猪MAP2K6基因多态性及其与经济性状的关联分析

本实验旨在探究猪丝裂原活化蛋白激酶激酶6(Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 6,MAP2K6)多态性与猪重要经济性状的关系,为猪育种提供新的标记资源。实验选用法系大白猪为研究对象,采用质谱技术对猪MAP2K6基因的SNPs位点进行基因分型,同时利用线性混合模型分析单个标记位点与猪重要经济性状的相关性,共检测出4个SNPs,通过与生长育肥和乳头数性状的关联分析表明,rs345304630(SNP1)、rs325278117(SNP2)和rs332017877(SNP3)与达100 kg体重日龄和右乳头数显著相关,rs325752048(SNP4)与眼肌面积显著相关;连锁不平衡结果表明,MAP2K6基因SNP1、SNP2和SNP3处于强连锁不平衡状态。结果提示,在育种进程中,通过对优质基因型的选择来缩短母猪达100 kg体重日龄,增加母猪的泌乳和带仔能力,对提高哺乳仔猪的存活率和断奶重具有重要意义,也可为猪生长育肥和乳头数性状的分子标记的挖掘和利用提供一定的理论依据。

黄芩素通过促进miR-29a-3p抑制MAP2K6改善骨性关节炎模型大鼠软骨细胞退化

目的:探索黄芩素(Baicalein)改善软骨细胞退化的可能机制。方法:用不同浓度黄芩素处理OA大鼠,观察软骨退化情况,并检测炎性细胞因子水平。用不同剂量黄芩素处理OA细胞模型,检测各组细胞的活力及凋亡情况,双荧光素酶报告验证miR-29a-3p、MAP2K6的靶向关系。结果:与假手术组比较,OA模型组大鼠血清中IL-1β、IL-6、TNF-α水平显著增高,细胞活力显著降低,细胞凋亡率显著增高,与模型对照组比较,黄芩素10、20、30 mg/kg能够显著降低OA模型血清中IL-1β、IL-6、TNF-α水平,能够显著改善OA大鼠软骨细胞活性抑制及凋亡情况,能够缓解OA模型软骨组织番红氧失染情况;miR-29a-3p与MAP2K6存在靶向关系,黄芩素10μmol/L能够明显下调OA细胞中MAP2K6、p38/p-p38、MAX蛋白表达水平。结论:黄芩素可以通过调节miR-29a-3p靶向抑制MAP2K6的磷酸化,提高软骨细胞活性,抑制细胞凋亡从而改善OA引起的软骨细胞退化。

沉默APE-1对肝癌细胞Hep 3B转录组表达谱及TNF信号通路的影响

目的探索沉默APE-1对肝癌细胞Hep 3B转录组表达谱及TNF信号通路的影响。方法基于沉默APE-1表达的肝癌Hep 3B稳定细胞株,进行转录组测序。实验组为APE-1沉默表达的细胞,对照组为转染空白质粒的细胞(n=3)。生物信息学分析肝癌细胞差异表达基因变化及差异基因的GO、KEGG、DO功能富集,蛋白互作网络。针对TNF信号通路关键基因TNFAIP3、MAP2K6,RT-PCR检测其在实验/对照组细胞中表达,收集10对肝癌/癌旁临床样本,免疫组化检测其蛋白表达。基于TCGA数据库中374例肝癌患者数据,分析APE-1和TNFAIP3,APE-1和MAP2K6表达相关性。结果沉默APE-1导致肝癌细胞Hep 3B中84个基因上调,39个基因下调。差异变化前10位的基因为APE-1、CEMIP、MAP2K6、TAF11L11、CNGB1、COL5A3、OTULINL、DNAJC12、FOLR1、ACKR3。RT-PCR验证TNFAIP3、MAP2K6在沉默APE-1的肝癌细胞Hep 3B中低表达。TNFAIP3、MAP2K6在临床肝癌组织样本中高表达,且APE-1和TNFAIP3,APE-1和MAP2K6表达均呈正相关(P<0.001)。结论APE-1是肝癌发生发展中关键的抗肿瘤基因,其可能通过影响TNF信号通路发挥作用。