miR-25对三阴性乳腺癌细胞增殖和凋亡的影响及潜在机制

目的:研究miR-25对人三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)细胞增殖和凋亡的影响,并初步探讨其可能机制。方法:在人TNBC细胞株MDA-MB-231中转染miR-25抑制性核苷酸(AS-miR-25)或对照核苷酸(NC oligo),通过MTT法和流式细胞术分别检测细胞的增殖和凋亡;采用实时定量PCR(qRT-PCR)和Western blot测量凋亡调节因子1(modulator of apoptosis 1,MOAP1)蛋白质和mRNA表达水平变化,采用双荧光素报告系统检测miR-25对MOAP1的直接调节。采用AS-miR-25和MOAP1 siRNA共转染MDA-MB-231细胞,MTT和流式细胞术检测细胞增殖、凋亡的变化。结果:下调miR-25后,MDAMB-231细胞的增殖能力较对照明显降低(P<0.05),凋亡显著增加(P<0.05),MOAP1 mRNA和蛋白质表达水平显著增高(P<0.05)。双荧光素报告实验显示MOAP1受miR-25的直接调节。共转染AS-miR-25和MOAP1 siRNA可显著缓解下调miR-25引起的增殖抑制和诱导凋亡。结论:miR-25可通过下调MOAP1表达水平调节TNBC细胞增殖和凋亡,提示miR-25在TNBC恶性生物学进程中可能发挥重要促进作用。

ATRNL1在阿尔茨海默病中的基因功能分析及ceRNA网络预测

目的:通过对ATRNL1基因的生物信息学分析,明确其在阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)中的作用。方法:通过高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库下载AD芯片数据GSE36980、GSE1297和GSE28146,利用3个独立数据验证ATRNL1在AD中的差异表达情况,并计算Pearson相关系数分析ATRNL1与临床信息的相关性;使用GSE1297数据筛选ATRNL1共表达基因并使用clusterProfiler程序包进行基因功能注释,包括基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;为研究ATRNL1差异表达的调控机制,使用multiMiR程序包下载miRNA相互作用数据,根据竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)的调控机制构建ATRNL1-miRNA-mRNA调控网络。结果:3个独立芯片数据中ATRNL1在AD中表达明显下降(P<0.05);ATRNL1表达与PMI评分明显相关(P<0.05),与简易智力状态检查量表(mini-mental status examination,MMSE)评分明显相关(P<0.001),与神经元神经原纤维缠结(neurofibrillary tangles,NFT)评分明显相关(P<0.05);ATRNL1共表达基因的富集分析发现,信号释放生物学过程(GO:0023061)、突触小泡周期(hsa04721)、γ-氨基丁酸能突触(hsa04727)与ATRNL1明显相关;构建的ATRNL1-miRNA-mRNA调控网络发现,MOAP1、WDR47、REEP1等基因很可能与hsa-miR-192-5p竞争性调控ATRNL1表达,与ATRNL1构成ceRNA。结论:首次发现ATRNL1可能通过调控突触的信号传递以及影响γ-氨基丁酸能突触,影响AD发病,ATRNL1可能通过hsamiR-192-5p与MOAP1构成ceRNA。