转录因子RUNX1上调MFAP2调控Notch信号通路促进甲状腺癌血管生成

目的探究微纤维相关蛋白2(MFAP2)在甲状腺癌中的功能以及其影响血管生成的分子机制。方法生信分析靶基因在甲状腺癌组织中的表达量及其富集通路,预测靶基因潜在的上游转录因子并分析其表达量与靶基因的相关性以及结合位点。双荧光素酶报告实验和染色质免疫沉淀(ChIP)实验验证基因之间的结合关系。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测靶基因的表达水平,western blot检测信号通路和血管形成相关蛋白的表达水平。细胞计数试剂盒(CCK-8)实验和血管形成实验检测细胞活力和血管形成能力。结果生信分析确定MFAP2在甲状腺癌中高表达(P<0.05),qRT-PCR发现MFAP2在甲状腺癌细胞FTC-133、TCP-1和IHH-4显著高表达于人甲状腺正常细胞NTHYORI3-1(均P<0.05)。MFAP2富集在Notch信号通路上,Runt相关转录因子1(RUNX1)与MFAP2表达呈正相关,RUNX1与MFAP2上游2000 bp处有结合位点。qRT-PCR实验证实RUNX1与MFAP2在甲状腺癌细胞中高表达(P<0.05),双荧光素酶报告实验和ChIP实验验证了RUNX1与MFAP2之间存在靶向结合关系。CCK-8实验和血管形成实验证实MFAP2通过激活Notch信号通路促进甲状腺癌细胞的活力和肿瘤的血管生成。回复实验证实RUNX1/MFAP2轴通过Notch轴促进甲状腺癌的血管生成。结论RUNX1/MFAP2/Notch信号网络在甲状腺癌进展中有促癌机制,提示抑制该调控网络的药物开发可能是甲状腺癌治疗的新途径。

基于生物信息学方法分析MFAP2基因在胃癌预后及免疫治疗中的意义

目的:筛选影响胃癌患者预后及治疗的关键基因,分析关键基因微纤维相关蛋白2(MFAP2)在提示胃癌患者预后及免疫治疗敏感性中的价值。方法:从TCGA数据库下载胃癌患者的癌和癌旁组织的表达谱数据及临床资料。综合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单因素Cox回归分析筛选与胃癌预后显著相关的基因。使用多个患者队列评估关键基因MFAP2的预后价值,分析其效能和临床病理指标的相关性。使用多个在线数据库数据及算法分析MFAP2与肿瘤免疫微环境的关联,免疫表型评分(IPS)联合免疫治疗患者队列分析MFAP2在预测免疫治疗响应性中的价值。采用多数据集验证MFAP2在胃癌及癌旁组织中的表达差异。结果:蓝色模块与胃癌患者的生存结局相关性最高(R=0.17,P<0.001);进一步与预后相关基因取交集,共筛选到20个关键基因。关键基因MFAP2的高表达提示胃癌的不良预后和病理进展(HR>1,P<0.05)。MFAP2与肿瘤相关成纤维细胞密切相关,高表达MFAP2的胃癌患者对免疫治疗更不敏感。多数据集验证结果显示,MFAP2 mRNA在胃癌组织中高表达(P<0.05或P<0.01)。结论:MFAP2的高表达是胃癌预后不良和免疫治疗响应不佳的提示因子,有望作为胃癌的新型治疗靶点和预后标志物。

MFAP2在头颈部肿瘤中高表达的临床意义

目的分析微纤丝关联蛋白2(MFAP2)在头颈部肿瘤组织中的表达,探讨其表达与头颈部肿瘤临床病理特征之间的联系。方法利用UALCAN生物信息学分析工具分析TCGA数据库中头颈部肿瘤组织中MFAP2的表达;利用RT-PCR技术分析76例头颈部肿瘤标本和正常组织中MFAP2的mRNA表达水平,并分析MFAP2的表达与临床病理特征之间的相关性。结果与44例正常组织比较,520例头颈部肿瘤组织中MFAP2基因的表达水平显著上调,即使在Ⅰ期和Ⅱ期等早期头颈部肿瘤患者中MFAP2的表达也显著上升;而且MFAP2的表达在肿瘤T1期中的表达也显著升高。不仅如此,MFAP2的表达在淋巴结未转移的头颈部肿瘤患者中的表达也显著升高。乳头瘤病毒(HPV)阳性的头颈部肿瘤患者肿瘤组织中MFAP2的表达显著低于HPV阴性的头颈部肿瘤患者。76例头颈部肿瘤组织中MFAP2 mRNA表达显著高于对应的癌旁组织,进一步分析MFAP2的表达与头颈部肿瘤患者的TNM分期、肿瘤大小、远端转移和淋巴结转移等病理特征存在相关性。结论 MFAP2在头颈部肿瘤组织中表达显著升高,并且即使在早期患者中MFAP2的表达也显著上升,并且MFAP2的表达与肿瘤大小、淋巴结转移等临床病理特征存在紧密的相关性。

基于公共数据库分析MFAP2在食管癌中表达及其预后意义

目的探讨微纤维相关糖蛋白2(MFAP2)基因在食管癌中的表达及预后意义。方法检索Oncomine和GEPIA数据库中有关MFAP2的基因表达信息,利用UALCAN数据库从不同临床信息分析MFAP2在食管癌组织中的基因表达。采用Kaplan-Meier Plotter在线网站进行预后分析。利用STRING构建MFAP2蛋白互作网络。结果Oncomine及GEPIA分析表明MFAP2基因在食管癌组织中表达上调。UALCAN分析表明:与癌旁组织相比,MFAP2基因在21~60岁人群、1级食管癌患者、吸烟的患者中显著上调。Kaplan-Meier Plotter在线网站分析表明当MFAP2基因高表达时,食管腺癌患者的预后较差。探索MFAP2在不同临床信息的食管腺癌患者的生存预后关系,结果显示:在男性、调节性T细胞等免疫细胞浸润的食管腺癌患者中预后较差。蛋白互作网络分析提示MFAP2可能引起染色体异常。结论MFAP2是食管腺癌中潜在的癌基因,可能与染色体异常相关,其中肿瘤微环境中的免疫细胞影响着食管腺癌的预后,其有望成为诊断和治疗食管腺癌的重要生物学指标。

微纤维相关蛋白2在结直肠癌中的表达及其对病人预后的影响

目的分析微纤维相关蛋白2(microfibril-associated protein 2,MFAP2)在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达与预后的相关性。方法分别采用RT-qPCR和Western blot在检测MFAP2 mRNA和蛋白在CRC组织中的表达水平;采用免疫组化技术检测MFAP2蛋白在65例CRC组织和相应癌旁组织中的表达水平,并分析其在癌组织中的表达水平与临床病理特征及预后的相关性。结果与正常的结直肠上皮细胞比较,MFAP2 mRNA和蛋白在CRC细胞中的表达水平均显著升高(P<0.05);在CRC组织中,MFAP2 mRNA和蛋白的表达水平高于配对的癌旁组织(P<0.05)。免疫组化检测结果显示,MFAP2蛋白在CRC组织中高表达,阳性率为60%,且MFAP2蛋白的高表达与肿瘤的组织分化程度、浸润深度、淋巴结转移、脉管浸润、神经侵犯及TNM分期显著相关(P<0.05)。生存分析显示,MFAP2高表达与CRC病人的不良预后显著相关(P<0.05),进一步的单因素和多因素分析结果表明,MFAP2蛋白高表达是影响CRC病人预后的独立因素(HR=3.733,95%CI:1.509~9.229,P=0.004)。结论 MFAP2在CRC组织中上调表达,其高表达与病人的不良临床病理特征及预后密切相关,可能成为结直肠癌预后评估新标志物和潜在的治疗靶标。