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Hp阳性慢性萎缩性胃炎患者miR-92a-1-5p和FOXD1表达特征及其与预后的相关性 被引量:3
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作者 朱巧英 李宁 +1 位作者 成春岚 倪雪梅 《新疆医科大学学报》 CAS 2022年第12期1431-1436,共6页
目的 探讨幽门螺杆菌(Hp)阳性慢性萎缩性胃炎(CAG)患者胃粘膜组织中微小RNA-92a-1-5p(mi R-92a-1-5p)和人转录因子叉头框1(FOXD1)表达特征及其与预后的相关性。方法 选取2017年1月至2021年10月四川省妇幼保健院收治的Hp阳性CAG患者124... 目的 探讨幽门螺杆菌(Hp)阳性慢性萎缩性胃炎(CAG)患者胃粘膜组织中微小RNA-92a-1-5p(mi R-92a-1-5p)和人转录因子叉头框1(FOXD1)表达特征及其与预后的相关性。方法 选取2017年1月至2021年10月四川省妇幼保健院收治的Hp阳性CAG患者124例作为研究对象,所有患者均在接受胃镜检查时取萎缩胃粘膜活检组织与周边正常形态粘膜活检组织,置于液氮内储存待检,测定mi R-92a-1-5p、FOXD1相对表达水平,并根据患者病情及病理评估结果给予针对性治疗。比较研究对象病变粘膜组织与正常粘膜组织mi R-92a-1-5p、FOXD1表达水平和不同病情程度患者粘膜组织mi R-92a-1-5p、FOXD1表达水平,并比较不同预后Hp阳性CAG患者mi R-92a-1-5p、FOXD1表达水平。统计分析mi R-92a-1-5p、FOXD1表达水平与疾病病情程度、Hp阳性CAG预后的相关性。结果(1)病变粘膜组织mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平高于正常粘膜组织(P<0.05)。(2)不同病情程度的Hp阳性CAG患者粘膜组织mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平差异有统计学意义(P<0.05),且随着病情程度的增加,Hp阳性CAG患者粘膜组织mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平呈持续增高趋势(P<0.05)。(3)预后不良患者mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平高于预后良好患者(P<0.05)。(4)经Pearson检验可知,mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平与Hp阳性CAG病情程度呈正相关(P<0.05),mi R-92a-1-5p、FOXD1mRNA及蛋白表达水平与Hp阳性CAG预后呈负相关(P<0.05)。结论 Hp阳性CAG患者胃粘膜组织中mi R-92a-1-5p、FOXD1表达较正常水平异常增高,且其增高幅度在不同病情程度患者中具有明显差异,其表达水平与疾病病情、预后均具有密切相关性,可评估病情、预测预后。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 慢性萎缩性胃炎 胃粘膜组织 预后 mi R-92a-1-5p FOXD1
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四重PCR技术鉴定番茄Ty-1、Ty-2、Mi和Cf-5基因研究 被引量:8
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作者 刘超勤 李景富 +1 位作者 许向阳 姜景彬 《北方园艺》 CAS 北大核心 2013年第9期119-123,共5页
以番茄为试材,只利用1次PCR反应体系,同时对与番茄黄化曲叶病毒病(Tomatoyellow leaf curl virus)的Ty-1、Ty-2基因、番茄根结线虫病(Root-knot nematode)的Mi基因和番茄叶霉病(Leaf mold)的Cf-5基因紧密连锁的SCAR标记进行了筛选。结... 以番茄为试材,只利用1次PCR反应体系,同时对与番茄黄化曲叶病毒病(Tomatoyellow leaf curl virus)的Ty-1、Ty-2基因、番茄根结线虫病(Root-knot nematode)的Mi基因和番茄叶霉病(Leaf mold)的Cf-5基因紧密连锁的SCAR标记进行了筛选。结果表明:扩增的特异性片段和单引物扩增的片段吻合,即对与Ty-1基因、Ty-2基因、Mi基因和Cf-5基因紧密连锁的片段特异性扩增,所获得的片段大小分别是395、900、750和960bp。经TaqI酶切后所获得的特异性片段大小与前人试验所得大小基本相同,初步证明了四重PCR检测的准确性。该体系可对Ty-1、Ty-2、Mi和Cf-5 4个抗病基因进行同时筛选,在苗期辅助选择。降低了生产成本,节约时间、人力、物力,为分子标记辅助选择育种奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 多重PCR Ty-1 Ty-2 mi Cf-5
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miR-629-5p对胃癌细胞生物学行为的影响及其靶基因MTRF1L的鉴定 被引量:2
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作者 何清 李照东 吴小翎 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期403-409,共7页
目的:研究miR-629-5p对胃癌细胞生物学行为的影响并鉴定其靶基因。方法:通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,q RT-PCR)检测miR-629-5p在16例胃癌组织和3种胃癌细胞中的表达水平;将细胞实验分为2个组:实验组(IN)和对照组(N... 目的:研究miR-629-5p对胃癌细胞生物学行为的影响并鉴定其靶基因。方法:通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,q RT-PCR)检测miR-629-5p在16例胃癌组织和3种胃癌细胞中的表达水平;将细胞实验分为2个组:实验组(IN)和对照组(NC);转染miR-629-5p抑制剂下调胃癌细胞MKN-45中miR-629-5p的表达;CCK-8实验和平板克隆实验检测MKN-45增殖;Transwell小室实验和划痕实验检测MKN-45迁移和侵袭;细胞流式技术检测MKN-45凋亡;通过miRWalk2.0工具预测miR-629-5p的靶基因,Western blot检测MKN-45中线粒体样转录释放因子1(mitochondrial translational release factor1 like,MTRF1L)蛋白表达。结果:与癌旁组织[1.574(0.197,4.503)]相比,胃癌组织中miR-629-5p相对表达量[2.081(0.231,7.216)]明显增加(P=0.003);与正常胃黏膜细胞(1.017±0.226)相比,胃癌细胞中miR-629-5p相对表达量(MKN-28:3.040±0.506;MKN-45:5.924±0.403;SCG-7901:3.377±0.372)均明显增加(P=0.000)。下调miR-629-5p表达后,胃癌细胞MKN-45的增殖减慢(IN:64±12;NC:102±12;P=0.018),迁移(IN:106±9;NC:194±29;P=0.008)和侵袭(IN:25±7;NC:60±9;P=0.007)能力减弱,凋亡细胞数增加[IN:(19.257±2.440)%;NC:11.687±2.237;P=0.017]。miR-629-5p预测的靶基因共有46个,下调miR-629-5p的表达后,MTRF1L表达量明显增加(IN:0.923±0.101;NC:0.556±0.026;P=0.004)。结论:miR-629-5p在胃癌中表达上调,可促进MKN-45的增殖,增强MKN-45迁移和侵袭能力,抑制MKN-45凋亡;MTRF1L可能是miR-629-5p的靶基因之一。 展开更多
关键词 胃癌 mi R-629-5p 生物信息学 线粒体样转录释放因子1
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MIS5b以来西樵山主量地球化学元素记录的D/O旋回与古生物实证
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作者 牛东风 李保生 +5 位作者 舒培仙 司月君 温小浩 朱丽东 王丰年 李志文 《沉积学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1166-1178,共13页
位于中国南亚热带的西樵剖面主要是一套大约MIS5b以来形成的湖沼相。根据对该剖面759个主要元素氧化物SiO2、Al2O3和TOFE(Fe2O3+FeO)含量分析结果并以Al2O3/SiO2比值作为考察"脱硅富铝"的气候代用指标,将西樵剖面MIS5b以来的... 位于中国南亚热带的西樵剖面主要是一套大约MIS5b以来形成的湖沼相。根据对该剖面759个主要元素氧化物SiO2、Al2O3和TOFE(Fe2O3+FeO)含量分析结果并以Al2O3/SiO2比值作为考察"脱硅富铝"的气候代用指标,将西樵剖面MIS5b以来的主要元素波动划分出34.5个元素旋回"CY0—CY34"(其中CY0属于0.5个旋回),其平均变率—3.1 ka/旋回为千年尺度级别。通过对这些元素与气候的关系和古生物(孢粉和哺乳动物化石)指示的古生态的论证,认为气候旋回与这些元素旋回存在内在的因果关系,进而提出MIS5b以来该地曾发生过34.5个时期的寒冷与温暖即东亚冬季风与夏季风交替变化的千年尺度的气候旋回。研究表明,MIS5b以来这些旋回中的若干阶段与北半球高纬地区D/O事件存在很好的"遥相关",即在时间—气候性质上的变化节奏基本一致。这是首次在中国的南亚热带发现的MIS5b以来高分辨率的元素/气候波动,其意义在于它展现了自那时以来一个比较完整的D/O气候旋回在东亚大陆更南部区域的存在。表明,这个时代东亚季风旋回的发生、发展和演化,除了北半球冰量变化幅度的影响外,西太平洋暖池(温度与消长幅度)亦对其产生过重要的影响,其中夏季风时期对低纬地区的影响更加强烈。 展开更多
关键词 mis5b—mis1 西樵山 主量地球化学元素 千年尺度气候旋回 气候变迁
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Mi R-9a-5p regulates proliferation and migration of hepatic stellate cells under pressure through inhibition of Sirt1 被引量:11
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作者 Feng Qi Jiang-Feng Hu +4 位作者 Bao-Hai Liu Chao-Qun Wu Hong-Yu Yu Ding-Kang Yao Liang Zhu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第34期9900-9915,共16页
AIM:To reveal the functions of micro RNAs(mi RNAs) with respect to hepatic stellate cells(HSCs) in response to portal hypertension.METHODS:Primary rat HSCs were exposed to static water pressure(10 mm Hg,1 h) and the p... AIM:To reveal the functions of micro RNAs(mi RNAs) with respect to hepatic stellate cells(HSCs) in response to portal hypertension.METHODS:Primary rat HSCs were exposed to static water pressure(10 mm Hg,1 h) and the pressureinduced mi RNA expression profile was detected by next-generation sequencing. Quantitative real-time polymerase chain reaction was used to verify the expression of mi RNAs. A potential target of Mi R-9a-5p was measured by a luciferase reporter assay and Western blot. CCK-8 assay and Transwell assay were used to detect the proliferation and migration of HSCs under pressure.RESULTS:According to the profile,the expression of mi R-9a-5p was further confirmed to be significantly increased after pressure overload in HSCs(3.70 ± 0.61 vs 0.97 ± 0.15,P = 0.0226),which resulted in the proliferation,migration and activation of HSCs. In vivo,the up-regulation of mi R-9a-5p(2.09 ± 0.91 vs 4.27 ± 1.74,P = 0.0025) and the down-regulation of Sirt1(2.41 ± 0.51 vs 1.13 ± 0.11,P = 0.0006) were observed in rat fibrotic liver with portal hypertension. Sirt1 was a potential target gene of mi R-9a-5p. Through restoringthe expression of Sirt1 in mi R-9a-5p transfected HSCs on pressure overload,we found that overexpression of Sirt1 could partially abrogate the mi R-9a-5p mediated suppression of the proliferation,migration and activation of HSCs. CONCLUSION:Our results suggest that during liver fibrosis,portal hypertension may induce the proliferation,migration and activation of HSCs through the up-regulation of mi R-9a-5p,which targets Sirt1. 展开更多
关键词 micro RNA mi R-9a-5p SIRT1 Pressure HEPATIC STELLA
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mi R-192-5p regulates lipid synthesis in non-alcoholic fatty liver disease through SCD-1 被引量:11
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作者 Xiao-Lin Liu Hai-Xia Cao +7 位作者 Bao-Can Wang Feng-Zhi Xin Rui-Nan Zhang Da Zhou Rui-Xu Yang Ze-Hua Zhao Qin Pan Jian-Gao Fan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2017年第46期8140-8151,共12页
AIM To evaluate the levels of mi R-192-5 p in non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD) models and demonstrate the role of mi R-192-5 p in lipid accumulation. METHODS Thirty Sprague Dawley rats were randomly divided in... AIM To evaluate the levels of mi R-192-5 p in non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD) models and demonstrate the role of mi R-192-5 p in lipid accumulation. METHODS Thirty Sprague Dawley rats were randomly divided into three groups, which were given a standard diet, a high-fat diet(HFD), and an HFD with injection of liraglutide. At the end of 16 weeks, hepatic mi R-192-5 p and stearoyl-Co A desaturase 1(SCD-1) levels were measured. Mi R-192-5 p mimic and inhibitor and SCD-1 si RNA were transfected into Huh7 cells exposed to palmitic acid(PA). Lipid accumulation was evaluated by oil red O staining and triglyceride assays. Direct interaction was validated by dual-luciferase reporter gene assays.RESULTS The HFD rats showed a 0.46-fold decrease and a 3.5-fold increase in hepatic mi R-192-5 p and SCD-1 protein levels compared with controls, respectively, which could be reversed after disease remission by liraglutide injection(P < 0.01). The Huh7 cells exposed to PA also showed down-regulation and up-regulation of mi R-192-5 p and SCD-1 protein levels, respectively(P < 0.01). Transfection with mi R-192-5 p mimic and inhibitor in Huh7 cells induced dramatic repression and promotion of SCD-1 protein levels, respectively(P < 0.01). Luciferase activity was suppressed and enhanced by mi R-192-5 p mimic and inhibitor, respectively, in wild-type SCD-1(P < 0.01) but not in mutant SCD-1. Mi R-192-5 p overexpression reduced lipid accumulation significantly in PA-treated Huh7 cells, and SCD-1 si RNA transfection abrogated the lipid deposition aggravated by mi R-192-5 p inhibitor(P < 0.01).CONCLUSION This study demonstrates that mi R-192-5 p has a negative regulatory role in lipid synthesis, which is mediated through its direct regulation of SCD-1. 展开更多
关键词 mi R-192-5p Stearoyl-Co A desaturase 1 High fat diet Lipid synthesis Non-alcoholic fatty liver disease
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EGCG上调miR-29抑制APP_(695)突变的SH-SY5Y神经细胞Aβ生成研究
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作者 赵坚毅 田立东 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2016年第10期38-41,共4页
目的:探讨没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对含有APP_(695)突变的SH-SY5Y神经细胞中淀粉样肽(amyloid-β,Aβ)生成的影响及其机制。方法:将SH-SY5Y细胞分为正常组(Control)、模型组(含有APP_(695)突变的细胞,APP)和给药组(APP+10、20、30... 目的:探讨没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对含有APP_(695)突变的SH-SY5Y神经细胞中淀粉样肽(amyloid-β,Aβ)生成的影响及其机制。方法:将SH-SY5Y细胞分为正常组(Control)、模型组(含有APP_(695)突变的细胞,APP)和给药组(APP+10、20、30μmol·L-1的EGCG,24 h);免疫荧光细胞化学法检测各组细胞中APP的表达;MTT法检测各组细胞的存活能力;ELISA法检测各组Aβ_(1-42)的浓度;RT-PCR检测各组mi R-29的表达;RT-PCR和ELISA法检测各组BACE1(β-分泌酶)m RNA水平与蛋白水平的表达。结果:模型组中APP高表达;与模型组比较EGCG明显改善细胞形态,促进神经细胞的存活能力,降低Aβ_(1-42)的浓度,上调mi R-29的表达以及在m RNA与蛋白水平上降低BACE1的表达。结论:EGCG能抑制APP_(695)突变所导致的细胞Aβ生成,其作用机制可能与上调mi R-29的表达及下调BACE1的表达有关。 展开更多
关键词 EGCG mi R-29 BACE1 SH-SY5Y细胞
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miRNA-449对SH-SY5Y细胞增殖活性的抑制作用
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作者 王丹 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期512-517,522,共7页
目的寻找并验证miRNA-449的靶基因,探讨miRNA-449调控SH-SY5Y细胞增殖活性的分子机制。方法检测神经母细胞瘤及其癌旁组织中的miRNA-449及NOTCH1蛋白的表达并分析其相关性;生物信息学预测miRNA-449与NOTCH1基因3'UTR区的结合靶位,... 目的寻找并验证miRNA-449的靶基因,探讨miRNA-449调控SH-SY5Y细胞增殖活性的分子机制。方法检测神经母细胞瘤及其癌旁组织中的miRNA-449及NOTCH1蛋白的表达并分析其相关性;生物信息学预测miRNA-449与NOTCH1基因3'UTR区的结合靶位,并通过荧光素酶报告基因法进行验证;化学合成miRNA-449模拟物、miRNA-449抑制剂及miRNA-449错义序列,经脂质体转染至SH-SY5Y细胞,转染后48 h,real-time PCR检测细胞中miRNA-449表达,Western blotting检测细胞中NOTCH1蛋白表达;转染后24、48和72 h,CCK-8法检测肿瘤细胞增殖活性。结果与癌旁组织比较,肿瘤组织中miRNA-449表达明显升高,NOTCH1蛋白表达则明显降低,差异均有统计学意义(P=0.002和P=0.021)。miRNA-449在NOTCH1基因3'UTR区存在结合位点5'-CACTGCC-3',并且通过结合位点对NOTCH1基因表达进行负调控。miRNA-449模拟物转染SH-SY5Y细胞,明显抑制细胞内NOTCH1蛋白表达(P=0.006);而miRNA-449抑制剂转染细胞后可明显增强胞内NOTCH1蛋白表达(P=0.018)。在48和72 h时间点,miRNA-449模拟物可明显抑制SH-SY5Y细胞增殖活性,而miRNA-449抑制剂则使细胞增殖活性进一步增强。结论 miRNA-449可以通过抑制其靶基因NOTCH1表达抑制SH-SY5Y细胞增殖活性。 展开更多
关键词 mi RNA-449 SH-SY5Y细胞 荧光素酶 NOTCH1 细胞活性
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血清lncRNA NNT-AS1、miR-582-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、气道高反应的关系研究
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作者 张珍 刘光辉 +3 位作者 梁慧玲 吴开松 张肆肆 董翔 《现代生物医学进展》 CAS 2024年第22期4256-4258,共3页
目的:探讨血清长链非编码核糖核酸(lncRNA)烟酰胺核苷酸反义转氢酶RNA1(NNT-AS1)、微小核糖核酸(mi R)-582-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、气道高反应的关系。方法:选择120例支气管哮喘患儿,根据相关指南分为缓解期组(n=52)与发作期组(n=... 目的:探讨血清长链非编码核糖核酸(lncRNA)烟酰胺核苷酸反义转氢酶RNA1(NNT-AS1)、微小核糖核酸(mi R)-582-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、气道高反应的关系。方法:选择120例支气管哮喘患儿,根据相关指南分为缓解期组(n=52)与发作期组(n=68)。另选择同期60例健康儿童作为对照组。对比三组血清lncRNA NNT-AS1、mi R-582-5p相对表达量及气道炎症细胞因子[白介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)]水平、气道反应性指标[基础呼吸阻力(Rrs cont)、最小诱发累积剂量(Dmin)、基础呼吸传导率(Grs cont)]。Pearson相关性检验分析血清lncRNA NNT-AS1、mi R-582-5p表达与血清气道炎症细胞因子、气道反应性指标的关系。结果:缓解期组、发作期组lncRNA NNT-AS1相对表达量、血清IL-17、TNF-α水平、Rrs cont高于对照组,且发作期组高于缓解期组(P<0.05)。缓解期组、发作期组mi R-582-5p相对表达量、Grs cont、Dmin低于对照组,且发作期组低于缓解期组(P<0.05)。支气管哮喘患儿血清lncRNA NNT-AS1表达与IL-7、TNF-α、Rrs cont呈正相关(r>0,P<0.05),与Grs cont、Dmin呈负相关(r<0,P<0.05);血清mi R-582-5p表达与IL-17、TNF-α、Rrs cont呈负相关(r<0,P<0.05),与Grs cont、Dmin呈正相关(r>0,P<0.05)。结论:支气管哮喘患儿血清lncRNA NNT-AS1呈高表达,mi R-582-5p呈低表达,二者表达与患儿哮喘分期、气道炎症、气道高反应密切相关。 展开更多
关键词 lncRNA NNT-AS1 mi R-582-5p 支气管哮喘 儿童 气道炎症 气道高反应
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慢性阻塞性肺疾病合并肺癌患者血清LncRNA-PVT1、miR-497-5p表达与肺功能和预后的关系研究
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作者 邢祥 提运山 +2 位作者 高晓旭 谷兰海 邢加强 《现代生物医学进展》 CAS 2024年第13期2546-2550,2472,共6页
目的:研究慢性阻塞性肺疾病(COPD)合并肺癌患者血清长链非编码核糖核酸-人浆细胞瘤转化迁移基因1(LncRNA-PVT1)、微小核糖核酸-497-5p(miR-497-5p)表达与肺功能和预后的关系。方法:选择临沂市肿瘤医院2018年3月-2020年3月收治的116例COP... 目的:研究慢性阻塞性肺疾病(COPD)合并肺癌患者血清长链非编码核糖核酸-人浆细胞瘤转化迁移基因1(LncRNA-PVT1)、微小核糖核酸-497-5p(miR-497-5p)表达与肺功能和预后的关系。方法:选择临沂市肿瘤医院2018年3月-2020年3月收治的116例COPD合并肺癌并行手术治疗的患者纳入观察组,同期单纯COPD患者50例纳入对照组。比较两组血清LncRNA-PVT1、miR-497-5p相对表达水平以及肺功能指标[第1秒用力呼气容积(FEV_(1))、用力肺活量(FVC)、FEV_(1)/FVC、第1秒用力呼气容积占预计值百分比(FEV_(1)%pred)]。采用Pearson检验分析COPD合并肺癌患者血清LncRNA-PVT1、miR-497-5p表达与肺功能指标的相关性。COPD合并肺癌患者术后进行3年随访,采用多因素Cox回归模型分析COPD合并肺癌患者预后影响因素。绘制Kaplan-Meier生存曲线分析LncRNA-PVT1、miR-497-5p低表达和高表达患者3年总生存率情况。结果:与对照组比较,观察组血清LncRNA-PVT1表达水平显著升高(P<0.05),miR-497-5p表达水平显著降低(P<0.05)。与对照组比较,观察组FEV_(1)、FEV_(1)%pred、FEV_(1)/FVC显著降低(P<0.05)。Pearson检验结果显示,COPD合并肺癌患者血清LncRNA-PVT1与FEV_(1)、FEV_(1)%pred、FEV_(1)/FVC呈负相关(P<0.05);血清miR-497-5p与FEV_(1)、FEV_(1)%pred、FEV_(1)/FVC呈正相关(P<0.05)。Kplan-Meier生存曲线显示,LncRNA-PVT1高表达组3年总生存率为29.23%明显低于LncRNA-PVT1低表达组的47.73%(P<0.05);miR-497-5p高表达组3年总生存率为46.77%明显高于miR-497-5p低表达组的23.40%(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,淋巴结转移、TNM分期Ⅲa期、肿瘤组织低分化、LncRNA-PVT1高表达、miR-497-5p低表达是COPD合并肺癌患者预后的危险因素(P<0.05)。结论:COPD合并肺癌患者血清中LncRNA-PVT1呈高表达、miR-497-5p呈低表达,其表达水平与肺功能指标相关,且LncRNA-PVT1表达水平越高、miR-497-5p表达水平越低者的3年总生存率越低。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 肺癌 LncRNA-PVT1 mi R-497-5p 肺功能 预后
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番茄5个抗病基因KASP分型技术体系的建立与应用 被引量:10
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作者 王鹏 田哲娟 +7 位作者 康忱 李亚栋 王洪乐 杨超沙 邙光伟 康亮 范庆杰 吴志明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2211-2226,共16页
竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)是一种基于单核酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的新型基因分型技术,建立高效、经济的番茄抗病基因的KASP分型技术对促进抗病品种的选育具有重要意义。本... 竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)是一种基于单核酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的新型基因分型技术,建立高效、经济的番茄抗病基因的KASP分型技术对促进抗病品种的选育具有重要意义。本研究中设计了抗番茄黄花曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)病基因Ty-1和抗根结线虫(root-knot nematode,RKN)基因Mi-1的KASP引物,结合已报道的抗番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)病基因Tm-2^(2)、抗番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)病基因Sw-5和抗镰刀菌颈腐根腐(fusarium crown and root rot,FCRR)病基因Frl的KASP引物,进行了番茄抗病基因KASP分型检测技术研究。利用不同基因型的番茄抗病种质,对影响KASP的反应体积、DNA模板浓度、引物浓度及反应循环数等进行了优化,建立了最优番茄抗病基因的KASP分型检测技术体系。研究结果显示,优化的KASP体系与Ty-1、Mi-1、Tm-2^(2)、Sw-5和Frl基因的PCR分子标记检测结果相一致。所用的KASP反应体系不但能节省试剂,且具有高准确性和强稳定性的优点,因此其可以广泛应用于番茄抗病基因的鉴定、遗传多样性和基因定位等研究,为番茄种质资源分子标记辅助的抗病性鉴定、抗原的快速筛选及利用提供技术支持和理论依据。 展开更多
关键词 番茄 种质资源 KASP技术 基因分型 Ty-1 mi-1 Tm-2^(2) Sw-5 Frl
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