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鸡MOB基因的克隆与表达谱分析
1
作者
于晓龙
金洪洲
+1 位作者
李响
满朝来
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009年第23期13-17,共5页
MOB家族是一个庞大的高度保守的蛋白家族,MOB蛋白参与调控细胞周期和细胞形态形成,而且与肿瘤的发生发展可能有关。该实验利用RT-PCR技术克隆获得了鸡的MOB基因全长编码序列,并对鸡MOB基因的遗传进化性和蛋白功能进行生物信息学预测,同...
MOB家族是一个庞大的高度保守的蛋白家族,MOB蛋白参与调控细胞周期和细胞形态形成,而且与肿瘤的发生发展可能有关。该实验利用RT-PCR技术克隆获得了鸡的MOB基因全长编码序列,并对鸡MOB基因的遗传进化性和蛋白功能进行生物信息学预测,同时利用半定量RT-PCR技术对雏鸡的MOB基因进行组织表达谱分析。实验结果表明:鸡MOB基因核酸和氨基酸序列与人和鼠的同源基因同源性在80%以上;生物信息学分析后发现鸡MOB蛋白具有6个跨膜结构域和一个SAM结构域;组织表达谱分析表明鸡MOB基因在各个组织中均有表达,但在脑、肠、脾、肺、骨骼肌和肝脏中表达量较高。含SAM结构域的多种蛋白在胚胎发育、神经形成和白血病等过程中具有重要功能,该研究通过对鸡MOB基因的研究希望能够为人类同源基因的深入研究和肿瘤发生机制的深人探讨提供有价值的参考。
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关键词
鸡
mob基因
克隆
生物信息学
SAM结构域
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职称材料
新基因人MOB cDNA的克隆与功能分析
被引量:
1
2
作者
袁红丰
王冬梅
+4 位作者
李海民
陈琳
白慈贤
岳文
裴雪涛
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期225-230,共6页
人MOB基因被认为是在脑组织中高表达的 5次跨膜而功能未知的膜蛋白 .从胎儿和成人肾脏消减杂交cDNA文库中获得了一条新的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST)序列 ,该序列对应于功能未知的MOB基因 .利用生物信息学分析工具和分子...
人MOB基因被认为是在脑组织中高表达的 5次跨膜而功能未知的膜蛋白 .从胎儿和成人肾脏消减杂交cDNA文库中获得了一条新的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST)序列 ,该序列对应于功能未知的MOB基因 .利用生物信息学分析工具和分子生物学技术 ,从胎儿肝脏中成功地克隆了人MOB基因cDNA序列 ,同时也获得了含有完整开放读码框的大鼠和鸡MOB的电子全长序列 .人MOB基因定位于 10q11 1~ 11 2之间 ,含有一个 12 4 2bp的开放阅读框 ,第 4 15位开始的ATG可能是翻译起始位点 .核酸序列相似性搜索发现 ,其他种属中存在与之高度相似的EST序列 ,如爪蟾 (79% )、羊 (87% )、猪 (94 % )、牛 (93% ) .蛋白质序列相似性搜索发现 ,人MOB与大鼠、小鼠和鸡MOB有 97%、 97%、 91%的相似性 ,与其他一些不同种属来源的假想蛋白有 4 5 %~ 73%的相似性 .不同物种之间MOB基因核酸和蛋白质序列的高度相似说明 ,MOB是进化上高度保守的蛋白质 .保守结构域分析发现 ,人、小鼠、大鼠和鸡MOB结构域组成完全一致 ,N端均与不育α基序(sterilealphamotif,SAM )结构域显著匹配 ,随后出现匹配显著性稍差的几个结构域 .核酸和蛋白质序列的保守性提示 ,除N端约 70个氨基酸组成SAM结构域外 。
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关键词
人
mob基因
脑组织
膜蛋白
表达序列标签
EST
生物信息学
SAM结构域
CDNA序列
生物学功能
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职称材料
题名
鸡MOB基因的克隆与表达谱分析
1
作者
于晓龙
金洪洲
李响
满朝来
机构
黑龙江省农业科学院畜牧研究所
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院
出处
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009年第23期13-17,共5页
基金
哈尔滨师范大学青年学术骨干资助计划项目"鸡肌肉发育相关新基因的克隆与表达分析"(KGB200806)
文摘
MOB家族是一个庞大的高度保守的蛋白家族,MOB蛋白参与调控细胞周期和细胞形态形成,而且与肿瘤的发生发展可能有关。该实验利用RT-PCR技术克隆获得了鸡的MOB基因全长编码序列,并对鸡MOB基因的遗传进化性和蛋白功能进行生物信息学预测,同时利用半定量RT-PCR技术对雏鸡的MOB基因进行组织表达谱分析。实验结果表明:鸡MOB基因核酸和氨基酸序列与人和鼠的同源基因同源性在80%以上;生物信息学分析后发现鸡MOB蛋白具有6个跨膜结构域和一个SAM结构域;组织表达谱分析表明鸡MOB基因在各个组织中均有表达,但在脑、肠、脾、肺、骨骼肌和肝脏中表达量较高。含SAM结构域的多种蛋白在胚胎发育、神经形成和白血病等过程中具有重要功能,该研究通过对鸡MOB基因的研究希望能够为人类同源基因的深入研究和肿瘤发生机制的深人探讨提供有价值的参考。
关键词
鸡
mob基因
克隆
生物信息学
SAM结构域
Keywords
chicken,
mob
Gene, clone, bioinformatics, SAM Domain
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
新基因人MOB cDNA的克隆与功能分析
被引量:
1
2
作者
袁红丰
王冬梅
李海民
陈琳
白慈贤
岳文
裴雪涛
机构
军事医学科学院输血研究所干细胞生物学研究室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期225-230,共6页
基金
国家重点基础研究发展规划项目 ( 973 ) ( 0 0 1CB5 0 990 6)
国家高技术"863"计划领域重大专项 ( 2 0 0 2AA2 0 5 0 5 1)
主题项目 ( 2 0 0 1AA2 1615 1)资助项目~~
文摘
人MOB基因被认为是在脑组织中高表达的 5次跨膜而功能未知的膜蛋白 .从胎儿和成人肾脏消减杂交cDNA文库中获得了一条新的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST)序列 ,该序列对应于功能未知的MOB基因 .利用生物信息学分析工具和分子生物学技术 ,从胎儿肝脏中成功地克隆了人MOB基因cDNA序列 ,同时也获得了含有完整开放读码框的大鼠和鸡MOB的电子全长序列 .人MOB基因定位于 10q11 1~ 11 2之间 ,含有一个 12 4 2bp的开放阅读框 ,第 4 15位开始的ATG可能是翻译起始位点 .核酸序列相似性搜索发现 ,其他种属中存在与之高度相似的EST序列 ,如爪蟾 (79% )、羊 (87% )、猪 (94 % )、牛 (93% ) .蛋白质序列相似性搜索发现 ,人MOB与大鼠、小鼠和鸡MOB有 97%、 97%、 91%的相似性 ,与其他一些不同种属来源的假想蛋白有 4 5 %~ 73%的相似性 .不同物种之间MOB基因核酸和蛋白质序列的高度相似说明 ,MOB是进化上高度保守的蛋白质 .保守结构域分析发现 ,人、小鼠、大鼠和鸡MOB结构域组成完全一致 ,N端均与不育α基序(sterilealphamotif,SAM )结构域显著匹配 ,随后出现匹配显著性稍差的几个结构域 .核酸和蛋白质序列的保守性提示 ,除N端约 70个氨基酸组成SAM结构域外 。
关键词
人
mob基因
脑组织
膜蛋白
表达序列标签
EST
生物信息学
SAM结构域
CDNA序列
生物学功能
Keywords
human
mob
gene,SAM domain, bioinformatics
分类号
Q527 [生物学—生物化学]
Q73 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡MOB基因的克隆与表达谱分析
于晓龙
金洪洲
李响
满朝来
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2009
0
下载PDF
职称材料
2
新基因人MOB cDNA的克隆与功能分析
袁红丰
王冬梅
李海民
陈琳
白慈贤
岳文
裴雪涛
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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