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撒坝猪MCUR1基因克隆、生物信息学分析及其组织表达量检测
被引量:
1
1
作者
董新星
李明丽
+3 位作者
崔艺佳
兰国湘
王孝义
严达伟
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第11期1825-1833,共9页
本研究克隆了撒坝猪MCUR 1基因,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR检测其在撒坝猪、大白猪不同组织中的表达水平。根据GenBank上公布的猪的MCUR1基因序列(登录号:XM_003128183.4)设计引物,通过PCR扩增及测序获得撒坝猪MCUR ...
本研究克隆了撒坝猪MCUR 1基因,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR检测其在撒坝猪、大白猪不同组织中的表达水平。根据GenBank上公布的猪的MCUR1基因序列(登录号:XM_003128183.4)设计引物,通过PCR扩增及测序获得撒坝猪MCUR 1基因CDS序列,该序列全长1095 bp,编码364个氨基酸;MCUR1蛋白的分子式C1787H2949N533O503S14,相对分子质量40.398 ku,理论等电点(pI)10.27,不稳定系数55.70,脂肪指数95.99,平均亲水性为-0.213,属于亲水蛋白;MCUR1蛋白没有信号肽和跨膜结构,含有2个螺旋卷曲结构,主要在细胞质中发挥生物学功能;含有32个磷酸化位点;含有一个CpG island;二级结构由58.24%的α-螺旋,4.12%的β-转角,30.22%的无规则卷曲,7.42%的延伸链构成;猪MCUR 1基因编码区序列与牛、鸡、狗、山羊、人、猴、鼠、绵羊的同源性分别为85.3%、68.0%、83.6%、87.9%、84.4%、80.3%、76.8%、88.2%,与绵羊、山羊、牛的亲缘关系较近,与鸡的关系较远;在肝脏中的表达量最多,肺脏中的表达量最少。在大白猪的背最长肌中MCUR 1的表达量高于撒坝猪的背最长肌(P<0.01)。
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关键词
撒坝猪
mcur
1基因
生物信息学分析
组织表达
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职称材料
MCUR1蛋白的表达纯化以及晶体初筛
被引量:
3
2
作者
金昊
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期42-46,共5页
Mitochondrial Ca^(2+)Uniporter(MCU)是线粒体钙离子通道的一个主要成分.近期研究发现Mitochondrial calcium uniporter regulator 1(MCUR1)是MCU的一个调节蛋白.研究通过合成人源的MCUR1基因,利用PCR得到目的DNA片段,克隆到表达载体PE...
Mitochondrial Ca^(2+)Uniporter(MCU)是线粒体钙离子通道的一个主要成分.近期研究发现Mitochondrial calcium uniporter regulator 1(MCUR1)是MCU的一个调节蛋白.研究通过合成人源的MCUR1基因,利用PCR得到目的DNA片段,克隆到表达载体PET.32a,构建Trx-MCUR1融合蛋白表达质粒PET.32aMCUR1.克隆质粒转化表达菌E.coli BL21(DE3)Condon Plus,经IPTG诱导表达.将得到的融合蛋白经过镍亲和层析柱进行初步纯化,然后加入PreScission酶分离目的蛋白与标签,再用离子柱和分子筛层析进行进一步的纯化以去除标签以及杂蛋白.浓缩纯化后的目的蛋白,进行晶体初筛以及后期的晶体优化.最后将生长的晶体进行初步的X射线衍射分析.
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关键词
MCU
mcur
1
线粒体钙离子摄取
蛋白表达纯化
X射线衍射
原文传递
HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的机制研究
被引量:
4
3
作者
宋平辉
张毅
+2 位作者
吴忠坤
李春博
李勤新
《医学分子生物学杂志》
CAS
2023年第1期70-77,共8页
目的探讨HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的潜在机制.方法过表达HBx后,检测肝癌细胞HepG2的增殖水平.在过表达Flag-HBx的肝癌细胞HepG2中免疫共沉淀HBx后进行蛋白质质谱鉴定,Score阈值设定为大于50,Coverage阈值设定为大于10.过表达HBx的...
目的探讨HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的潜在机制.方法过表达HBx后,检测肝癌细胞HepG2的增殖水平.在过表达Flag-HBx的肝癌细胞HepG2中免疫共沉淀HBx后进行蛋白质质谱鉴定,Score阈值设定为大于50,Coverage阈值设定为大于10.过表达HBx的肝癌细胞HepG2中,使用siRNA敲低质谱鉴定的相应基因,检测HepG2的增殖水平.结果过表达Flag-HBx后,肝癌细胞HepG2的增殖水平上升(P<0.05).与对照组比较,敲低MCUR1后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与对照组比较,同时过表达MCUR1和HBx能够促进肝癌细胞HepG2的增殖(P<0.05),而仅过表达MCUR1对肝癌细胞HepG2的增殖无显著影响.与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2的ROS水平上升(P<0.05);与对照组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的ROS水平无显著变化.与对照组或过表达HBx组比较,同时过表达MCUR1和HBx能够增加肝癌细胞HepG2的ROS水平(P<0.05).与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05),但这种下降能被H2 O2恢复.与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2中转录因子Nrf2在细胞核中的定位增加(P<0.05),而过表达HBx的同时敲低MCRU1后Nrf2在细胞核中的定位无显著变化.与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2中转录因子Notch的激活形式NICD1在细胞核中的定位增加(P<0.05),而过表达HBx的同时Nrf2抑制剂ML385处理后NICD1在细胞核中的定位无显著变化.与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时ML385处理后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时Notch抑制剂IMR-1处理后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).结论HBx促进HepG2细胞增殖与MCUR1/ROS/Nrf2/Notch轴有关.
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关键词
HBX
肝癌
增殖
ROS
mcur
1
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职称材料
题名
撒坝猪MCUR1基因克隆、生物信息学分析及其组织表达量检测
被引量:
1
1
作者
董新星
李明丽
崔艺佳
兰国湘
王孝义
严达伟
机构
云南农业大学动物科学技术学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第11期1825-1833,共9页
基金
国家重点研发计划(2018YFD0501200)
文摘
本研究克隆了撒坝猪MCUR 1基因,对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR检测其在撒坝猪、大白猪不同组织中的表达水平。根据GenBank上公布的猪的MCUR1基因序列(登录号:XM_003128183.4)设计引物,通过PCR扩增及测序获得撒坝猪MCUR 1基因CDS序列,该序列全长1095 bp,编码364个氨基酸;MCUR1蛋白的分子式C1787H2949N533O503S14,相对分子质量40.398 ku,理论等电点(pI)10.27,不稳定系数55.70,脂肪指数95.99,平均亲水性为-0.213,属于亲水蛋白;MCUR1蛋白没有信号肽和跨膜结构,含有2个螺旋卷曲结构,主要在细胞质中发挥生物学功能;含有32个磷酸化位点;含有一个CpG island;二级结构由58.24%的α-螺旋,4.12%的β-转角,30.22%的无规则卷曲,7.42%的延伸链构成;猪MCUR 1基因编码区序列与牛、鸡、狗、山羊、人、猴、鼠、绵羊的同源性分别为85.3%、68.0%、83.6%、87.9%、84.4%、80.3%、76.8%、88.2%,与绵羊、山羊、牛的亲缘关系较近,与鸡的关系较远;在肝脏中的表达量最多,肺脏中的表达量最少。在大白猪的背最长肌中MCUR 1的表达量高于撒坝猪的背最长肌(P<0.01)。
关键词
撒坝猪
mcur
1基因
生物信息学分析
组织表达
Keywords
Saba pig
mcur
1 gene
bioinformatics analysis
tissue expression
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
MCUR1蛋白的表达纯化以及晶体初筛
被引量:
3
2
作者
金昊
机构
南开大学生命科学学院
出处
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期42-46,共5页
文摘
Mitochondrial Ca^(2+)Uniporter(MCU)是线粒体钙离子通道的一个主要成分.近期研究发现Mitochondrial calcium uniporter regulator 1(MCUR1)是MCU的一个调节蛋白.研究通过合成人源的MCUR1基因,利用PCR得到目的DNA片段,克隆到表达载体PET.32a,构建Trx-MCUR1融合蛋白表达质粒PET.32aMCUR1.克隆质粒转化表达菌E.coli BL21(DE3)Condon Plus,经IPTG诱导表达.将得到的融合蛋白经过镍亲和层析柱进行初步纯化,然后加入PreScission酶分离目的蛋白与标签,再用离子柱和分子筛层析进行进一步的纯化以去除标签以及杂蛋白.浓缩纯化后的目的蛋白,进行晶体初筛以及后期的晶体优化.最后将生长的晶体进行初步的X射线衍射分析.
关键词
MCU
mcur
1
线粒体钙离子摄取
蛋白表达纯化
X射线衍射
Keywords
MCU
mcur
1
mitochondrial Ca^2+ uptake
protein expression and purification
X-ray diffraction
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的机制研究
被引量:
4
3
作者
宋平辉
张毅
吴忠坤
李春博
李勤新
机构
陕西省核工业二一五医院普通外科
兴平市人民医院儿科
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
2023年第1期70-77,共8页
文摘
目的探讨HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的潜在机制.方法过表达HBx后,检测肝癌细胞HepG2的增殖水平.在过表达Flag-HBx的肝癌细胞HepG2中免疫共沉淀HBx后进行蛋白质质谱鉴定,Score阈值设定为大于50,Coverage阈值设定为大于10.过表达HBx的肝癌细胞HepG2中,使用siRNA敲低质谱鉴定的相应基因,检测HepG2的增殖水平.结果过表达Flag-HBx后,肝癌细胞HepG2的增殖水平上升(P<0.05).与对照组比较,敲低MCUR1后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与对照组比较,同时过表达MCUR1和HBx能够促进肝癌细胞HepG2的增殖(P<0.05),而仅过表达MCUR1对肝癌细胞HepG2的增殖无显著影响.与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2的ROS水平上升(P<0.05);与对照组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的ROS水平无显著变化.与对照组或过表达HBx组比较,同时过表达MCUR1和HBx能够增加肝癌细胞HepG2的ROS水平(P<0.05).与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时敲低MCUR1时肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05),但这种下降能被H2 O2恢复.与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2中转录因子Nrf2在细胞核中的定位增加(P<0.05),而过表达HBx的同时敲低MCRU1后Nrf2在细胞核中的定位无显著变化.与对照组比较,过表达HBx后肝癌细胞HepG2中转录因子Notch的激活形式NICD1在细胞核中的定位增加(P<0.05),而过表达HBx的同时Nrf2抑制剂ML385处理后NICD1在细胞核中的定位无显著变化.与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时ML385处理后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).与过表达HBx组比较,过表达HBx的同时Notch抑制剂IMR-1处理后肝癌细胞HepG2的增殖水平下降(P<0.05).结论HBx促进HepG2细胞增殖与MCUR1/ROS/Nrf2/Notch轴有关.
关键词
HBX
肝癌
增殖
ROS
mcur
1
Keywords
HBX
liver cancer
proliferation
ROS
mcur
1
分类号
Q591.2 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
撒坝猪MCUR1基因克隆、生物信息学分析及其组织表达量检测
董新星
李明丽
崔艺佳
兰国湘
王孝义
严达伟
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019
1
下载PDF
职称材料
2
MCUR1蛋白的表达纯化以及晶体初筛
金昊
《南开大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
原文传递
3
HBV HBx蛋白调控肝癌细胞增殖的机制研究
宋平辉
张毅
吴忠坤
李春博
李勤新
《医学分子生物学杂志》
CAS
2023
4
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