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Bioinformatics and Functional Analysis of High Oleic Acid-Related Gene GmSAM22 in Soybean [Glycine max (L.) Merr.] 被引量:2
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作者 Shuo Qu Qi Cai +4 位作者 Huimin Cui Lamboro Abraham Yaolei Jiao Guilong Ma Piwu Wang 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第2期501-519,共19页
High yield,high quality,stable yield,adaptability to growth period,and modern mechanization are the basic requirements for crops in the 21st century.Soybean oleic acid is a natural unsaturated fatty acid with strong a... High yield,high quality,stable yield,adaptability to growth period,and modern mechanization are the basic requirements for crops in the 21st century.Soybean oleic acid is a natural unsaturated fatty acid with strong antioxidant properties and stability.Known as a safe fatty acid,it has the ability to successfully prevent cardiovascular and cerebrovascular disorders.Improving the fatty acid composition of soybean seeds,can not only speed up the breeding process of high-quality high-oil and high-oleic soybeans,but also have important significance in human health,and provide the possibility for the development of soybean oil as a new energy source.Hence,the aim of this study was to analyze the high oleic acid elated gene GmSAM22 in soybean.In this research the soybean oleic acid-related gene GmSAM22 was screened out by Genome-wide association analysis,a 662 bp fragment was acquired by specific PCR amplification,and the pMD18T cloning vector was linked by the use of a seamless cloning technique.Bioinformatics analysis of the signal peptide prediction,subcellular localization,protein hydrophobicity,transmembrane region analysis,a phosphorylation site,protein secondary and tertiary structure and protein interaction analysis of the protein encoded by the SAM22 gene was carried out.The plasmid of the gene editing vector is pBK041.The overexpression vector was transformed from pCAMBIA3301 as the base vector,and overexpression vector were designed.Positive plants were obtained by genetic transformation by the pollen tube channel method.Fluorescence quantitative PCR was performed on the T2 generation plants to detect the relative expression levels in different tissues.Southern Blot was used to detect the presence of hybridization signal.Screening genes BAR,35S,and NOS in plants were identified by conventional PCR.10 seeds with high and low oleic acid content were chosen for quantitative PCR identification,and finally,the concentration and morphology of soybean fatty acids were identified by nearfar infrared spectroscopy.On 10 seeds with an upper and lower oleic acid content,a quantitative fluorescence analysis was done.In Southern blot hybridization,the SAM22 gene was integrated into the recipient soybean plant in hands of a sole copy.Fluorescence quantitative PCR appeared that the average relative expression of the SAM22 gene in roots,stems,leaves,and seeds was 1.70,1.67,3.83,and 4.41,respectively.Positive expression seeds had a 4.77%increase in oleic acid content.The level of oleic acid in the altered seeds was reduced by 4.13%when compared to CK,and it was discovered that the GmSAM22 gene could be a regulatory and secondary gene that promotes the conversion of stearic acid to oleic acid in soybean.There has not been a discussion of gene cloning or functional verification.The cloning and genetic transformation of the soybean SAM22 gene can effectively increase the content of oleic acid,which lays a foundation for the study of soybean with high oleic acid. 展开更多
关键词 SOYBEAN SAM22 gene oleic acid CLONING CRISPR/Cas9 expression vector
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长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因22调控微小RNA-27b-3p对口腔鳞状细胞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响
2
作者 周金阔 张晋弘 +3 位作者 史晓晶 刘广顺 姜磊 刘倩峰 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期52-59,共8页
目的探究长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因(SNHG)22调控微小RNA(miR)-27b-3p对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法收集52例OSCC患者的癌组织及癌旁组织标本,体外培养人正常口腔角质细胞HOK和3种人OSCC细胞(CA... 目的探究长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因(SNHG)22调控微小RNA(miR)-27b-3p对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法收集52例OSCC患者的癌组织及癌旁组织标本,体外培养人正常口腔角质细胞HOK和3种人OSCC细胞(CAL-27、SCC-25和HSC-3),实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测癌组织、癌旁组织、HOK细胞和3种OSCC细胞中SNHG22、miR-27b-3p表达情况。对SCC-25细胞进行转染并将其分为Ctrl组(未进行转染)、si-SNHG22组、si-NC组、miR-27b-3p inhibitor组、inhibitor-NC组、si-SNHG22+inhibitor-NC组和si-SNHG22+miR-27b-3p inhibitor组,检测各组SCC-25细胞增殖情况[细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测增殖率、流式细胞术检测增殖指数(PI)];Transwell实验检测各组SCC-25细胞侵袭情况;划痕愈合实验检测各组SCC-25细胞迁移情况;双荧光素酶实验验证SNHG22与miR-27b-3p的靶向作用关系。结果与癌旁组织比较,OSCC癌组织中SNHG22表达显著升高,miR-27b-3p表达显著降低(P<0.05);与HOK细胞比较,CAL-27、SCC-25和HSC-3细胞中SNHG22表达显著升高,miR-27b-3p表达显著降低,且SCC-25细胞中SNHG22与miR-27b-3p的表达与HOK细胞差异最大(P<0.05)。与Ctrl组比较,si-SNHG22组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著减少(P<0.05),miR-27b-3p inhibitor组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著增加(P<0.05);与si-SNHG22组比较,si-SNHG22+miR-27b-3p inhibitor组SCC-25细胞增殖率、PI、侵袭数和划痕面积愈合率均显著增加(P<0.05)。双荧光素酶实验显示SNHG22与miR-27b-3p存在靶向作用关系。结论SNHG22在OSSC中高表达,miR-27b-3p在OSSC中低表达,SNHG22可能通过海绵化miR-27b-3p促进SCC-25细胞增殖、侵袭和迁移,SNHG22/miR-27b-3p轴可能是OSCC一个新的诊断和治疗靶点。 展开更多
关键词 长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因22 微小RNA-27b-3p 口腔鳞状细胞癌 增殖 侵袭 迁移
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急性单核细胞白血病新抗原MLAA-22的生物信息学分析及相关鉴定 被引量:7
3
作者 周芙玲 张王刚 +2 位作者 蒙昕 陈刚 王剑利 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第3期466-471,共6页
本研究采用生物信息学方法对SEREX法筛库获得的急性单核细胞白血病抗原新基因MLAA-22进行分析,并进一步做基因表达鉴定。通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库检索MLAA-22基因的相关信息,分析MLAA-22抗原CTL表位,制备其多克隆抗体... 本研究采用生物信息学方法对SEREX法筛库获得的急性单核细胞白血病抗原新基因MLAA-22进行分析,并进一步做基因表达鉴定。通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库检索MLAA-22基因的相关信息,分析MLAA-22抗原CTL表位,制备其多克隆抗体;利用荧光定量PCR及免疫印迹鉴定的方法,在转录翻译水平检测该基因的表达。结果表明:肿瘤抗原新基因MLAA-22 cDNA全长为2.0kb,定位于染色体17q11.2,编码631个氨基酸,蛋白分子量约72.4kD,非分泌型,亚细胞定位在胞浆,属于不稳定蛋白,但具有一定的亲水和热稳定性,无信号肽。MLAA-22有多个基序(motif),可能在细胞的生长、增殖、分化和凋亡中具有重要作用。应用Protean等软件分析选取了序列543-556位作为MLAA-22的抗原表位,采用多通道同步固相全自动合成系统合成15肽,将纯化后的MLAA-22预测抗原多肽通过C末端Cys的-SH与KLH偶联,免疫兔子,制备相应的多抗,ELISA法检测抗体效价1∶8000。Real-time PCR和Western blot检测结果显示MLAA-22在M5患者中有不同程度的表达,且表达量高于正常人,在其他血液肿瘤细胞中低表达,但在胃、肾和前列腺癌等组织中不表达。结论:mlaa-22是一个新的急性单核细胞白血病相关抗原新基因,有进一步研究的价值。 展开更多
关键词 急性单核细胞白血病 mlaa-22 SEREX 生物信息学
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MLAA-22在急性单核细胞白血病中的表达及临床意义 被引量:1
4
作者 古流芳 李月 +1 位作者 崔晓光 曹星梅 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第17期2753-2756,共4页
目的:检测MLAA-22基因及其编码蛋白在不同状态急性单核细胞白血病(M5)中的表达,探讨MLAA-22是否可作为M5特异性标记应用于临床。方法:收集临床初诊、完全缓解及复发的M5患者骨髓血,应用荧光实时定量PCR(QRT-PCR)及Western blot检测各组M... 目的:检测MLAA-22基因及其编码蛋白在不同状态急性单核细胞白血病(M5)中的表达,探讨MLAA-22是否可作为M5特异性标记应用于临床。方法:收集临床初诊、完全缓解及复发的M5患者骨髓血,应用荧光实时定量PCR(QRT-PCR)及Western blot检测各组MLAA-22 m RNA及蛋白质的表达,比较、分析基因及蛋白在各组中的表达变化,分析MLAA-22与M5疗效及转归的关系。结果:MLAA-22 m RNA在初诊的M5中特异性高表达,与完全缓解组表达差异具有统计学意义(P<0.01),与复发组差异无统计学意义(P>0.05)。MLAA-22蛋白在初诊的M5中显著高表达,完全缓解组MLAA-22蛋白表达较初诊患者明显下降。结论:MLAA-22 m RNA及蛋白在急性单核细胞白血病中特异性高表达,有望成为急性单核细胞白血病诊断、临床疗效评估、预后判断及微小残留病监测的特异性指标,值得深入研究。 展开更多
关键词 急性单核细胞白血病 mlaa-22 完全缓解 微小残留灶
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急性单核细胞白血病相关抗原基因MLAA-22全长的克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 古流芳 张鹏宇 +2 位作者 曹星梅 何爱丽 张王刚 《实用癌症杂志》 2018年第12期1920-1923,1927,共5页
目的获得急性单核细胞白血病相关抗原基因MLAA-22cDNA全长序列,以便进行新基因的生物学功能研究。方法本研究采用cDNA末端快速扩增法(rapid-amplification of cDNA ends,RACE),从人急性单核细胞白血病细胞株U937中克隆获得了的cDNA全长... 目的获得急性单核细胞白血病相关抗原基因MLAA-22cDNA全长序列,以便进行新基因的生物学功能研究。方法本研究采用cDNA末端快速扩增法(rapid-amplification of cDNA ends,RACE),从人急性单核细胞白血病细胞株U937中克隆获得了的cDNA全长,并对MLAA-22进行了生物信息学分析及预测。结果 MLAA-22 cDNA全长3067bp,染色体定位于17q11. 2,基因包含12个外显子和11个内含子。生物信息学预测其有完整的ORF框,编码1个含有701个氨基酸残基的蛋白质,蛋白分子量约80. 5 kD,非分泌型,亚细胞定位为胞质蛋白。大多数capase酶均对MLAA-22无剪切作用。新的MLAA-22序列的5'端序列1-349 bp与KIAA0100 mRNA无同源性,但这一段序列与人类基因组序列完全匹配,属于MLAA-22的5'UTR(untranslated regions,UTR)。结论 MLAA-22基因cDNA全长3067 bp,5'UTR可能发生了选择性剪接,推测MLAA-22可能是一个和急性单核细胞白血病相关的新的选择性剪接变体,它参与了急性单核细胞白血病的发生,值得进一步深入研究。 展开更多
关键词 急性单核细胞白血病 mlaa-22 RACE CDNA全长 生物信息学分析
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白血病相关抗原基因MLAA-22在不同白血病细胞系中的表达 被引量:1
6
作者 崔鹤 张王刚 《内蒙古医科大学学报》 2015年第6期557-562,共6页
目的:探讨白血病相关抗原基因MLAA-22在不同白血病细胞系中的表达。方法:采用实时荧光定量PCR方法检测MLAA-22基因在不同白血病中的表达水平。结果:MLAA-22基因在各白血病细胞系均有表达。结论:MLAA-22基因表达升高可能与急性单核细胞... 目的:探讨白血病相关抗原基因MLAA-22在不同白血病细胞系中的表达。方法:采用实时荧光定量PCR方法检测MLAA-22基因在不同白血病中的表达水平。结果:MLAA-22基因在各白血病细胞系均有表达。结论:MLAA-22基因表达升高可能与急性单核细胞白血病、急性粒细胞白血病部分分化型、急性早幼粒细胞白血病、急性T淋巴细胞白血病、慢性髓细胞白血病的发生均有关。 展开更多
关键词 mlaa-22 急性单核细胞白血病 实时荧光定量 PCR
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下调MLAA-22基因对U937细胞增殖与分化的影响
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作者 崔鹤 张王刚 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期519-524,共6页
目的研究MLAA-22基因的表达下调对U937细胞增殖及分化的影响。方法采用规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关核酸酶9(Cas9)系统下调U937细胞MLAA-22基因的表达;CruiserTM酶切法检测单链引导RNA(single guide RNA,sgRNA)的活性... 目的研究MLAA-22基因的表达下调对U937细胞增殖及分化的影响。方法采用规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关核酸酶9(Cas9)系统下调U937细胞MLAA-22基因的表达;CruiserTM酶切法检测单链引导RNA(single guide RNA,sgRNA)的活性;基因突变区PCR产物的TA克隆及测序法检测MLAA-22基因的突变率;细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)检测细胞增殖;流式细胞仪检测CD11b的表达。结果CruiserTM酶切结果显示:所采用的CRISPR/Cas9系统的sgRNA序列能够高效地识别基因编辑靶点;TA克隆及测序结果显示:MLAA-22基因的突变率为61.3%;CCK-8检测结果显示:MLAA-22基因下调后,U937细胞的增殖明显受到抑制;流式细胞仪检测结果显示:MLAA-22基因下调后,CD11b阳性细胞率显著升高。结论 MLAA-22基因可能通过调控细胞分化而影响U937细胞增殖,从而促进急性单核细胞白血病的发生与发展。 展开更多
关键词 mlaa-22基因 细胞增殖 细胞分化 急性单核细胞白血病
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MLAA-22基因上游调控区的分离及启动子活性分析
8
作者 崔鹤 张王刚 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第4期489-493,共5页
目的:分离MLAA-22基因上游转录调控区序列,进行启动子活性鉴定。方法:人工合成MLAA-22基因上游转录调控区序列MLAA-22(-999^+1)和MLAA-22(-1999^+1)两个区段,将两个区段插入到双荧光素酶报告基因表达载体psi CHECK-2的BglⅡ/Nhe I限制... 目的:分离MLAA-22基因上游转录调控区序列,进行启动子活性鉴定。方法:人工合成MLAA-22基因上游转录调控区序列MLAA-22(-999^+1)和MLAA-22(-1999^+1)两个区段,将两个区段插入到双荧光素酶报告基因表达载体psi CHECK-2的BglⅡ/Nhe I限制性内切酶位点中,构建双荧光素酶报告基因表达质粒,将重组质粒分别命名为psi CHECK-2-MLAA-22(-999^+1)和psi CHECK-2-MLAA-22(-1999^+1);采用双荧光素酶报告基因系统检测所分离区段的启动子活性。结果 :MLAA-22(-999^+1)和MLAA-22(-1999^+1)两个区段均具有较强的相对荧光素酶活性,并且MLAA-22(-999^+1)区段的相对荧光素酶活性明显高于MLAA-22(-1999^+1)区段。结论:MLAA-22基因上游转录调控区(-999^+1)区段将是今后我们进行MLAA-22基因上游转录调控区启动子活性研究的重点区域。 展开更多
关键词 mlaa-22基因 转录调控区 双荧光素酶报告基因 启动子
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微小RNA-22对妊娠糖尿病患者糖代谢的影响 被引量:3
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作者 李伟 曾一文 +2 位作者 王婧 胡可胜 杨莉 《武警医学》 CAS 2023年第2期93-96,103,共5页
目的探索微小RNA-22(miR-22)对妊娠糖尿病(GDM)患者糖代谢的影响。方法收集2018-01至2019-01在武警广东总队医院就诊的75例妊娠糖尿病孕妇组的胎盘组织作为观察组(GDM组),75例正常妊娠孕妇作为对照组(HC组)。培养人绒毛膜HTR8/Svneo细... 目的探索微小RNA-22(miR-22)对妊娠糖尿病(GDM)患者糖代谢的影响。方法收集2018-01至2019-01在武警广东总队医院就诊的75例妊娠糖尿病孕妇组的胎盘组织作为观察组(GDM组),75例正常妊娠孕妇作为对照组(HC组)。培养人绒毛膜HTR8/Svneo细胞建立细胞模型,检测胎盘绒毛组织和细胞的miR-22表达。用人工合成的miR-22类似物和抑制物(反义寡核苷酸)转染HTR8/Svneo细胞,葡萄糖氧化酶法检测体外细胞摄取葡萄糖能力,Western blot检测细胞胰岛素信号通路上的PI3K、AKT、IRS、萄糖转运体4(GLUT4)的表达。设计构建含目的基因野生型和突变型的质粒,双荧光素酶报告基因系统分析miR-22与靶基因的关系。结果GDM胎盘组织和高糖组细胞中miR-22表达均明显低于对照组(P<0.05),miR-22表达与胰岛素抵抗指数呈负相关。GDM组织的IRS、PI3K、AKT、Glut4蛋白表达水平明显低于对照组;miR-22表达时,HTR8/Svneo细胞摄糖升高,Glut4表达升高,miR-22表达抑制时,细胞摄糖减少,GLUT4表达下降;miR-22过表达或抑制时,IRS、PI3K、AKT表达明显降低。双荧光素酶报告基因系统实验显示SLC2A4基因(编码GLUT4)是miR-22调节靶点。结论发生胰岛素耐受时,胎盘绒毛组织和细胞miR-22表达下降,miR-22过表达可以提高体外细胞摄取糖水平,miR-22可能通过调节GLUT4而参与GDM的发病机制。 展开更多
关键词 妊娠糖尿病 微小RNA-22 葡萄糖转运体4 双荧光素酶报告基因
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哮喘患儿IL-22、RAD50基因多态性与易感性的关系
10
作者 侯颖莹 赵惯军 +1 位作者 贾耀丽 王艳 《西南医科大学学报》 2023年第3期242-246,共5页
目的探讨哮喘患儿白介素-22(IL-22)、RAD50基因多态性与疾病易感性的关系。方法选取2019年1月至2021年1月河南省平顶山市第一人民医院收治的哮喘患儿76例作为观察组,另选取同期体检健康的儿童62例作为对照组,收集两组背景资料,以聚合酶... 目的探讨哮喘患儿白介素-22(IL-22)、RAD50基因多态性与疾病易感性的关系。方法选取2019年1月至2021年1月河南省平顶山市第一人民医院收治的哮喘患儿76例作为观察组,另选取同期体检健康的儿童62例作为对照组,收集两组背景资料,以聚合酶链式反应结合直接测序法检测IL-22(rs17224704位点、rs2227473位点)、RAD50(rs6871536位点、rs17166050位点)基因多态性,并对影响儿童哮喘的发生因素进行回归分析。结果两组出生方式、1岁内抗生素使用次数、饲养宠物、家族过敏史、家族哮喘史、被动吸烟等项目比较差异有统计学意义(P<0.05);两组IL-22基因rs17224704位点、rs2227473位点等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05),RAD50基因rs6871536位点、rs17166050位点基因型、等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05);rs17224704位点、rs2227473位点存在交互作用(P<0.05);Logistic回归分析显示,有家族过敏史、家族哮喘史儿童发生哮喘的风险增加(P<0.05),IL-22基因rs17224704位点携带等位基因A的儿童发生哮喘风险较携带T的儿童增加(P<0.05),RAD50基因rs6871536位点携带等位基因C的儿童发生哮喘风险较携带T的儿童增加(P<0.05)。结论IL-22基因rs17224704位点基因多态性、RAD50基因rs6871536位点基因多态性与儿童哮喘的易感性密切相关。 展开更多
关键词 哮喘 儿童 基因多态性 白介素-22 RAD50
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LncRNA MIR22HG调节miR-132-3p/TLR2轴对急性心肌梗死小鼠心肌细胞凋亡和心室重构的影响
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作者 李延民 冯艳 +1 位作者 魏燕云 王献忠 《广西医科大学学报》 CAS 2023年第7期1123-1131,共9页
目的:探讨长链非编码RNA miR-22宿主基因(lncRNA MIR22HG)调节miR-132-3p/Toll样受体2(TLR2)轴对急性心肌梗死(AMI)小鼠心肌细胞凋亡和心室重构的影响。方法:取C57BL/6J小鼠随机分为sham组、AMI组、AMI+sh-NC组、AMI+shMIR22HG组、AMI+s... 目的:探讨长链非编码RNA miR-22宿主基因(lncRNA MIR22HG)调节miR-132-3p/Toll样受体2(TLR2)轴对急性心肌梗死(AMI)小鼠心肌细胞凋亡和心室重构的影响。方法:取C57BL/6J小鼠随机分为sham组、AMI组、AMI+sh-NC组、AMI+shMIR22HG组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-NC组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-132-3p组,每组10只,除去sham组外,其它组都进行冠状动脉左前降支结扎,sham组只开胸不结扎冠状动脉,其中AMI+sh-NC组、AMI+sh-MIR22HG组、AMI+shMIR22HG+antagomir-NC组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-132-3p组小鼠分别相对应的对尾静脉注射sh-NC、sh-MIR22HG、sh-MIR22HG+antagomir-NC、sh-MIR22HG+antagomir-132-3p。超声心动图评估小鼠心室重构和心脏功能;HE染色和Masson染色观察心肌组织病理学变化及纤维化;RT-qPCR检测心肌组织MIR22HG、miR-132-3p表达;TUNEL法检测心肌细胞凋亡;Western blotting检测心肌组织B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、激活型半胱氨酸蛋白酶-3(cleved caspase-3)/半胱氨酸蛋白酶-3(caspase-3)、Ⅰ型胶原蛋白(collagenⅠ)、collagenⅢ和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达;双荧光素酶报告基因实验分别验证MIR22HG和miR-132-3p、miR-132-3p和TLR2的关系。结果:与sham组比较,AMI组小鼠心功能显著降低,心肌组织损伤、心肌纤维化加重,心肌细胞凋亡率、MIR22HG、TLR2、cleved caspase-3/caspase-3、collagenⅠ、collagenⅢ和α-SMA蛋白表达水平显著升高,miR-132-3p和Bcl-2蛋白表达降低(P<0.05);与AMI+sh-NC组比较,AMI+sh-MIR22HG组小鼠心功能改善,心肌组织损伤、心肌纤维化减轻,心肌细胞凋亡率、MIR22HG、TLR2、cleved caspase-3/caspase-3、collagenⅠ、collagenⅢ和α-SMA蛋白表达水平显著降低,miR-132-3p和Bcl-2蛋白表达上升(P<0.05);下调miR-132-3p减弱了敲减MIR22HG对心肌组织的保护作用;双荧光素酶报告基因实验结果显示,MIR22HG靶向调控miR-132-3p表达,miR-132-3p靶向负调控TLR2表达。结论:抑制MIR22HG表达可通过调节miR-132-3p/TLR2轴抑制AMI小鼠心肌细胞凋亡,改善小鼠心室重构。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 lncRNA MIR22HG miR-132-3p TLR2 细胞凋亡 心室重构
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Cloning and Character Analysis of A Novel Testis-specific Gene,TSF22,in Mice 被引量:2
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作者 Ai-fa TANG Zhen-dong YU +3 位作者 Yao-ting GUI Xin GUO Xin GAO Zhi-ming CAI 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2007年第1期11-18,共8页
Objective To identify genes that involved in spermatogenesis. Methods In order to screen the testis-specific genes, testes cDNA samples from BALB/c mice of different postnatal days (days 4, 9, 18, 35, 54 and 6 months... Objective To identify genes that involved in spermatogenesis. Methods In order to screen the testis-specific genes, testes cDNA samples from BALB/c mice of different postnatal days (days 4, 9, 18, 35, 54 and 6 months) were performed with mouse whole genome Affymetrix chip. The characteristics of the selected gene were analyzed by various bioinformatic tools. The expression profile of the selected gene was identified by RT-PCR. Results By analyzing the hybridization signals, a gene with a differential expression in the developmental stages of testis was identified. This gene was designated as TSF22. The full length cDNA of 1 597 bp contained an open reading frame of 570 bp which encoded a putative protein of 190 amino acids and a molecular weight of 22.106 kD. RT-PCR analysis revealed that TSF22 mRNA was exclusively expressed in mice testis. Conclusions TSF22, functions as a testis-specific transcription factor, may play important roles during spermatogenesis. 展开更多
关键词 gene chip TSF22 gene SPERMATOgeneSIS
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Identification of Differentially Expressed Genes Associated with Cotton Fiber Development in a Chromosomal Substitution Line(CS-B22sh) 被引量:4
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作者 SOLIMAN Khairy M BOLTON James J SAHA Sukumar JENKINS Johnie N 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期36-,共1页
One of the impediments in the genetic improvement of cotton fiber is the paucity of information about genes associated with fiber development.Availability of chromosome arm substitution line CS-
关键词 CS-B22sh Identification of Differentially Expressed genes Associated with Cotton Fiber Development in a Chromosomal Substitution Line LINE
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The Anti-tumor Immunity of Dendritic Cells Modified by IFN γ Gene on Mice Bearing Ascite Hepatoma Cell H22
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作者 Zi-You CUI Hong-Yan YANG You-Tian HUANG Zhi-min ZHENGMing-Yao ZHAO Zi-Ming DONG(Department of Pathophysiology, Basic Medical College, Zhengzhou University, Zhengzhou 450052,China) 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第S1期109-110,共2页
关键词 The Anti-tumor Immunity of Dendritic Cells Modified by IFN gene on Mice Bearing Ascite Hepatoma Cell H22 Cell
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ZBTB18基因突变致常染色体显性遗传智力低下22型1例并文献复习
15
作者 李毅 周正 +1 位作者 郭智丹 陆相朋 《疑难病杂志》 CAS 2023年第3期320-321,共2页
报道1例常染色体显性遗传智力低下22型患者的临床资料,并进行文献复习。
关键词 常染色体显性遗传智力低下22 ZBTB18基因 智力障碍 运动发育迟缓 语言发育落后
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精细定位和克隆9p21-22区域内鼻咽癌候选抑瘤基因 被引量:34
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作者 阳剑波 宾亮华 +7 位作者 李忠花 张小慧 钱骏 张必成 周鸣 谢奕 邓龙文 李桂源 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期6-9,共4页
目的:进一步精细限定鼻咽癌9p21-22区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,筛选和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法:应用11个定位于 9p21-22区域的高密度微卫星位点,检测 25例低分化鼻咽癌患者的... 目的:进一步精细限定鼻咽癌9p21-22区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,筛选和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法:应用11个定位于 9p21-22区域的高密度微卫星位点,检测 25例低分化鼻咽癌患者的杂合性丢失,确定其共同缺失区;用RT-PCR和Northern筛出在鼻咽癌细胞株HNE1和鼻咽癌活检组织中表达下调的、定位于共同缺失区内的 3’末端ESTs(Express Sequence Tags);采用 RACE技术和生物信息学资源克隆出候选EST的全长cDNA。结果: 25例患者中有17例(68%)存在一个或多个位点的杂合性丢失,其中D9s161(35.0%,7/20),D9S1678(31.5%,6/19),D9S263(3.3%,6/18)和D9S1853(33.3%,7/21)四个紧邻位点的丢失频率相对较高,并发现六位患者在该四个位点表现为连续性缺失;筛选D9S161-D9S1853区域内25个代表新基因的3’末端ESTs序列,发现一个EST(dbEST:208825)在鼻咽癌细胞株HNE1及73%(11/15)的活检组织中表达降低, Multiple Tissue Nort 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 染色体 9p21-22 杂合性丢失 克隆
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小麦品种中梁22抗条锈病基因的遗传分析和分子作图 被引量:25
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作者 杨敏娜 徐智斌 +3 位作者 王美南 宋建荣 井金学 李振岐 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1280-1284,共5页
对中梁22/铭贤169杂交F2群体苗期抗条锈病鉴定及中国春单体系抗病基因的染色体定位发现,中梁22携带1个显性(暂命名YrZhong22)和1个隐性抗病基因,前者位于5B染色体。由中梁22×铭贤169的F2群体构建抗病、感病池,用SSR标记结合集群分... 对中梁22/铭贤169杂交F2群体苗期抗条锈病鉴定及中国春单体系抗病基因的染色体定位发现,中梁22携带1个显性(暂命名YrZhong22)和1个隐性抗病基因,前者位于5B染色体。由中梁22×铭贤169的F2群体构建抗病、感病池,用SSR标记结合集群分离分析法(BSA),建立了与YrZhong22连锁的4个微卫星标记Xwmc289、Xwmc810、Xgdm116和Xbarc232,并将YrZhong22定位于小麦5BL染色体。YrZhong22与相邻微卫星位点Xwmc810和Xgdm116的遗传距离分别是2.7cM和4.4cM。系谱分析及分子标记分析表明,YrZhong22可能是一个来自中间偃麦草的新抗条锈病基因。 展开更多
关键词 中梁22 小麦条锈病 抗病基因 遗传分析 单体分析 分子作图
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重组人白介素-22生物学活性检测方法研究 被引量:3
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作者 张军要 黄智华 +4 位作者 黄予良 许飞 李晓颖 邢瑞青 傅强 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期162-165,共4页
目的建立重组人白介素-22(IL-22)生物学活性的检测方法。方法将pSTAT3-TA-Luc质粒与pcDNA3.1质粒共转染HepG2细胞,经G418筛选出稳定转染的HepG2/STAT3细胞株。用重组人IL-22刺激细胞,定量检测荧光强度确定IL-22的活性。通过正交实验确... 目的建立重组人白介素-22(IL-22)生物学活性的检测方法。方法将pSTAT3-TA-Luc质粒与pcDNA3.1质粒共转染HepG2细胞,经G418筛选出稳定转染的HepG2/STAT3细胞株。用重组人IL-22刺激细胞,定量检测荧光强度确定IL-22的活性。通过正交实验确定最佳检测条件,观察此方法的重复性和特异性,并进行方法对比。结果最佳检测条件为细胞密度4×105/mL,加重组人IL-22刺激4h,加入萤光素酶底物50μL。本方法检测结果为半数有效量(ED50)=16.89ng/mL,变异系数(RSD)=7.09%。中和抗体实验证实其特异性好。与ELISA法比较,该方法稳定性更好,耗时少且价格更便宜。结论选择萤光素酶为报告基因,将报告基因的检测与细胞的转录诱导机制相结合,构建了生物活性检测细胞株,建立了IL-22活性检测方法。 展开更多
关键词 白介素-22 正交实验 报告基因 萤光素酶
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白介素-22基因多态性与结肠癌相关性的研究 被引量:6
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作者 林林 秦晓宁 +3 位作者 阮洪训 赵晶 郝英豪 阎庆辉 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期657-661,共5页
目的:白介素-22(interleukin-22,IL-22)是由 T 细胞和固有淋巴细胞产生的一种白介素-10(interleukin-10,IL-10)家族细胞因子,与炎症形成和肿瘤的发生密切相关。本研究旨在探讨 IL-22 基因多态性与中国人群结肠癌的关系。方法:采用病例... 目的:白介素-22(interleukin-22,IL-22)是由 T 细胞和固有淋巴细胞产生的一种白介素-10(interleukin-10,IL-10)家族细胞因子,与炎症形成和肿瘤的发生密切相关。本研究旨在探讨 IL-22 基因多态性与中国人群结肠癌的关系。方法:采用病例对照研究的方法,收集结肠癌患者 540 例和健康对照组 540 例,用 5’端核酸外切酶法分析 IL-22 基因 3 种常见多态性(-429 C/T、+1046 T/A 和+1995A/C)。分类变量间的差异采用 Pearson 卡方检验,Student’s t 检测连续变量间的差异。结果:结肠癌患者中IL-22-429 TT 基因型出现频率明显增高(OR=1.69,95%CI=1.24~2.30,P=0.001),-429T 等位基因(OR=1.35,95%CI=1.14~1.60, P=0.001)。此结果经过 Bonferroni 校正依然有统计学意义(P<0.017)。进一步分层研究后发现分化低的结肠癌患者相对于中高级别分化的结肠癌患者 IL-22 -429 TT 基因型频率较高(OR=1.45,95%CI=1.02~2.07,P=0.040),而-429 C/T 基因多态性与结肠癌的部位、肿瘤大小、生长方式和 TNM 分期无关。 IL-22+1046 T/A 及 IL-22+1995 A/C 基因多态性与结肠癌无关(P=0.980,P=0.750)。结论:IL-22-429C/T 基因多态性可能与结肠癌有关。 展开更多
关键词 IL-22 结肠癌 基因多态性 病例对照研究 5'端核酸外切酶法
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四川小麦条锈病菌贵农22致病类群流行对小麦品种抗性的影响 被引量:8
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作者 徐志 王胜 +4 位作者 姬红丽 倪建英 尹勇 沈丽 彭云良 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第12期2845-2853,共9页
为了解小麦条锈病菌贵农22致病类群在四川流行后小麦品种田间抗性表现,将134份抗条锈基因载体材料和84份四川小麦生产品种,播种于四川省盐亭县黄溪乡、郫县太清镇和江油市武都镇病圃,乳熟后期调查。结果表明,Lee(Yr7,Yr22,Yr23,YrLe1,Yr... 为了解小麦条锈病菌贵农22致病类群在四川流行后小麦品种田间抗性表现,将134份抗条锈基因载体材料和84份四川小麦生产品种,播种于四川省盐亭县黄溪乡、郫县太清镇和江油市武都镇病圃,乳熟后期调查。结果表明,Lee(Yr7,Yr22,Yr23,YrLe1,YrLe2)、Heines Kolben(Yr2,Yr6)、T.spelta album(Yr5)、Hybrid 46(Yr3b,Yr4b,YrH46)、Hobbit(Yr3,Yr4)、VPM1(Yr17)、Renan、Alba(YrAlba)、Avocet S*6/Yr15、Jupateco R Yr18、Kalyansona Yr2、Palula Yr30、Opata 85 YrSk、C591(Yr591)、Armada、Reichersberg 42和中四等17份材料,川麦45、川麦58、川农19、川农27、川育18、川育20、川育23、国豪麦3号、绵麦43、绵阳29号、先麦99和玉脉1号等12份四川小麦生产品种,连续两年中在各病圃均表现抗病;该致病类群流行前表现抗病的贵农22(Yr10)、兰天17(Yr26)和铭贤169*6/Yr10等材料和品种的抗性已丧失作用。品种抗性监测结果表明,贵农22致病类群流行过程中毒性不断增强。 展开更多
关键词 小麦条锈病菌 贵农22致病类群 品种 基因 抗性丧失.
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