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丽江猪MAPK10基因编码区分离、序列分子特征及组织差异表达分析
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作者 兰国湘 金思琪 +5 位作者 严达伟 鲁绍雄 崔艺佳 李国美 李海莲 董新星 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期82-90,共9页
【目的】分离丽江猪丝裂原活化蛋白激酶10(mitogen-activated protein kinase,MAPK10)基因序列,并分析其组织mRNA和蛋白表达情况。【方法】采用PCR技术扩增丽江猪MAPK10基因,并利用生物信息学软件对获得的序列进行分析,实时荧光定量PCR... 【目的】分离丽江猪丝裂原活化蛋白激酶10(mitogen-activated protein kinase,MAPK10)基因序列,并分析其组织mRNA和蛋白表达情况。【方法】采用PCR技术扩增丽江猪MAPK10基因,并利用生物信息学软件对获得的序列进行分析,实时荧光定量PCR检测丽江猪脑、肝脏、心脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰脏、背脂和背最长肌等9种组织中MAPK10基因的相对表达量;以大白猪为对照,实时荧光定量PCR和Western-blotting检测丽江猪与大白猪背脂中mRNA和蛋白表达差异。【结果】MAPK10基因序列总长1281 bp,编码426个氨基酸;MAPK10蛋白属亲水蛋白,无跨膜结构和信号肽,有44个磷酸化位点和2个糖基化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;丽江猪MAPK10基因序列与人、牛、山羊、绵羊、鼠、狗、猴和鸡的同源性分别为95.3%、93.5%、93.2%、93.0%、92.6%、91.2%、90.5%和85.6%;MAPK10基因在丽江猪9个组织中差异表达,以脑中最高;丽江猪背脂MAPK10基因的mRNA表达量极显著低于大白猪(P<0.01),蛋白表达量也有低于大白猪的趋势(P>0.05)。【结论】MAPK10基因可作为研究丽江猪脂肪沉积性状的候选基因,结果可为研究猪脂肪沉积提供参考。 展开更多
关键词 丽江猪 mapk10基因 生物信息学分析 组织表达 脂肪沉积
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