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2019—2022年宁夏回族自治区炭疽时空聚集性及炭疽芽孢杆菌分子分型分析
1
作者
冼然
杨聪
+7 位作者
高建炜
高磊
陈倩
赵瑜
蒯文和
樊浩浩
李筱笛
马江涛
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1235-1243,共9页
目的对2019—2022年宁夏回族自治区炭疽病例进行时空聚集性分析和同时期分离的14株炭疽芽孢杆菌进行分子分型分析。方法收集宁夏回族自治区2019—2022年发生的炭疽病例资料,以区县为单位应用SaTScan软件进行时空聚类分析;对2019—2021...
目的对2019—2022年宁夏回族自治区炭疽病例进行时空聚集性分析和同时期分离的14株炭疽芽孢杆菌进行分子分型分析。方法收集宁夏回族自治区2019—2022年发生的炭疽病例资料,以区县为单位应用SaTScan软件进行时空聚类分析;对2019—2021年分离的全部14株炭疽芽孢杆菌采用CanSNPs、MLVA-25、SNR-4方法进行分子分型分析。结果2019—2022年宁夏回族自治区共报告炭疽病80例,均为皮肤炭疽病例。SaTScan时空聚类分析显示,2021年1月1日—2022年12月31日在宁夏中北部存在时空聚集区,其中永宁县存在一类聚集区(P<0.01,RR=13.83),同期在灵武市和吴忠市利通区存在二类聚集区(P=0.022,RR=3.47)。同时期分离的14株炭疽芽孢杆菌的遗传关系被定义为:A.Br 001/002亚群、A3.b基因簇内6种不同的MLVA基因型,其中存在3个共享基因型,并分别被SNR-4分析定义为2、3、5种PHRANA基因型;SNR-4分析显示有12种SNR基因型。结论2019—2022年宁夏回族自治区炭疽病发病率呈上升趋势。2021—2022年形成炭疽病的时空聚集区的原因之一可能是自然疫源地形成和发展。通过分子分型发现,2019—2022年宁夏回族自治区分离出的菌株遗传关系较为单一,同一遗传关系下遗传多样性丰富。
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关键词
炭疽
mlva-25
CanSNPs
SNR-4
时空聚类分析
宁夏回族自治区
原文传递
题名
2019—2022年宁夏回族自治区炭疽时空聚集性及炭疽芽孢杆菌分子分型分析
1
作者
冼然
杨聪
高建炜
高磊
陈倩
赵瑜
蒯文和
樊浩浩
李筱笛
马江涛
机构
宁夏回族自治区疾病预防控制中心
宁夏医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
出处
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1235-1243,共9页
基金
宁夏自然科学基金(2022AAC03712,2023AAC02075)。
文摘
目的对2019—2022年宁夏回族自治区炭疽病例进行时空聚集性分析和同时期分离的14株炭疽芽孢杆菌进行分子分型分析。方法收集宁夏回族自治区2019—2022年发生的炭疽病例资料,以区县为单位应用SaTScan软件进行时空聚类分析;对2019—2021年分离的全部14株炭疽芽孢杆菌采用CanSNPs、MLVA-25、SNR-4方法进行分子分型分析。结果2019—2022年宁夏回族自治区共报告炭疽病80例,均为皮肤炭疽病例。SaTScan时空聚类分析显示,2021年1月1日—2022年12月31日在宁夏中北部存在时空聚集区,其中永宁县存在一类聚集区(P<0.01,RR=13.83),同期在灵武市和吴忠市利通区存在二类聚集区(P=0.022,RR=3.47)。同时期分离的14株炭疽芽孢杆菌的遗传关系被定义为:A.Br 001/002亚群、A3.b基因簇内6种不同的MLVA基因型,其中存在3个共享基因型,并分别被SNR-4分析定义为2、3、5种PHRANA基因型;SNR-4分析显示有12种SNR基因型。结论2019—2022年宁夏回族自治区炭疽病发病率呈上升趋势。2021—2022年形成炭疽病的时空聚集区的原因之一可能是自然疫源地形成和发展。通过分子分型发现,2019—2022年宁夏回族自治区分离出的菌株遗传关系较为单一,同一遗传关系下遗传多样性丰富。
关键词
炭疽
mlva-25
CanSNPs
SNR-4
时空聚类分析
宁夏回族自治区
Keywords
anthrax
twenty-five marker multi-locus variable number tandem repeat analysis
canonical single nucleotide polymorphisms
single nucleotide repeat
spatiotemporal cluster analysis
Ningxia Hui Autonomous Region
分类号
R517.2 [医药卫生—内科学]
R181.3 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
2019—2022年宁夏回族自治区炭疽时空聚集性及炭疽芽孢杆菌分子分型分析
冼然
杨聪
高建炜
高磊
陈倩
赵瑜
蒯文和
樊浩浩
李筱笛
马江涛
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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