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大豆GmMATH基因家族鉴定与盐胁迫下的表达模式分析
1
作者
何敬宇
王裕东
+1 位作者
张薇
程志远
《土壤与作物》
2024年第4期448-461,共14页
植物MATH基因参与发育、激素信号转导和非生物胁迫等过程,但是大豆GmMATH基因未见详细的研究报道。本文在大豆中鉴定到40个保守的GmMATH基因,根据蛋白相似性分为6个亚家族。对全部GmMATH基因上游2kb启动子上的顺式调控元件进行分析,发现...
植物MATH基因参与发育、激素信号转导和非生物胁迫等过程,但是大豆GmMATH基因未见详细的研究报道。本文在大豆中鉴定到40个保守的GmMATH基因,根据蛋白相似性分为6个亚家族。对全部GmMATH基因上游2kb启动子上的顺式调控元件进行分析,发现431个与植物发育、应激反应相关的顺式调控元件,表明GmMATH基因参与调节发育和响应胁迫等过程。转录组数据分析显示,GmMATH基因参与大豆不同阶段生长发育过程,并发现32个GmMATH基因在盐胁迫下表达水平会发生显著变化;其中GmMATH01和GmMATH13基因在盐耐受材料中表达明显高于盐敏感材料,表明大豆GmMATH基因表达模式与大豆盐碱耐性相关。本研究为深入解析大豆GmMATH基因在响应外界胁迫和发育调控中的作用提供了重要依据。
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关键词
大豆
math家族
生物信息学分析
表达模式
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职称材料
题名
大豆GmMATH基因家族鉴定与盐胁迫下的表达模式分析
1
作者
何敬宇
王裕东
张薇
程志远
机构
中国科学院东北地理与农业生态研究所
出处
《土壤与作物》
2024年第4期448-461,共14页
基金
吉林省科技发展计划项目(20230101166JC)
国家自然科学基金项目(32272102).
文摘
植物MATH基因参与发育、激素信号转导和非生物胁迫等过程,但是大豆GmMATH基因未见详细的研究报道。本文在大豆中鉴定到40个保守的GmMATH基因,根据蛋白相似性分为6个亚家族。对全部GmMATH基因上游2kb启动子上的顺式调控元件进行分析,发现431个与植物发育、应激反应相关的顺式调控元件,表明GmMATH基因参与调节发育和响应胁迫等过程。转录组数据分析显示,GmMATH基因参与大豆不同阶段生长发育过程,并发现32个GmMATH基因在盐胁迫下表达水平会发生显著变化;其中GmMATH01和GmMATH13基因在盐耐受材料中表达明显高于盐敏感材料,表明大豆GmMATH基因表达模式与大豆盐碱耐性相关。本研究为深入解析大豆GmMATH基因在响应外界胁迫和发育调控中的作用提供了重要依据。
关键词
大豆
math家族
生物信息学分析
表达模式
Keywords
soybean
math
family
bioinformatics analysis
expression pattern
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆GmMATH基因家族鉴定与盐胁迫下的表达模式分析
何敬宇
王裕东
张薇
程志远
《土壤与作物》
2024
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