MAX二聚化蛋白1基因rs12475412和rs7349311多态性与中国汉族人群缺血性脑卒中及其中医证候的相关性

目的探索MAX二聚化蛋白1(MXD1)基因rs12475412、rs7349311多态性与中国汉族人群缺血性脑卒中(IS)及其中医证候的相关性。方法选取2016年1月至2019年12月于广西中医药大学第一附属医院脑病科就诊的774例IS患者作为观察组,选取同期本院社区体检中心健康体检者或外科等科室病情较轻的外伤患者793例作为对照组。使用MassARRAY单核苷酸多态性技术进行基因分型检测,应用PLINK软件进行遗传关联分析统计。结果观察组与对照组rs12475412、rs7349311位点的基因型频率分布差异均无统计学意义(均P>0.05)。校正年龄后,MXD1基因rs12475412、rs7349311多态性与中国汉族女性IS患者血瘀证发生风险显著相关(rs12475412加性模型、显性模型、隐性模型的比值比分别为1.033、1.031、1.034,rs7349311显性模型、隐性模型的比值比分别为1.034、1.033,均P<0.05),并与气虚证发生风险显著相关(rs12475412加性模型、显性模型、隐性模型的比值比分别为1.036、1.036、1.036,rs7349311加性模型、显性模型、隐性模型的比值比分别为1.043、1.043、1.044,均P<0.05)。但MXD1基因rs12475412、rs7349311多态性与中国汉族男性IS各中医证候均无明显相关性(均P>0.05)。在校正年龄后,MXD1基因rs12475412、rs7349311多态性与中国汉族女性IS血瘀证和气虚证患者空腹血糖、D-二聚体、凝血酶时间水平显著相关(均P<0.05)。结论MXD1基因多态性可能通过参与调控血糖代谢、凝血功能而影响中国汉族女性IS血瘀证和气虚证的发生发展。

DNA甲基转移酶3A、MAX基因关联蛋白A、磷酯酰肌醇-3激酶催化亚基γ基因基因突变与老年非小细胞肺癌患者预后的关系

目的:探讨DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)、MAX基因关联蛋白A(MGA)、磷酯酰肌醇-3激酶催化亚基γ基因(PIK3CG)基因突变与老年非小细胞肺癌患者预后的关系。方法:选择2014年3月至2017年3月收治的468例非小细胞肺癌患者,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)检测其癌组织中DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变,分析DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变与临床病理特征及预后的相关性。结果:468例非小细胞肺癌患者中,DNMT3A基因突变阳性37例(7.91%),MGA基因突变阳性25例(5.34%),PIK3CG基因突变阳性19例(4.06%);年龄、性别、吸烟情况、肿瘤直径、病理类型不同的非小细胞肺癌患者DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变率差异无统计学意义(P>0.05);淋巴结转移、临床分期不同的非小细胞肺癌患者DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变率差异有统计学意义(P<0.05);DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变阳性的非小细胞肺癌患者OS、PFS显著低于DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变阴性的非小细胞肺癌患者(P<0.05)。结论:DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变与老年非小细胞肺癌患者淋巴结转移、临床分期及预后明显相关,发生淋巴结转移、临床分期较高、预后较差的老年非小细胞肺癌患者DNMT3A、MGA、PIK3CG基因突变率越高。

甘蓝型油菜种子硫苷含量全基因组关联分析

【目的】挖掘与种子硫苷含量显著关联的SNP位点及候选基因,有助于油菜品质改良和培育高品质油菜品种。【方法】以300份甘蓝型油菜自交系为材料,考察了江西农业大学试验地和江西省红壤及种质资源研究所试验地2种环境下种子硫苷含量,采用前期开发的201817个SNP(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记对油菜种子硫苷含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),搜寻显著位点两侧100 kb范围内的候选基因并进行功能注释。【结果】300份甘蓝型油菜种子硫苷含量在两地均表现出表型差异;基于一般线性模型和混合线性模型检测到209个硫苷含量显著关联SNP位点,其中两地两种方法重复检测到41个SNP位点,分别在A05(1个)、A09(36个)、C09(4个)3条染色体上。候选基因功能注释结果显示,有8个候选基因参与硫苷生物合成途径(GO:0019761),包含调控硫苷合成相关基因MYB28(BnaC09g05290D、BnaC09g05300D)、MYB34(BnaA09g05480D)和编码硫苷转运蛋白2相关基因(BnaA09g06180D、BnaA09g06190D)。【结论】通过两种方法在两地检测到多个与硫苷显著关联的SNP位点,并在显著性位点附近挖掘到相关候选基因,研究结果有助于解析甘蓝型油菜硫苷含量的遗传变异,为低硫苷含量油菜新品种的遗传改良提供基础。

西北早粳稻核心种质资源蛋白质含量全基因组关联分析

为挖掘与稻米蛋白质含量相关的基因,以139份西北早粳稻核心种质资源为材料,基于SNP标记分析方法对139份种质资源的蛋白质含量表型数据进行全基因组关联分析。结果表明,本试验共定位到3个与稻米蛋白质含量显著相关的SNPs位点,关联到32个基因,包括1个已克隆基因和31个未克隆基因,对水稻的生长发育和品质形成有重要影响。

早期可溶性生长刺激表达基因2蛋白在心力衰竭和急性心肌梗死患者中的表达及其对预后的影响

目的 探讨早期可溶性生长刺激表达基因2蛋白(soluble suppression of tumorigenicity-2,sST2)在心力衰竭及急性心肌梗死患者中的表达情况及对疾病预后评估的价值。方法 分别收集2018年6月至2019年8月中山大学附属中山医院98例对照组、191例心力衰竭及215例急性心肌梗死患者入院时的血清,并进行sST2及氨基末端脑钠肽前体(N-terminal pro-brain natriuretic peptide,NT-proBNP)检测,通过spearman分析sST2的表达水平与各指标间的关联性,通过Kaplan-Meier生存分析sST2指标对心力衰竭、心肌梗死患者预后的评估。结果 sST2的表达水平在心力衰竭组明显高于心肌梗死及对照组,差异有统计学意义(P=0.000)。相关分析显示心力衰竭组:sST2与NT-proBNP(r=0.323,P<0.01)、C反应蛋白(r=0.311,P<0.01)、肌酐(r=0.230,P<0.01)呈明显正相关,与左心室射血分数(left ventricular ejection fraction,LVEF)呈负相关(r=-0.265,P<0.01);在心肌梗死组中sST2与NT-proBNP(r=0.233,P<0.01)、C反应蛋白(r=0.348,P<0.01)、肌酐(r=0.163,P<0.05)呈正相关。对比低于中位数组,sST2在高于中位数组中的心力衰竭风险值达2.332倍(P=0.019),而在心肌梗死患者中无明显差异;且心力衰竭患者中sST2及NT-proBNP均高于中位数组,其风险预测值为两者均低于中位数组的6.646倍(P=0.002)。结论 sST2与NT-proBNP均升高心力衰竭患者预后越差,而心肌梗死患者中早期sST2无明显表达增高及对短期死亡风险的评估作用不明显。

肌红蛋白基因多态与有氧训练效果的关联性分析

目的:探讨肌红蛋白第2外显子的单核苷酸多态(A79G)与有氧耐力训练效果的关联性。方法:对中国北方新征入伍的104名汉族士兵进行每次5000米、每周3次、训练强度为95～105%通气无氧阈(VT)、为期20周的耐力训练。递增负荷运动实验测定受试对象训练前后最大摄氧量(VO2max)和通气无氧阈(VT),PCR-RFLP法测定基因多态性,分析基因多态性与训练效果之间的关联性。结果:3种基因型的分布频率分别为AA(0.52)、AG(0.45)、GG(0.03),分布频率符合Hardy-weinberg遗传平衡定律;训练后3种基因型VO2max的组间比较均无显著性差异(P>0.05);训练后GG组和AG组VT显著提高(P<0.05),AA组达到VT时仅HR显著升高,其余指标均无显著变化(P>0.05)。在VO2max和VT的变化率(Δ%)方面,GG组受试者提高最多,AG组居中,AA组提高最少。提示肌红蛋白基因第2外显子的单核苷酸多态(A79G)与有氧耐力训练效果有一定关联,79G等位基因携带者对有氧耐力训练可能更敏感。

大口黑鲈肌球蛋白重链基因SNPs的筛选及与生长性状的关联

肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了研究肌球蛋白重链(MYH)基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,本研究采用PCR技术扩增得到编码区序列全长为9759 bp的大口黑鲈MYH基因,该基因包含37个外显子和36个内含子,编码1940个氨基酸。采用直接测序法在MYH基因上筛选到8个单核苷酸多态性标记(SNP)位点(A-305G、G-558C、A-2784C、A-2816G、T-4765A、C-6206T、C-6811T和G-6935T),有4个位于外显子上,其中2个属于同义突变。用SNa Pshot方法对从同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈"优鲈1号"群体中随机选取的430尾个体中各位点的基因型进行检测。结果显示,内含子上的A-2784C和A-2816G位点完全连锁,所有位点在大口黑鲈"优鲈1号"群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.635、0.406和0.373,仅C-6206T、C-6811T和T-4765A位点的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg定律。采用一般线性模型分析各位点与大口黑鲈生长性状之间的相关性,研究发现,C-6811T位点CC基因型个体的体质量和全长显著大于TT基因型,CC基因型个体的体高和尾柄长显著大于CT和TT基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异。C-6811T位点与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。

齐卡兔瘦蛋白基因在不同组织中的表达水平与肉质指标的关联性

选取齐卡兔(N系)为实验材料,利用荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time fluorescence polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术测定齐卡兔在35、70、84和91日龄4个阶段腿肌、肾周脂肪和皮下脂肪中瘦蛋白基因(leptin)的表达水平,并检测腿肌的pH值、熟肉率、滴水损失、肌内脂肪等相关肉品质指标,从而分析齐卡兔在这3种组织中leptin基因表达水平与所测肉品质指标的关联性。结果表明:母兔肾周脂肪和腿肌中leptin基因的表达量高于公兔,而在皮下脂肪中公兔的leptin基因表达量高于母兔。84日龄母兔皮下脂肪中leptin基因的表达量与肌内脂肪含量、熟肉率和屠宰后24 h的pH值的相关系数分别为0.95(P<0.01)、0.83(P<0.05)和0.67(P<0.05);公兔屠宰后24 h的pH值与腿肌中leptin基因表达量的相关系数为-0.85(P<0.01)。根据分析,认为leptin基因在齐卡兔各组织中的表达量与肉质指标具有显著的相关性,可以作为研究家兔肉质的一个候选基因,从而为采用分子遗传标记技术和开展肉兔的遗传改良提供参考。

利用高密度SNP对猪血糖和糖基化血清蛋白性状的全基因组关联分析

【目的】测定苏太猪和白色杜洛克×二花脸F2资源家系240 d血糖(glucose,GLU)和糖基化血清蛋白(glycosylated serum proteins,GSP)浓度,采用全基因组关联分析定位影响GLU和GSP的染色体位点,为最终鉴别影响该性状的因果基因奠定基础,同时为人类低血糖症和糖尿病的遗传学研究提供参考。【方法】分别将435头苏太猪和760头白色杜洛克×二花脸F2资源家系F2个体在相同条件下饲养至240日龄进行统一屠宰,收集血液后分离血清,利用全自动生化分析仪测定GLU和GSP浓度。采集猪只耳组织提取DNA并测定DNA浓度。将质检合格的DNA样品利用Illumina porcine 60K SNP芯片判定基因型。运用PLINK软件对SNP判型结果进行质控,将合格的SNP标记用于后续的关联性分析,利用广义混合线性模型及R语言GenABEL软件包进行全基因组关联分析,定位影响苏太猪和白色杜洛克×二花脸F2资源家系240 d血清GLU和GSP含量的染色体位点。根据全基因组关联分析结果从Ensembl或NCBI网站上分析可能的位置候选基因。【结果】全基因组关联分析共检测到5个与血清GLU和GSP达染色体显著水平相关的SNP位点。其中白色杜洛克×二花脸F2资源群体在10号染色体(SSC10)24.67Mb处定位到与血清GSP含量显著相关的SNP(ALGA0057739,P=1.58×10-5),解释表型变异为3.72%。苏太猪群体共检测到2个与血清GSP显著相关的SNP(ALGA0108699和DRGA0017552,P=1.45×10-5),解释表型变异均为3.72%。使用猪参考基因组序列(10.2版本),无法定位到具体的染色体位置。通过人、猪比较基因组分析,这两个SNP都位于SSC8,距STPG2基因3’端约180.0—193.0 kb。将两个群体进行Meta分析,未发现新的与GSP显著相关的SNP;在1号染色体250.32Mb处(DRGA0002016,P=2.48×10-5)和14号染色体43.97Mb处(ASGA0062984,P=1.29×10-5),定位到与血清GLU显著相关的SNP。通过搜寻显著相关SNP所在染色体区域内的注释基因,发现ASPM、TRPM3和KCTD10等基因是影响血清GSP和GLU的重要候选基因。【结论】检测到5个显著影响猪血清GLU和GSP的SNP位点。这些SNP位点所处染色体区域内的ASPM、TRPM3、STPG2和KCTD10基因是影响血清GSP和GLU的重要候选基因。

转录组与蛋白质组关联分析鉴定桑树硬枝扦插皮部生根相关功能基因

前期以桑品种育711号硬枝扦插皮部生根的插穗为材料,对扦插生根过程起始阶段(S0)、根原基形成阶段(S1)和不定根伸长阶段(S2)的插穗基部皮层进行了转录组与蛋白质组测序。在此基础上对差异表达基因与蛋白质(差异系数>1.5,错误发现率≤0.05)做关联分析。结果显示:不同阶段插穗基部皮层的基因和蛋白质表达趋势总体上呈正相关,关联系数分别为0.470 3(S0-vs-S1)与0.113 0(S1-vs-S2);基因与蛋白质表达趋势相反的关联数量较少,关联系数分别为-0.319 9(S0-vs-S1)与-0.107 1(S1-vs-S2);基因与蛋白质表达趋势相同的关联数量相对较多,关联系数分别为0.855 4(S0-vs-S1)与0.834 6(S1-vs-S2),均呈强相关。在关联分析表达趋势相同组中筛选鉴定出21个差异表达基因,并进行功能注释与信号通路分析。其中,有5个基因在生根过程中持续上调表达,主要包括酚氧化酶(PPO)、马铃薯糖蛋白(Patatin)、生长素酰胺水解酶(ILL)、肌氨酸氧化酶(SOX)的编码基因;有13个基因在根原基形成期上调表达,在不定根伸长期下调表达,主要包括赤霉素双加氧酶(GA3OX4)、12-氧植物二烯酸还原酶(OPR)、内切葡聚糖酶(EG)和吲哚乙酸氨基化合成酶(GH3)的编码基因;有3个基因在根原基形成期下调表达,在不定根伸长期上调表达,分别为细胞膜相关钙结合蛋白(PCa P)、肌肉LIM蛋白(MLP)和膜联蛋白(ANX)的编码基因。上述关联分析的结果为深入认识桑树插穗皮部生根过程的生理机制提供了相关功能基因信息。

组织蛋白酶D基因C224T多态与散发阿尔茨海默氏病的关联研究

组织蛋白酶D(Cathepsin D)是一种细胞核内体/溶酶体内的门冬酰胺蛋白酶。它有可能通过剪切淀粉样前体蛋白参与阿尔茨海默氏病(Alzheimer’s disease, AD)相关的神经退化。在以德国人为对象中的研究显示组织蛋白酶D基因(CTSD)C224T多态与AD发病风险紧密相关。然而,此结果未能在另一些群体中得到重复。为此,通过聚合酶链反应 限制性片段长度多态性方法分析了 CTSD 基因 C224T 多态性和载脂蛋白 E(apolipoprotein E,ApoE)基因多态性在成都地区汉族老年人中的分布,探讨了 CTSD C224T多态与散发 AD的相关性。结果发现:CTSD 基因C224T多态分布在病例组与对照组之间没有显著性差异,提示成都地区汉族人群中 CTSD 基因 C224T多态与散发AD不具有关联;但比值比的比较提示CTSD 等位基因T 和ApoEε4有弱的协同作用。

神经丛蛋白A2(PLXNA2)基因多态性与精神分裂症的关联研究

目的:探讨神经丛蛋白(PLXNA2)基因与汉族人群精神分裂症的关联。方法:采用DNA测序检测方法,依据ICD-10诊断标准,在735例汉族精神分裂症住院患者和1316例年龄、性别匹配的正常对照者中,探索PLXNA2基因5个单核苷酸多态性(SNP)位点与精神分裂症的关联。结果:PLXNA2基因的4个SNPs位点与精神分裂症关联(均P<0.05);由rs3811383-rs841865-rs2785622组成的单体型ATT及由rs841865-rs752016组成的单体型AC与精神分裂症关联(均P<0.05)。结论:本研究结果提示PLXNA2基因多态性在中国汉族人群中与精神分裂症关联。

骨桥蛋白基因多态性与母猪繁殖性状的关联分析

为探讨骨桥蛋白(OPN)基因多态性对母猪繁殖性状的影响,用直接测序法检测长白、大约克、杜洛克和金华母猪群体OPN基因的多态性,并对母猪的繁殖性能指标进行了关联分析。结果显示,OPN外显子6有一处T→A的突变,存在TT、AT、AA 3种基因型,等位基因T为优势等位基因;OPN基因多态性对初产和经产长白、大约克、杜洛克和金华母猪群体的总产仔数、产活仔数和初生窝重有显著影响(P<0.05)。试验结果表明,OPN基因多态性对母猪的繁殖性能存在影响,可作为潜在的遗传标记。

胆固醇酯转运蛋白基因D442G多态性与维吾尔族自然长寿的关联

目的探讨胆固醇酯转运蛋白(CETP)基因D442G多态性与维吾尔族自然长寿之间的关系。方法以新疆和田地区191名90岁以上的维吾尔族自然长寿个体为研究对象,以53名在75岁前自然死亡的同地区、同民族相匹配个体作为对照。采用PCR-限制长度片段多态性(PCR-RFLP)和PCR-直接测序法(PCR-Sequencing)对CETP基因第15外显子D442G多态性进行分型。结果CETP基因D442G多态性基因型、等位基因分布在长寿组和对照组之间无差异。结论CETP基因D442G多态性与和田维吾尔族自然长寿无关。但D442G多态性分布不仅存在种族差异,在同一民族之间还存在地域差异。

受体型蛋白酪氨酸磷酸酶R基因多态性与重性抑郁障碍的关联分析

目的探讨受体型蛋白酪氨酸磷酸酶R（PTPRR）基因多态性与重性抑郁障碍（MDD）及其内表型的关联性。方法收集中国北方汉族MDD患者517例（MDD组）和健康志愿者455人（对照组）,采用时间飞行质谱技术检测研究对象PTPRR基因的11个单核苷酸多态性（SNPs）位点的多态性,采用UNPHASED软件进行等位基因、基因型、单倍型及数量性状分析。结果单位点分析显示,等位基因频率和基因型分布在MDD组和对照组间差异无统计学意义（校正后P〉0.05）;单倍型分析显示,三位点单倍型rs1398599（C）-rs2175711（A）-rs4489789（T）（P=0.0023,OR=1.334,95%CI=1.104~1.612）和四位点单倍型rs11178391（C）-rs1398599（C）-rs2175711（A）-rs4489789（T）（P=0.0063,OR=1.281,95%CI=1.059~1.549）均显著增加MDD发病风险;数量性状分析显示,SNP rs2203231的等位基因和基因型分别与韦氏记忆量表（WMS-R）的心智原始分（P=0.0038,P=0.0024）和心智量表分（P=0.0057,P=0.0038）以及图片原始分（P=0.0027,P=0.0015）和图片量表分（P=0.0035,P=0.002）显著相关。结论 PTPRR基因rs2203231多态性可能与MDD患者的长时记忆和短时记忆功能障碍相关联。

中国南方群体线粒体基因变异及载脂蛋白E基因与长寿的关联性

背景:有研究表明线粒体基因变异与长寿相关,但在中国南方群体中线粒体单倍组D及其亚组与长寿的相关性研究至今少有报道,并且线粒体单倍组D及其亚组与载脂蛋白E基因相互作用对长寿的影响未见报道。目的:探讨在中国南方群体中线粒体单倍组D及其亚组与长寿的相关性,以及线粒体单倍组D及其亚组与载脂蛋白E基因的相互作用。方法:于2007/2008在广西壮族自治区巴马县选取对象1038人,包括长寿组367人(年龄>90岁)和与长寿组无亲缘关系的当地健康对照组671人(年龄40～60岁)。采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测线粒体单倍组D及其亚组(D4和D4a)的分布情况,并通过分层分析调整性别和载脂蛋白E基因混杂因素的作用。结果与结论:线粒体单倍组D及其亚组与长寿无明显相关性(P>0.05)。按照性别进行分层分析后,在女性和男性群体中仍未发现线粒体单倍组D及其亚组与长寿的关联(P>0.05)。然而,对载脂蛋白E基因分层分析后,在载脂蛋白Eε4携带者中长寿组和对照组线粒体单倍组D的分布频率差异有显著性意义(P<0.05)。结果提示线粒体单倍组D可能是与载脂蛋白E基因的相互作用对长寿产生影响。

中国荷斯坦奶牛K-酪蛋白基因多态性与泌乳性能关联性分析

本研究采用PCR-RFLP技术检测新疆地区中国荷斯坦奶牛K-CN基因多态性,并分析了该基因多态性与奶牛泌乳性能的关系。结果表明:检测群体K-CN基因表现出三种基因型:AA、AB、BB,基因型频率分别为0.6171、0.3278、0.0551,且达到平衡状态。三种基因型与泌乳性状的关联性分析表明,B基因对中国荷斯坦奶牛乳脂率有显著影响。

突触结合蛋白2基因多态性与中国汉族精神分裂症的关联研究

目的·探讨突触结合蛋白2(synaptotagmin 2,SYT2)基因与中国汉族人群精神分裂症(schizophrenia,SZ)的关联性。方法·采用TaqMan探针基因分型技术对478例SZ患者(SZ组)和474名健康对照者(HC组)的SYT2基因的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(rs6427957、rs907697、rs12564274、rs10800856、rs61820945)进行检测分型,应用HaploView软件、SHEsis及SNPstats在线软件比较SZ组与HC组的等位基因、基因型、不同遗传模式下基因型以及单倍型频率分布有无差异。结果·rs10800856位点等位基因及基因型频率分布在SZ组与HC组之间差异有统计学意义(P=0.003,P=0.012);经Bonferroni校正后,rs10800856位点等位基因频率差异仍有统计学意义(P=0.015),基因型频率差异无统计学意义。rs10800856位点在显性及加性遗传模式下,基因型频率分布在SZ组与HC组之间比较差异有统计学意义(P=0.004,P=0.005),校正后差异仍有统计学意义(P=0.020,P=0.025)。由rs12564274-rs10800856-rs61820945组成的单倍型C-T-C频率分布在SZ组与HC组间差异有统计学意义(P=0.009);经Bonferroni校正后,差异仍具有统计学意义(P=0.036)。结论·在中国汉族人群中,SYT2基因可能是SZ的易感基因,rs10800856位点可能与精神分裂症发病风险有关联。

肾小管间质性肾病基因-表型关联性分析

目的:筛选肾小管间质性肾病遗传变异枢纽基因。方法:对经肾活检证实且无明确病因的24例肾小管间质性肾病患者进行全外显子组测序,应用Phenolyzer数据库进行基因-表型关联评分,筛选其共有的罕见遗传变异,利用DAVID 6.8数据库进行基因功能通路富集分析。应用String数据库构建PPI网络图,并使用Cytoscape中的插件cytoHubba进行可视化分析,寻找枢纽基因。应用SWISS-Pdb Viewer软件分析枢纽基因突变前后表达蛋白三级结构的变化。结果:24例中女9例,男15例,年龄18~40(26.17±8.82)岁。全外显子组测序检测出19例患者携带致病或可能致病的基因突变位点,共发现35个肾小管间质性肾病易感基因,其在TGF-β信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路中富集。PPI网络和Cytoscape分析筛选出4个枢纽基因,即VCP、PRKDC、RBPJ、MYH11,且VCP基因突变造成蛋白质空间结构和功能的改变。结论:肾小管间质性肾病易感基因主要富集在离子跨膜转运的调节、蛋白质转运的调控、蛋白质磷酸化等生物过程,TGF-β信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路中。VCP基因可能与肾小管间质性肾病有关。