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利用蛋白支架复合物提高大肠杆菌MG1655的L-苹果酸产量
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作者 周志东 王晓瑜 +3 位作者 张同 李琪 杨之帆 陈俊 《武汉科技大学学报》 CAS 北大核心 2023年第3期201-209,共9页
构建RIAD-RIDD人工蛋白支架并验证其对蛋白的共定位能力,在此基础上,利用蛋白支架对L-苹果酸生成途径关键酶Pykf和maeB进行共定位,通过形成蛋白支架复合物来促进苹果酸酶的逆向催化,从而提高大肠杆菌MG1655发酵时的L-苹果酸产量。检测... 构建RIAD-RIDD人工蛋白支架并验证其对蛋白的共定位能力,在此基础上,利用蛋白支架对L-苹果酸生成途径关键酶Pykf和maeB进行共定位,通过形成蛋白支架复合物来促进苹果酸酶的逆向催化,从而提高大肠杆菌MG1655发酵时的L-苹果酸产量。检测结果表明,人工蛋白支架RIAD-RIDD在胞外、胞内均可有效实现蛋白共定位,在导入蛋白支架复合物后,重组大肠杆菌MG1655发酵时的L-苹果酸产量大幅提高。 展开更多
关键词 蛋白支架 大肠杆菌mg1655 苹果酸酶 丙酮酸激酶 L-苹果酸
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大肠杆菌MG1655菌株ERIC-PCR图谱主带序列组成分析 被引量:29
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作者 陈迎春 曹又方 赵立平 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期28-32,共5页
ERIC PCR已经在细菌分类、鉴定及混合菌群分析中得到广泛应用 ,但对其产物形成规律的认识仍存在分歧。以大肠杆菌MG1 655为对象 ,对其ERIC PCR指纹图谱中 1 1kb主带中的DNA片段进行了克隆、测序、基因组定位以及引物匹配分析。结果表... ERIC PCR已经在细菌分类、鉴定及混合菌群分析中得到广泛应用 ,但对其产物形成规律的认识仍存在分歧。以大肠杆菌MG1 655为对象 ,对其ERIC PCR指纹图谱中 1 1kb主带中的DNA片段进行了克隆、测序、基因组定位以及引物匹配分析。结果表明 ,这条1 1kb主带由分布在基因组中不同位置的 3种序列不同的片段组成 ,各片段的丰度差异较大 ,最高为 97 89% ;3种片段中的 2种所在的基因组区域仅一端含有ERIC序列。推测对含有ERIC序列的基因组DNA进行扩增时 ,ERIC PCR是一种非随机扩增。 展开更多
关键词 大肠杆菌 mg1655菌株 ERIC-PCR图谱主带 序列组成分析
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基于大肠杆菌MG1655载体矿化合成纳米硒的研究 被引量:4
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作者 武童 汪振炯 +3 位作者 华春 周峰 王仁雷 黄和 《南京工业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2017年第3期52-57,共6页
根据生物矿化策略,以不同质量浓度的Na_2SeO_3溶液作为硒源,利用大肠杆菌MG1655生物还原Na_2SeO_3制备纳米硒。研究Na_2SeO_3质量浓度对大肠杆菌生长曲线的影响,用氢化物原子荧光光谱法(HG-AFS)测定Na_2SeO_3的还原效率,进一步利用扫描... 根据生物矿化策略,以不同质量浓度的Na_2SeO_3溶液作为硒源,利用大肠杆菌MG1655生物还原Na_2SeO_3制备纳米硒。研究Na_2SeO_3质量浓度对大肠杆菌生长曲线的影响,用氢化物原子荧光光谱法(HG-AFS)测定Na_2SeO_3的还原效率,进一步利用扫描电子显微镜(SEM)、X线衍射仪(XRD)和傅里叶红外光谱(FT-IR)等仪器对产物进行了相关表征。结果表明:大肠杆菌MG1655能将Na_2SeO_3大量矿化为粒径基本在100~250 nm左右的红色单质纳米硒颗粒,且对各质量浓度下的Na_2SeO_3的还原率均在50%以上。 展开更多
关键词 大肠杆菌mg1655 Na2SeO3 纳米硒 表征
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代谢工程改造大肠杆菌MG1655积累L-苹果酸 被引量:1
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作者 何彬 周志东 +3 位作者 曹阳 黄皓 周卫 陈俊 《武汉科技大学学报》 CAS 北大核心 2020年第6期424-431,共8页
利用CRISPR/Cas9基因编辑技术依次敲除了野生型大肠杆菌MG1655的poxB、pta-ackA、ldhA、pflB、maeA、maeB和pfkA基因,最后获得突变菌株M07。摇瓶发酵实验结果表明,菌株M07发酵48 h时所得L-苹果酸产量达到9.893 g/L,得率为66%,相比野生... 利用CRISPR/Cas9基因编辑技术依次敲除了野生型大肠杆菌MG1655的poxB、pta-ackA、ldhA、pflB、maeA、maeB和pfkA基因,最后获得突变菌株M07。摇瓶发酵实验结果表明,菌株M07发酵48 h时所得L-苹果酸产量达到9.893 g/L,得率为66%,相比野生型大肠杆菌MG1655相应值明显增加。 展开更多
关键词 L-苹果酸 代谢工程 大肠杆菌mg1655 CRISPR/Cas9系统 基因编辑
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大肠杆菌MG1655三个膜蛋白的生物信息学分析 被引量:4
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作者 王永刚 杨光瑞 +3 位作者 冷非凡 杨明俊 王鸣刚 陈凯 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期4763-4768,共6页
从NCBI数据库中检索大肠杆菌MG1655膜蛋白pspD、yiaW和yeeE的氨基酸序列,采用生物信息学在线分析软件对三种膜蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析。实验表明psp... 从NCBI数据库中检索大肠杆菌MG1655膜蛋白pspD、yiaW和yeeE的氨基酸序列,采用生物信息学在线分析软件对三种膜蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析。实验表明pspD为亲水性蛋白,分子中不存在跨膜结构,yiaW和yeeE为疏水性蛋白,分子中分别有2个和9个跨膜区;3个蛋白分子中均不存在信号肽序列,也没有磷酸化位点,pspD中有1个糖基化位点,yiaW和yeeE中分别有2个和7个糖基化位点。3个蛋白二级结构中组成最多的是α-螺旋分别占56.16%、57.94%$1142.61%。三级结构的预测结果与二级结构预测一致。对其相互作用蛋白的拓扑网络预测发现,pspD属于噬菌体休克蛋白操纵子家族成员,与pspA、pspB和pspC蛋白关系最为密切,推测其可能在特殊环境中对于维持膜功能有极其重要的作用;yiaW与yiaV蛋白为膜融合蛋白(外排泵组件,信号锚,与物质外排有关),和ycdZ(DUF1097家族内膜蛋白)、nrfA(亚硝酸还原酶)、nrfD(甲酸依赖亚硝酸盐还原酶)蛋白相互作用关系最为密切。yeeE蛋白与保守蛋白yeeD和yedF为同源蛋白,关系最为密切。此外,yeeE蛋白与cysJ、Cysp、cysN、cysD等硫酸盐跨膜运输蛋白关系密切,根据前面的预测其有9个跨膜区,推测其可能与物质的跨膜转运相关。 展开更多
关键词 大肠杆菌mg1655 膜蛋白 生物信息学 预测分析
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Converting Escherichia coli MG1655 into a chemical overproducer through inactivating defense system against exogenous DNA 被引量:2
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作者 Jingge Wang Chaoyong Huang +4 位作者 Kai Guo Lianjie Ma Xiangyu Meng Ning Wang Yi-Xin Huo 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE 2020年第4期333-342,共10页
Escherichia coli strain K-12 MG1655 has been proposed as an appropriate host strain for industrial production.However,the direct application of this strain suffers from the transformation inefficiency and plasmid inst... Escherichia coli strain K-12 MG1655 has been proposed as an appropriate host strain for industrial production.However,the direct application of this strain suffers from the transformation inefficiency and plasmid instability.Herein,we conducted genetic modifications at a serial of loci of MG1655 genome,generating a robust and universal host strain JW128 with higher transformation efficiency and plasmid stability that can be used to efficiently produce desired chemicals after introducing the corresponding synthetic pathways.Using JW128 as the host,the titer of isobutanol reached 5.76 g/L in shake-flask fermentation,and the titer of lycopene reached 1.91 g/L in test-tube fermentation,40-fold and 5-fold higher than that of original MG1655,respectively.These results demonstrated JW128 is a promising chassis for high-level production of value-added chemicals. 展开更多
关键词 Escherichia coli mg1655 CRISPR-Cas9 Defense system Metabolic engineering
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L-赖氨酸脱羧酶的表达、纯化及其酶学性质研究
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作者 何世霞 谢文鹏 +4 位作者 郭欣欣 吕育财 张文 杨潇 龚大春 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第21期39-44,共6页
戊二胺可由赖氨酸经过赖氨酸脱羧酶脱羧生成,是生物基聚酰胺PA56的关键单体。该研究以pET-28a(+)质粒为载体,将来源于大肠杆菌K12 MG1655的赖氨酸脱羧酶Ldc基因,经过密码子优化后克隆到大肠杆菌BL21(DE3)中,构建重组菌E.coli BL21(DE3)/... 戊二胺可由赖氨酸经过赖氨酸脱羧酶脱羧生成,是生物基聚酰胺PA56的关键单体。该研究以pET-28a(+)质粒为载体,将来源于大肠杆菌K12 MG1655的赖氨酸脱羧酶Ldc基因,经过密码子优化后克隆到大肠杆菌BL21(DE3)中,构建重组菌E.coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-Ldc,用Ni-Agarose柱分离纯化出带有His标签的目的蛋白,进行酶学性质研究。重组酶Ldc分子质量在81.2 kDa左右,比酶活力为0.56 U/mg,在pH 5.7~8.0稳定性较好,相对酶活力保持80%上;该酶在20~60℃稳定性很好,T_(50)值为72℃;金属离子对酶活力有一定的影响,在终浓度为5 mmol/L条件下,Cu^(2+)抑制作用最明显,其次是Ni^(2+),而Mg^(2+)和Ca^(2+)有微弱的激活作用;对赖氨酸脱羧酶的动力学参数进行了表征,该酶对赖氨酸具有较好的亲和力和催化效率,其K_(m)为0.011 mol/L,V_(max)值为0.643 mmol/(L·min),k_(cat)值为0.23 s-1。研究结果为赖氨酸脱羧酶Ldc分子改造和工业化生产应用提供了科学依据。 展开更多
关键词 戊二胺 赖氨酸脱羧酶 大肠杆菌K12 mg1655 重组表达 酶学性质
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大肠杆菌发酵中强裂解性噬菌体的分离和鉴定 被引量:2
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作者 陈江坡 程江红 +1 位作者 康培 刁刘洋 《发酵科技通讯》 CAS 2018年第4期209-211,248,共4页
噬菌体在自然界中种类很多,在细菌发酵的工业生产中极易感染噬菌体。从工业苏氨酸生产菌(大肠杆菌MG1655来源)的培养液中分离到一株裂解能力强大的噬菌体,分析其生物学特性并鉴定其种类能够为以后抗性菌株的制备和防止再次感染提供研究... 噬菌体在自然界中种类很多,在细菌发酵的工业生产中极易感染噬菌体。从工业苏氨酸生产菌(大肠杆菌MG1655来源)的培养液中分离到一株裂解能力强大的噬菌体,分析其生物学特性并鉴定其种类能够为以后抗性菌株的制备和防止再次感染提供研究基础。采用双层琼脂平板法分离、纯化噬菌体,观察噬菌斑特征,通过电镜观察噬菌体形态特征。分离、纯化获得一株能高效裂解大肠杆菌MG1655的噬菌体。噬菌斑呈圆形、大而透明、边缘整齐。电镜观察噬菌体的头部呈二十面体立体对称,尾部较长。酶切鉴定结果表明噬菌体的核酸类型为dsDNA,确定其属于有尾噬菌体目长尾噬菌体科成员,命名为MHV4。分离鉴定了一株裂解效率极高的大肠肝菌MG1655噬菌体,并确认其为长尾噬菌体科成员,为后续抗噬菌体菌株的筛选和改造奠定基础,并为苏氨酸工业生产提供保障。 展开更多
关键词 噬菌体 大肠杆菌mg1655 苏氨酸 生物学特性
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Metabolic engineering of Escherichia coli for the production of Lacto-N-neotetraose(LNnT) 被引量:3
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作者 Wei Zhang Zhenmin Liu +7 位作者 Mengyue Gong Nan Li Xueqin Lv Xiaomin Dong Yanfeng Liu Jianghua Li Guocheng Du Long Liu 《Systems Microbiology and Biomanufacturing》 2021年第3期291-301,共11页
Lacto-N-neotetraose(LNnT),one of the most important human milk oligosaccharides,can be used as infants’food addi-tives.Nowadays,extraction,chemical and biological synthesis were utilized to obtain LNnT,while these me... Lacto-N-neotetraose(LNnT),one of the most important human milk oligosaccharides,can be used as infants’food addi-tives.Nowadays,extraction,chemical and biological synthesis were utilized to obtain LNnT,while these methods still face some problems such as low yield and high cost.The aim of current work is to construct a de novo biosynthesis pathway of LNnT in E.coli K12 MG1655.The lgtA and lgtB were first expressed by a plasmid,resulting in a LNnT titer of 0.04 g/L.To improve the yield of LNnT on substrate lactose,lacZ and lacI were knocked out,and lacY was over-expressed.As a result,the yield of LNnT on lactose increased from 0.01 to 0.09 mol/mol,and the titer of LNnT elevated to 0.41 g/L.In addition,the pathway was regulated using the titer of Lacto-N-triose II(LNTII)as a measure,and obtained a high titer strain of LNnT for 1.04 g/L.Finally,the gene expressions were fine-tuned,the titer of LNnT reached 1.2 g/L,which was 93%higher than the control strain,and the yield on lactose reached 0.28 mol/mol.The engineering strategy of pathway construction and modulation used in this study is applicable to facilitate the microbial production of other metabolites in E.coli. 展开更多
关键词 Lacto-N-neotetraose Lacto-N-triose II Human milk oligosaccharides Escherichia coli K12 mg1655
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定量监控大肠杆菌主代谢目标蛋白质及中间代谢物
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作者 程永波 邓子新 刘天罡 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1458-1467,共10页
【目的】监控大肠杆菌(Escherichia coli)主代谢通路上蛋白表达状况及中间代谢物变化,为代谢工程改造提供基础性数据及检测方法。【方法】利用Skyline软件靶向设计主代谢(糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、混合酸发酵途径及脂肪... 【目的】监控大肠杆菌(Escherichia coli)主代谢通路上蛋白表达状况及中间代谢物变化,为代谢工程改造提供基础性数据及检测方法。【方法】利用Skyline软件靶向设计主代谢(糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、混合酸发酵途径及脂肪酸合成途径)目标蛋白质label-free(MRM)方法对其相对定量监控;在相同质谱平台(Triple Quad 4500)上利用LC-MS/MS(MRM)方法对目标中间代谢物绝对定量监控。【结果】实验表明不同生长时期内(对数生长期、稳定期及衰亡期)大肠杆菌主代谢蛋白质表达表现出4种不同的变化现象,某一代谢通路上的单一蛋白不能反映该通路的表达状态;磷酸戊糖途径、混合酸发酵途径以及三羧酸循环途径中较多的蛋白质在衰亡期表达量最高,但几种目标中间代谢产物(ATP、ADP、AMP、NAD+、NADH、NADP+、NADPH、Co A、acetyl-Co A)的积累量与对数生长期相比,稳定期及衰亡期都相应减少(除了acetylCo A以外)。【结论】该文中使用的检测方法可以有效地反映大肠杆菌体内代谢的基本状况。 展开更多
关键词 大肠杆菌(K12 MGl655) 液质联用 代谢物 靶向蛋白组
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