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大麦幼穗MLOC-14401基因编码区的同源克隆和序列分析
1
作者
彭澎
王楠
+4 位作者
陈升位
王家曦
沈真辉
李静烨
王新天
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第1期1-6,共6页
【目的】编码区序列是基因作用机制、遗传多样性和进化关系等研究的重要资源。【方法】以盐城红茎大麦、青田红大麦、淳安六棱胭脂大麦和北青7号为材料,采用同源克隆技术分离、克隆MLOC-14401基因CDS序列,利用ORF Finder、BLAST和Clusta...
【目的】编码区序列是基因作用机制、遗传多样性和进化关系等研究的重要资源。【方法】以盐城红茎大麦、青田红大麦、淳安六棱胭脂大麦和北青7号为材料,采用同源克隆技术分离、克隆MLOC-14401基因CDS序列,利用ORF Finder、BLAST和Clustal X等软件分析所克隆的CDS序列。【结果】MLOC-14401基因CDS序列全长1 248 bp、包含3个外显子、GC含量为62.82%,位于大麦3H染色体的609 892 778~609895 303 bp区间,起始密码(ATG)和终止密码序列(TAA)分别位于119 bp和1 366 bp位点。所编码多肽链包含415个氨基酸、2个MYB结构域,与普通小麦等9个物种的MYB基因编码多肽链具有不同程度的氨基酸序列相似性,保守序列位于105氨基酸与237氨基酸之间。【结论】MLOC-14401基因属大麦转录调控基因R2R3-MYB,所克隆的CDS序列对于大麦MYB基因作用机制等研究具有一定指导作用。
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关键词
大麦
mloc-
14401
基因
编码区
同源克隆
序列分析
下载PDF
职称材料
题名
大麦幼穗MLOC-14401基因编码区的同源克隆和序列分析
1
作者
彭澎
王楠
陈升位
王家曦
沈真辉
李静烨
王新天
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第1期1-6,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31460385)
文摘
【目的】编码区序列是基因作用机制、遗传多样性和进化关系等研究的重要资源。【方法】以盐城红茎大麦、青田红大麦、淳安六棱胭脂大麦和北青7号为材料,采用同源克隆技术分离、克隆MLOC-14401基因CDS序列,利用ORF Finder、BLAST和Clustal X等软件分析所克隆的CDS序列。【结果】MLOC-14401基因CDS序列全长1 248 bp、包含3个外显子、GC含量为62.82%,位于大麦3H染色体的609 892 778~609895 303 bp区间,起始密码(ATG)和终止密码序列(TAA)分别位于119 bp和1 366 bp位点。所编码多肽链包含415个氨基酸、2个MYB结构域,与普通小麦等9个物种的MYB基因编码多肽链具有不同程度的氨基酸序列相似性,保守序列位于105氨基酸与237氨基酸之间。【结论】MLOC-14401基因属大麦转录调控基因R2R3-MYB,所克隆的CDS序列对于大麦MYB基因作用机制等研究具有一定指导作用。
关键词
大麦
mloc-
14401
基因
编码区
同源克隆
序列分析
Keywords
barley
mloc-14401 gene
coding domain
homology cloning
sequence analysis
分类号
S512.303.53 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大麦幼穗MLOC-14401基因编码区的同源克隆和序列分析
彭澎
王楠
陈升位
王家曦
沈真辉
李静烨
王新天
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018
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