miR-142-3p靶向调控mll-af4融合基因的实验研究

本研究探讨mll-af4融合基因的表观遗传学调控机制,以筛选靶向调控mll-af4融合基因的microRNA。利用Targetscan在线分析软件预测特异性靶向mllaf4基因3′端非翻译区域(3′-untranslated region,3′UTR)的microRNA,采用PCR方法从1例健康供者DNA中扩增mll-af4基因3′UTR序列,插入经EcoRI和PstI双酶切的荧光素酶报告载体pGL3-M,采用脂质体SuperFect包裹荧光素酶重组质粒及microRNA表达质粒转染293T细胞,应用双荧光素酶检测试剂盒测定荧光素酶活性。miR-142-3p mimics以脂质体Hiperfect转染至RS4;11细胞,选用实时定量PCR及Western blot检测mll-af4 mRNA及蛋白的表达。结果表明,成功构建了含有1935bp、2104bp和1371bp的mll-af4基因3′UTR序列的荧光素酶报告重组质粒pGL3-AF4-3′UTR,并通过酶切及基因测序方法鉴定得到证实。荧光素酶报告实验提示,miR-142组荧光素酶活性明显低于对照组。RS4;11细胞中过表达miR-142-3p可以明显下调MLL-AF4融合蛋白及mRNA表达。结论:miR-142-3p通过靶向结合mll-af4基因3′UTR的结合位点特异调控mll-af4基因表达。

MLL-AF4融合基因阳性初治急性淋巴细胞白血病患者临床特征及预后分析

目的探讨MLL-AF4融合基因阳性在初治急性淋巴细胞白血病(ALL)中的发生情况,分析MLL-AF4融合基因阳性ALL患者的临床特征及预后情况。方法回顾性分析驻马店市中心医院2010年2月至2021年2月收治的455例原发初治ALL患者的临床资料。采用荧光原位杂交检测患者是否存在MLL基因重排,采用多重巢式反转录聚合酶链反应检测患者MLL-AF4融合基因阳性发生情况,比较MLL-AF4融合基因阳性与阴性患者的临床特征及预后。结果455例原发初治ALL患者中,MLL基因重排阳性30例(6.6%),其中MLL-AF4融合基因阳性21例(MLL-AF4阳性组),MLL-ENL融合基因阳性6例,MLL-AF9融合基因阳性2例,MLL-AF10融合基因阳性1例。随机选取同期未检出任何融合基因的60例ALL患者作为MLL-AF4阴性组。MLL-AF4阳性组的肝或脾大、中枢神经系统(CNS)侵犯者比例及中位外周血白细胞计数、中位外周血幼稚细胞绝对值均高于MLL-AF4阴性组(均P<0.05)。MLL-AF4阳性组与阴性组化疗第15天完全缓解率分别为81.0%(17/21)、90.0%(54/60)(χ^(2)=0.49,P=0.484),3个月累积复发率分别为38.1%(8/21)、13.3%(8/60)(χ^(2)=4.56,P=0.033)。MLL-AF4阳性组总生存差于MLL-AF4阴性组(χ^(2)=5.93,P=0.015)。结论MLL-AF4融合基因阳性ALL患者较阴性患者初诊时肿瘤负荷高,复发率高,总生存率低,预后较差。

基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测

针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。

实时荧光定量PCR检测急性髓系白血病患者MLL-AF9融合基因表达的预后意义

本研究旨在探讨急性髓系白血病(AML)患者治疗过程中,应用实时荧光定量PCR(RQ-PCR)检测混合谱系白血病(MLL)的相关融合基因MLL-AF9的基因表达水平及其对监测微小残留病(MRD)的价值。应用RQ-PCR精确地定量检测433例初治AML患者中11例MLL-AF9融合基因阳性患者的表达水平,分析该基因表达水平的变化与临床表现的关系。结果显示:患者MLL-AF9融合基因表达水平初诊时为(1.3-55.28)%;5例单纯化疗患者之中有2例在第1个疗程结束后至第2疗程开始前,该融合基因表达水平<0.1%,2例全部获得血液学完全缓解且存活;3例MLL-AF9融合基因≥0.1%,均未获得血液学完全缓解且仅1例存活。6例造血干细胞移植患者中,有4例在移植前1个月内该融合基因表达水平<0.1%,全部患者存活且无复发;2例≥0.1%,均在移植后复发、死亡,且在骨髓细胞形态学复发前1个月内该基因表达水平均≥0.1%。结论:RQ-PCR检测MLL-AF9融合基因可以反映患者MRD的动态变化,与患者的临床预后存在内在相关性,是检测预后的良好指标。此外,RQ-PCR可能有早期检测分子生物学复发的潜力。

EGFR突变的非小细胞肺癌患者EML4-ALK融合基因的检测及其临床特征分析

目的:检测EML4-ALK融合基因在表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变的非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)人群中的突变率,并分析其与临床特征的关系。方法:入选的102例NSCLC患者均为中国人,且至少满足以下1个入选条件:女性、不吸烟/少吸烟和肺腺癌。将102例患者的组织标本采用多重逆转录聚合酶链反应(multiplex RT-PCR)的方法检测其EML4-ALK融合基因的突变率;对EML4-ALK阳性患者的组织标本采用DNA扩增后直接测序的方法来检测其EGFR(18～21号外显子)及Kirsten鼠肉瘤基因(Kirsten rat sarcoma,KRAS)(1、2号外显子)的突变情况。结果:102例非小细胞肺癌患者的组织标本,有8例(7.8%)存在EML4-ALK融合基因突变,其中7例为突变体1(variant 1,V1),1例为突变体2(vari-ant 2,V2);这8例EML4-ALK阳性患者组织标本的EGFR(18～21号外显子)及KRAS(1、2号外显子)均为野生型。8例阳性患者中,5例患者的年龄小于总体患者的平均年龄(59±10)岁,占62.5%(5/8);女性患者6例,占75%(6/8);不吸烟患者7例,占87.5%(7/8);腺癌患者5例,占62.5%(5/8)。结论:EML4-ALK融合基因突变代表了NSCLC的一个新的分子亚型,EML4-ALK突变与EGFR及KRAS突变是不共存的。

猪囊尾蚴抗原与猪白细胞介素-4基因融合DNA疫苗载体的构建

目的： 为增强猪囊尾蚴抗原ｃ Ｃ１ 的免疫保护作用而构建一表达猪白细胞介素４（ Ｉ Ｌ４）与 ｃ Ｃ１ 抗原融合蛋白的 Ｄ Ｎ Ａ 疫苗载体。方法： 通过聚合酶链反应（ Ｐ Ｃ Ｒ），分别扩增猪 Ｉ Ｌ４ｃ Ｄ Ｎ Ａ 和ｃ Ｃ１ｃ Ｄ Ｎ Ａ 片段并进行融合，获得的嵌合基因 Ｉ Ｌ４ｃ Ｃ１ 中含有１０ 个氨基酸的中间接头序列，同时对其５’ Ａ Ｕ Ｇ 侧翼序列进行翻译优化突变。结果：经酶切鉴定，证实有一１．５ ｋｂ 的片段插入载体，其 Ｄ Ｎ Ａ 序列分析结果与文献报道和实验设计完全一致。结论：表达猪 Ｉ Ｌ４ 与猪囊尾蚴抗原ｃ Ｃ１ 融合蛋白的 Ｄ Ｎ Ａ 疫苗载体构建成功。

猪白细胞介素4,6融合基因和CpG基序对猪蓝耳病疫苗免疫的强化效应

为探索新型高效安全的猪蓝耳病疫苗免疫佐剂,本实验用离子交联法制备壳聚糖纳米颗粒包裹猪融合基因PIL-46和CpG基序的真核表达质粒(CNP-(VRIL-46+VR1C)),将CNP-(VRIL-46+VR1C)肌注接种过猪蓝耳病灭活苗的长白川白杂交猪,接种后1、2、4、6和8周采取实验猪静脉血,用Sandwich ELISA检测血清中白细胞介素2(IL-2)、IL-4、IL-6和IgG、IgA、IgM及特异抗体的含量,同时检测外周血液免疫细胞数量的变化。结果发现实验猪接种CNP-(VRIL-46+VR1C)后1～8周内,其血清中IL-2、IL-4、IL-6和IgG、IgA、IgM及特异抗体的含量较对照组均显著增多(P<0.05),淋巴细胞和单核细胞数量也明显升高(P<0.05)。这些表明接种CNP-(VRIL-46+VR1C)的实验猪的特异体液和细胞免疫水平均显著多于对照组,提示PIL-46基因和CpG基序组合能显著增强猪的特异体液和细胞免疫机能,明显提高其免疫防御力,具有研制为高效安全的分子免疫增强剂的应用前景。

EGFP-IgG4融合基因真核表达载体的构建及其表达

构建增强型绿色荧光蛋白(Enhanced Green Fluorescent Protein,EGFP)和IgG4基因的融合蛋白真核表达载体pMM-EGFP-IgG4/WG,转染至中华仓鼠卵巢细胞(Chinese HamsterOvary,CHO)中成功表达,并发出绿色荧光,证明pMM-EGFP-IgG4/WG是一种良好的生产分泌型外源融合蛋白的阳性对照.

浙江省非小细胞肺癌患者EGFR基因与EML4-ALK融合基因突变的检测及其临床特征

目的 :检测中国人非小细胞肺癌表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因和棘皮动物微管相关蛋白样-4与渐变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因的突变情况,同时分析这两种基因与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)临床病理特征的关系。方法 :采用PCR扩增和基因测序法检测252例NSCLCs EGFR基因外显子19和21的突变情况,real-time PCR法检测EML4-ALK融合基因的突变情况,分析突变与临床特征的关系。结果:252例非小细胞肺癌组织标本EGFR的突变率为38.8%(98例),其中19外显子突变率为15.8%(40例),21外显子突变率为23.0%(58例)。EGFR突变的患者多为女性、无吸烟史和腺癌(P<0.05),与患者年龄无关(P>0.05)。252例非小细胞肺癌组织标本中,EML4-ALK融合基因突变率4.7%(12例)。EML4-ALK基因突变患者多为女性和年龄较小者(P<0.05),与患者吸烟史和病理类型无关(P>0.05)。没有检测到EGFR和EML4-ALK的突变共存情况。结论:中国人中NSCLCs的EGFR突变率较高,在使用EGFR酪氨酸激酶抑制剂治疗前进行EGFR基因突变检测很有必要。EML4-ALK基因突变代表了NSCLC另一种分子亚型,这为临床NSCLC患者的治疗提供了一种新的选择方案。EML4-ALK融合基因突变与EGFR突变共存是罕见的现象。

梅花鹿S100A4基因的克隆及融合蛋白的表达

为了研究梅花鹿S100A4(S100 calcium binding protein A4)基因在鹿茸生长过程中的作用。用RT-PCR法从生茸骨膜细胞总RNA中克隆了梅花鹿S100A4基因,在NCBI中对基因序列进行比对;将完整的基因序列与逆转录病毒表达载体pLEGFP-C1重组,获得了重组质粒pLEGFP-S100;用脂质体法将pLEGFP-S100与pVSV-G(被膜载体)共转染包装细胞GP2-293,获得重组病毒上清液,感染角柄骨膜细胞后逆转录病毒携带的基因进入宿主细胞。结果显示:S100A4基因是一个相对保守的基因,与多个物种的匹配度达到90%;重组逆转录病毒载体pLEGFP-S100可以形成重组逆转录病毒粒子,将S100A4基因导入靶细胞,并表达S100A4与GFP(Green fluores-cent protein)的融合蛋白。

猪带绦虫TSO45W-4B-TSOL18融合基因在长双歧杆菌中的表达

目的在成功构建猪带绦虫大肠杆菌-双歧杆菌穿梭表达质粒pGEX-TSO45W-4B-TSOL18的基础上,研究猪带绦虫TSO45W-4B-TSOL18融合基因在长双歧杆菌中的表达情况。方法将猪带绦虫大肠杆菌-双歧杆菌穿梭表达质粒pGEX-TSO45W-4B-TSOL18电转化入长双歧杆菌,IPTG诱导表达,SDS-PAGE和Western blot分析表达情况。结果酶切、PCR和测序证实,重组质粒pGEX-TSO45W-4B-TSOL18成功转入长双歧杆菌。SDS-PAGE显示,重组蛋白相对分子质量(Mr)约为55kD,与预期结果相一致。Western blot显示,重组蛋白能被兔抗血清、囊虫病猪血清和囊虫病患者血清所识别。结论猪带绦虫TSO45W-4B-TSOL18融合基因能够在长双歧杆菌中获得表达,表达的重组蛋白具有特异的抗原性。

非小细胞肺癌患者EML4-ALK融合基因突变研究

背景与目的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌的主要类型,相关位点突变检测研究已经成为肺癌分子靶向治疗的热门方向,研究NSCLC肿瘤组织中动物微管相关蛋白4与间变性淋巴瘤激酶融合基因(echinodem microtubule associated protein like 4-Anaplastic lymphoma kinase,EML4-ALK)与表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)的基因突变状态,比较免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)与蝎形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions amplification refractory mutation system,Scorpions ARMS)荧光定量PCR与荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测EML4-ALK融合基因与EGFR基因突变的敏感性。方法应用IHC、ARMS荧光定量PCR及FISH技术检测85例NSCLC石蜡包埋肿瘤组织以及癌旁正常肺组织中EML4-ALK融合基因状态,并应用ARMS方法检测EGFR基因第18、19、20和21外显子突变状态。结果 115例NSCLC中IHC显示32例有ALK(D5F3)表达,表达率为27.8%;ARMS检测27例存在EML4-ALK融合基因突变,突变检出率为23.5%;53例检出EGFR突变,突变率为46%。而FISH检测23例存在EML4-ALK融合基因突变,检出率为20%,稍低于ARMS检测结果,提示ARMS的敏感度更高。结论联合运用IHC/ARMS荧光定量PCR/FISH技术能够对EML4-ALK融合基因状态做出快速、准确评价。

新城疫病毒HN基因与T4噬菌体SOC基因在大肠埃希氏菌中的融合表达

用RT PCR方法扩增了新城疫病毒 (NDV)的完整HN基因序列 ;设计了 1对带有EcoRⅠ限制位点的引物 ,用PCR扩增出了HN基因片段。将该片段克隆至 pSOC质粒SOC基因 3′端 ,成功构建了重组质粒pSOC HN。用该重组质粒转化E .coliBL 2 1(DE3)感受态细胞 ,以终浓度 1mmol/mL的IPTG诱导表达。在SDS PAGE凝胶上可检测到分子质量约 6 7ku的特异条带 ,蛋白质印迹法证实 。

非小细胞肺癌治疗的新靶点:EML4-ALK融合基因

3年前棘皮动物微管相关类蛋白4(echinoderm microtubule-associated protein-like 4,EML4)与间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合基因被发现存在于部分非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中。该融合基因常见于不吸烟的肺腺癌患者,有其独特的病理学特征,可以诱导肿瘤生成。ALK抑制剂能够作用于该基因的下游信号传导通路并拮抗其促肿瘤生成活性。本文旨在介绍EML4-ALK基因的结构、功能、生物学特征、检测方法及其在肺癌诊断治疗中的意义。

非小细胞肺癌EML4-ALK融合基因检测结果的初步分析

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织棘皮动物微管样蛋白4-间变淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因的突变情况,及其与NSCLC临床病理特征和预后的关系。方法采用突变扩增阻滞系统检测26例NSCLC组织中EML4-ALK融合基因的9种突变和表皮生长因子受体(EGFR)的18、19、20、21外显子突变,进一步分析EML4-ALK融合基因突变与NSCLC临床病理特征和总生存期(OS)的关系。结果 26例NSCLC患者中检测到6例EML4-ALK融合基因突变。EML4-ALK融合基因突变与年龄、吸烟史、临床分期、组织分化和EGFR突变有关,与病理类型、性别、标本类型和血清癌胚抗原无关(P>0.05)。EML4-ALK融合基因阳性者的中位OS为9个月,低于阴性者的12个月,但差异无统计学意义(P=0.460)。结论 NSCLC中EML4-ALK融合基因突变多见于无吸烟史或少量吸烟、年龄较小、临床分期较晚、组织分化较差、无EGFR突变的患者。

非小细胞肺癌患者EML4-ALK融合基因的检测及其临床病理特征分析

目的：检测EML4-ALK融合基因在非小细胞肺癌（NSCLC）人群中的突变率,并分析其与临床病理特征的关系。方法：采用逆转录定量PCR检测66例NSCLC患者组织标本中EML4-ALK融合基因的突变率;采用DNA扩增后直接测序的方法检测EML4-ALK阳性患者的组织标本中EGFR基因（18~21号外显子）及K-Ras基因（2号外显子）的突变情况。结果：66例NSCLC患者的组织标本中,有5例（7.6%）存在EML4-ALK融合基因阳性,这5例组织标本的EGFR（18~21号外显子）及K-Ras（2号外显子）均为野生型。5例阳性患者中,4例年龄小于总体患者的平均年龄（59±11）岁,占80%（4/5）;女性患者4例,占80%（4/5）;不吸烟患者3例,占60%（3/5）。EML4-ALK融合基因阳性NSCLC患者均为腺癌,1例NSCLC组织为腺泡样结构,3例组织为印戒细胞样结构,4例伴有胞内或胞外黏液。结论：EML4-ALK融合基因阳性NSCLC多见于年轻女性腺癌患者,多为伴有黏液产生的印戒细胞样结构,不同时合并EGFR和KRas突变。

存在EML4-ALK融合基因非小细胞肺癌患者的临床和病理学特征

研究一：Takahashi T，Sonobe M，Kobayashi M，et al．Clinicopathologic features of non—small-cell lung cancer with EML4-ALK fusion gene[J]．Ann Surg Oncol，2010，17（3）：889—897．

猪白细胞介素2与融合白细胞介素4/6基因共表达的免疫效应研究

目的构建猪融合白细胞介素4/6与猪白细胞介素2基因的共表达载体,研究其共表达对小鼠免疫的协同效应。方法以2A自剪接技术首次构建猪融合白细胞介素4/6与白细胞介素2基因的共表达重组质粒,以壳聚糖纳米材料包裹制成纳米颗粒,进行体外转染HEK293细胞,提取总RNA进行RT-PCR分析,最后肌肉注射小鼠进行体内实验并分析。结果成功构建了重组共表达质粒VRIL4/6-2;壳聚糖包裹后转染HEK293细胞,48 h后收集细胞,RT-PCR检测显示目的基因能够在HEK293细胞中高效地转录与表达。小鼠接种实验结果表明,实验组血清中的IgG和IgG2a的含量比对照组显著增加,并且VRIL4/6-2-CS接种组的小鼠体液免疫水平明显增高(P<0.05);VRIL4/6-2实验组的CD4+淋巴细胞显著多于其它实验组(P<0.05);实验组IL-2、IL-4、IL-6、IL-23基因的表达水平明显高于对照组(P<0.05),实验组小鼠外周血白细胞、血小板和血红蛋白的含量均显著高于对照组(P<0.05)。结论 VRIL4/6-2共表达质粒能够更好的增强动物体液免疫和细胞免疫机能,可作为提高动物体液免疫和细胞免疫的经济高效安全新型免疫调节剂,具有潜在的重要应用前景。

旁路信号通路激活介导的EML4-ALK融合基因阳性肺癌细胞株H3122对alectinib继发耐药的研究

目的:本研究旨在探讨肝细胞生长因子(HGF)、表皮生长因子(EGF)及转化生长因子α(TGF-α)是否以旁路激活的方式诱导EML4-ALK融合基因阳性肺癌细胞株H3122对alectinib的耐药,并进一步探讨旁路信号激活在alectinib耐药中的作用。方法:用不同浓度的alectinib、克唑替尼(crizotinib)、17-DMAG或(和)HGF(50μg/L)、EGF(100μg/L)、TGF-α(100μg/L)处理EML4-ALK阳性肺癌细胞株H3122,采用CCK-8法检测细胞活力,流式细胞术检测细胞凋亡,应用Western blot技术检测细胞中ALK、c-Met、EGFR及相应磷酸化蛋白的表达,观察其下游通路关键蛋白AKT、ERK、p-AKT和p-ERK水平。结果:Alectinib作用72 h后,H3122细胞株的活力随着alectinib药物浓度的增加而逐渐下降,呈剂量依赖性。HGF、EGF和TGF-α诱导后,alectinib抑制H3122细胞的生长曲线往右移,HGF、EGF和TGF-α处理能够降低alectinib对肺癌细胞活力的抑制作用。0.05μmol/L alectinib作用H3122细胞株48 h后的凋亡率为(20.12±1.36)%,而alectinib联合HGF、EGF和TGF-α后的凋亡率分别为(7.85±1.03)%、(5.60±0.79)%和(4.58±1.00)%,显著低于alectinib单药处理(P<0.05)。Alectinib单药成功抑制p-ALK及其下游信号通路,HGF明显增加细胞中p-Met及其下游p-AKT、p-ERK的蛋白水平,EGF和TGF-α明显增加细胞中p-EGFR及其下游p-AKT、p-ERK的表达,alectinib抑制p-ALK,但不能抑制HGF、EGF和TGF-α诱导的pAKT和p-ERK的蛋白表达。此外,联合应用crizotinib和17-DMAG可以抑制因HGF和EGFR配体而导致的H3122耐药细胞的活力。结论:HGF、EGF和TGF-α可通过旁路激活的方式诱导EML4-ALK阳性肺癌细胞H3122对alectinib耐药,其机制可能与HGF激活c-Met磷酸化、EGF和TGF-α激活EGFR磷酸化有关。

EML4-ALK融合基因与非小细胞肺癌

非小细胞肺癌是危害人类生命最常见的恶性肿瘤之一,分子靶向治疗是目前治疗非小细胞肺癌最具前景的研究领域,如何选择合适的患者一直是靶向治疗的关键。EML4-ALK融合基因是新近发现主要表达于非小细胞肺腺癌中,可能与非小细胞肺癌EGFR-TKI耐药相关的新靶点,本文就其发现过程以及研究现状进行综述。