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家鸡MDH2基因克隆、生物信息学分析及原核表达载体构建 被引量:1
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作者 袁铭君 李军德 +3 位作者 邢建永 高巍 闫士猛 张恬 《中国现代中药》 CAS 2023年第8期1646-1654,共9页
目的:初步探索家鸡苹果酸脱氢酶2编码基因MDH2的序列特征、组织表达及原核表达情况。方法:采用克隆技术与测序技术获取家鸡MDH2基因互补脱氧核糖核酸(cDNA)全长,使用多种在线软件对其进行生物信息学分析,利用实时荧光定量聚合酶链式反应... 目的:初步探索家鸡苹果酸脱氢酶2编码基因MDH2的序列特征、组织表达及原核表达情况。方法:采用克隆技术与测序技术获取家鸡MDH2基因互补脱氧核糖核酸(cDNA)全长,使用多种在线软件对其进行生物信息学分析,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术检测该基因在不同组织中的表达情况,利用同源重组技术构建pET32a(+)-MDH2表达载体,使用异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导蛋白表达。结果:从新鲜家鸡砂囊内壁中成功克隆到MDH2基因,序列长度1120 bp,其开放阅读框(ORF)为1014 bp,编码337个氨基酸;MDH2蛋白相对分子质量为35.95 kDa,理论等电点9.17,属于稳定碱性疏水性蛋白。MDH2蛋白含25个磷酸化位点;二级结构主要包括α-螺旋、β-螺旋、无规则卷曲,无信号肽和跨膜结构域。MDH2基因在心、肝、脾、肺、肾、砂囊内壁中都有表达,其中心、肾、砂囊内壁中表达量较高,pET32a(+)-MDH2重组蛋白主要是以包涵体的形式存在。结论:MDH2基因在家鸡体内广泛表达,但其在各组织/器官中表达趋势不同,提示其功能可能具有广泛性与多重性。 展开更多
关键词 mdh2 基因克隆 生物信息学 原核表达
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拟南芥MDH2基因GFP载体构建及转基因植株的筛选鉴定
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作者 王媛媛 韩洋洋 +3 位作者 耿庆鎏 朱香豫 曹树青 樊婷婷 《安徽农业科学》 CAS 2019年第2期96-98,共3页
[目的]以野生型拟南芥为材料构建MDH2基因GFP载体及GFP转基因植株,研究MDH2基因在植物响应镉胁迫机制中的功能。[方法]通过提取野生型拟南芥的RNA,反转录成为cDNA,并以cDNA为模板,利用PCR扩增MDH2基因,将扩增所获得MDH2基因和pXB94-GFP... [目的]以野生型拟南芥为材料构建MDH2基因GFP载体及GFP转基因植株,研究MDH2基因在植物响应镉胁迫机制中的功能。[方法]通过提取野生型拟南芥的RNA,反转录成为cDNA,并以cDNA为模板,利用PCR扩增MDH2基因,将扩增所获得MDH2基因和pXB94-GFP质粒双酶切后连接,并转化进大肠杆菌感受态细胞中,鉴定正确后再转入农杆菌感受态细胞中,通过菌落PCR鉴定出阳性单菌落。再通过浸花法转入野生型拟南芥中,最后利用抗性筛选和PCR鉴定获得MDH2转基因阳性植株。[结果]成功克隆MDH2基因,并构建了MDH2-GFP重组质粒,抗性筛选获得了MDH2-GFP转基因植株。[结论]成功获得MDH2-GFP转基因植株,为进一步研究该基因在植物响应镉胁迫机制中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 拟南芥 mdh2 载体 转基因植株
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利用CRISPR/Cas9技术构建MDH2敲除细胞株及抗呕吐毒素效应研究
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作者 施炜涛 姚春鹏 +7 位作者 魏文康 王蕾 房元杰 仝钰洁 马晓姣 蒋文 张晓爱 邵伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期307-315,共9页
试验旨在利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建稳定敲除苹果酸脱氢酶2(malate dehydrogenase 2,MDH2)基因的IPEC-J2单克隆细胞株,并研究敲除MDH2基因后抗呕吐毒素效应。针对MDH2基因序列设计sgRNA插入PX459载体中,构建PX459-sgRNA-MDH2重组... 试验旨在利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建稳定敲除苹果酸脱氢酶2(malate dehydrogenase 2,MDH2)基因的IPEC-J2单克隆细胞株,并研究敲除MDH2基因后抗呕吐毒素效应。针对MDH2基因序列设计sgRNA插入PX459载体中,构建PX459-sgRNA-MDH2重组质粒;将质粒通过电转导入IPEC-J2细胞中,并加入嘌呤霉素筛选阳性细胞;利用有限稀释法筛选单克隆细胞并进行基因型测序鉴定、荧光定量PCR和蛋白质印迹法验证,获得MDH2基因敲除的单克隆细胞株;最后通过CCK8试剂盒和细胞凋亡与坏死检测试剂盒检测细胞存活情况,测定MDH2敲除细胞株对呕吐毒素的抗性。测序结果显示MDH2基因敲除载体构建成功。利用荧光定量PCR及蛋白免疫印迹法验证了获得的细胞系为MDH2基因敲除的单克隆细胞株。CCK8细胞活力实验结果显示,与野生型细胞相比,敲除MDH2可使IPEC-J2细胞在不同浓度呕吐毒素(4、2、1和0.5μg/mL)处理5 d时细胞活力分别极显著提高18.67%、19.59%、26.36%和27.01%。流式细胞仪实验结果显示,与野生型细胞相比,敲除MDH2使不同浓度呕吐毒素处理5 d的细胞死亡率分别极显著降低30.33%、15.81%、16.00%和14.70%。利用CRISPR/Cas9系统对IPEC-J2细胞中的MDH2基因进行敲除并筛选获得了MDH2-KO单克隆细胞株,并通过细胞活力和细胞死亡检测,证明该细胞株具有抗呕吐毒素毒性效应的效果,为揭示呕吐毒素诱导宿主细胞死亡的毒性机制提供借鉴,为防治呕吐毒素提供新策略。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9系统 呕吐毒素 mdh2基因 细胞存活 细胞死亡
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MDH2在膀胱癌中的表达以及作用研究
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作者 张文圣 曾加 +6 位作者 邓新喜 卢依刚 李勋钢 张卓 杨洋 陶韬 万滨 《江西医药》 CAS 2021年第6期742-745,共4页
目的膀胱癌与苹果酸脱氢酶2(MDH2)的关系尚不清楚,本研究旨在探索MDH2在膀胱癌中的表达以及作用。方法为了揭示MDH2的表达,使用了TCGA(The Cancer Genome Atlas Program)在线数据库分析和实时荧光定量PCR。通过TCGA在线数据库分析评估... 目的膀胱癌与苹果酸脱氢酶2(MDH2)的关系尚不清楚,本研究旨在探索MDH2在膀胱癌中的表达以及作用。方法为了揭示MDH2的表达,使用了TCGA(The Cancer Genome Atlas Program)在线数据库分析和实时荧光定量PCR。通过TCGA在线数据库分析评估膀胱癌患者生存期与MDH2表达的关系。然后进行RNA干扰以研究MDH2的表达对膀胱癌的影响,同时通过CCK-8实验分析评估膀胱癌细胞的增殖。结果我们的结果表明,MDH2在膀胱癌组织和膀胱癌细胞系中高表达,且与膀胱癌患者的生存期有关。在膀胱癌细胞中干扰MDH2后其表达明显下调,CCK-8实验表明敲低MDH2表达后抑制了膀胱癌细胞的增值。结论我们的研究表明,MDH2在膀胱癌中高表达且与膀胱癌患者生存期呈负相关,在膀胱癌的发展过程中发挥重要作用,可能成为膀胱癌的潜在诊断标记和治疗靶点。 展开更多
关键词 mdh2 膀胱癌 增殖
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Palmitoylation of MDH2 by ZDHHC18 activates mitochondrial respiration and accelerates ovarian cancer growth 被引量:6
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作者 Xuan Pei Kai-Yue Li +9 位作者 Yuan Shen Jin-Tao Li Ming-Zhu Lei Cai-Yun Fang Hao-Jie Lu Hui-Juan Yang Wenyu Wen Miao Yin Jia Qu Qun-Ying Lei 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2022年第10期2017-2030,共14页
Epithelial ovarian cancer(EOC) exhibits strong dependency on the tricarboxylic acid(TCA) cycle and oxidative phosphorylation to fuel anabolic process.Here,we show that malate dehydrogenase 2(MDH2),a key enzyme of the ... Epithelial ovarian cancer(EOC) exhibits strong dependency on the tricarboxylic acid(TCA) cycle and oxidative phosphorylation to fuel anabolic process.Here,we show that malate dehydrogenase 2(MDH2),a key enzyme of the TCA cycle,is palmitoylated at cysteine 138(C138) residue,resulting in increased activity of MDH2.We next identify that ZDHHC18 acts as a palmitoyltransferase of MDH2.Glutamine deprivation enhances MDH2 palmitoylation by increasing the binding between ZDHHC18 and MDH2.MDH2 silencing represses mitochondrial respiration as well as ovarian cancer cell proliferation both in vitro and in vivo.Intriguingly,re-expression of wild-type MDH2,but not its palmitoylation-deficient C138 S mutant,sustains mitochondrial respiration and restores the growth as well as clonogenic capability of ovarian cancer cells.Notably,MDH2 palmitoylation level is elevated in clinical cancer samples from patients with high-grade serous ovarian cancer.These observations suggest that MDH2 palmitoylation catalyzed by ZDHHC18 sustains mitochondrial respiration and promotes the malignancy of ovarian cancer,yielding possibilities of targeting ZDHHC18-mediated MDH2 palmitoylation in the treatment of EOC. 展开更多
关键词 EOC mdh2 cysteine palmitoylation ZDHHC18 GLUTAMINE
原文传递
基于网络药理学和分子对接技术分析甲硝唑治疗卵巢癌的作用机制
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作者 许悦 吴楚玲 +1 位作者 庄圆 杨华 《临床合理用药杂志》 2024年第23期36-40,47,共6页
目的基于网络药理学和分子对接技术分析甲硝唑治疗卵巢癌潜在可能性及作用机制。方法通过化学数据库PubChem查找甲硝唑的分子信息和分子结构,通过PharmMapper数据库获得甲硝唑潜在的药效团靶点,通过OMIM、PharmGkb、TTD、GeneCards四大... 目的基于网络药理学和分子对接技术分析甲硝唑治疗卵巢癌潜在可能性及作用机制。方法通过化学数据库PubChem查找甲硝唑的分子信息和分子结构,通过PharmMapper数据库获得甲硝唑潜在的药效团靶点,通过OMIM、PharmGkb、TTD、GeneCards四大数据库收集卵巢癌相关靶点。运用R语言(4.3.1),最终筛选出甲硝唑与卵巢癌的交集靶点基因。应用String在线平台获得蛋白相互作用(PPI)网络,再通过Cytoscape软件进行拓扑分析,找到核心靶点。利用R(4.3.1)对潜在靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。借助在线数据库GEPIA2深入分析核心靶点在卵巢癌中的表达及预后。利用Autodock Vina软件进行药物与核心靶点的分子对接。结果共筛选出甲硝唑的潜在作用靶点68个,卵巢癌相关作用靶点12255个,其中交集靶点56个,GO分析共富集到309个条目,KEGG分析则富集到24条信号通路,最终确定治疗卵巢癌的核心靶点2个,分别为HSP90AA1和MDH2。通过核心靶点基因表达及预后分析,显示MDH2在治疗中具有关键作用。分子对接显示,MDH2与甲硝唑结合活性强。结论甲硝唑能够通过调控多条信号通路而发挥治疗卵巢癌的作用,MDH2是其治疗卵巢癌的核心与关键靶点。 展开更多
关键词 甲硝唑 卵巢癌 网络药理学 分子对接 mdh2
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