氮原子在N-CD中主要以吡啶氮形式存在,氮原子的孤电子对与碳点的sP2芳香体系以垂直形式构成的共轭结构,增大了共结晶电子解吸/电离效率。使用N-CD对谷氨酸、组氨酸、苯丙氨酸和天冬氨酸进行检测。检测结果表明氨基酸离子信号强度最高可达30382。N-CD溶液作为基质最佳质量浓度为0.5 mg/mL,最大耐盐度为1 mol/L,初步实现对人体血清中氨基酸进行高通量检测。N-CD作为MALDI-TOF-MS新型基质材料在分析化学检测、环境检测以及生物小分子检测中具有良好的应用潜力,也为多元素掺杂生物质碳点材料作为MALDI-TOF-MS基质提供了参考。

MALDI-TOF-MS高灵敏度分析EGFR基因多位点突变方法的建立与应用

目的以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)为分析平台,建立表皮生长因子受体(EGFR)基因多位点突变的高灵敏度同步检测方法,用于辅助临床伴随诊断。方法使用MALDI-TOF-MS推荐的网站设计引物和单碱基延伸引物(UEP),设计添加针对野生型基因组的blocker,以减少野生型模板对突变位点检测的干扰。用数字PCR定量标准品,使用定量后的标准品验证检测体系的灵敏度。收集228例非小细胞肺癌(NSCLC)患者的血液标本,比较MALDI-TOF-MS平台与微滴式数字PCR(ddPCR)平台检测结果的特异度、灵敏度。结果MALDI-TOF-MS检测E746_A750del位点、T790M位点突变灵敏度达0.1%,最小突变检出拷贝数达2.8;L858R位点突变灵敏度达0.5%,最小突变检出拷贝数达12。与ddPCR检测相比,MALDI-TOF-MS检测E746_A750del、L858R和T790M位点的灵敏度、特异度、Kappa值分别为94.4%(34/36)、99.5%(191/192)、0.95,94.6%(35/37)、100.0%(191/191)、0.97,83.3%(15/18)、99.5%(209/210)、0.87。结论MALDI-TOF-MS建立的检测方法具有很高的灵敏度,与ddPCR检测具有非常高的一致性,有广阔的临床应用前景。

克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库的建立及应用

应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术建立了克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库,用于该菌属内种和亚种的高通量鉴定及菌株分型。在优化培养条件、样品处理方法及确定MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱采集参数的基础上,将采集的8种参考菌株蛋白质质谱数据通过Biotyper软件构建克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库,再用相近肠杆菌及该属分离株验证数据库的准确性。结果表明:应用建立的克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库对135株克罗诺杆菌分离株进行分析,鉴定分值均不小于2.0,达到了种水平鉴定要求,通过聚类分析,可进一步分型。构建的MALDI-TOF-MS数据库为克罗诺杆菌高通量鉴定与分型提供了一种新的手段。

沙门氏菌MALDI-TOF-MS检测方法的建立

建立利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对食品中沙门氏菌的快速检测方法。从食品中分离出可疑沙门氏菌,利用不同培养基分离纯化,通过MALDI-TOF-MS法进行鉴定,并与其他检测方法比较。MALDI-TOF-MS对野生沙门氏菌株的鉴定结果与传统鉴定结果一致,说明本试验建立的方法对于沙门氏菌的鉴定准确性较高。MALDI-TOF-MS方法检测食品中沙门氏菌快速准确且操作简单,可发展成为食品检验沙门氏菌的重要辅助工具。

沙门氏菌MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱分析方法的研究

以沙门氏菌标准菌株(Salmonella enterica DSM 17058 T)为研究对象,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对其进行蛋白质指纹图谱分析,进而得到正确的鉴定结果。为了获得重现性良好的质谱图,对沙门氏菌的最佳培养基、最适培养时间以及样品前处理方法进行了优化,从而确立沙门氏菌MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱标准分析方法。结果表明:乙醇/甲酸处理法所得图谱中的特征峰多,包含更多的蛋白标志物,所得图谱基线平滑,噪音少,信噪比高,是最佳的样品处理方法。以营养丰富的哥伦比亚琼脂为培养基,在24 h时即可达到强峰值信号,质谱图重现性良好,鉴定结果准确,并且相比于其它3种培养基所需培养时间短。

单增李斯特氏菌MALDI-TOF-MS鉴定与分型研究

为建立单增李斯特氏菌的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)快速鉴定与分型方法,实验收集37株单增李斯特氏菌分离株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质指纹图谱,汇总成标准图谱,建立单增李斯特氏菌鉴定数据库。采用单增李斯特氏菌标准菌株进行验证,表明鉴定结果的可信度很高。在数据库信息的基础上,对37株单增李斯特氏菌分离株进行聚类分型。分型结果表明,在蛋白质水平上,MALDI-TOF-MS可把37株单增李斯特氏菌分成9个型别。

兔肝金属硫蛋白亚型异构体的高效液相色谱分离与ESI-MS,MALDI-TOF-MS鉴定

由于金属硫蛋白 (MT)基因的多态性 ,决定不同亚型的 MT异构体的存在 ,MT亚型异构体的结构是MT功能研究的基础 .通过离子交换柱可将 MT分成 MT-1和 MT-2两个异构体 ,用不同条件的反相高效液相色谱 (RP-HPLC)可将 MT-1和 MT-2分成不同的亚型异构体 ,并利用 MALDI-TOF MS和 LC-ESI-MS对比确定了它们的分子量 .结果表明 ,兔肝 MT在不同的 p H条件下分离得到不同分子量的亚型异构体 .在酸性条件下 ,MT-1可分为 2个主要亚型异构体 ,分子量分别为 61 49.0和 62 44.5 ,而 MT-2主要分为 3个亚型异构体 ,分子量分别为 61 49.0 ,62 44.0和 61 2 7.0 . MT-1和 MT-2有 2个亚型异构体分子量相同的异构体存在 .在酸性条件下 ,MT-1的 2个异构体及 MT-2分子量为 61 2 7的亚型异构体可稳定存在 .

MALDI-TOF-MS鉴定布鲁氏菌方法建立和评价

目的为了快速、准确、便捷的检测和鉴定布鲁氏菌,本研究拟建立鉴定布鲁氏菌属的MALDI-TOF-MS方法,利用现场分离菌株对该方法进行特异性和敏感性评价。方法收集布鲁氏菌标准菌株和地方流行株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质指纹图谱,汇总成标准图谱,建立布鲁氏菌鉴定数据库。并用39株布鲁氏菌菌株,对建立的数据库进行验证。结果经数据库鉴定,39株布鲁氏菌菌株与数据库中布鲁氏菌的匹配分数全部大于2.300,均报告为布鲁氏菌,表明鉴定结果的可信度很高。聚类分型结果表明,在蛋白质水平,MALDI-TOF-MS将测试的布鲁氏菌分成3大类。结论MALDI-TOF-MS对布鲁氏菌进行鉴定,具有快速、准确、灵敏等优点,可以实现对布鲁氏菌属的准确鉴定,对布鲁氏菌病的临床诊断具有较高的使用价值。

基于MALDI-TOF-MS的脂质组学研究——鲫鱼受镉暴露的潜在生物标志物

以含镉(Cd)500μg/L水体中养殖0,10,20 d的3组鲫鱼为研究对象,测定鱼肉中Cd含量,借助HPLC与MALDI-TOF-MS离线联用技术得到鱼肉磷脂图谱,并采用偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)针对图谱数据开展模式识别分析.结果表明,在20 d暴露期内,鱼肉中Cd含量呈持续上升趋势,而磷脂酰胆碱(PC)含量在暴露10 d后显著低于正常水平(未受镉暴露)(p<0.05),暴露20 d后基本恢复到正常水平.PLS-DA分析实现了3组样本的组间判别,说明磷脂指纹图谱能更好的反映外源Cd对鲫鱼的代谢影响.PC可以作为指示水体Cd对鲫鱼毒害作用的生物标志物.HPLC与MALDI-TOF-MS离线联用技术不仅能定量分析鱼肉中PC总量,也分离纯化了PC组分,从而使MALDI-TOF-MS成功用于复杂鱼肉样品的磷脂分析,适用于脂质组学研究.

MALDI-TOF-MS方法检测、鉴定副溶血性弧菌

目的建立快速检测和鉴定副溶血性弧菌的基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析方法。方法采用副溶血性弧菌标准菌株,在不同的培养基或不同的培养时间下进行MALDI-TOF-MS检测,同时对长时间冷冻保存的菌株进行检测,以验证该方法的稳定性和重复性。对不同来源的菌株进行检测,以确认方法的准确性。结果用PW、TCBS琼脂和弧菌显色培养基等3种培养基,分别培养18、42、72h时,对该菌的蛋白质谱图影响很小;保存2年的菌株,其MALDI-TOF-MS鉴定分值保持稳定;对来自不同国家和地区的菌株都可以得到同样准确的结果。结论 MALDI-TOF-MS方法可以快速、准确地鉴定副溶血性弧菌。因其具有很好的稳定性和重复性,可用于副溶血性弧菌的日常检测。

MALDI-TOF-MS在病原微生物鉴定中的研究进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是鉴定多种致病性细菌的快速、可靠的方法,具有较好的稳定性和可重复性,在快速和准确性方面的总体表现明显好于传统的细菌生化鉴定方法。适合于一些致病菌的快速、高通量的检测和鉴定。综述MALDI-TOF-MS技术在普通病原菌、多血清型病原菌、非发酵性细菌,以及植物病原菌等病原微生物鉴定方面的最新研究进展。

APTIMA HPV E6/E7 mRNA和MALDI-TOF-MS HPV基因分型检测宫颈高度病变效果评价

目的：以HC-Ⅱ法HPV DNA为对照,评价APTIMA法HPV E6/E7 mRNA检测（A-HPV）和MALDI-TOF-MS HPV分型检测技术（M-HPV）用于宫颈癌与癌前病变筛查的临床价值。方法：深圳市25-59岁、3年内未行宫颈癌筛查、未接受过子宫切除和盆腔放疗的2095例未孕妇女参加了本次筛查。医生于患者宫颈外口处直接收集2份宫颈脱落细胞标本,一份用于液基细胞学检查,一份用于HC-Ⅱ、A-HPV和M-HPV检测。宫颈细胞学≥ASCUS及3种方法 HPV检测任一阳性结果者均回叫行阴道镜下定点或四象限活检及宫颈管诊刮（ECC）。以病理诊断为标准评价各种HPV检测方法用于宫颈癌筛查的价值。结果：2095例研究对象中各项检测数据齐全者1970例。1970例患者的平均年龄为（35.89±7.655）岁。细胞学≥ASCUS者占6.4%（127/1970）,CINⅡ＋者占1.3%（26/1970）,CINⅢ＋者占0.76%（15/1970）。HC-Ⅱ、A-HPV和M-HPV总的HPV阳性率分别是19.4%、12.1%和14.8%,差异有统计学意义（P〈0.05）。HC-Ⅱ、A-HPV和M-HPV对检出CINⅡ＋病变的敏感性分别为88.5%（95%CI为68.7-97.0）、100%（95%CI为84.0-100）和92.3%（95%CI为73.4-98.7）,特异性分别为81.5（95%CI为79.7-83.2）、89.1%（95%CI为87.6-90.4）和86.3%（95%CI为84.6-87.8）;A-HPV与HC-Ⅱ相比敏感性稍高（P〈0.05）,M-HPV敏感性和HC-Ⅱ相同（P〉0.05）,三者比较有统计学意义（P〈0.05）。结论：A-HPV和M-HPV用于宫颈癌筛查都有很好的敏感性和准确性,两者活检率明显低于HC-Ⅱ,可减少医疗负担和花费。HPV亚型分型和HPV E6/E7 mRNA结合有更好地预测宫颈癌患病风险的作用。

MALDI-TOF-MS鉴定生物脱氮细菌的方法研究

采用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对生物脱氮废水处理系统中分离得到的两株细菌进行蛋白质质量指纹图谱分析。对供试细菌,比较样品处理方法和基质选择对细菌蛋白质质量指纹图谱的影响,获得优化的实验条件,并对方法的重现性进行了研究。建立了一种快速的细菌蛋白质质量指纹图谱鉴定方法。结果显示:该方法灵敏度高,且分析过程简单快速,具有广泛的开发和应用意义。

应用MALDI-TOF-MS联合分离胶法快速鉴定阳性血培养标本的初步研究

目的运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)联合分离胶法快速鉴定血培养阳性标本,探讨快速鉴定法的符合率。方法运用分离胶法提取阳性血培养瓶中富集的菌落,应用MALDITOF-MS对经前处理的血培养阳性标本进行直接鉴定,鉴定结果与传统的VITEK-2Compact全自动细菌分析仪鉴定结果进行比较,若有不符,以16SrRNA序列分析结果作为金标准。结果在实验的200株阳性血培养标本中,革兰阳性菌的鉴定符合率达79.5%;革兰阴性菌鉴定符合率达85.7%;真菌的鉴定符合率达20.0%。由此可见,革兰阴性菌的鉴定符合率高于革兰阳性菌,二者鉴定符合率均远高于真菌。两种及两种以上细菌混合感染的阳性标本直接鉴定还存在一定困难,其直接鉴定方式还需进一步探讨。应用两种鉴定方法得出不同结果的12株阳性标本,16SrRNA序列分析结果均与VITEK-2Compact全自动细菌分析仪鉴定结果一致。结论MALDI-TOF-MS联合分离胶促凝管直接检测血培养阳性标本,对血流感染中主要病原菌的鉴定符合率较高,且迅速简便,此方法可将细菌更快地鉴定到种属,使临床能够进行早期治疗,有效控制菌血症的病死率和院内感染。

MALDI-TOF-MS技术在酵母样真菌鉴定中的临床应用评价

目的评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time Of FlightMass Spectrometry,MALDI-TOF-MS）技术对酵母样真菌鉴定的临床应用价值。方法将2015年6月-2016年6月临床检出的142株酵母样真菌标本同时采用MALDI-TOF-MS技术和传统真菌培养方法进行鉴定,记录结果并对结果进行对比分析。结果两种方法对于常见的白念珠菌、热带念珠菌、克柔念珠菌和新生隐球菌的鉴定率很高（100%）,符合率较高（100%）;对于少见的葡萄牙念珠菌、解脂念珠菌、产朊念珠菌,两种方法的符合率较低,分别为25.00%、00.00%、00.00%。结论 MALDI-TOF-MS技术对酵母样真菌的鉴定率较高,操作简便快速,是传统真菌培养鉴定的有力补充,可将其推广应用于酵母样真菌的早期快速鉴定。

基于2D-DIGE/MALDI-TOF-MS技术筛选奶牛低血钙症生物标志物

奶牛乳热(MF)是一种严重的营养代谢性疾病,通常被分为临床型及亚临床型低血钙症(SH)。奶牛乳热的诊断通常是应用奶牛血浆中的钙浓度进行判定的,但是在奶牛乳热整个发生发展的过程中,发病的具体机制仍是研究的盲点。在本试验中通过筛选奶牛乳热、亚临床低血钙症及健康奶牛间生物标志物进而解释可能的发生机制。选取27头奶牛作为实验动物,并根据其血浆钙浓度及有无临床症状分为乳热组(MF组)、亚临床低血钙组(SH组)和正常组(C组)。在组内每3个样品混合成为1个混合样本应用于2D-DIGE试验。结果得到110个差异蛋白质点,选取其中80个点进行MALDI-TOF-MS质谱分析,得到66个阳性结果并整合成为16种蛋白质。根据试验结果,选取A2M、HP和PON1进行Western blotting验证试验。本试验首次证实A2M、HP和PON1是奶牛乳热症3种新的生物标志物,并分析了其在乳热症发生过程中的可能作用机制。

MALDI-TOF-MS测定天然白芨多糖相对分子质量的研究

目的 考察基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）用于检测天然多糖相对分子质量的可行性及条件。方法 以2，5-二羟基苯甲酸（DHB）为基质对精制后的天然白芨多糖（未分级）相对分子质量进行测定。条件采用DHB-白芨多糖为1．5：1，室温液滴自然干燥法；线性正离子谱模式，激光强度：1500～2500单位。结果 白芨多糖相对分子质量分布在6×10^4～3×10^5，其分散性较大。结论 采用DHB与白芨多糖样品比例为1．5：1，直接液滴干燥法效果好，能获得较好的图谱效果。

MALDI-TOF-MS鉴定宋内志贺菌的初步应用研究

目的通过扩充基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)的数据库研究宋内志贺菌的鉴定。方法用提取法进行宋内志贺菌质谱图的建库,建库后分别使用直接涂抹法和提取法对50株宋内志贺菌野生株进行鉴定。结果提取法的鉴定符合率为100%,而直接涂抹法的鉴定符合率为60%。结论 MALDI-TOF-MS通过数据库的扩充和流程的优化可以鉴定宋内志贺菌到血清学水平,它将会成为临床微生物实验室的诊断和鉴别工具。